演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

MRPS14HSMRPS14

mitochondrial ribosomal protein S14

MRPS14 的基因身分與分類資料已收錄,功能註解尚待補充。

Homo sapiens1q25.1UniProt O60783
OFFICIAL SYMBOL
MRPS14
CHROMOSOME
1
UNIPROT
O60783
PDB / ALPHAFOLD
3J9M
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

MRPS14 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 mitochondrial ribosomal protein S14。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 1q25.1。

Official symbol
MRPS14
Gene name
mitochondrial ribosomal protein S14
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14049
UniProt
O60783
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HSMRPS14uS14m

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 11q25.1
chr1 · 248,956,422 bp · GRCh38chr1p36.33 · 1–2300000 · gnegchr1p36.32 · 2300001–5300000 · gpos25chr1p36.31 · 5300001–7100000 · gnegchr1p36.23 · 7100001–9100000 · gpos25chr1p36.22 · 9100001–12500000 · gnegchr1p36.21 · 12500001–15900000 · gpos50chr1p36.13 · 15900001–20100000 · gnegchr1p36.12 · 20100001–23600000 · gpos25chr1p36.11 · 23600001–27600000 · gnegchr1p35.3 · 27600001–29900000 · gpos25chr1p35.2 · 29900001–32300000 · gnegchr1p35.1 · 32300001–34300000 · gpos25chr1p34.3 · 34300001–39600000 · gnegchr1p34.2 · 39600001–43700000 · gpos25chr1p34.1 · 43700001–46300000 · gnegchr1p33 · 46300001–50200000 · gpos75chr1p32.3 · 50200001–55600000 · gnegchr1p32.2 · 55600001–58500000 · gpos50chr1p32.1 · 58500001–60800000 · gnegchr1p31.3 · 60800001–68500000 · gpos50chr1p31.2 · 68500001–69300000 · gnegchr1p31.1 · 69300001–84400000 · gpos100chr1p22.3 · 84400001–87900000 · gnegchr1p22.2 · 87900001–91500000 · gpos75chr1p22.1 · 91500001–94300000 · gnegchr1p21.3 · 94300001–99300000 · gpos75chr1p21.2 · 99300001–101800000 · gnegchr1p21.1 · 101800001–106700000 · gpos100chr1p13.3 · 106700001–111200000 · gnegchr1p13.2 · 111200001–115500000 · gpos50chr1p13.1 · 115500001–117200000 · gnegchr1p12 · 117200001–120400000 · gpos50chr1p11.2 · 120400001–121700000 · gnegchr1p11.1 · 121700001–123400000 · acenchr1q11 · 123400001–125100000 · acenchr1q12 · 125100001–143200000 · gvarchr1q21.1 · 143200001–147500000 · gnegchr1q21.2 · 147500001–150600000 · gpos50chr1q21.3 · 150600001–155100000 · gnegchr1q22 · 155100001–156600000 · gpos50chr1q23.1 · 156600001–159100000 · gnegchr1q23.2 · 159100001–160500000 · gpos50chr1q23.3 · 160500001–165500000 · gnegchr1q24.1 · 165500001–167200000 · gpos50chr1q24.2 · 167200001–170900000 · gnegchr1q24.3 · 170900001–173000000 · gpos75chr1q25.1 · 173000001–176100000 · gnegchr1q25.2 · 176100001–180300000 · gpos50chr1q25.3 · 180300001–185800000 · gnegchr1q31.1 · 185800001–190800000 · gpos100chr1q31.2 · 190800001–193800000 · gnegchr1q31.3 · 193800001–198700000 · gpos100chr1q32.1 · 198700001–207100000 · gnegchr1q32.2 · 207100001–211300000 · gpos25chr1q32.3 · 211300001–214400000 · gnegchr1q41 · 214400001–223900000 · gpos100chr1q42.11 · 223900001–224400000 · gnegchr1q42.12 · 224400001–226800000 · gpos25chr1q42.13 · 226800001–230500000 · gnegchr1q42.2 · 230500001–234600000 · gpos50chr1q42.3 · 234600001–236400000 · gnegchr1q43 · 236400001–243500000 · gpos75chr1q44 · 243500001–248956422 · gnegMRPS14pq1 bp248,956,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr1:175,010,789–175,023,471
Gene span
12,683 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000476371 ★175,012,958–175,023,4253
ENST00001129707175,011,349–175,023,4713
ENST00000881843175,012,958–175,023,4464
ENST00001144926175,012,958–175,023,4713
ENST00000915397175,014,401–175,023,4712
ENST00001129708175,018,223–175,023,4712
ENST00001106781175,018,234–175,023,4462

顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

目前匯入的來源未提供可採用的功能敘述。這不代表此基因缺乏生物學作用;有新的可用註解時可再補充。
05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 175023425 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>MRPS14 ENST00000476371 GRCh38 chr1:175023325-175024425 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TTTTTTTTTTTGTCTTGCTGTGTTGCCAAGGCTGGAGTGCAGGGATGCAATCTCGGCTCACTACAACCTC
TACCTCCTGGGTTCAAGAAATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAGTACGTGGGATTACAGGCACCTGCCACC
GCACCTGGCTGATTTTTGTATTTTCAGTAGAGACTGGGTTTCACCCATATTGGTCAGGCTGGTCTTGAAC
TCCTGACCTCAAGTGATCCACCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGAATTACAGGTGTGAGCCACCATGC
CCAGCCTTTTTTTAATATCCTTCATAAAATCAGTAAAAAGCCAGCAGGGCTGCACTAGCAGCTTCCAGGG
TATGAACATCTCCACCACCCATAAGAGTTCTGGATCCTGGGCTACCTCTTCATCCAACAGTATTTTGCCA
TCTTTGAAAGGGCAAACGATCAGCTTGGCCTAACTCCCGTGGCTTAAGTCTAAGTCTTTCTGACCACTTT
CCAGGAAGATCTGGCCTAAGTCCTGTGCCCGCTGTAGATGTATATAATTCTCCTGACTGTTCTTCCTATG
GGATTGTAGAGGTGGACTCTTGCCCTGTTCCTGGTCACACCAATAAGGTAGAATTAAATCATAACCTACA
ACAGCAACAAAAAAGATGCTTTCAGAACTAGTTTTCCAGAAAGGAAGAAAAGAGTGCACAGAGCTAGCTC
GCCTATTTCATGACCCGCTTATAGAAGATGACCCCAACTGTGGGTAGGGAGAGAAGGGTATTACACGGGC
TGCAACACACGGGGCGGGTCTGGCTGCGCCATCAGCATCAACGCGGCGCCTTCAGATTTGTCATTTGCCC
AAGTTCCGTGAAATATCGCGAGAGCTCCGATCCCAAAACTAACCCCGCTTTCCTGTAGGCCACATTCCCA
CCCACCTCCCAGCTCCGCCCCAGGCGGCCCAGGCCCCGCCCCTCGTGTCCTGCGCTATTCGGCAGTGTCA
ATAAAGTTTCAGCGGTTTGTAGTTTGTAGCGGACAACATGGCGGCCTTCATGCTGGGCTCGCTGCTGCGG
ACGTTCAAGCAGGTCAGGCCTCTACTTTTATCCACACCGCTACCCCTCACC
MRPS14 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
MRPS14_1 ↗1:175,023,425負股175,023,415–175,023,474

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR1_94KGN7 · promoter · 175022670–175023170 · regulatory

ENSR1_94KGNF · promoter · 175023415–175023915 · regulatory

· motif · 175021369–175021381 · motif

· motif · 175023228–175023239 · motif

· motif · 175023400–175023410 · motif

· motif · 175023421–175023436 · motif

· motif · 175023473–175023483 · motif

· motif · 175023507–175023517 · motif

· motif · 175023511–175023522 · motif

· motif · 175023636–175023646 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:128 aa

MRPS14 的蛋白質屬於普遍存在的核糖體蛋白 uS14 家族。

07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 3J9M…

PDB · 3J9M

EM · 3.50 A · AK=1-128

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Mitochondrion

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 4 個夥伴 · 最多顯示 50 個
HSMRPS14MRPS14FGFR3GSNUBQLN1Q9Y649
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 4 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

MRPS14 是粒線體小型核糖體次單元(mt-SSU)的組成成分。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小型與 39S 大型次單元構成;小型次單元含有 12S mt-rRNA 和 30 種蛋白質。另有相似性推定的資料指出,MRPS14 與 LIAT1 互作。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

Combined oxidative phosphorylation deficiency 38(COXPD38)是一種體染色體隱性疾病,與粒線體功能障礙有關,特徵包括圍產期肥厚型心肌病、發育遲緩、肌張力低下、乳酸升高、形態異常及智能障礙。影響 MRPS14 所代表基因的變異可能導致此病;此描述表示可能的致病關聯,並非所有相關變異均已證實具有因果作用。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
交互作用MRPS14 是粒線體小型核糖體次單元(mt-SSU)的組成成分。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小型與 39S 大型次單元構成;小型次單元含 12S mt-rRNA 與 30 種蛋白質,大型次單元則含 16S mt-rRNA、具有重要結構作用的 mt-tRNA(Val) 及 52 種蛋白質。MRPS14 與 LIAT1 的互作為相似性推定。含實驗來源
證據與來源

Component of the mitochondrial small ribosomal subunit (mt-SSU). Mature mammalian 55S mitochondrial ribosomes consist of a small (28S) and a large (39S) subunit. The 28S small subunit contains a 12S ribosomal RNA (12S mt-rRNA) and 30 different proteins. The 39S large subunit contains a 16S rRNA (16S mt-rRNA), a copy of mitochondrial valine transfer RNA (mt-tRNA(Val)), which plays an integral structural role, and 52 different proteins. Interacts with LIAT1 (By similarity)

PMID 25838379 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位MRPS14 的細胞內定位為粒線體。含實驗來源
證據與來源

Mitochondrion

PMID 25838379 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯Combined oxidative phosphorylation deficiency 38(COXPD38)是與粒線體功能障礙相關的體染色體隱性疾病,特徵包括圍產期肥厚型心肌病、發育遲緩、肌張力低下、乳酸升高、形態異常及智能障礙。影響此條目所代表基因的變異可能導致該病,描述保留了可能性,未表示所有變異均具確定因果作用。含實驗來源
證據與來源

Combined oxidative phosphorylation deficiency 38 COXPD38 An autosomal recessive disorder due to mitochondrial dysfunction and characterized by perinatal hypertrophic cardiomyopathy, growth retardation, muscle hypotonia, elevated lactate, dysmorphy and intellectual disability. The disease may be caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 618378

PMID 30358850 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000476371 · 2,115 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AGTTTGTAGCGGACAACATGGCGGCCTTCATGCTGGGCTC40
41GCTGCTGCGGACGTTCAAGCAGATGGTTCCTTCATCAGCT80
81TCAGGCCAAGTTCGAAGTCACTATGTAGACTGGAGAATGT120
121GGCGCGATGTGAAGAGACGAAAAATGGCCTATGAATACGC160
161AGATGAGAGGCTACGTATTAATTCACTCAGGAAGAATACC200
201ATTTTGCCAAAAATTCTTCAGGATGTGGCTGATGAAGAAA240
241TTGCTGCCCTCCCCCGGGATAGCTGTCCTGTTAGAATCAG280
281AAATCGGTGTGTTATGACGTCCCGTCCGCGTGGTGTGAAG320
321CGGCGCTGGAGGCTTAGTCGTATAGTCTTCCGTCACTTAG360
361CTGACCATGGGCAACTTTCTGGGATCCAGCGAGCGACATG400
401GTAAATGAGCTCCAGAACCTATTGAGCTTGCAGGGAAGCC440
441AAGCTTGCAGTTCCAGCAAGCAAAGATTTTTTTTAATAGA480
481CCAAACCCTAATCTCTACAGGGGCCCAGTACAGTTGTTTG520
521GCCTACCTGATGCTATCTCTAAACTACTTTTAAAATGAAG560
561ACATTTGGGTGTTTCATGTCAGTGAATTATCTTTTCTCTT600
601GGACTTAACAAACATACTGTTCCCATACATAGTACAAAGA640
641GTAGCATAATAAATATTTTCTGTGAATGTTTTTTATACCC680
681TCCTTTTAAGTTTAATCTTTTAGTAACATATAGGGGTTTT720
721TGTATTAAGAGCATTATTTCATAAAATGCTATCTTATACA760
761TAATCCAACTAATTGACATGTAGCTCATGTATGGCAGTTT800
801GTAATCCTGGACTAGCTTTGCTGACCTGCAGAGCTCCCCT840
841TAACTATTATTGTTAGATAAACAGATTGGATAGCAAGGCT880
881GCTGTTCTGGATTATCTAATGCTCCACTTCTTCTTGTGAT920
921GGCTGAACAAAAGAACCACTAAGTGTTTTCTTGTCCATCC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。