基因總覽
MRPS11 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 mitochondrial ribosomal protein S11。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 15q25.3。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000325844 ★ | 88,467,708–88,480,776 | 6 |
| ENST00000892746 | 88,467,421–88,480,776 | 7 |
| ENST00000892747 | 88,467,421–88,478,387 | 5 |
| ENST00000915412 | 88,467,421–88,479,034 | 6 |
| ENST00000915413 | 88,467,421–88,478,389 | 5 |
| ENST00000915414 | 88,467,421–88,478,387 | 6 |
| ENST00000915415 | 88,467,421–88,478,264 | 5 |
| ENST00000958955 | 88,467,421–88,480,773 | 6 |
| ENST00000958956 | 88,467,421–88,480,773 | 5 |
| ENST00001060421 | 88,467,421–88,478,387 | 6 |
| ENST00001060423 | 88,467,421–88,478,387 | 6 |
| ENST00001060430 | 88,467,421–88,478,267 | 5 |
顯示 12/27 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>MRPS11 ENST00000325844 GRCh38 chr15:88466708-88467808 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ACTGTTTTTGCCCATGCTTCCTCACTTGCCCCTCACACAGATAGCCCCATGAGATAAAACAGAGTAGGCT TATCATAGGCATCTGACAGATGTGCCCACCGCCTCTTGTATTTCCTTCTTAACATTCATCACATCACAAA GACTTTCTCCCTCCAGACTTGTAAGCTCCTAGTGACACGGACCGATTCTTGTTCACCACAGGATCCCTAT TGTGTTGCATGAACAAGAAGTAGAGTATCTCCAAAGAGTTGTCTAAGGTGACAATAAACACGGCCAATGA AAAGAAACCACTTTTTGTTGAACATCTATGTACCAAACCAAGTCAGTAAGGTAGGTACCATTCTGCGGAT AAGTACCGTATACTTAAGTTCAGAGAGGTGAAATTACTCGCTCAAAGTCACGCAGAATAAACGTCACTCT GAACCCTGCATCTCAGTCCCACCTGCTGCAGTAGAGACGCCATCTCTTCCTGCAATGGGGTCAACGGCTT GGAGACTACAGGTGGCCGCTGCAGGCACAACGCGCCCAACAAGCGCCATGGGGATCCGTTGCTTGAGGGT GCGGCTGCAAGAGCCAGGCTGCGAGAGCTTAGACTGCCGGCCCAGAGCCTCTCGAACCGCCGCCAACCCC CCGCCACCCCTAACAGCGTCCGCCTTACGGGCGCCGCCATCTTTCGTTCTCCCACAATGCACCGCGGCTC CCAGGGATCCCTCAGCCGCGGGAGCGGCAAACTAGGGGAAAGCTCAGTCCCGGAACTGCTAGAACGAACC ATTCGCATATGGAGGGGGTGACCCACCATCTCAGAACATTAAAAAAGGGAAAGAATCCCCTGGTGAACTA CAGTGAAAGTCTTATTGAGCATTTAAATGGAAATAAAAATATTCAGTGGACCTAATGAAGAGTAGATGAC TTTCCCTTCTGTCCCCTCCCCGACAGGCACTCATGGTACCGGCGCCGGCGCAGCTGTGACTGTCGCTGCA GACGGAAACTGACTGGGGTCAATTCAAGTCATGCAGGCTGTGAGAAACGCGGGGTCGCGGTTCCTGCGGT CCTGGACTTGGCCCCAGACAGCCGGGTAACAAATGACTGCCCCCTCGAGCC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MRPS11_1 ↗ | 15:88,467,708 | 正股 | 88,467,659–88,467,718 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR15_93B53S · enhancer · 88465873–88466243 · regulatory
ENSR15_5QRSB7 · CTCF_binding_site · 88467368–88467389 · regulatory
ENSR15_93B548 · promoter · 88467378–88467728 · regulatory
ENSR15_5QRSD8 · CTCF_binding_site · 88467808–88467829 · regulatory
ENSR15_5QRSGR · CTCF_binding_site · 88468361–88468382 · regulatory
ENSR15_5QRSXB · CTCF_binding_site · 88471067–88471088 · regulatory
· motif · 88465780–88465793 · motif
· motif · 88465780–88465794 · motif
· motif · 88465954–88465969 · motif
· motif · 88465954–88465969 · motif
· motif · 88465955–88465969 · motif
· motif · 88466006–88466021 · motif
· motif · 88466678–88466693 · motif
· motif · 88466683–88466695 · motif
· motif · 88467184–88467191 · motif
· motif · 88467329–88467339 · motif
· motif · 88467335–88467345 · motif
· motif · 88467369–88467379 · motif
· motif · 88467370–88467386 · motif
· motif · 88467420–88467437 · motif
· motif · 88467456–88467465 · motif
· motif · 88467489–88467502 · motif
· motif · 88467702–88467709 · motif
· motif · 88467742–88467759 · motif
· motif · 88467810–88467826 · motif
· motif · 88468022–88468038 · motif
· motif · 88468022–88468038 · motif
· motif · 88468139–88468152 · motif
· motif · 88468363–88468379 · motif
· motif · 88471069–88471085 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：194 aa
mitochondrial ribosomal protein S11 長 194 個胺基酸，屬於 universal ribosomal protein uS11 家族。其 N 端第 1 個胺基酸起始的轉運胜肽與粒線體定位相關；來源未提供其他功能區域或序列註解。
蛋白質三維結構
細胞內定位
mitochondrial ribosomal protein S11 定位於粒線體。 來源未提供定位隨條件或異構型改變的資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- NAA10P41227 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
mitochondrial ribosomal protein S11 是粒線體小型核糖體次單位（mt-SSU）的組成成分。成熟哺乳類粒線體核糖體為 55S，由 28S 小型次單位與 39S 大型次單位構成；28S 次單位含有 12S mt-rRNA 與 30 種不同蛋白質。此來源未指出 mitochondrial ribosomal protein S11 與其他分子的直接結合關係。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 交互作用 | mitochondrial ribosomal protein S11 是粒線體小型核糖體次單位（mt-SSU）的組成成分。成熟哺乳類粒線體核糖體由 28S 小型次單位及 39S 大型次單位構成；28S 次單位含有 12S 粒線體核糖體 RNA（12S mt-rRNA）與 30 種不同蛋白質。39S 次單位則含有 16S mt-rRNA、一份具有重要結構作用的粒線體纈胺酸轉運 RNA（mt-tRNA(Val)），以及 52 種不同蛋白質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the mitochondrial small ribosomal subunit (mt-SSU). Mature mammalian 55S mitochondrial ribosomes consist of a small (28S) and a large (39S) subunit. The 28S small subunit contains a 12S ribosomal RNA (12S mt-rRNA) and 30 different proteins. The 39S large subunit contains a 16S rRNA (16S mt-rRNA), a copy of mitochondrial valine transfer RNA (mt-tRNA(Val)), which plays an integral structural role, and 52 different proteins PMID 25838379 ↗ |
| 細胞定位 | mitochondrial ribosomal protein S11 位於粒線體。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AATTCAAGTCATGCAGGCTGTGAGAAACGCGGGGTCGCGG40TTCCTGCGGTCCTGGACTTGGCCCCAGACAGCCGGCAGGG80TCGTGGCCAGAACGCCGGCCGGGACCATCTGCACAGGCGC120TCGACAGCTCCAAGACGCTGCGGCCAAGCAGAAAGTTGAA160CAGAACGCGGCTCCCAGCCACACCAAGTTCAGCATTTACC200CTCCCATTCCAGGAGAGGAGAGCTCTCTGAGGTGGGCAGG240AAAGAAATTTGAGGAGATCCCAATTGCACACATTAAAGCA280TCCCACAACAACACACAGATCCAGGTAGTCTCTGCTAGTA320ATGAGCCCCTTGCCTTTGCTTCCTGTGGCACAGAGGGATT360TCGGAATGCCAAGAAGGGCACAGGCATCGCAGCACAGACA400GCAGGCATAGCCGCAGCGGCGAGAGCTAAACAAAAGGGCG440TGATCCACATCCGAGTTGTGGTGAAAGGCCTGGGGCCAGG480ACGCTTGTCTGCCATGCACGGACTGATCATGGGCGGCCTG520GAAGTGATCTCAATCACAGACAACACCCCAATCCCACACA560ACGGCTGCCGCCCCAGGAAGGCTCGGAAGCTGTGATGGGA600AGGAGGCCTGCACTTGGACCTGACCTCAAGCCTCAGCTCC640AGTGGGACCTTGTAAAATGCTCCCTGTCAGAGCTCTCCAG680AATATGCTTGTTGGAGATCCTTCAGGCAGTAAGGGAGAGT720TTTGCCTCCTTACACAGTGGCCTTTGCTTGCACCTCCAGC760TGGAGATGGGTGTGCCCCAGAAGTAAGCTTTGCATCTCTT800ACAAGAGGGGAGCTACAGGGGCAGCCGTGGCCTAGGCCCA840AACTCTGCTCTGAGAAAATAAATATCTGTACCACCTGTCA880TAATTTTGAGATTTTTTGCTTTCAGAGTTACGTAATTCCT920AATTCCTCTTGAAAAAGAGAGTGTGAAATGAGGTGAGGCC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。