基因總覽
MRPL9 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 mitochondrial ribosomal protein L9。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 1q21.3。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000368830 ★ | 151,759,647–151,763,496 | 7 |
| ENST00000983189 | 151,759,643–151,763,522 | 7 |
| ENST00001087283 | 151,759,643–151,763,522 | 6 |
| ENST00001087284 | 151,759,643–151,763,522 | 7 |
| ENST00001087286 | 151,759,643–151,763,522 | 5 |
| ENST00001087290 | 151,759,643–151,763,522 | 6 |
| ENST00000983190 | 151,759,647–151,763,522 | 6 |
| ENST00001028982 | 151,759,647–151,763,522 | 6 |
| ENST00001028984 | 151,759,647–151,763,522 | 5 |
| ENST00001028985 | 151,759,647–151,763,522 | 6 |
| ENST00001087292 | 151,759,647–151,763,522 | 6 |
| ENST00001087294 | 151,759,647–151,763,522 | 7 |
顯示 12/18 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>MRPL9 ENST00000368830 GRCh38 chr1:151763396-151764496 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GAGAGGAAAAAGGCTGCAGATGGGGCAGTTTTGGGGGCGAGGGGGGAATAAATAAATTAGTTTGGGACAG TTAACTTTGAGGTGTCCTTTGGATACGTAAGAGGAAAATGACGAATAAACAGTTGAATATTTGAGACGAG TTTGGGAGATGTCTAGGATGGAACTAGAAATTTGGGAGTCATTGGCTTATAAATGGTATTGTAAGCCACG AGACTGGATGAGATCAACAGTGAGTGTATACTGAGAAGAGTAAAGGTTCAAAAACGGAGTCCCGAGGGCA TTCTAAGAAGCGGGGAGAAAAGGAGAAATCAGCAAACGAGACTGAAGAAGACCGGTGTCCAGGAGGCCAA GTAGTGTATTTAGGAGGAAGGAGGACTGGTCAGTATGTTTAAGGGCCAGTCTTTCCATAATCTCTGCCAA ATGGACCTTCTTTCATCCAGTTTTTATGGTCTTCTGTCCAGTACTGAGACCCTCCCCAGAGGGAACTGTC GCGGCCTTACCATAGTTGCTTTTTTTTCTACGGTTTACATAGCTTGTGATTTAGAATTCTCCTTTATTAG CTTAAATACTGCAGTATAATGATTAAGGGTCAGGCTCCTCCTGGAGCTGGCAGAGTTTTCCAAGGGATCC CATCCTTTACCACTTTTAGGTAGATTTGAAGTAAGGAAAAGTGAGAGCATCATTCATTCTCCGGTCAGTA TCCAGTCATCACAGAACGTTAGAATTAAAAGTTAGCCCAGCAACTGGAGCTACAGCAAAGCCCACACTTT CAAGAGGAAGAGCGTCTTTTCCGGCGTCAGTCCACCTAACACTCATTCCATTATCAGTCAGTAATTCTAG GCGTCCGTCACCTCTGCCAAAAAGCAAAAATAGGCAAGCCGCGGTGCCATCTGTTCCCCGGCCCGCTCCC CATACTTTCGCTCAGCCGTACCGGCGCGCCGCAGGCAGCACTGGCGGGGGCCTTTCCTGCCGCCGACGCC GGGGTCCTCCCTCAGGTCTCATTCTGTGCCTGTGAACATGGCGGCGCCCGTTGTCACGGCCCCGGGCAGA GCTCTGCTGCGGGCGGGCGCTGGACGGCTGCTTCGGGGAGGCGTCCAGGAG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MRPL9_1 ↗ | 1:151,763,496 | 負股 | 151,763,486–151,763,545 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR1_9488DT · promoter · 151762724–151762979 · regulatory
ENSR1_B3557H · promoter · 151762990–151763588 · regulatory
ENSR1_B3557K · enhancer · 151763589–151764310 · regulatory
ENSR1_9488GH · enhancer · 151768388–151768686 · regulatory
· motif · 151762448–151762459 · motif
· motif · 151763088–151763097 · motif
· motif · 151763471–151763481 · motif
· motif · 151764457–151764468 · motif
· motif · 151765660–151765671 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：267 aa
MRPL9 蛋白質長 267 個胺基酸，屬於 bacterial ribosomal protein bL9 家族。序列註解指出其第 1–52 個胺基酸為粒線體轉運胜肽；此註解為依序列相似性推定。
蛋白質三維結構
細胞內定位
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- CDC37Q16543 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FAM9BQ8IZU0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HNRNPKP61978-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
MRPL9 是粒線體大型核糖體次單位（mt-LSU）的組成成員。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小次單位與 39S 大次單位構成；其中 39S 次單位含有 16S 粒線體 rRNA、1 個具結構作用的粒線體纈胺酸轉運 RNA，以及 52 種不同蛋白質。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 交互作用 | MRPL9 是粒線體大型核糖體次單位（mt-LSU）的組成成員。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體分為 28S 小次單位與 39S 大次單位；小次單位含 12S 粒線體 rRNA 和 30 種不同蛋白質，大次單位則含 16S 粒線體 rRNA、1 個具重要結構作用的粒線體纈胺酸轉運 RNA，以及 52 種不同蛋白質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the mitochondrial large ribosomal subunit (mt-LSU). Mature mammalian 55S mitochondrial ribosomes consist of a small (28S) and a large (39S) subunit. The 28S small subunit contains a 12S ribosomal RNA (12S mt-rRNA) and 30 different proteins. The 39S large subunit contains a 16S rRNA (16S mt-rRNA), a copy of mitochondrial valine transfer RNA (mt-tRNA(Val)), which plays an integral structural role, and 52 different proteins PMID 25278503 ↗ · PMID 25838379 ↗ · PMID 28892042 ↗ · PMID 35177605 ↗ |
| 細胞定位 | MRPL9 位於粒線體。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
ATTCTGTGCCTGTGAACATGGCGGCGCCCGTTGTCACGGC40CCCGGGCAGAGCTCTGCTGCGGGCGGGCGCTGGACGGCTG80CTTCGGGGAGGCGTCCAGGAGCTACTGCGGCCGCGACATG120AAGGGAACGCCCCTGACCTGGCCTGCAACTTCAGCCTTTC160TCAAAATCGGGGCACGGTCATCGTGGAGCGCTGGTGGAAG200GTACCGCTGGCCGGGGAGGGCCGGAAGCCGCGCCTGCACC240GGCGACATCGCGTCTATAAGCTGGTGGAGGACACGAAGCA280TCGGCCCAAAGAAAACCTGGAGCTCATCCTGACGCAGTCG320GTGGAGAATGTTGGAGTCCGGGGTGACCTGGTCTCAGTGA360AGAAATCTTTAGGCCGGAATCGACTCCTTCCTCAGGGACT400GGCTGTATATGCATCCCCTGAAAACAAGAAGCTGTTTGAA440GAGGAGAAATTGCTGAGACAAGAAGGAAAATTAGAGAAGA480TCCAGACCAAGGCAGGTGAGGCGACAGTGAAATTTCTAAA520AAGCTGTCGCCTGGAGGTAGGGATGAAGAACAATGTCAAA560TGGGAGCTGAACCCTGAAATAGTTGCCCGCCACTTCTTTA600AGAATCTTGGTGTTGTGGTTGCCCCACATACATTAAAGTT640ACCAGAAGAGCCTATCACACGGTGGGGCGAGTATTGGTGT680GAGGTGACGGTAAATGGGCTTGATACTGTGAGAGTGCCTA720TGTCTGTCGTGAACTTTGAGAAGCCCAAGACCAAAAGATA760TAAGTACTGGTTAGCCCAGCAAGCTGCCAAGGCTATGGCC800CCCACCAGCCCCCAGATCTAAATCTACTCTCCCTCCAAGG840CAGCAAAGCAGAATCGGGAGCAGTGGAGCAGAAATGTGCA880AGCACCCTGATCTCACTCCCAGCTCTGACCAAATACAGAA920TTTTAGAGAACATCTGAAGACATCAGACTGCACTGCGTAT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。