基因總覽
MRPL51 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 mitochondrial ribosomal protein L51。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 12p13.31。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000229238 ★ | 6,491,886–6,493,262 | 3 |
| ENST00000537701 | 6,490,204–6,493,841 | 3 |
| ENST00000543164 | 6,490,204–6,493,840 | 3 |
| ENST00000543703 | 6,490,204–6,493,840 | 2 |
| ENST00000538814 | 6,490,204–6,493,046 | 2 |
| ENST00000543959 | 6,490,204–6,493,718 | 3 |
| ENST00000925507 | 6,490,204–6,493,856 | 4 |
| ENST00001096701 | 6,490,204–6,493,856 | 2 |
| ENST00001096702 | 6,490,204–6,493,258 | 3 |
| ENST00001136512 | 6,490,204–6,493,856 | 3 |
| ENST00001075377 | 6,492,140–6,493,856 | 3 |
| ENST00000540949 | 6,492,281–6,493,295 | 3 |
顯示 12/12 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>MRPL51 ENST00000229238 GRCh38 chr12:6493162-6494262 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GCCCCAGGGATATACTTACTAGGCCTATTGTATTTTGCCCAAGACTGGGTCACACTGCCATGTACTCGAC TTTCCTACTCTTTTACGACCTGCAACACCACATCTTACCTGGGGATCTCACCCGCGGCTCTGATTCCGGC AGTCAGGCTGAAATGAAAAGGAAAAAACACGCGTGCACAACACGCACCAATTAGCAAGGCAGTTTTCAAG TCGGCGGAGAATCCGGCCAATCCCCGGCAGGCAGAGGCAAAGGGCCGCCTCTGAGTCTGGCAACGCGCGG GCAAAGCCACAAATACCGAGTTCAAATCTCAACGGCTGCAGGACGGCCAATCGCGACGCCCGCCGGAGCG GCCGGCCAATCACAGCGCCGCCCGGGGGCGGGCCAAGGCTCCGGCTCCGGCCCCCGCTCCCACCCCCGGC CCGCCTGCGAATCCCTCCTTGGCCGCAAGGTCCCCCTTTGCCCAGTCGGCGGGGAGGAGGCCGTATTTCT GCTGGCCAGAGACGTCGCGTCCCTGGCTGGGCATTCAGTCACCCCCAGGAAAGGAGGCAAGTCCACGCTG GGAGTTAGAAGGCATCGCCTCTAATCCAGGTTTCGCCATCTCCTCTGCTAAGTGACGTCCAGCAAGTCAC TTCACTTTCAGGACCTCAAATCTCCTCCCCAGTAGTAAAATAGGGGTAATAAAAACAGCTACAGCGGAAG ACTGTTGTGAGGCACAGAGAAAGGGCTTGGTCATTGGAAGCGGGTTCCAGGTTCTCAACCTTCATTTCCT TCACGGTTGAAGGACGCCAAAGAAAGCGGAAAGGGTGAATTTTCTTGAAATCTCAGTTTTGGGGAATCTT AGCGACGAGTCGCGGACCTCAGCTTGTCCGGCGCTCCAAAACTTCCGGCAGGCGGACCGGAAGCACTGAG GCGGGAAGGGTGGTAGAGGCCCCTCCTGCCGGAACCCGGGGGGCGGGGCTCGTGGCTGTTGCGGATGGGG CGTAGGTGGGCGGTGCGCCCACAGCTGCCTGGGTAAGGCCCAAGATGGCTGTCTTCGCCTTAGTACTCGT GTGAAGTTGGCGGGGACGGTTCCTGTCATCTTCTTGGGCTTATTTGGTGTG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MRPL51_1 ↗ | 12:6,493,262 | 負股 | 6,493,252–6,493,311 |
| MRPL51_2 ↗ | 12:6,493,799 | 負股 | 6,493,789–6,493,848 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR12_CMDP · promoter · 6493036–6494112 · regulatory
ENSR12_53J8HB · CTCF_binding_site · 6493879–6493900 · regulatory
ENSR12_B39RL · enhancer · 6494113–6494857 · regulatory
· motif · 6491982–6491993 · motif
· motif · 6493193–6493206 · motif
· motif · 6493267–6493277 · motif
· motif · 6493269–6493282 · motif
· motif · 6493273–6493286 · motif
· motif · 6493286–6493303 · motif
· motif · 6493304–6493314 · motif
· motif · 6493345–6493361 · motif
· motif · 6493358–6493367 · motif
· motif · 6493372–6493383 · motif
· motif · 6493372–6493383 · motif
· motif · 6493374–6493383 · motif
· motif · 6493478–6493494 · motif
· motif · 6493662–6493672 · motif
· motif · 6493846–6493856 · motif
· motif · 6493853–6493866 · motif
· motif · 6493879–6493889 · motif
· motif · 6493881–6493894 · motif
· motif · 6493881–6493897 · motif
· motif · 6493962–6493979 · motif
· motif · 6494077–6494093 · motif
· motif · 6494077–6494093 · motif
· motif · 6494079–6494095 · motif
· motif · 6494079–6494095 · motif
· motif · 6494096–6494116 · motif
· motif · 6494265–6494277 · motif
· motif · 6495177–6495186 · motif
· motif · 6495233–6495246 · motif
· motif · 6495233–6495246 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:128 aa
MRPL51 的蛋白質長度為 128 個胺基酸,屬於粒線體專一性核糖體蛋白 mL51 家族。其 N 端第 1 至 31 個胺基酸為粒線體轉運胜肽,與蛋白質輸送至粒線體相關。
蛋白質三維結構
細胞內定位
MRPL51 位於粒線體;來源未提供其定位隨條件或異構型而改變的資料。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
MRPL51 是粒線體大型核糖體次單元(mt-LSU)的組成成分。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小型次單元與 39S 大型次單元組成;後者含有 16S 粒線體 rRNA、1 個粒線體纈胺酸轉運 RNA,以及 52 種不同蛋白質。來源另指出 MRPL51 與 OXA1L 互作,但此關係標示為依相似性推定。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 交互作用 | MRPL51 是粒線體大型核糖體次單元(mt-LSU)的組成成分。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小型次單元及 39S 大型次單元構成;小型次單元含 12S 粒線體核糖 RNA 與 30 種不同蛋白質,大型次單元則含 16S 粒線體核糖 RNA、1 個具有重要結構作用的粒線體纈胺酸轉運 RNA,以及 52 種不同蛋白質。MRPL51 與 OXA1L 的互作關係為依相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the mitochondrial large ribosomal subunit (mt-LSU). Mature mammalian 55S mitochondrial ribosomes consist of a small (28S) and a large (39S) subunit. The 28S small subunit contains a 12S ribosomal RNA (12S mt-rRNA) and 30 different proteins. The 39S large subunit contains a 16S rRNA (16S mt-rRNA), a copy of mitochondrial valine transfer RNA (mt-tRNA(Val)), which plays an integral structural role, and 52 different proteins. Interacts with OXA1L (By similarity) PMID 25278503 ↗ · PMID 25838379 ↗ · PMID 28892042 ↗ · PMID 35177605 ↗ |
| 細胞定位 | MRPL51 位於粒線體。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
ACAGCTGCCTGGGTAAGGCCCAAGATGGCTGTCTTCGCCT40TAGTACTCGTGTGAAGTTGGCGGGGACGGTTCCTGTCATC80TTCTTGGGCTTATTTGGTGTGCTGTTGAAGGGGGGAGACT120AGAGAAATGGCAGGGAACCTCTTATCCGGGGCAGGTAGGC160GCCTGTGGGACTGGGTGCCTCTGGCGTGCAGAAGCTTCTC200TCTTGGTGTGCCTAGATTGATCGGTATAAGGCTCACTCTC240CCGCCCCCCAAAGTGGTTGATCGTTGGAACGAGAAAAGGG280CCATGTTCGGAGTGTATGACAACATCGGGATCCTGGGAAA320CTTTGAAAAGCACCCCAAAGAACTGATCAGGGGGCCCATA360TGGCTTCGAGGTTGGAAAGGGAATGAATTGCAACGTTGTA400TCCGAAAGAGGAAAATGGTTGGAAGTAGAATGTTCGCTGA440TGACCTGCACAACCTTAATAAACGCATCCGCTATCTCTAC480AAACACTTTAACCGACATGGGAAGTTTCGATAGAAGAGAA520AGCTGAGAACTTCGGAAAAGGCTCATCTGTCACCCTGGAG560AAGGGAAACTGTACTTTTCCCTGTGAGGAAACGGCTTTGT600ATTTTCTCTGTAATAAAATGGGGCTTCTTTGGAATTTGAT640AGCCACATACTTTTGTTTTCCTCTAGATGCTGCCTCTACT680CATGTAGACTATGAAGTCTTGACTCATCCTAGATCTTAGG720ATCTTAGGTTTGGGCTTCACACCACTTGCCTTTTACAGTC760TAGCTATACCTAATTCCTTTAAAAAGAAAAGTTGGTGAGA800ATGTTATTGGCGCTTTTTGACATAATGCTGTTATGTTAAT840AGTGTTTCTAAAGAGCCTTCCACACTGAAATGAAATATAA880GAGAAAAATGGAGTCATA898cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。