演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

MRPL51CDA09

mitochondrial ribosomal protein L51

MRPL51 的基因身分與分類資料已收錄,功能註解尚待補充。

Homo sapiens12p13.31UniProt Q4U2R6
OFFICIAL SYMBOL
MRPL51
CHROMOSOME
12
UNIPROT
Q4U2R6
PDB / ALPHAFOLD
3J7Y
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

MRPL51 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 mitochondrial ribosomal protein L51。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 12p13.31。

Official symbol
MRPL51
Gene name
mitochondrial ribosomal protein L51
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14044
UniProt
Q4U2R6
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
CDA09HSPC241bMRP64mL51MRP64

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1212p13.31
chr12 · 133,275,309 bp · GRCh38chr12p13.33 · 1–3200000 · gnegchr12p13.32 · 3200001–5300000 · gpos25chr12p13.31 · 5300001–10000000 · gnegchr12p13.2 · 10000001–12600000 · gpos75chr12p13.1 · 12600001–14600000 · gnegchr12p12.3 · 14600001–19800000 · gpos100chr12p12.2 · 19800001–21100000 · gnegchr12p12.1 · 21100001–26300000 · gpos100chr12p11.23 · 26300001–27600000 · gnegchr12p11.22 · 27600001–30500000 · gpos50chr12p11.21 · 30500001–33200000 · gnegchr12p11.1 · 33200001–35500000 · acenchr12q11 · 35500001–37800000 · acenchr12q12 · 37800001–46000000 · gpos100chr12q13.11 · 46000001–48700000 · gnegchr12q13.12 · 48700001–51100000 · gpos25chr12q13.13 · 51100001–54500000 · gnegchr12q13.2 · 54500001–56200000 · gpos25chr12q13.3 · 56200001–57700000 · gnegchr12q14.1 · 57700001–62700000 · gpos75chr12q14.2 · 62700001–64700000 · gnegchr12q14.3 · 64700001–67300000 · gpos50chr12q15 · 67300001–71100000 · gnegchr12q21.1 · 71100001–75300000 · gpos75chr12q21.2 · 75300001–79900000 · gnegchr12q21.31 · 79900001–86300000 · gpos100chr12q21.32 · 86300001–88600000 · gnegchr12q21.33 · 88600001–92200000 · gpos100chr12q22 · 92200001–95800000 · gnegchr12q23.1 · 95800001–101200000 · gpos75chr12q23.2 · 101200001–103500000 · gnegchr12q23.3 · 103500001–108600000 · gpos50chr12q24.11 · 108600001–111300000 · gnegchr12q24.12 · 111300001–111900000 · gpos25chr12q24.13 · 111900001–113900000 · gnegchr12q24.21 · 113900001–116400000 · gpos50chr12q24.22 · 116400001–117700000 · gnegchr12q24.23 · 117700001–120300000 · gpos50chr12q24.31 · 120300001–125400000 · gnegchr12q24.32 · 125400001–128700000 · gpos50chr12q24.33 · 128700001–133275309 · gnegMRPL51pq1 bp133,275,309 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr12:6,490,204–6,493,856
Gene span
3,653 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000229238 ★6,491,886–6,493,2623
ENST000005377016,490,204–6,493,8413
ENST000005431646,490,204–6,493,8403
ENST000005437036,490,204–6,493,8402
ENST000005388146,490,204–6,493,0462
ENST000005439596,490,204–6,493,7183
ENST000009255076,490,204–6,493,8564
ENST000010967016,490,204–6,493,8562
ENST000010967026,490,204–6,493,2583
ENST000011365126,490,204–6,493,8563
ENST000010753776,492,140–6,493,8563
ENST000005409496,492,281–6,493,2953

顯示 12/12 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

目前匯入的來源未提供可採用的功能敘述。這不代表此基因缺乏生物學作用;有新的可用註解時可再補充。
05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 6493262 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>MRPL51 ENST00000229238 GRCh38 chr12:6493162-6494262 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GCCCCAGGGATATACTTACTAGGCCTATTGTATTTTGCCCAAGACTGGGTCACACTGCCATGTACTCGAC
TTTCCTACTCTTTTACGACCTGCAACACCACATCTTACCTGGGGATCTCACCCGCGGCTCTGATTCCGGC
AGTCAGGCTGAAATGAAAAGGAAAAAACACGCGTGCACAACACGCACCAATTAGCAAGGCAGTTTTCAAG
TCGGCGGAGAATCCGGCCAATCCCCGGCAGGCAGAGGCAAAGGGCCGCCTCTGAGTCTGGCAACGCGCGG
GCAAAGCCACAAATACCGAGTTCAAATCTCAACGGCTGCAGGACGGCCAATCGCGACGCCCGCCGGAGCG
GCCGGCCAATCACAGCGCCGCCCGGGGGCGGGCCAAGGCTCCGGCTCCGGCCCCCGCTCCCACCCCCGGC
CCGCCTGCGAATCCCTCCTTGGCCGCAAGGTCCCCCTTTGCCCAGTCGGCGGGGAGGAGGCCGTATTTCT
GCTGGCCAGAGACGTCGCGTCCCTGGCTGGGCATTCAGTCACCCCCAGGAAAGGAGGCAAGTCCACGCTG
GGAGTTAGAAGGCATCGCCTCTAATCCAGGTTTCGCCATCTCCTCTGCTAAGTGACGTCCAGCAAGTCAC
TTCACTTTCAGGACCTCAAATCTCCTCCCCAGTAGTAAAATAGGGGTAATAAAAACAGCTACAGCGGAAG
ACTGTTGTGAGGCACAGAGAAAGGGCTTGGTCATTGGAAGCGGGTTCCAGGTTCTCAACCTTCATTTCCT
TCACGGTTGAAGGACGCCAAAGAAAGCGGAAAGGGTGAATTTTCTTGAAATCTCAGTTTTGGGGAATCTT
AGCGACGAGTCGCGGACCTCAGCTTGTCCGGCGCTCCAAAACTTCCGGCAGGCGGACCGGAAGCACTGAG
GCGGGAAGGGTGGTAGAGGCCCCTCCTGCCGGAACCCGGGGGGCGGGGCTCGTGGCTGTTGCGGATGGGG
CGTAGGTGGGCGGTGCGCCCACAGCTGCCTGGGTAAGGCCCAAGATGGCTGTCTTCGCCTTAGTACTCGT
GTGAAGTTGGCGGGGACGGTTCCTGTCATCTTCTTGGGCTTATTTGGTGTG
MRPL51 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
MRPL51_1 ↗12:6,493,262負股6,493,252–6,493,311
MRPL51_2 ↗12:6,493,799負股6,493,789–6,493,848

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR12_CMDP · promoter · 6493036–6494112 · regulatory

ENSR12_53J8HB · CTCF_binding_site · 6493879–6493900 · regulatory

ENSR12_B39RL · enhancer · 6494113–6494857 · regulatory

· motif · 6491982–6491993 · motif

· motif · 6493193–6493206 · motif

· motif · 6493267–6493277 · motif

· motif · 6493269–6493282 · motif

· motif · 6493273–6493286 · motif

· motif · 6493286–6493303 · motif

· motif · 6493304–6493314 · motif

· motif · 6493345–6493361 · motif

· motif · 6493358–6493367 · motif

· motif · 6493372–6493383 · motif

· motif · 6493372–6493383 · motif

· motif · 6493374–6493383 · motif

· motif · 6493478–6493494 · motif

· motif · 6493662–6493672 · motif

· motif · 6493846–6493856 · motif

· motif · 6493853–6493866 · motif

· motif · 6493879–6493889 · motif

· motif · 6493881–6493894 · motif

· motif · 6493881–6493897 · motif

· motif · 6493962–6493979 · motif

· motif · 6494077–6494093 · motif

· motif · 6494077–6494093 · motif

· motif · 6494079–6494095 · motif

· motif · 6494079–6494095 · motif

· motif · 6494096–6494116 · motif

· motif · 6494265–6494277 · motif

· motif · 6495177–6495186 · motif

· motif · 6495233–6495246 · motif

· motif · 6495233–6495246 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:128 aa

1 aa128 aa轉運胜肽
依 Q4U2R6 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

MRPL51 的蛋白質長度為 128 個胺基酸,屬於粒線體專一性核糖體蛋白 mL51 家族。其 N 端第 1 至 31 個胺基酸為粒線體轉運胜肽,與蛋白質輸送至粒線體相關。

轉運胜肽Mitochondrion1–31 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 3J7Y…

PDB · 3J7Y

EM · 3.40 A · i=1-128

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Mitochondrion

MRPL51 位於粒線體;來源未提供其定位隨條件或異構型而改變的資料。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
CDA09MRPL51
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

MRPL51 是粒線體大型核糖體次單元(mt-LSU)的組成成分。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小型次單元與 39S 大型次單元組成;後者含有 16S 粒線體 rRNA、1 個粒線體纈胺酸轉運 RNA,以及 52 種不同蛋白質。來源另指出 MRPL51 與 OXA1L 互作,但此關係標示為依相似性推定。

11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
交互作用MRPL51 是粒線體大型核糖體次單元(mt-LSU)的組成成分。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小型次單元及 39S 大型次單元構成;小型次單元含 12S 粒線體核糖 RNA 與 30 種不同蛋白質,大型次單元則含 16S 粒線體核糖 RNA、1 個具有重要結構作用的粒線體纈胺酸轉運 RNA,以及 52 種不同蛋白質。MRPL51 與 OXA1L 的互作關係為依相似性推定。含實驗來源
證據與來源

Component of the mitochondrial large ribosomal subunit (mt-LSU). Mature mammalian 55S mitochondrial ribosomes consist of a small (28S) and a large (39S) subunit. The 28S small subunit contains a 12S ribosomal RNA (12S mt-rRNA) and 30 different proteins. The 39S large subunit contains a 16S rRNA (16S mt-rRNA), a copy of mitochondrial valine transfer RNA (mt-tRNA(Val)), which plays an integral structural role, and 52 different proteins. Interacts with OXA1L (By similarity)

PMID 25278503 ↗ · PMID 25838379 ↗ · PMID 28892042 ↗ · PMID 35177605 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位MRPL51 位於粒線體。含實驗來源
證據與來源

Mitochondrion

PMID 25278503 ↗ · PMID 25838379 ↗ · PMID 28892042 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000229238 · 898 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ACAGCTGCCTGGGTAAGGCCCAAGATGGCTGTCTTCGCCT40
41TAGTACTCGTGTGAAGTTGGCGGGGACGGTTCCTGTCATC80
81TTCTTGGGCTTATTTGGTGTGCTGTTGAAGGGGGGAGACT120
121AGAGAAATGGCAGGGAACCTCTTATCCGGGGCAGGTAGGC160
161GCCTGTGGGACTGGGTGCCTCTGGCGTGCAGAAGCTTCTC200
201TCTTGGTGTGCCTAGATTGATCGGTATAAGGCTCACTCTC240
241CCGCCCCCCAAAGTGGTTGATCGTTGGAACGAGAAAAGGG280
281CCATGTTCGGAGTGTATGACAACATCGGGATCCTGGGAAA320
321CTTTGAAAAGCACCCCAAAGAACTGATCAGGGGGCCCATA360
361TGGCTTCGAGGTTGGAAAGGGAATGAATTGCAACGTTGTA400
401TCCGAAAGAGGAAAATGGTTGGAAGTAGAATGTTCGCTGA440
441TGACCTGCACAACCTTAATAAACGCATCCGCTATCTCTAC480
481AAACACTTTAACCGACATGGGAAGTTTCGATAGAAGAGAA520
521AGCTGAGAACTTCGGAAAAGGCTCATCTGTCACCCTGGAG560
561AAGGGAAACTGTACTTTTCCCTGTGAGGAAACGGCTTTGT600
601ATTTTCTCTGTAATAAAATGGGGCTTCTTTGGAATTTGAT640
641AGCCACATACTTTTGTTTTCCTCTAGATGCTGCCTCTACT680
681CATGTAGACTATGAAGTCTTGACTCATCCTAGATCTTAGG720
721ATCTTAGGTTTGGGCTTCACACCACTTGCCTTTTACAGTC760
761TAGCTATACCTAATTCCTTTAAAAAGAAAAGTTGGTGAGA800
801ATGTTATTGGCGCTTTTTGACATAATGCTGTTATGTTAAT840
841AGTGTTTCTAAAGAGCCTTCCACACTGAAATGAAATATAA880
881GAGAAAAATGGAGTCATA898

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。