基因總覽
MRPL46 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 mitochondrial ribosomal protein L46。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 15q25.3。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000312475 ★ | 88,459,478–88,467,388 | 4 |
| ENST00000887805 | 88,459,468–88,467,420 | 4 |
| ENST00000887806 | 88,459,468–88,467,420 | 3 |
| ENST00000962924 | 88,459,468–88,467,420 | 4 |
| ENST00001027554 | 88,459,468–88,467,420 | 5 |
| ENST00001132647 | 88,459,468–88,467,420 | 4 |
| ENST00001060474 | 88,459,478–88,467,420 | 4 |
| ENST00001094488 | 88,459,478–88,467,377 | 4 |
| ENST00000992426 | 88,459,479–88,467,420 | 4 |
| ENST00001109644 | 88,460,667–88,467,420 | 4 |
| ENST00001109645 | 88,463,862–88,467,420 | 4 |
| ENST00000558531 | 88,465,013–88,467,420 | 2 |
顯示 12/12 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>MRPL46 ENST00000312475 GRCh38 chr15:88467288-88468388 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TCCATCGCTAGCGCCCTCTACCTCCCCATTTTGTTTTGGAGGCAGGGAAGGTTATTGGTCTGAAAAGATC TCCATCTCAGAAGAAAAGAACGCTGATACATGTTATGGATATCTCACATTCACTCATTGATTTAACGAAT GTTCACTGAACATTTACTCTGTACCACGGCTCATCTGATTCTCACAACCTCTCTCAGCATTATCCGCATT TTTAGATGAGAAGGCTGAGGCTCAGATTTATTTGCATAAGGTCCCACGGATAGCAAGTGACATAGCTGAA AATTCACTGGTTCTGACTCTGGAGGGTGTCGGGCAAGAGTCAGGGGTTGCGGGTCTCCAGAGGGCTGGTC CAAGTGGGGCTCACCTGAACTTGGTGTGGCTGGGAGCCGCGTTCTGTTCAACTTTCTGCTTGGCCGCAGC GTCTTGGAGCTGTCGAGCGCCTGTGCAGATGGTCCCGGCCGGCGTTCTGGCCACGACCCTGCTGGGAAGA AAAGCTCGGTGAGGGCCACGGCCTAACGGTCACTGGGGCCCGGGTGGCTCAAGGGACACGAGTAGGAGCA TAGTCCTGGAGGTGGCGGTGGGCTCGAGGGGGCAGTCATTTGTTACCCGGCTGTCTGGGGCCAAGTCCAG GACCGCAGGAACCGCGACCCCGCGTTTCTCACAGCCTGCATGACTTGAATTGACCCCAGTCAGTTTCCGT CTGCAGCGACAGTCACAGCTGCGCCGGCGCCGGTACCATGAGTGCCTGTCGGGGAGGGGACAGAAGGGAA AGTCATCTACTCTTCATTAGGTCCACTGAATATTTTTATTTCCATTTAAATGCTCAATAAGACTTTCACT GTAGTTCACCAGGGGATTCTTTCCCTTTTTTAATGTTCTGAGATGGTGGGTCACCCCCTCCATATGCGAA TGGTTCGTTCTAGCAGTTCCGGGACTGAGCTTTCCCCTAGTTTGCCGCTCCCGCGGCTGAGGGATCCCTG GGAGCCGCGGTGCATTGTGGGAGAACGAAAGATGGCGGCGCCCGTAAGGCGGACGCTGTTAGGGGTGGCG GGGGGTTGGCGGCGGTTCGAGAGGCTCTGGGCCGGCAGTCTAAGCTCTCGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MRPL46_1 ↗ | 15:88,467,388 | 負股 | 88,467,378–88,467,437 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR15_93B53S · enhancer · 88465873–88466243 · regulatory
ENSR15_5QRSB7 · CTCF_binding_site · 88467368–88467389 · regulatory
ENSR15_93B548 · promoter · 88467378–88467728 · regulatory
ENSR15_5QRSD8 · CTCF_binding_site · 88467808–88467829 · regulatory
ENSR15_5QRSGR · CTCF_binding_site · 88468361–88468382 · regulatory
ENSR15_5QRSXB · CTCF_binding_site · 88471067–88471088 · regulatory
· motif · 88465780–88465793 · motif
· motif · 88465780–88465794 · motif
· motif · 88465954–88465969 · motif
· motif · 88465954–88465969 · motif
· motif · 88465955–88465969 · motif
· motif · 88466006–88466021 · motif
· motif · 88466678–88466693 · motif
· motif · 88466683–88466695 · motif
· motif · 88467184–88467191 · motif
· motif · 88467329–88467339 · motif
· motif · 88467335–88467345 · motif
· motif · 88467369–88467379 · motif
· motif · 88467370–88467386 · motif
· motif · 88467420–88467437 · motif
· motif · 88467456–88467465 · motif
· motif · 88467489–88467502 · motif
· motif · 88467702–88467709 · motif
· motif · 88467742–88467759 · motif
· motif · 88467810–88467826 · motif
· motif · 88468022–88468038 · motif
· motif · 88468022–88468038 · motif
· motif · 88468139–88468152 · motif
· motif · 88468363–88468379 · motif
· motif · 88471069–88471085 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：279 aa
mitochondrial ribosomal protein L46 屬於粒線體特異性的 mL46 核糖體蛋白家族，長 279 個胺基酸。其序列註解包含位於蛋白質 N 端的粒線體轉運肽，範圍自第 1 個胺基酸起。
蛋白質三維結構
細胞內定位
MRPL46 定位於粒線體；來源未提供不同條件下的定位變化或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
MRPL46 是粒線體大型核糖體次單元（mt-LSU）的組成成員，位於中央突起。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小次單元與 39S 大次單元構成；後者含 16S 粒線體核糖體 RNA、具結構作用的粒線體 valine transfer RNA，以及 52 種蛋白質。來源支持其為複合體成員，未提供與特定分子的直接結合資訊。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 交互作用 | MRPL46 是粒線體大型核糖體次單元（mt-LSU）的組成成員，位於中央突起。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小次單元和 39S 大次單元組成；大次單元含 16S 粒線體核糖體 RNA、具有結構作用的粒線體 valine transfer RNA，以及 52 種不同蛋白質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the mitochondrial large ribosomal subunit (mt-LSU). Mature mammalian 55S mitochondrial ribosomes consist of a small (28S) and a large (39S) subunit. The 28S small subunit contains a 12S ribosomal RNA (12S mt-rRNA) and 30 different proteins. The 39S large subunit contains a 16S rRNA (16S mt-rRNA), a copy of mitochondrial valine transfer RNA (mt-tRNA(Val)), which plays an integral structural role, and 52 different proteins. mL46 is located at the central protuberance PMID 11551941 ↗ · PMID 25278503 ↗ · PMID 25838379 ↗ · PMID 28892042 ↗ |
| 細胞定位 | MRPL46 定位於粒線體。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GAGAACGAAAGATGGCGGCGCCCGTAAGGCGGACGCTGTT40AGGGGTGGCGGGGGGTTGGCGGCGGTTCGAGAGGCTCTGG80GCCGGCAGTCTAAGCTCTCGCAGCCTGGCTCTTGCAGCCG120CACCCTCAAGCAACGGATCCCCATGGCGCTTGTTGGGCGC160GTTGTGCCTGCAGCGGCCACCTGTAGTCTCCAAGCCGTTG200ACCCCATTGCAGGAAGAGATGGCGTCTCTACTGCAGCAGA240TTGAGATAGAGAGAAGCCTGTATTCAGACCACGAGCTTCG280TGCTCTGGATGAAAACCAGCGACTGGCAAAGAAGAAAGCT320GACCTTCATGATGAAGAAGATGAACAGGATATATTGCTGG360CGCAAGATTTGGAAGATATGTGGGAGCAGAAATTTCTACA400GTTCAAACTTGGAGCTCGCATAACAGAAGCTGATGAAAAG440AATGACCGAACATCCCTGAACAGGAAGCTAGACAGGAACC480TTGTCCTGTTAGTCAGAGAGAAGTTTGGAGACCAGGATGT520TTGGATACTGCCCCAGGCAGAGTGGCAGCCTGGGGAGACC560CTTCGAGGAACAGCTGAACGAACCCTGGCCACACTCTCAG600AAAACAACATGGAAGCCAAGTTCCTAGGAAATGCACCCTG640TGGGCACTACACATTCAAGTTCCCCCAGGCAATGCGGACA680GAGAGTAACCTCGGAGCCAAGGTGTTCTTCTTCAAAGCAC720TGCTATTAACTGGAGACTTTTCCCAGGCTGGGAATAAGGG760CCATCATGTGTGGGTCACTAAGGATGAGCTGGGTGACTAT800TTGAAACCAAAATACCTGGCCCAAGTTAGGAGGTTTGTTT840CAGACCTCTGATGGGCCGAGCTGCCTGTGGACGGTGCTCA880GACAAGTCTGGGATTAGAGCCTCAAGGACATTGTGTGATT920GCCTCACATTTGCAGGTAATATCAAGCAGCAAACTAAATT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。