基因總覽
MRPL43 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 mitochondrial ribosomal protein L43。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 10q24.31。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000318364 ★ | 100,986,269–100,987,497 | 3 |
| ENST00000523148 | 100,969,458–100,987,196 | 4 |
| ENST00001020476 | 100,977,815–100,987,524 | 4 |
| ENST00001068984 | 100,977,820–100,987,524 | 5 |
| ENST00000318325 | 100,977,821–100,987,524 | 5 |
| ENST00000370241 | 100,977,822–100,987,524 | 5 |
| ENST00001068988 | 100,977,822–100,987,524 | 6 |
| ENST00000370242 | 100,979,198–100,987,524 | 6 |
| ENST00000952360 | 100,981,083–100,987,524 | 4 |
| ENST00001020479 | 100,981,363–100,987,524 | 4 |
| ENST00000448244 | 100,981,376–100,987,433 | 6 |
| ENST00000299179 | 100,981,376–100,987,524 | 5 |
顯示 12/19 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>MRPL43 ENST00000318364 GRCh38 chr10:100987397-100988497 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ACACCAGTCTGGCCTTTGAGCTGTGAAGACTCTGCAAAGGGGCTCAGTGCCCGCAGGCAACTGTGACCAT CCTGGAAGGGGATCCCATGCCCCCGCAAATACTGGCGGATTTCAGTTGCAGTTACAGGCAACACTGGCAT ATCCAAGGCTTGGAGAGTCTCCTTCCTGTAACGTCTGCGAGGAGGGCCTGGGGCCAAGTTTCGGGGCAGG CCCCTCCGACCCATCCACTCCCCACGCAGGGGTAACAAGATACGGAGGGGGTACCCACTTCGGAGGAGGA CCCACATTCCTAGCCAAATGTGGGAAGTCACTACTTGAAATGCCTTAGGTGCCTGGTTAGCGTGCCTTCA CTAGACCAAACTCTAGGGATATCCCACGCAGCACTCTGCAGAGCTCACTCTAGGTGCATTCTTTCTCTCC ATGAATTTCTCCTCTTCAGCCCCTCTACGTTGCTGCTTCACACATATGCCCATCTACACGACCCTTTCGC GTCCACGTCCTTCTACAATGGCTCCCCCACCTCTATGGTCCGTTAGTTAGTTTCTCTCCGCCACCTCACC TCTATGACCCTCTATACAGTTCCTCACTGACACAGTTTCTTTGCATCATCTTCTCACCTCTACTGCTCCT CCACAGCATCTCCTCGTCGTCCTCATTTCTATAGTCATCTGCATCCTTTTTGTAGTCCCTTTGCCCTAGG CCCCGACTAGAGACCCTCTTCCGCTTCTCCTTCCCCTCACTGGGACCTCAACACGGCGAGAGCACCCAGC ACGACTCCCGCCAATCCCCCGGCCCAAAGGAATGCCAGTCTCTATCCTCCCCCGTGTCTTCACTCCGCTC TACTACTCCGAGCTCCGCCGCGCCGGCCCCCAGCCCCAGGTTACCACTTTTCTCTCTCCCACTTCGCCGG CAACGTGAGTCTCCCGCACATGCTACTCGCCTTGACCTCGGAAGCAAAACTCCGGGAGCGGTCGTCCCGG AACCGGAAGCCTCGAGGTTTAGTCCCGCCCCCCTCTCCTCGCTGCTTAGGCTCCGCGGCCTCCAAGCTGT AGCTATGACGGCGCGCGGGACTCCGAGCCGCTTCTTGGCCAGCGTTCTCCA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MRPL43_2 ↗ | 10:100,987,235 | 負股 | 100,987,225–100,987,284 |
| MRPL43_1 ↗ | 10:100,987,497 | 負股 | 100,987,487–100,987,546 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR10_5TQBZD · CTCF_binding_site · 100986768–100986789 · regulatory
ENSR10_93H48R · promoter · 100986877–100987377 · regulatory
ENSR10_5TQC34 · CTCF_binding_site · 100987140–100987161 · regulatory
ENSR10_77XC2N · promoter · 100987446–100987560 · regulatory
ENSR10_BQ35H · enhancer · 100987561–100988172 · regulatory
· motif · 100984931–100984946 · motif
· motif · 100985131–100985142 · motif
· motif · 100985414–100985427 · motif
· motif · 100985414–100985427 · motif
· motif · 100985657–100985670 · motif
· motif · 100986770–100986786 · motif
· motif · 100987142–100987158 · motif
· motif · 100987220–100987232 · motif
· motif · 100987223–100987230 · motif
· motif · 100987286–100987297 · motif
· motif · 100987286–100987297 · motif
· motif · 100987507–100987516 · motif
· motif · 100987547–100987559 · motif
· motif · 100987549–100987556 · motif
· motif · 100987567–100987578 · motif
· motif · 100987713–100987724 · motif
· motif · 100987771–100987782 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：215 aa
MRPL43 的產物 mitochondrial ribosomal protein L43 長 215 個胺基酸，屬於粒線體特異性核糖體蛋白 mL43 家族。其序列 N 端包含粒線體轉運胜肽，註解指向粒線體定位。
蛋白質三維結構
細胞內定位
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 6 個夥伴
- FXR2P51116 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KAT5Q92993 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LMO3Q8TAP4-4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PRKCAP17252 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SETDB1Q15047-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- YWHAGP61981 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
MRPL43 是粒線體大型核糖體次單元（mt-LSU）的組成成分。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小次單元與 39S 大次單元構成；其中 39S 大次單元含有 16S mt-rRNA、具結構作用的 mt-tRNA(Val)，以及 52 種不同蛋白質。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 交互作用 | MRPL43 是粒線體大型核糖體次單元（mt-LSU）的組成成分。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體包含 28S 小次單元和 39S 大次單元；小次單元含 12S mt-rRNA 與 30 種不同蛋白質，大次單元則含 16S mt-rRNA、具有重要結構作用的一份粒線體纈胺酸轉運 RNA（mt-tRNA(Val)），以及 52 種不同蛋白質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the mitochondrial large ribosomal subunit (mt-LSU). Mature mammalian 55S mitochondrial ribosomes consist of a small (28S) and a large (39S) subunit. The 28S small subunit contains a 12S ribosomal RNA (12S mt-rRNA) and 30 different proteins. The 39S large subunit contains a 16S rRNA (16S mt-rRNA), a copy of mitochondrial valine transfer RNA (mt-tRNA(Val)), which plays an integral structural role, and 52 different proteins PMID 25278503 ↗ · PMID 25838379 ↗ · PMID 28892042 ↗ · PMID 35177605 ↗ |
| 細胞定位 | MRPL43 定位於粒線體。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AGTCCCGCCCCCCTCTCCTCGCTGCTTAGGCTCCGCGGCC40TCCAAGCTGTAGCTATGACGGCGCGCGGGACTCCGAGCCG80CTTCTTGGCCAGCGTTCTCCACAACGGACTGGGTCGCTAT120GTGCAGCAGCTGCAGCGTCTGAGCTTCAGCGTCAGCCGCG160ACGGCGCCTCGTCTCGCGGCGCCAGGGAGTTCGTGGAGCG200GGAGGTGATCGACTTCGCCCGACGGAATCCAGGGGTCGTA240ATATATGTAAACTCGCGTCCGTGCTGCGTGCCCAGAGTAG280TGGCCGAATACCTTAACGGGGCTGTGCGCGAGGAGAGCAT320CCACTGCAAGTCGGTCGAGGAGATCTCGACGCTGGTGCAG360AAGCTGGCCGACCAGTCGGGCTTGGACGTGATCCGCATCC400GCAAGCCCTTCCACACCGACAACCCTAGCATCCAGGGCCA440GTGGCACCCCTTCACCAACAAGCCGACCACGTTCCGCGGG480CTACGCCCCCGAGAGGTTCAGGATCCTGCCCCAGCCCAGG520TGCAAGCACAGTGAAGAGTTGCCCCACCAACTGCAGCCCC560AGGCTTTGGACTGTTACTCCGGTAAAGGTGGTTCTTCCCC600TTTGGGATTCCAAGCCCAGGCAAATGGAACCCATCAATGG640GCAAGTTGACAGAGGTTCTGCTTGGGATAATGAAGAGCTG680CCTGTTTCTTTCCAGTGCCTGCTTCTGGGGGCAGTGACCT720TGTGAACCACTCATTTTTATGCAAGTGGCATCCCTAAAAC760CTGAGATGAGGAAGACTTCAAGGGTTTTACAGGGCCCTTG800TTTTTTAAATCCAAATTGATAATAATGATCTCAAAACACA840GTGAGAGGTCTGAAGGCTGGCTTCTGAAGAATCCCTGATG880TCTTATTGGAACAACCACTGAGCTACGGAGAGCTCTGCTG920TGATGGGCTAGGCACTTTATATCTGTGTGAATACAGATTT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。