基因總覽
MRPL41 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 mitochondrial ribosomal protein L41。其產物屬於粒線體特有的 mL41 核糖體蛋白家族,並為粒線體核糖體大型次單元的組成部分。來源也指出,此蛋白與細胞凋亡及細胞週期有關;相關調控作用與其在粒線體核糖體中的角色不同,具體作用方式見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000371443 ★ | 137,551,879–137,552,555 | 2 |
| ENST00001098865 | 137,550,424–137,552,555 | 2 |
| ENST00001135560 | 137,551,863–137,552,555 | 2 |
顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
MRPL41 的一項角色是構成粒線體核糖體大型次單元。除此之外,來源亦指出它參與細胞凋亡與細胞週期調控,並描述其在生長抑制條件下與 p53/TP53 相關的作用。
在生長抑制條件下,MRPL41 可增強 p53/TP53 的穩定性,因而促進 p53/TP53 所引發的細胞凋亡。它也會增強 p53/TP53 向粒線體的轉位。這些敘述指出 MRPL41 與 p53/TP53 的穩定及細胞內位置變化相關,並將其連結至上述條件下的凋亡反應。
MRPL41 另具有使細胞週期停滯於 G1 期的能力;來源提出,這可能是藉由穩定 CDKN1A 與 CDKN1B(p27Kip1)蛋白所致。此作用機制以可能性表述,不能視為已確定的因果機制。現有資料支持其同時具有粒線體核糖體組成角色,並與 p53/TP53 相關的凋亡及 G1 期細胞週期調控相連;但未提供更完整的分子步驟或作用條件。
Promoter 與基因調控
>MRPL41 ENST00000371443 GRCh38 chr9:137550879-137551979 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GGAGGGGGTGCAGCTGGGGAGGGGGTGGATCTGGGGTGTGGGGGTGCCGCTGGGGAGGGGGTGCAGCTGG GGAGGGGGTGGATCTGGGGCGTGGGGGTGCCGCTGGGGAGGGGGTGCAGCTGGGGAGGGGGTGGATCTGG GGCGTGGGGGTGCCGCTGGGGAGGGGGTGCAGCTGGGGAGGGGATGGATCTGGGGTGTGGGGGTACCGCT GGGGAAGGGCGTGCAGCTGGAGAGGGGATGGATCTGGGCTGTGGGGGTGCCGCTGGGGACGGGGTGCAGC TGGGGAGGGGGTGGATCCGGATTGTGAGGGTGCGGCTGGGGGGCGACTTCCGCGTGGGGTGAGAGGTCGC CTGCGAGGGTGACCGGGCAGGAGGGCTCAGTGCGCAAGCCGGACGTGCTGGGTCCAAGATTATTGATTAA TTTGGGCACCGCGAGGGCTCGAGTCCCCCCACACCACTGCCCGGCCTGCGGGGGAGCACAGACAGCCCGG GCCCTCCCGGCTGCAGGTCCCGGGCTTTCCCCGCGCGGTTGCCGGCTCCGCCCAGAGGAGCCGCGCCCGG CGGAGGGGTAAGAAAGGCAGGGTCGCGGCGTCAACGCGGCGGCCGTCTCGAGTCCAGGGCCCGCGTCCTC CCCGACCTCCCGACGCCACCTCACGGCCTCAGGGGGACTGGGCTCCCGGGAAACCGCCGGCCACCTGGCG GACGAACACAGGCAGTGGCGGGCAGTGGAGACGCCAGGGACCACCGCGCTGAGAGCGATCACTCATCCGC CAGCCCCGCCCCGCGAGCCCCGCCCCGCGAGCCCCGCCCCGCGAGCCCCGCCCCGCGAGCCCCGCCCCGC GAGCCCCGCCCCGCGAGCCCCGCACCGCCGGCCCCGCACCGCCAGCCCCGCGAGCCCCGCCCCGCCCCGC GCGCTCCTCGCATTGGCCGAGTCCCCGCGGCCACACCCCCTACCAGATTGGGGCCGCTATTGGACGCGGC GGCCGCGGCCAATCGGAGCCGCTCTTGCTGCGACGCAGCGGTCGGAAGCGGAGCAAGGTCGAGGCCGGGT TGGCGCCGGAGCCGGGGCCGCTTGGAGCTCGTGTGGGGTCTCCGGTCCAGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MRPL41_1 ↗ | 9:137,551,893 | 正股 | 137,551,844–137,551,903 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR9_537CJ49 · CTCF_binding_site · 137548205–137548226 · regulatory
ENSR9_B32B36 · enhancer · 137549766–137550373 · regulatory
ENSR9_B32B39 · promoter · 137550374–137550892 · regulatory
ENSR9_942L4S · promoter · 137551389–137551889 · regulatory
ENSR9_537CJMM · CTCF_binding_site · 137551518–137551539 · regulatory
ENSR9_942L65 · enhancer · 137556022–137556385 · regulatory
· motif · 137548207–137548223 · motif
· motif · 137550437–137550446 · motif
· motif · 137550437–137550446 · motif
· motif · 137551203–137551214 · motif
· motif · 137551203–137551214 · motif
· motif · 137551214–137551227 · motif
· motif · 137551264–137551275 · motif
· motif · 137551457–137551472 · motif
· motif · 137551510–137551525 · motif
· motif · 137551520–137551536 · motif
· motif · 137551852–137551869 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:137 aa
mitochondrial ribosomal protein L41 前 13 個胺基酸被註記為粒線體轉運胜肽,該註記依據為同源性推定。此蛋白全長為 137 個胺基酸,屬於粒線體特有的 mL41 核糖體蛋白家族。
蛋白質三維結構
細胞內定位
來源將 MRPL41 的定位記為粒線體;未提供更細的粒線體區域、定位改變條件或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- TMED8Q6PL24 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRIM63Q969Q1 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
MRPL41 是粒線體大型核糖體次單元(mt-LSU)的組成蛋白。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小型次單元與 39S 大型次單元組成;後者含 16S mt-rRNA、具有結構作用的 mt-tRNA(Val),以及 52 種不同蛋白。另有資料記載 MRPL41 與 BCL2 互作;來源未進一步說明此互作的功能後果。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | MRPL41 是粒線體核糖體大型次單元的組成部分,也與細胞凋亡及細胞週期有關。在生長抑制條件下,它可增強 p53/TP53 的穩定性及其向粒線體的轉位,並因此促進 p53/TP53 所引發的凋亡;它也可能藉由穩定 CDKN1A 與 CDKN1B(p27Kip1)使細胞停滯於 G1 期。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the mitochondrial ribosome large subunit. Also involved in apoptosis and cell cycle. Enhances p53/TP53 stability, thereby contributing to p53/TP53-induced apoptosis in response to growth-inhibitory condition. Enhances p53/TP53 translocation to the mitochondria. Has the ability to arrest the cell cycle at the G1 phase, possibly by stabilizing the CDKN1A and CDKN1B (p27Kip1) proteins PMID 16024796 ↗ · PMID 16256947 ↗ · PMID 25278503 ↗ · PMID 25838379 ↗ · PMID 28892042 ↗ · PMID 35177605 ↗ |
| 交互作用 | MRPL41 是粒線體大型核糖體次單元(mt-LSU)的組成蛋白。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小型與 39S 大型次單元構成;大型次單元含 16S mt-rRNA、具有結構作用的 mt-tRNA(Val)及 52 種不同蛋白。來源另記載 MRPL41 與 BCL2 互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the mitochondrial large ribosomal subunit (mt-LSU). Mature mammalian 55S mitochondrial ribosomes consist of a small (28S) and a large (39S) subunit. The 28S small subunit contains a 12S ribosomal RNA (12S mt-rRNA) and 30 different proteins. The 39S large subunit contains a 16S rRNA (16S mt-rRNA), a copy of mitochondrial valine transfer RNA (mt-tRNA(Val)), which plays an integral structural role, and 52 different proteins. Interacts with BCL2 PMID 15547950 ↗ · PMID 25278503 ↗ · PMID 25838379 ↗ · PMID 11551941 ↗ |
| 細胞定位 | MRPL41 的細胞內定位為粒線體。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GCTCTTGCTGCGACGCAGCGGTCGGAAGCGGAGCAAGGTC40GAGGCCGGGTTGGCGCCGGAGCCGGGGCCGCTTGGAGCTC80GTGTGGGGTCTCCGGTCCAGGGCGCGGCATGGGCGTCCTG120GCCGCAGCGGCGCGCTGCCTGGTCCGGGGTGCGGACCGAA160TGAGCAAGTGGACGAGCAAGCGGGGCCCGCGCAGCTTCAG200GGGCCGCAAGGGCCGGGGCGCCAAGGGCATCGGCTTCCTC240ACCTCGGGCTGGAGGTTCGTGCAGATCAAGGAGATGGTCC280CGGAGTTCGTCGTCCCGGATCTGACCGGCTTCAAGCTCAA320GCCCTACGTGAGCTACCTCGCCCCTGAGAGCGAGGAGACG360CCCCTGACGGCCGCGCAGCTCTTCAGCGAAGCCGTGGCGC400CTGCCATCGAAAAGGACTTCAAGGACGGTACCTTCGACCC440TGACAACCTGGAAAAGTACGGCTTCGAGCCCACACAGGAG480GGAAAGCTCTTCCAGCTCTACCCCAGGAACTTCCTGCGCT520AGCTGGGCGGGGGAGGGGCGGCCTGCCCTCATCTCATTTC560TATTAAACGCCTTTGCCAGCTA582cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。