演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

MRPL41MRP-L27

mitochondrial ribosomal protein L41

MRPL41 編碼 mitochondrial ribosomal protein L41,是粒線體核糖體大型次單元的組成蛋白;來源亦記載其與細胞凋亡及細胞週期調控相關。

Homo sapiens9q34.3UniProt Q8IXM3
OFFICIAL SYMBOL
MRPL41
CHROMOSOME
9
UNIPROT
Q8IXM3
PDB / ALPHAFOLD
3J7Y
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

MRPL41 是蛋白質編碼基因,正式名稱為 mitochondrial ribosomal protein L41。其產物屬於粒線體特有的 mL41 核糖體蛋白家族,並為粒線體核糖體大型次單元的組成部分。來源也指出,此蛋白與細胞凋亡及細胞週期有關;相關調控作用與其在粒線體核糖體中的角色不同,具體作用方式見功能說明。

Official symbol
MRPL41
Gene name
mitochondrial ribosomal protein L41
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14492
UniProt
Q8IXM3
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
MRP-L27RPML27BMRPPIG3MRPL27mL41

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 99q34.3
chr9 · 138,394,717 bp · GRCh38chr9p24.3 · 1–2200000 · gnegchr9p24.2 · 2200001–4600000 · gpos25chr9p24.1 · 4600001–9000000 · gnegchr9p23 · 9000001–14200000 · gpos75chr9p22.3 · 14200001–16600000 · gnegchr9p22.2 · 16600001–18500000 · gpos25chr9p22.1 · 18500001–19900000 · gnegchr9p21.3 · 19900001–25600000 · gpos100chr9p21.2 · 25600001–28000000 · gnegchr9p21.1 · 28000001–33200000 · gpos100chr9p13.3 · 33200001–36300000 · gnegchr9p13.2 · 36300001–37900000 · gpos25chr9p13.1 · 37900001–39000000 · gnegchr9p12 · 39000001–40000000 · gpos50chr9p11.2 · 40000001–42200000 · gnegchr9p11.1 · 42200001–43000000 · acenchr9q11 · 43000001–45500000 · acenchr9q12 · 45500001–61500000 · gvarchr9q13 · 61500001–65000000 · gnegchr9q21.11 · 65000001–69300000 · gpos25chr9q21.12 · 69300001–71300000 · gnegchr9q21.13 · 71300001–76600000 · gpos50chr9q21.2 · 76600001–78500000 · gnegchr9q21.31 · 78500001–81500000 · gpos50chr9q21.32 · 81500001–84300000 · gnegchr9q21.33 · 84300001–87800000 · gpos50chr9q22.1 · 87800001–89200000 · gnegchr9q22.2 · 89200001–91200000 · gpos25chr9q22.31 · 91200001–93900000 · gnegchr9q22.32 · 93900001–96500000 · gpos25chr9q22.33 · 96500001–99800000 · gnegchr9q31.1 · 99800001–105400000 · gpos100chr9q31.2 · 105400001–108500000 · gnegchr9q31.3 · 108500001–112100000 · gpos25chr9q32 · 112100001–114900000 · gnegchr9q33.1 · 114900001–119800000 · gpos75chr9q33.2 · 119800001–123100000 · gnegchr9q33.3 · 123100001–127500000 · gpos25chr9q34.11 · 127500001–130600000 · gnegchr9q34.12 · 130600001–131100000 · gpos25chr9q34.13 · 131100001–133100000 · gnegchr9q34.2 · 133100001–134500000 · gpos25chr9q34.3 · 134500001–138394717 · gnegMRPL41pq1 bp138,394,717 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr9:137,550,424–137,552,555
Gene span
2,132 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000371443 ★137,551,879–137,552,5552
ENST00001098865137,550,424–137,552,5552
ENST00001135560137,551,863–137,552,5552

顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

MRPL41 的一項角色是構成粒線體核糖體大型次單元。除此之外,來源亦指出它參與細胞凋亡與細胞週期調控,並描述其在生長抑制條件下與 p53/TP53 相關的作用。

在生長抑制條件下,MRPL41 可增強 p53/TP53 的穩定性,因而促進 p53/TP53 所引發的細胞凋亡。它也會增強 p53/TP53 向粒線體的轉位。這些敘述指出 MRPL41 與 p53/TP53 的穩定及細胞內位置變化相關,並將其連結至上述條件下的凋亡反應。

MRPL41 另具有使細胞週期停滯於 G1 期的能力;來源提出,這可能是藉由穩定 CDKN1A 與 CDKN1B(p27Kip1)蛋白所致。此作用機制以可能性表述,不能視為已確定的因果機制。現有資料支持其同時具有粒線體核糖體組成角色,並與 p53/TP53 相關的凋亡及 G1 期細胞週期調控相連;但未提供更完整的分子步驟或作用條件。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 137551879 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>MRPL41 ENST00000371443 GRCh38 chr9:137550879-137551979 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GGAGGGGGTGCAGCTGGGGAGGGGGTGGATCTGGGGTGTGGGGGTGCCGCTGGGGAGGGGGTGCAGCTGG
GGAGGGGGTGGATCTGGGGCGTGGGGGTGCCGCTGGGGAGGGGGTGCAGCTGGGGAGGGGGTGGATCTGG
GGCGTGGGGGTGCCGCTGGGGAGGGGGTGCAGCTGGGGAGGGGATGGATCTGGGGTGTGGGGGTACCGCT
GGGGAAGGGCGTGCAGCTGGAGAGGGGATGGATCTGGGCTGTGGGGGTGCCGCTGGGGACGGGGTGCAGC
TGGGGAGGGGGTGGATCCGGATTGTGAGGGTGCGGCTGGGGGGCGACTTCCGCGTGGGGTGAGAGGTCGC
CTGCGAGGGTGACCGGGCAGGAGGGCTCAGTGCGCAAGCCGGACGTGCTGGGTCCAAGATTATTGATTAA
TTTGGGCACCGCGAGGGCTCGAGTCCCCCCACACCACTGCCCGGCCTGCGGGGGAGCACAGACAGCCCGG
GCCCTCCCGGCTGCAGGTCCCGGGCTTTCCCCGCGCGGTTGCCGGCTCCGCCCAGAGGAGCCGCGCCCGG
CGGAGGGGTAAGAAAGGCAGGGTCGCGGCGTCAACGCGGCGGCCGTCTCGAGTCCAGGGCCCGCGTCCTC
CCCGACCTCCCGACGCCACCTCACGGCCTCAGGGGGACTGGGCTCCCGGGAAACCGCCGGCCACCTGGCG
GACGAACACAGGCAGTGGCGGGCAGTGGAGACGCCAGGGACCACCGCGCTGAGAGCGATCACTCATCCGC
CAGCCCCGCCCCGCGAGCCCCGCCCCGCGAGCCCCGCCCCGCGAGCCCCGCCCCGCGAGCCCCGCCCCGC
GAGCCCCGCCCCGCGAGCCCCGCACCGCCGGCCCCGCACCGCCAGCCCCGCGAGCCCCGCCCCGCCCCGC
GCGCTCCTCGCATTGGCCGAGTCCCCGCGGCCACACCCCCTACCAGATTGGGGCCGCTATTGGACGCGGC
GGCCGCGGCCAATCGGAGCCGCTCTTGCTGCGACGCAGCGGTCGGAAGCGGAGCAAGGTCGAGGCCGGGT
TGGCGCCGGAGCCGGGGCCGCTTGGAGCTCGTGTGGGGTCTCCGGTCCAGG
MRPL41 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
MRPL41_1 ↗9:137,551,893正股137,551,844–137,551,903

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR9_537CJ49 · CTCF_binding_site · 137548205–137548226 · regulatory

ENSR9_B32B36 · enhancer · 137549766–137550373 · regulatory

ENSR9_B32B39 · promoter · 137550374–137550892 · regulatory

ENSR9_942L4S · promoter · 137551389–137551889 · regulatory

ENSR9_537CJMM · CTCF_binding_site · 137551518–137551539 · regulatory

ENSR9_942L65 · enhancer · 137556022–137556385 · regulatory

· motif · 137548207–137548223 · motif

· motif · 137550437–137550446 · motif

· motif · 137550437–137550446 · motif

· motif · 137551203–137551214 · motif

· motif · 137551203–137551214 · motif

· motif · 137551214–137551227 · motif

· motif · 137551264–137551275 · motif

· motif · 137551457–137551472 · motif

· motif · 137551510–137551525 · motif

· motif · 137551520–137551536 · motif

· motif · 137551852–137551869 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:137 aa

1 aa137 aa轉運胜肽
依 Q8IXM3 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

mitochondrial ribosomal protein L41 前 13 個胺基酸被註記為粒線體轉運胜肽,該註記依據為同源性推定。此蛋白全長為 137 個胺基酸,屬於粒線體特有的 mL41 核糖體蛋白家族。

轉運胜肽Mitochondrion1–13 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 3J7Y…

PDB · 3J7Y

EM · 3.40 A · 9=1-137

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Mitochondrion

來源將 MRPL41 的定位記為粒線體;未提供更細的粒線體區域、定位改變條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
MRP-L27MRPL41TMED8TRIM63
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

MRPL41 是粒線體大型核糖體次單元(mt-LSU)的組成蛋白。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小型次單元與 39S 大型次單元組成;後者含 16S mt-rRNA、具有結構作用的 mt-tRNA(Val),以及 52 種不同蛋白。另有資料記載 MRPL41 與 BCL2 互作;來源未進一步說明此互作的功能後果。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能MRPL41 是粒線體核糖體大型次單元的組成部分,也與細胞凋亡及細胞週期有關。在生長抑制條件下,它可增強 p53/TP53 的穩定性及其向粒線體的轉位,並因此促進 p53/TP53 所引發的凋亡;它也可能藉由穩定 CDKN1A 與 CDKN1B(p27Kip1)使細胞停滯於 G1 期。含實驗來源
證據與來源

Component of the mitochondrial ribosome large subunit. Also involved in apoptosis and cell cycle. Enhances p53/TP53 stability, thereby contributing to p53/TP53-induced apoptosis in response to growth-inhibitory condition. Enhances p53/TP53 translocation to the mitochondria. Has the ability to arrest the cell cycle at the G1 phase, possibly by stabilizing the CDKN1A and CDKN1B (p27Kip1) proteins

PMID 16024796 ↗ · PMID 16256947 ↗ · PMID 25278503 ↗ · PMID 25838379 ↗ · PMID 28892042 ↗ · PMID 35177605 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用MRPL41 是粒線體大型核糖體次單元(mt-LSU)的組成蛋白。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小型與 39S 大型次單元構成;大型次單元含 16S mt-rRNA、具有結構作用的 mt-tRNA(Val)及 52 種不同蛋白。來源另記載 MRPL41 與 BCL2 互作。含實驗來源
證據與來源

Component of the mitochondrial large ribosomal subunit (mt-LSU). Mature mammalian 55S mitochondrial ribosomes consist of a small (28S) and a large (39S) subunit. The 28S small subunit contains a 12S ribosomal RNA (12S mt-rRNA) and 30 different proteins. The 39S large subunit contains a 16S rRNA (16S mt-rRNA), a copy of mitochondrial valine transfer RNA (mt-tRNA(Val)), which plays an integral structural role, and 52 different proteins. Interacts with BCL2

PMID 15547950 ↗ · PMID 25278503 ↗ · PMID 25838379 ↗ · PMID 11551941 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位MRPL41 的細胞內定位為粒線體。含實驗來源
證據與來源

Mitochondrion

PMID 16024796 ↗ · PMID 25278503 ↗ · PMID 25838379 ↗ · PMID 28892042 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000371443 · 582 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GCTCTTGCTGCGACGCAGCGGTCGGAAGCGGAGCAAGGTC40
41GAGGCCGGGTTGGCGCCGGAGCCGGGGCCGCTTGGAGCTC80
81GTGTGGGGTCTCCGGTCCAGGGCGCGGCATGGGCGTCCTG120
121GCCGCAGCGGCGCGCTGCCTGGTCCGGGGTGCGGACCGAA160
161TGAGCAAGTGGACGAGCAAGCGGGGCCCGCGCAGCTTCAG200
201GGGCCGCAAGGGCCGGGGCGCCAAGGGCATCGGCTTCCTC240
241ACCTCGGGCTGGAGGTTCGTGCAGATCAAGGAGATGGTCC280
281CGGAGTTCGTCGTCCCGGATCTGACCGGCTTCAAGCTCAA320
321GCCCTACGTGAGCTACCTCGCCCCTGAGAGCGAGGAGACG360
361CCCCTGACGGCCGCGCAGCTCTTCAGCGAAGCCGTGGCGC400
401CTGCCATCGAAAAGGACTTCAAGGACGGTACCTTCGACCC440
441TGACAACCTGGAAAAGTACGGCTTCGAGCCCACACAGGAG480
481GGAAAGCTCTTCCAGCTCTACCCCAGGAACTTCCTGCGCT520
521AGCTGGGCGGGGGAGGGGCGGCCTGCCCTCATCTCATTTC560
561TATTAAACGCCTTTGCCAGCTA582

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。