基因總覽
MRPL4 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 mitochondrial ribosomal protein L4。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 19p13.2。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000253099 ★ | 10,252,214–10,260,055 | 9 |
| ENST00000592514 | 10,251,901–10,259,778 | 10 |
| ENST00000590669 | 10,251,952–10,259,125 | 8 |
| ENST00000393733 | 10,251,952–10,260,025 | 9 |
| ENST00000906087 | 10,251,952–10,260,055 | 10 |
| ENST00000906088 | 10,251,952–10,260,052 | 7 |
| ENST00000906089 | 10,251,952–10,260,052 | 6 |
| ENST00000906090 | 10,251,952–10,260,052 | 10 |
| ENST00000930029 | 10,251,952–10,260,060 | 9 |
| ENST00000930030 | 10,251,952–10,260,043 | 10 |
| ENST00000983622 | 10,251,952–10,260,055 | 8 |
| ENST00001019842 | 10,251,952–10,260,052 | 9 |
顯示 12/23 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>MRPL4 ENST00000253099 GRCh38 chr19:10251214-10252314 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GGGGAGAGGACCCTGGTCTAGGGGGTAAGGGACACAAATACCTAATCTGAGGGGTTTCGGGGGGACATGG CCCTGCCCTGGGGAATCTAAACTGGGAGGCATGGTCTGGCAGGCCCAATCCTGAAGGCTTTCTGAGGGCA ATAAGGCCCTGCCTTTAAACAAATGAAAAAACGCCAGGCACGGTGGCTCACGCCTGTAATCCCAGCACTT TGGAAGGCTGAGGCGGGAGGATCACGAGGTCAGGAGATCGAGACCATCCTGGCTAACGCGGTGATACCCG TCTCTACTAAAAATACAAAAAATTAGCCAGGCGTGGTGGCGGGCGCCTGCAGTCCCAGCTACTCGGGAGG CTGAGGCAGGAGAATGGCGTGAACCCAGGAGGCGGAGCTTGCAGTGAGCCGAGATCGCGCCACTGCACTC CAGCCTGGGCAACAGAGCAAGACTCCGTCTCAAAAAAAACAAAAACAAAAACAAAAACAAAAACAAAAAA ACAAATAAAAAAACAAAACCACATAACTGGATAAAGAAAAAACCATCTCCGACAGCCTTGGAGGCGGGAT GAAGGCGTGGCCCGGTGGGCGTGACCAACAGCAAAAGTTTAAGCGTTATTGGCTGTATTCCTTAGTTGCT CACTCCAGAACTGCCCACTTATGGGCGGGGGTCACTCCTTCAGGCTTAACAGTCATTGGCTGAATTGGGC CAGAGAGGTCTCATTGGCTGAATTCCTGCACCGGCTCGTCGGAGGCGGGACCCAAAGTAGGCTAGGCCTA CGGAAGCTGGGTCTTCTTGCTGTGAGGTCGCGTTCCCCAGTGTTACGGAGGGTCCTTGAGGCAGGAGTGA AAATTGGGTCTGGGGGTTAGTCCTGGGGTGGAGGTCTGGGCACGCCGGGTCGGACCCCCTCCATCTTCGG TTTTGCACACCCCGCTTTCCAGCGCGGAGTCGCGGCGGGTAGGGCGGCGTCGCGTGCGTGACGTCATCCA GCGGCGCCTCGCGAGGCTCCAGTGGCCTTGACCTCCCGCGGCGTGGGAGGCTGCGCGGCGATGCTGCAGT TCGTCCGGGCCGGGGCGCGGGCCTGGCTTCGGCCTACCGGCAGCCAGGTGA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MRPL4_2 ↗ | 19:10,251,981 | 正股 | 10,251,932–10,251,991 |
| MRPL4_1 ↗ | 19:10,252,214 | 正股 | 10,252,165–10,252,224 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR19_B42WZ · enhancer · 10250011–10250577 · regulatory
ENSR19_54F4L3 · CTCF_binding_site · 10250279–10250300 · regulatory
ENSR19_B42X6 · promoter · 10251474–10252020 · regulatory
ENSR19_7L9GS · enhancer · 10252021–10252145 · regulatory
ENSR19_8B5PZ · promoter · 10252146–10252286 · regulatory
· motif · 10247207–10247222 · motif
· motif · 10247326–10247341 · motif
· motif · 10247327–10247341 · motif
· motif · 10247328–10247341 · motif
· motif · 10249732–10249744 · motif
· motif · 10250092–10250104 · motif
· motif · 10250130–10250143 · motif
· motif · 10250130–10250143 · motif
· motif · 10250199–10250212 · motif
· motif · 10250281–10250297 · motif
· motif · 10251788–10251798 · motif
· motif · 10251864–10251874 · motif
· motif · 10252179–10252192 · motif
· motif · 10252179–10252192 · motif
· motif · 10252221–10252228 · motif
· motif · 10252326–10252336 · motif
· motif · 10252510–10252523 · motif
· motif · 10252513–10252525 · motif
· motif · 10252516–10252523 · motif
· motif · 10252523–10252536 · motif
· motif · 10252526–10252538 · motif
· motif · 10252529–10252536 · motif
· motif · 10252890–10252903 · motif
· motif · 10252890–10252903 · motif
· motif · 10257162–10257176 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：311 aa
MRPL4 蛋白質長311個胺基酸，屬於 universal ribosomal protein uL4 家族。第118至149位胺基酸區段註記為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- CLK2P49760 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LITAFQ99732 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRIM23P36406 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
MRPL4 是粒線體大型核糖體次單位（mt-LSU）的組成成分。成熟哺乳類55S粒線體核糖體由28S小次單位與39S大型次單位構成；後者含有16S mt-rRNA、具結構作用的 mt-tRNA(Val)及52種蛋白質。另有資料記載，MRPL4 與 MIEF1 upstream open reading frame protein 互作。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 交互作用 | MRPL4 是粒線體大型核糖體次單位（mt-LSU）的組成成分。成熟哺乳類55S粒線體核糖體由28S小次單位和39S大型次單位構成；大型次單位含16S rRNA、具重要結構作用的 mt-tRNA(Val)及52種蛋白質。MRPL4 另與 MIEF1 upstream open reading frame protein 互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the mitochondrial large ribosomal subunit (mt-LSU). Mature mammalian 55S mitochondrial ribosomes consist of a small (28S) and a large (39S) subunit. The 28S small subunit contains a 12S ribosomal RNA (12S mt-rRNA) and 30 different proteins. The 39S large subunit contains a 16S rRNA (16S mt-rRNA), a copy of mitochondrial valine transfer RNA (mt-tRNA(Val)), which plays an integral structural role, and 52 different proteins. Interacts with MIEF1 upstream open reading frame protein PMID 25278503 ↗ · PMID 25838379 ↗ · PMID 28892042 ↗ · PMID 30215512 ↗ · PMID 35177605 ↗ |
| 細胞定位 | MRPL4 的細胞內定位為粒線體。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AGTGGCCTTGACCTCCCGCGGCGTGGGAGGCTGCGCGGCG40ATGCTGCAGTTCGTCCGGGCCGGGGCGCGGGCCTGGCTTC80GGCCTACCGGCAGCCAGGGCCTGAGTTCCCTGGCGGAAGA120GGCAGCGCGTGCGACCGAGAACCCGGAGCAGGTGGCGAGC160GAGGGTCTCCCGGAGCCCGTGCTGCGCAAAGTCGAGCTCC200CGGTACCCACTCATCGACGCCCAGTGCAGGCCTGGGTCGA240GTCCTTGCGGGGCTTCGAGCAGGAGCGCGTGGGCCTGGCC280GACCTGCACCCCGATGTTTTCGCCACCGCGCCCAGGCTGG320ACATACTGCACCAGGTTGCTATGTGGCAGAAGAACTTCAA360GAGAATTAGCTATGCCAAGACCAAGACGAGAGCCGAGGTG400CGGGGCGGTGGCCGGAAGCCTTGGCCGCAGAAAGGCACTG440GGCGGGCCCGGCATGGCAGCATCCGCTCTCCGCTCTGGCG480AGGAGGAGGTGTTGCCCATGGCCCCCGGGGCCCCACAAGT520TACTACTACATGCTGCCCATGAAGGTGCGGGCGCTGGGTC560TCAAAGTGGCACTGACCGTCAAGCTGGCCCAGGACGACCT600GCACATCATGGACTCCCTAGAGCTGCCCACCGGAGACCCA640CAGTACCTGACAGAGCTGGCGCACTACCGCCGCTGGGGGG680ACTCCGTACTCCTCGTGGACTTAACACACGAGGAGATGCC720ACAGAGCATCGTGGAGGCCACCTCTAGGCTTAAGACCTTC760AACTTGATCCCGGCTGTTGGCCTAAATGTGCACAGCATGC800TCAAGCACCAGACGCTGGTCCTGACGCTGCCCACCGTCGC840CTTCCTGGAGGACAAGCTGCTCTGGCAGGACTCACGTTAC880AGACCCCTCTACCCCTTCAGCCTGCCCTACAGCGACTTCC920CCCGACCCCTACCCCACGCTACCCAGGGCCCAGCGGCCAC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。