基因總覽
MRPL38 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 mitochondrial ribosomal protein L38。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 17q25.1。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000309352 ★ | 75,898,644–75,904,884 | 9 |
| ENST00000884827 | 75,898,643–75,904,916 | 9 |
| ENST00000884829 | 75,898,643–75,904,916 | 9 |
| ENST00000922024 | 75,898,643–75,904,916 | 7 |
| ENST00000922025 | 75,898,643–75,904,916 | 6 |
| ENST00000922026 | 75,898,643–75,904,916 | 8 |
| ENST00000957222 | 75,898,643–75,904,916 | 8 |
| ENST00000957223 | 75,898,643–75,904,916 | 8 |
| ENST00001136889 | 75,898,643–75,904,916 | 9 |
| ENST00000884825 | 75,898,644–75,904,916 | 9 |
| ENST00000957221 | 75,898,646–75,904,916 | 9 |
| ENST00001107028 | 75,903,403–75,904,916 | 2 |
顯示 12/12 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>MRPL38 ENST00000309352 GRCh38 chr17:75904784-75905884 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TCACTGCAGCTTCTGCCTCCCGGGTTCAAGTTAATTCTTGTGCCATAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTAC AGGCGCCTGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTGTATCATTAGTAGAGATACAAAAATTTTTGTATCTTTAG GGTTTTGCCATGTTCGTAGGGCTGGTCTCAAACTAATTACCTCAGATGATCCGCCCACCTCGGCCTCCCA AAGTGCTGGGATTACAGGTATGAGCCACCGCGCCCAGCCACAATCTGGGTTTTTATTACTATTATTTTAT TATTATTATTATTATTGAAATAGAGTTTTCACTTTTGTCGCCCATGCTGGAGTGCAGTGGCGCGATCTCG GCTCACTGCAGCCTCCGCCTCTGCCTCCCAGGTTCAAGCGAGTCTCCTCCCTCAGCCTCCCGAGTAGCTG GGATTACAGGCGTATGCCACGCCCGGCTAATTTTTGTATTTTGAGTAGAGACGGGTTTTCACCGTGTTGG CCAGGATGGTCTCGATCTCCTGACTTCGTGATCCACCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTCCCGG CGTGAGCCACCGCGCCCAGCCCTCAATCTGGGTTTTAAACCCAAGCAGAGTCCGGAATCGGAGCTCGCAC CCCTTCTCCCAACCAGGCCTGCGTCCCTGGGGAAATCAGGACGCAGCGTCCAGGGGTTGGAGGAGGGCCC CGGCGGCCGACCCCGGTCTGTGCCGCCCCCTGGTGGCCAGCCATGGGCGAGCATATGACTGCTCTCGGCT CCGCCCCGCCGTCCAACGGGCACTTCCGGAGCCGGGCGTCTACAGACCGCGGCCACCTTCCACCTGCGCC CGAGGCAGACGGTGCAGGGGCCTCCGGGACAGGCGTCTGAGGCCTGCTCCGCAGCGCGGGCCCGGGGGCG GGCCTAGGGGCGGGGCCTGCTGTGGTGCGCTCAGGCACCGCGCTGGCCACCTGTGCCCGGGTCCTAGTGG CGGCCGCAGTGTCGCAGGCCGGAGGGAAGATGGCGGCGCCCTGGTGGCGAGCCGCGCTGTGCGAGTGTCG GAGATGGCGGGGCTTCAGCACCTCGGGTGAGGGGTGGGCAGCTCTGCGGGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MRPL38_1 ↗ | 17:75,904,884 | 負股 | 75,904,874–75,904,933 |
| MRPL38_2 ↗ | 17:75,905,093 | 負股 | 75,905,083–75,905,142 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR17_9355G9 · promoter · 75904874–75905374 · regulatory
ENSR17_5MT39Q · CTCF_binding_site · 75905145–75905166 · regulatory
ENSR17_BK3PR · enhancer · 75905839–75906755 · regulatory
ENSR17_9355H8 · enhancer · 75908198–75908692 · regulatory
ENSR17_C9JD6 · enhancer · 75909297–75910380 · regulatory
· motif · 75900190–75900202 · motif
· motif · 75900192–75900199 · motif
· motif · 75900201–75900213 · motif
· motif · 75900204–75900211 · motif
· motif · 75900204–75900218 · motif
· motif · 75900205–75900218 · motif
· motif · 75902189–75902197 · motif
· motif · 75903351–75903359 · motif
· motif · 75904043–75904051 · motif
· motif · 75904823–75904833 · motif
· motif · 75904867–75904877 · motif
· motif · 75904959–75904969 · motif
· motif · 75904971–75904981 · motif
· motif · 75905083–75905094 · motif
· motif · 75905083–75905094 · motif
· motif · 75905085–75905094 · motif
· motif · 75905147–75905163 · motif
· motif · 75905220–75905233 · motif
· motif · 75905220–75905233 · motif
· motif · 75905598–75905609 · motif
· motif · 75905891–75905900 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：380 aa
MRPL38 蛋白質長 380 個胺基酸，屬於 phosphatidylethanolamine-binding protein family 中的粒線體專一性核糖體蛋白 mL38 亞家族。其 N 端第 1 至 26 個胺基酸被註記為粒線體轉運胜肽。
蛋白質三維結構
細胞內定位
MRPL38 定位於粒線體；來源未提供更細部的粒線體區域或定位變化條件。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 18 個夥伴
- ARHGAP9Q9BRR9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BAG3O95817 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BEX2Q9BXY8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CCDC120Q96HB5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CENATACQ86UT8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ENKD1Q9H0I2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GADD45GIP1Q8TAE8 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- GOLGA6AQ9NYA3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LONRF1Q17RB8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MKRN3Q13064 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MRPL18Q9H0U6 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- MRPL52Q86TS9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MYOZ3Q8TDC0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PPP1R18Q6NYC8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PRMT6Q96LA8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RALYQ53GL6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RPL13P26373 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- TSEN54Q7Z6J9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
MRPL38 是粒線體大型核糖體次單位（mt-LSU）的組成成分，位於其中央突起。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小次單位與 39S 大次單位構成；後者含有 16S 粒線體核糖體 RNA、一份具結構作用的粒線體纈胺酸轉運 RNA，以及 52 種蛋白質。來源描述的是次單位組成與位置，未指出 MRPL38 和其他成分之間的直接結合。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 交互作用 | MRPL38 是粒線體大型核糖體次單位（mt-LSU）的組成成分，位於中央突起。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小次單位與 39S 大次單位組成；39S 次單位含 16S 粒線體核糖體 RNA、一份具結構作用的粒線體纈胺酸轉運 RNA，以及 52 種蛋白質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the mitochondrial large ribosomal subunit (mt-LSU). Mature mammalian 55S mitochondrial ribosomes consist of a small (28S) and a large (39S) subunit. The 28S small subunit contains a 12S ribosomal RNA (12S mt-rRNA) and 30 different proteins. The 39S large subunit contains a 16S rRNA (16S mt-rRNA), a copy of mitochondrial valine transfer RNA (mt-tRNA(Val)), which plays an integral structural role, and 52 different proteins. mL38 is located at the central protuberance PMID 25278503 ↗ · PMID 25838379 ↗ · PMID 28892042 ↗ · PMID 35177605 ↗ |
| 細胞定位 | MRPL38 的定位記載為粒線體。此項資訊只說明其位於粒線體，未提供更細部的粒線體區域，也沒有說明定位是否會隨條件或細胞狀態改變。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GGAGGGAAGATGGCGGCGCCCTGGTGGCGAGCCGCGCTGT40GCGAGTGTCGGAGATGGCGGGGCTTCAGCACCTCGGCCGT80CCTGGGCCGCCGGACACCCCCGCTGGGGCCGATGCCCAAC120AGTGACATCGACTTGAGCAACCTGGAGCGGCTGGAGAAGT160ACCGGAGCTTCGACCGCTACCGGCGCCGAGCAGAGCAGGA200GGCGCAGGCCCCGCACTGGTGGCGGACCTACCGAGAGTAT240TTCGGGGAGAAGACAGATCCCAAAGAGAAGATTGATATTG280GGCTGCCTCCACCCAAAGTCTCCCGGACCCAACAGCTACT320GGAACGGAAACAGGCCATCCAGGAGCTTCGGGCCAATGTG360GAAGAGGAGCGGGCTGCCCGCCTCCGCACAGCCAGTGTCC400CGCTGGATGCCGTGCGGGCCGAGTGGGAGAGGACCTGTGG440CCCCTACCACAAGCAGCGTCTGGCTGAGTATTACGGCCTC480TACCGAGACCTGTTCCACGGTGCCACCTTTGTGCCCCGAG520TCCCCCTGCACGTGGCCTACGCTGTGGGTGAGGATGACCT560GATGCCTGTGTACTGTGGCAATGAGGTGACTCCAACCGAG600GCTGCCCAAGCGCCAGAGGTGACCTATGAGGCAGAAGAGG640GCTCCTTGTGGACGTTGCTACTCACTAGCTTGGATGGGCA680CCTGCTGGAGCCAGATGCTGAGTACCTCCACTGGCTGCTA720ACCAACATCCCGGGTAACCGGGTGGCTGAAGGACAGGTGA760CGTGTCCCTACCTCCCCCCCTTCCCTGCCCGAGGCTCCGG800CATCCACCGTCTTGCCTTCCTGCTCTTCAAGCAGGACCAG840CCGATTGACTTCTCTGAGGACGCACGCCCCTCACCCTGCT880ATCAGCTGGCCCAGCGGACCTTCCGCACTTTTGATTTCTA920CAAGAAACACCAAGAAACCATGACTCCAGCCGGCTTGTCC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。