基因總覽
MRPL35 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 mitochondrial ribosomal protein L35。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 2p11.2。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000337109 ★ | 86,199,457–86,213,790 | 4 |
| ENST00000254644 | 86,199,355–86,212,838 | 5 |
| ENST00000605125 | 86,199,355–86,211,045 | 3 |
| ENST00000409180 | 86,199,355–86,213,738 | 5 |
| ENST00001095512 | 86,199,355–86,210,823 | 4 |
| ENST00001129461 | 86,199,355–86,222,540 | 5 |
| ENST00001145006 | 86,199,355–86,213,790 | 4 |
顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>MRPL35 ENST00000337109 GRCh38 chr2:86198457-86199557 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGGAGGCTTAGGTGGGAGGATTGCTTGAGCCTAGGAGGTCGAGGCTGCAGTGAGCTGTGATCGCACCACT GCACTCAAGCCTTCGCAACAGACCAAGACCTAGTCTCAAAAAAAAAAAAAAGTGCGCAATGACTCCCGTT GCCAATTCAAAGAGCTTTTATGAATGTTTCAATATACTTGTCTAGCGTATGTGCCTGTTTTTGGACTCAA AGTGGCCACCATAGGTGGGAGATCAAGTTGGCAACAATAGTGTTCCAAGGTAATACACCCTATATCTTGC TCTGTACCCCAGGCTGGAGTGCGGTGGCTCAATCTTGGCTTGCTGCAACAACCGCCTCCCAAGTTCAAGC GATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCGAATAGCTGGAACTACAGGCGCGCGCCACCACGCCCGGCTAATTTTTT GTACCCCTTAGTAGAGACGGGGTTTCACCCTGTTAGCCAGGATGGTCTCAATCTCCTGACCTCGTGATCT GCCCGCCTCGGCCGCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGCGCCCGGCAAGAATTTTTTTTT TTTTTTTGAGATGGAGTTTCGCTCTTTCGCCCAGACTGGAGTTCAGTGGCACGATCTCTGCTCACTGCAA CCTCCGCCTTCCGGTTTCAAGCGATTCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAGCCCGGCTACTTTTTGTATTTTTA GTACAGACGGGGGTTTCATCATGTTGGCCAGGCTGGTCTCGAACTCCTGACCTTGTGATCCGCCCGCCGC GGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGGCGTGAGCCACCGTGCCCGGCCCCAAGAATTTTTTTTAATAAGA AATTTTGTAGAACCTTCTATAGGCAGTCGTTTTACAGCGGCGAAGAACGGAACCCGGCAGATGACATTGA ATAAATGTTGAGTGGACAACTTTGTTCTTTTCCTCTTCCTTGACTCCGCCTCCTTGCTTTCCCTTCATTC TCTTTTGCTCTTGTGCTTTTAAACCCAAAGCGGCCGCCGTAGGCGAAGGTGAAGATGGCTGCCTCTGCCT TTGCTGGTGCAGTGAGAGCAGCTTCAGGTCAGTGGAGAGCGACATACTCCA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MRPL35_2 ↗ | 2:86,195,680 | 正股 | 86,195,631–86,195,690 |
| MRPL35_1 ↗ | 2:86,199,481 | 正股 | 86,199,432–86,199,491 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR2_CBJX5 · enhancer · 86193955–86194991 · regulatory
ENSR2_84JFGF · promoter · 86194992–86195158 · regulatory
ENSR2_BM4TF · promoter · 86195393–86195962 · regulatory
ENSR2_5Q9DQN · CTCF_binding_site · 86195582–86195603 · regulatory
ENSR2_9397QW · promoter · 86199031–86199473 · regulatory
ENSR2_5Q9FFD · CTCF_binding_site · 86199409–86199430 · regulatory
ENSR2_BM4W2 · enhancer · 86199474–86200126 · regulatory
ENSR2_84JFLH · enhancer · 86202063–86202259 · regulatory
ENSR2_5Q9FW3 · CTCF_binding_site · 86202144–86202165 · regulatory
· motif · 86194729–86194744 · motif
· motif · 86194737–86194750 · motif
· motif · 86194737–86194750 · motif
· motif · 86194878–86194890 · motif
· motif · 86194881–86194888 · motif
· motif · 86195103–86195113 · motif
· motif · 86195122–86195132 · motif
· motif · 86195278–86195289 · motif
· motif · 86195443–86195453 · motif
· motif · 86195488–86195497 · motif
· motif · 86195511–86195522 · motif
· motif · 86195511–86195522 · motif
· motif · 86195584–86195600 · motif
· motif · 86195633–86195644 · motif
· motif · 86195665–86195676 · motif
· motif · 86195665–86195676 · motif
· motif · 86195743–86195756 · motif
· motif · 86195743–86195756 · motif
· motif · 86195830–86195841 · motif
· motif · 86198677–86198688 · motif
· motif · 86199195–86199210 · motif
· motif · 86199200–86199212 · motif
· motif · 86199203–86199218 · motif
· motif · 86199411–86199427 · motif
· motif · 86199867–86199880 · motif
· motif · 86199920–86199930 · motif
· motif · 86199925–86199932 · motif
· motif · 86199988–86200010 · motif
· motif · 86199988–86200010 · motif
· motif · 86202146–86202162 · motif
· motif · 86202407–86202421 · motif
· motif · 86202908–86202923 · motif
· motif · 86202913–86202925 · motif
· motif · 86202916–86202923 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：188 aa
mitochondrial ribosomal protein L35 長 188 個胺基酸，屬於 bacterial ribosomal protein bL35 家族。其序列註解包含粒線體轉運胜肽，起始位置標示為第 1 個胺基酸；來源未提供該區段的終止位置。
蛋白質三維結構
細胞內定位
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- RHBDD2Q6NTF9-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
MRPL35 是粒線體大型核糖體次單元（mt-LSU）的組成成分。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小型次單元與 39S 大型次單元構成；其中 39S 次單元含有 16S 粒線體核糖體 RNA、1 個具有結構作用的粒線體纈胺酸轉運 RNA，以及 52 種不同蛋白質。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 交互作用 | MRPL35 是粒線體大型核糖體次單元（mt-LSU）的組成成分。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小型與 39S 大型次單元構成；小型次單元含 12S 粒線體核糖體 RNA 和 30 種不同蛋白質，大型次單元則含 16S 粒線體核糖體 RNA、1 個具有重要結構作用的粒線體纈胺酸轉運 RNA，以及 52 種不同蛋白質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the mitochondrial large ribosomal subunit (mt-LSU). Mature mammalian 55S mitochondrial ribosomes consist of a small (28S) and a large (39S) subunit. The 28S small subunit contains a 12S ribosomal RNA (12S mt-rRNA) and 30 different proteins. The 39S large subunit contains a 16S rRNA (16S mt-rRNA), a copy of mitochondrial valine transfer RNA (mt-tRNA(Val)), which plays an integral structural role, and 52 different proteins PMID 25278503 ↗ · PMID 25838379 ↗ · PMID 28892042 ↗ · PMID 35177605 ↗ |
| 細胞定位 | MRPL35 定位於粒線體。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AAACCCAAAGCGGCCGCCGTAGGCGAAGGTGAAGATGGCT40GCCTCTGCCTTTGCTGGTGCAGTGAGAGCAGCTTCAGGAA80TCCTACGGCCCCTGAATATTTTGGCATCTTCAACCTACCG120CAACTGTGTCAAGAATGCCTCTCTTATTTCTGCATTGTCC160ACTGGACGTTTTAGTCATATTCAGACACCAGTTGTTTCCT200CCACTCCCAGACTTACCACATCTGAGAGAAACCTGACATG240TGGGCATACCTCAGTGATCCTTAATAGAATGGCCCCCGTG280CTTCCAAGTGTCCTGAAGCTGCCAGTCAGATCTCTAACAT320ACTTCAGTGCAAGAAAAGGCAAGAGAAAGACCGTGAAAGC360TGTCATCGATAGGTTTCTTCGACTTCATTGTGGCCTTTGG400GTGAGGAGAAAGGCTGGCTATAAGAAAAAATTATGGAAAA440AGACACCTGCAAGGAAGAAGCGATTGAGGGAATTTGTATT480CTGCAATAAAACCCAGAGTAAACTCTTAGATAAAATGACG520ACGTCCTTCTGGAAGAGGCGAAACTGGTACGTTGATGATC560CTTATCAGAAGTATCATGATCGAACAAACCTGAAAGTATA600GATCAGAAGTTTCACTTGTTTCTCAGTTATTGGATATGTA640TCTTTGTGTACATATCTTTGCAAAAATGGATAAGTACAAA680ACTTGATGTAAATTGTACCAATGAATACGTAAACATACAG720TGACAACATTAAACTTAGAAAAGTTTTAAAACTTAATGGA760TCAGACTTTGCCAGATTTGGTTAGGGAAACAGAAATTTAG800AATGGTGCATTATTTTTAACAAATGGTATTGGCTTAACTA840GTTGTTTCAGTTATGCTCTTTTAGTTGCAAGGAATCTCAA880GTGGGACAAACATAAAAAGACTCAAAAGCTACAAGTTAGC920TCAAGCAATGTGACATTATTTCAAGGATATGTGCCAGGGA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。