基因總覽
MRPL34 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 mitochondrial ribosomal protein L34。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 19p13.11。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000252602 ★ | 17,305,872–17,306,843 | 2 |
| ENST00000595444 | 17,292,543–17,306,847 | 3 |
| ENST00000600434 | 17,292,633–17,306,847 | 4 |
| ENST00000594999 | 17,302,867–17,306,847 | 3 |
| ENST00001097569 | 17,305,829–17,306,847 | 2 |
| ENST00001097570 | 17,305,869–17,306,843 | 2 |
| ENST00000602206 | 17,305,872–17,306,782 | 2 |
| ENST00001097571 | 17,305,872–17,306,843 | 2 |
| ENST00001135388 | 17,305,872–17,306,847 | 2 |
顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>MRPL34 ENST00000252602 GRCh38 chr19:17304872-17305972 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CCTGGGTTCAGGGAATCCTCCCACCTCACCTTCAAGTACTTGAGACTATAGGTGGTTGCTACCATGTCCC CAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGCCCCAAGGGATCCTCCCTCCTCAGCCTCCCAAAATGCTGGAATTACAG GCATGAGCCACACCTCACTCAGCCCTTGGAGAGGAAAGGATTTTTAAAGGGCGGATAGGGGAACACCAGG CAGAGAGGAGAGTGTGGCTGAAATGTAAGATGGTGTGTGTAGAGGGTTTTGCATGCCTGATGGAAGGGCT GAGCAGGTTTTACCTGGGGAAATGGGGAGCCAAGGATAGTGTGTGAGTAGGGGAGGGGTTCAGATCTGAG TATCAGAAAATTTTTCTTCCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGTTCTAACAACAGAGGAGAATTCTTCTAG GGCCCAAAATGGGGGCAAGATTGCCAAAGACAAGCTTGCAATCCCTGAGTTTACAGATTGAGAAAGCCCA GAGTGGCGCAGGGACCACCCCAAGGACACGCAGCGAGCTTGAACTCAGGCCTCCTCGGCTTCCTGCCAAG AGGCGGAGACTTGGCTGCAGCCAGGACAAGCTGCCAGCCAGCTGTGTGCCATCTGCCCAGCTCCCGCTGG GGGCGGGAAGACCAACCAGCCGCTTCCTGCAGCTGCCACCAGCTGCGCCCGGCCACCGCGGGGCACCCTC TGCCGGTCAATAGGAGAGAGAACTACAGCTCAGCTGCCAGCTGACCGCGGGAGATAATGCCTTGTGCGCA CGCGCTTGCTCAGAAGGCGCCGTTCGCCGGCTACCTGTTGGTGTGTATGCAGAGCATCCCTGTGCCCCGC GGATATAGACTGGCGCGCCTCTGTTGCGCAGGCGCAGAACTACAACTTCAGGGTTTTCCCCAACGGCCTC TTTTTTGCACGTTAGGAGAAACTACATTTCCCATAATCCTTTGTTCCAGGGCTGGAGCGGCTCTGGGCTC CGGAATCGCCCGCAGCCGGTACTGCGGGACCCACTGCGGATATGGCTGTCTTGGCTGGATCCCTGTTGGG CCCCACGAGTAGGTCGGCAGCGTTGCTGGGTGGCAGGTAAGTCCTCAGGGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MRPL34_2 ↗ | 19:17,292,573 | 正股 | 17,292,524–17,292,583 |
| MRPL34_1 ↗ | 19:17,305,872 | 正股 | 17,305,823–17,305,882 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR19_98TFJ · promoter · 17302377–17302877 · regulatory
ENSR19_B5FPC · enhancer · 17302878–17303414 · regulatory
ENSR19_98TFS · promoter · 17303415–17303915 · regulatory
ENSR19_98TGF · promoter · 17305382–17305882 · regulatory
ENSR19_563WCD · CTCF_binding_site · 17305561–17305582 · regulatory
ENSR19_8HPZB · enhancer · 17308037–17308285 · regulatory
ENSR19_8HPZN · enhancer · 17308689–17308926 · regulatory
ENSR19_98THH · promoter · 17309073–17309573 · regulatory
ENSR19_563WZS · CTCF_binding_site · 17309330–17309351 · regulatory
ENSR19_B5FQC · enhancer · 17309574–17310594 · regulatory
· motif · 17303334–17303341 · motif
· motif · 17303450–17303459 · motif
· motif · 17303450–17303459 · motif
· motif · 17303566–17303576 · motif
· motif · 17303913–17303928 · motif
· motif · 17304304–17304316 · motif
· motif · 17305563–17305579 · motif
· motif · 17305636–17305647 · motif
· motif · 17305636–17305647 · motif
· motif · 17305642–17305653 · motif
· motif · 17305642–17305653 · motif
· motif · 17305736–17305747 · motif
· motif · 17305736–17305747 · motif
· motif · 17305979–17305994 · motif
· motif · 17306017–17306033 · motif
· motif · 17306111–17306123 · motif
· motif · 17306130–17306142 · motif
· motif · 17306505–17306520 · motif
· motif · 17306594–17306608 · motif
· motif · 17306824–17306838 · motif
· motif · 17306824–17306839 · motif
· motif · 17306824–17306839 · motif
· motif · 17309154–17309165 · motif
· motif · 17309183–17309205 · motif
· motif · 17309183–17309205 · motif
· motif · 17309304–17309317 · motif
· motif · 17309304–17309317 · motif
· motif · 17309332–17309348 · motif
· motif · 17309338–17309347 · motif
· motif · 17309338–17309349 · motif
· motif · 17309338–17309349 · motif
· motif · 17309417–17309427 · motif
· motif · 17309490–17309500 · motif
· motif · 17309678–17309688 · motif
· motif · 17309700–17309710 · motif
· motif · 17309713–17309723 · motif
· motif · 17309775–17309785 · motif
· motif · 17309780–17309790 · motif
· motif · 17309791–17309804 · motif
· motif · 17309794–17309806 · motif
· motif · 17309796–17309811 · motif
· motif · 17309797–17309811 · motif
· motif · 17309798–17309811 · motif
· motif · 17309804–17309819 · motif
· motif · 17309859–17309872 · motif
· motif · 17309862–17309874 · motif
· motif · 17309865–17309872 · motif
· motif · 17309903–17309912 · motif
· motif · 17309903–17309914 · motif
· motif · 17309903–17309914 · motif
· motif · 17309906–17309921 · motif
· motif · 17310135–17310142 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：92 aa
MRPL34 的蛋白質長度為 92 個胺基酸，屬於 bacterial ribosomal protein bL34 家族。其第 1 至 46 個胺基酸被註記為粒線體轉運胜肽；此序列註解依據相似性資料。
蛋白質三維結構
細胞內定位
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
MRPL34 是粒線體大型核糖體次單元（mt-LSU）的組成部分。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小型次單元與 39S 大型次單元構成；前者含有 12S mt-rRNA 與 30 種蛋白質，後者含有 16S mt-rRNA、具有結構作用的 mt-tRNA(Val)，以及 52 種蛋白質。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 交互作用 | MRPL34 是粒線體大型核糖體次單元（mt-LSU）的組成部分。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小型與 39S 大型次單元組成；28S 次單元含 12S mt-rRNA 和 30 種不同蛋白質，39S 次單元則含 16S mt-rRNA、具有重要結構作用的一份粒線體纈胺酸轉運 RNA（mt-tRNA(Val)），以及 52 種不同蛋白質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the mitochondrial large ribosomal subunit (mt-LSU). Mature mammalian 55S mitochondrial ribosomes consist of a small (28S) and a large (39S) subunit. The 28S small subunit contains a 12S ribosomal RNA (12S mt-rRNA) and 30 different proteins. The 39S large subunit contains a 16S rRNA (16S mt-rRNA), a copy of mitochondrial valine transfer RNA (mt-tRNA(Val)), which plays an integral structural role, and 52 different proteins PMID 25278503 ↗ · PMID 25838379 ↗ · PMID 28892042 ↗ · PMID 35177605 ↗ |
| 細胞定位 | MRPL34 位於粒線體。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
ACTGCGGGACCCACTGCGGATATGGCTGTCTTGGCTGGAT40CCCTGTTGGGCCCCACGAGTAGGTCGGCAGCGTTGCTGGG80TGGCAGGTGGCTCCAGCCCCGGGCCTGGCTGGGGTTCCCA120GACGCCTGGGGCCTCCCCACCCCGCAGCAGGCCCGGGGCA160AGGCTCGCGGGAATGAGTATCAGCCGAGCAACATCAAACG200CAAGAACAAGCACGGCTGGGTCCGGCGCCTGAGCACGCCG240GCCGGCGTGCAGGTCATCCTTCGCCGAATGCTCAAGGGCC280GCAAGTCGCTGAGCCATTGAGGATCGCGACGCAGTCGGCG320GGACCCTCATGGAAGCATCGCCCTCGCCTCGGACCTTGCC360TGGCGCTATTTTTGCAGGGAGCTGGGGAGCAGGAACGCCT400CGGACCTGAGTGCTCTCCATATTGTGGGGTTGAAGTCTGG440ATGGGAGCTTGCCAAGTCCCTTTTTAGGCTTTTTAATTAG480GAAGCATTTCGAACCTGCGCAACAGACCAAAGAACAGTAC520AAAGAACATCCGTGTACCCAGTACCCTGACTACCGACTAC560CTACAACCCGTCCCTGCCCCATCCTGAGTTCTTTTGAAGC600TGATCTCAGGCATCGGATTATTTCTTCTGTAAATATTTCA640GAATGTATCTCTCCAAGATGAGAGCTCATTAAAAGACAAT680TACAAAGCTTATCACATCCAAAAGAATTATCAATAATTTT720GAAATATTATTAAACGTGTAATAAATGTTCAAAGTTCCAC760TTGC764cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。