基因總覽
MRPL33 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 mitochondrial ribosomal protein L33。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 2p23.2。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000296102 ★ | 27,771,719–27,779,733 | 4 |
| ENST00000379666 | 27,771,683–27,781,484 | 3 |
| ENST00000883033 | 27,771,683–27,781,484 | 2 |
| ENST00001088341 | 27,771,683–27,781,484 | 4 |
| ENST00001102782 | 27,771,683–27,779,732 | 3 |
| ENST00001142949 | 27,771,683–27,781,484 | 4 |
| ENST00001036805 | 27,771,767–27,779,736 | 4 |
| ENST00001036806 | 27,771,767–27,781,484 | 3 |
顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>MRPL33 ENST00000296102 GRCh38 chr2:27770719-27771819 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CTGCAACCTCCGCCTCCCGGGTTCAGCTAATTTTTGTATTTTTAGTACAGGCGGGATTCCGCGACGTTGG CCAGGCTGGTCTCAAACTCGTGACCTCAAGTGATCTGCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGGGCTGGGATTACA GGCGTGAGCCATGCGATTAAATCTTATTTCACATCTGTAAGACTTCATATGTAGATACAAATCACGGATT AGGAAAAAAATCCAAAAGTCCTGATTATTAGTTGCGAAATGAGGTTACTGACGAGGTCCTTGGTGTTAGA GGAGCCCAGGTTCCTTACAGAGCCATGAAAAATTAATGATTGCAAACTGGTAGGTCCCAATGTCTACTGG GAAAGGCATGAGTCTTTGGAGTCAGATAAAATCTAGGTTTAAATTCTTACTCTGCCACCTGGTAGTTCTG TGATATTAGGCACGTGATGTGAATGCTCTCAATCTGTTATTTGGCTTCTATGTCAGGAACTGTGCTAGGT GTTTGGATACAGAAGTTTGAGATGCAAAGGGTCCTGCCCTCCTAGAGATTGGGATAACTAAGGAAAGGTG GGGTTCTTAATGCCGAAGGGACTCAGAAGAGTGAGAGTAAGGCTTAACCAGGCGGAGAGGGAGTTGGGTC GGGGGAGGCAACATTTTAAGAAAATATGCGAGGGGCTGATACGCTGGAGCGGCCGAAGTACAATACACAG TTGTTCTTGTGGGTCTAATGCAGGTGGTTGCGATTATTTCGTGAAACAAATATGGAAAGCACCTAACGCT GAAAGCACTTGACCCAGAAATAGGAGTCAGGGCCGGGGCGCGAACCCTGAGCTGTAAATCCCTTTCCAGA ATGATGAGGATTCCAACCTCCAGCACGACAAAAGCAAAACACACTCGCTCTGAGAAACCGAGGAACGAGC CAGACGACTGGAGGCAGGTTCCAGGCGGGGGGCGTGGCCTCGGGCGACTGCCGGATGTCCTCTTCCAGAA CCGGGCCGTGCCCCGGAAGCAGTTGTTGTTGGTTGGGGGCCTTTTGGCCGGTGACGGAGACTGCCCAGGT GTGGTCACCATGTTCCTCTCCGCGGTCTTCTGTAAGTGGGGCTGGAGACGC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MRPL33_1 ↗ | 2:27,771,719 | 正股 | 27,771,670–27,771,729 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR2_9F2LP · promoter · 27771227–27771729 · regulatory
ENSR2_B7HRX · enhancer · 27771730–27772515 · regulatory
ENSR2_58JCZ9 · CTCF_binding_site · 27771815–27771836 · regulatory
ENSR2_9F2N6 · enhancer · 27776196–27776588 · regulatory
· motif · 27770959–27770968 · motif
· motif · 27770959–27770968 · motif
· motif · 27771656–27771669 · motif
· motif · 27771678–27771687 · motif
· motif · 27771708–27771719 · motif
· motif · 27771710–27771719 · motif
· motif · 27771762–27771771 · motif
· motif · 27771817–27771833 · motif
· motif · 27771998–27772013 · motif
· motif · 27772352–27772374 · motif
· motif · 27772352–27772374 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:65 aa
MRPL33 蛋白長 65 個胺基酸,屬於 bacterial ribosomal protein bL33 family。序列第 1 至 8 位被註記為粒線體轉運胜肽;此區段的註解依序列相似性支持。
蛋白質三維結構
細胞內定位
來源未提供更細部的粒線體內位置,也未說明定位是否會隨條件或異構型而改變。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
MRPL33 是粒線體大型核糖體次單位(mt-LSU)的組成成分。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小次單位與 39S 大次單位構成;其中 39S 次單位含有 16S 粒線體 rRNA、具有結構作用的粒線體 valine tRNA,以及 52 種不同蛋白質。來源支持 MRPL33 屬於此大型次單位,未提供其與特定分子的直接結合資訊。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 交互作用 | MRPL33 是粒線體大型核糖體次單位(mt-LSU)的組成成分。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小次單位和 39S 大次單位構成;小次單位含 12S 粒線體 rRNA 與 30 種不同蛋白質,大次單位則含 16S 粒線體 rRNA、具有重要結構作用的粒線體 valine tRNA,以及 52 種不同蛋白質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the mitochondrial large ribosomal subunit (mt-LSU). Mature mammalian 55S mitochondrial ribosomes consist of a small (28S) and a large (39S) subunit. The 28S small subunit contains a 12S ribosomal RNA (12S mt-rRNA) and 30 different proteins. The 39S large subunit contains a 16S rRNA (16S mt-rRNA), a copy of mitochondrial valine transfer RNA (mt-tRNA(Val)), which plays an integral structural role, and 52 different proteins PMID 25278503 ↗ · PMID 25838379 ↗ · PMID 28892042 ↗ · PMID 35177605 ↗ |
| 細胞定位 | MRPL33 的定位註記為粒線體。此項資訊僅指出其位於粒線體,沒有提供粒線體內更具體的區域,也未描述定位的條件或變化。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
AGTTGTTGTTGGTTGGGGGCCTTTTGGCCGGTGACGGAGA40CTGCCCAGGTGTGGTCACCATGTTCCTCTCCGCGGTCTTC80TTTGCCAAGAGCAAGTCAAAAAACATTCTGGTGAGAATGG120TGAGCGAAGCTGGGACAGGTTTCTGCTTCAACACCAAGAG160AAACCGACTGCGGGAAAAACTGACTCTTTTGCATTATGAT200CCAGTTGTGAAACAAAGAGTCCTCTTCGTGGAAAAGAAAA240AAATACGCTCCCTTTAAACGGTGGATTGAAAATGACTTTG280ATTTATAAAGAGAAGACTGAGGGCGGGGATACTGATTCAG320AAATCCTGTAGCGTGTAATAAAAGAAGAGGAAATGGCATG360GAATCACTGCCTCCTGTGATTTGAAGGCCATTGTGAAGGA400AAACAATGCAGTGAAAGAAAGTTCTTCATATTAGGACAGA440TATCATTGCATCACATTTATTTATCTTTCTGGGTATTTTT480ATAGCCCTTAATAAAAAATATTAAAATA508cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。