基因總覽
MRPL27 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 mitochondrial ribosomal protein L27。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 17q21.33。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000225969 ★ | 50,367,867–50,373,184 | 4 |
| ENST00000507088 | 50,367,293–50,372,960 | 4 |
| ENST00000511860 | 50,367,293–50,371,163 | 4 |
| ENST00000928292 | 50,367,293–50,373,207 | 3 |
| ENST00001043321 | 50,367,293–50,373,207 | 4 |
| ENST00001089858 | 50,367,293–50,373,207 | 3 |
| ENST00001136477 | 50,367,293–50,373,207 | 4 |
| ENST00000990390 | 50,367,860–50,373,207 | 4 |
| ENST00001089856 | 50,367,864–50,373,207 | 5 |
| ENST00000508200 | 50,367,865–50,370,573 | 3 |
| ENST00001089860 | 50,367,865–50,373,207 | 3 |
| ENST00000503633 | 50,367,868–50,373,207 | 5 |
顯示 12/14 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>MRPL27 ENST00000225969 GRCh38 chr17:50373084-50374184 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ATTCAGTAGATTTTAGTATATTCACAATGTTGTGCAACCATCATCACTATTTTATCACCTCAAAAAGAAT TCCTGCAGCCATTAAGCCGTCACTGTCCTTTCCCTCCCTCCCCAGCTCCTGGCAACCATAAATCTGTCTC TATGCATTTGCCTATTCTGGATATTTCATATAAATAGAATCATACACTATGTGGCCTTTTGTGATTGACT TTTTTCACTCAGCTTGTTTTCAAGGTTTATCTATGATGTAGCCTGTATCAGTAGTTAATTGCTTTTCATG ACTGAATAATATTCCACTGTATGGATATGCTACATTTTGTTTATCCATTCATCACTTGGACATTTAATTT GTTTCCTTTTTTTGCCTGTTATGAATAATGCTGCTATGAACACTGACATACAAGTTTTTGTGGGGGTATG TTTTCAAATCCCTTTCGTGTATATACCTAGGAGTAGAATTGCTGGGTCATATGCAAAGCTAATCATTTCT TGAACATTTACTAACACTGTAGGTATGACCCAGAAGGAGACATGTAACCTGCCTAGGCCTCAGTTTCTTC CTTAGTAAAACAGGGATGGTAACAGCACCCATTTTATAAGGTAGTGAGAATTAAATAAAATAATGCATCC ACCGCGCTTAGTACAGCATCTGGCACACAGCTGGCTAAGTAGAGTAAGTTGAATGACTAGGGAGGGGGCC TCATCTCTGACCCTTCGCTGGGCCTCCGTTGACATCTGCAAATCAGGGGAGTGGGACAAGCGGGCCCCTG CCCGACAAGCTCTGCGCCTCTCAGGCTGGCGGTCCGCTGCAGAGGCTCCTGGACACCTTAGCCACCAAGA TTCTGCAGAGCGGTGTTCAGGAGGGAAGCCCTGCCCAATCCGCAGGCCTGCGACCGGGGACGCTCACCTG CAACTTCTCCCGCCACTCTTTCAACTGCCACGCAGGGCCCGGAAGTAGATCTCCTGATAGCGGAAGTAGA AACTTTTCGAGACCGGAAGTGAGTGATCGAAAGCATGGCGTCGGTGGTGTTGGCGCTGAGGACCCGGACA GCCGGTAATGGGACGCAGTAGTCAGAGCGGGGTGAGGCGGGGAGGCAGAGT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄；不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR17_BCZWN · enhancer · 50372266–50372949 · regulatory
ENSR17_9PZSJ · promoter · 50372950–50373239 · regulatory
ENSR17_9PZSM · enhancer · 50373240–50373719 · regulatory
· motif · 50371719–50371725 · motif
· motif · 50372904–50372918 · motif
· motif · 50372904–50372918 · motif
· motif · 50372969–50372978 · motif
· motif · 50372969–50372978 · motif
· motif · 50373184–50373193 · motif
· motif · 50373184–50373195 · motif
· motif · 50373184–50373195 · motif
· motif · 50373207–50373216 · motif
· motif · 50373207–50373218 · motif
· motif · 50373207–50373218 · motif
· motif · 50373207–50373220 · motif
· motif · 50373228–50373237 · motif
· motif · 50373228–50373239 · motif
· motif · 50373228–50373239 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：148 aa
MRPL27 產物長 148 個胺基酸，屬於 bacterial ribosomal protein bL27 家族。序列第 1 至 30 位被註解為粒線體轉運胜肽；此註解依相似性推定。
蛋白質三維結構
細胞內定位
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- FHL3Q13643 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
MRPL27 是粒線體大型核糖體次單元（mt-LSU）的組成成分。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小次單元與 39S 大次單元構成；其中 39S 次單元含有 16S 粒線體核糖體 RNA、具結構作用的粒線體纈胺酸轉運 RNA，以及 52 種蛋白質。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 交互作用 | MRPL27 是粒線體大型核糖體次單元（mt-LSU）的組成成分。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體分為 28S 小次單元與 39S 大次單元；小次單元含 12S 粒線體核糖體 RNA 和 30 種蛋白質，大次單元則含 16S 粒線體核糖體 RNA、具有重要結構作用的粒線體纈胺酸轉運 RNA，以及 52 種蛋白質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the mitochondrial large ribosomal subunit (mt-LSU). Mature mammalian 55S mitochondrial ribosomes consist of a small (28S) and a large (39S) subunit. The 28S small subunit contains a 12S ribosomal RNA (12S mt-rRNA) and 30 different proteins. The 39S large subunit contains a 16S rRNA (16S mt-rRNA), a copy of mitochondrial valine transfer RNA (mt-tRNA(Val)), which plays an integral structural role, and 52 different proteins PMID 25278503 ↗ · PMID 25838379 ↗ · PMID 28892042 ↗ · PMID 35177605 ↗ |
| 細胞定位 | MRPL27 定位於粒線體。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GAGTGATCGAAAGCATGGCGTCGGTGGTGTTGGCGCTGAG40GACCCGGACAGCCGTTACATCCTTGCTAAGCCCCACTCCG80GCTACAGCTCTTGCTGTCAGATACGCATCCAAGAAGTCGG120GTGGTAGCTCCAAAAACCTCGGTGGAAAGTCATCAGGCAG160ACGCCAAGGCATTAAGAAAATGGAAGGTCACTATGTTCAT200GCTGGGAACATCATTGCAACACAGCGCCATTTCCGCTGGC240ACCCAGGTGCCCATGTGGGTGTTGGGAAGAATAAATGTCT280GTATGCCCTGGAAGAGGGGATAGTCCGCTACACTAAGGAG320GTCTACGTGCCTCATCCCAGAAACACGGAGGCTGTGGATC360TGATCACCAGGCTGCCCAAGGGTGCTGTGCTCTACAAGAC400TTTTGTCCACGTGGTTCCTGCCAAGCCTGAGGGCACCTTC440AAACTGGTAGCTATGCTTTGATGTCCTGTTGAGGCCATCG480GACAGAGACTGGAGCCCAGGTGACAGGAGATGGTGATACC520AGAAGTCAAGGGTTGGGGTGGCGACACGGCCTCCCGAGGA560AGAGGTCTGCTTGATGGTGACTCTGCAGGAGACTCTGAAG600TGACTGCTGGGAAACCCTTTGGGAGACCTGACCTGGGGCC640AAAAATAAAGTGAGCCAGCGTCATGAACGCATGCTATTTA680GGGACA686cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。