基因總覽
MRPL24 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 mitochondrial ribosomal protein L24。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 1q23.1。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000361531 ★ | 156,737,303–156,741,088 | 6 |
| ENST00000368211 | 156,737,292–156,741,143 | 6 |
| ENST00000858113 | 156,737,292–156,741,114 | 6 |
| ENST00000858114 | 156,737,292–156,741,143 | 7 |
| ENST00000858115 | 156,737,292–156,741,143 | 6 |
| ENST00000858116 | 156,737,292–156,741,143 | 7 |
| ENST00000858117 | 156,737,292–156,741,115 | 6 |
| ENST00000858118 | 156,737,292–156,741,143 | 7 |
| ENST00000858119 | 156,737,292–156,741,143 | 6 |
| ENST00000858120 | 156,737,292–156,741,143 | 6 |
| ENST00000858121 | 156,737,292–156,741,143 | 6 |
| ENST00000858123 | 156,737,292–156,741,096 | 5 |
顯示 12/41 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>MRPL24 ENST00000361531 GRCh38 chr1:156740988-156742088 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TTTGGGGGTGTATTGGTTAACTGAAGACAGAAAGTGGGGTAATGGAATGCAAATGATTTCCAGGTCATCT CAGATTTAGGTAGAGGGTGTCAACCTCCTCCATTTTTAGGCATTTGGAAATCCAAACTTCTTGTGGGCAG AGTCGTAGAATAAACCACACCATTCATTCTACTCCTGCCCAGCCACTGTTTAACGCACCTGGGAAAGTTT TTTTTAAAAAAGGGTTTGCACAAGAAGTGGGGTGTGGGAGGATGCGAGTATCGGCCACAGCCCAAGATGG CCATGAAGTGGGAGTTTGGAGGCTGGTTGTATAAACAATTTGACCCCAAAGTGCAAGTCAAATAATAGGA TAACCCTTTCTCCTTGCTAATGCTAGGGGTACCTGCCACCCTTAGCTGGTGATGGGGTGGTAGGGGGAGG GGGTTGGTAGGGTGAAATTCCGCCAGTACTCCCTGAGTTAAGTGGAATGACTGGTTTAGATCATTTCTGT TTCCTTCCAGATCTGACATTTTGTAACTAGATCGGCTACTAGCATTGGAAGGGCCCACGTTTCATCCCTT CCTCTAGAAAGCCTACCGGCAGTTTTTGAATCTGCCCTGCCCCCACTCCAGCAGAGAAGGACAGGGAGAG CATTGGCGGTAGCCCTGTCTGGAAAGGGCGGCCCTTTGCCTTGAACAGGAAGCCACAACCACCTAGAAAA TGGAGCCTTCTTCTCTAGAAACTACAATTCCCAGCGGCCTCCACGCAGAGCATGCGCGGGAATGTGCCAG GCGGGCCAGCCGAACCAGCTTGCCTTTCGATTCCCGACATGCTTCATGGTGTGTTCCGGTTTCCTTGATT TCCTACCCCCGCCAAACTTCCTGTTTCCAGCTTTCTAGCGGCGGACTACAACTCCCAGCATGCTGAGAGG TAAGATTCGTGGTTGAGCTTCCGTTTTACACTTGGACTACAACTCCCAGAAAGTCGACGGGCGTGGCGGG GGAGGGGACGCTGAGGGCCCATGTGCTGAAAATCCGAAGTGCCGCGGAAAGTGGAGGTGAGGGCCGCCCG CCCTAGAGGTGCCCGTCCGAGAGGCAGGTGCGGGAAGAGCCTATCCTTTTC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MRPL24_1 ↗ | 1:156,741,088 | 負股 | 156,741,078–156,741,137 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR1_B364TL · enhancer · 156740273–156741077 · regulatory
ENSR1_B364TN · promoter · 156741078–156741621 · regulatory
· motif · 156740391–156740402 · motif
· motif · 156740833–156740846 · motif
· motif · 156740939–156740948 · motif
· motif · 156741101–156741111 · motif
· motif · 156741112–156741122 · motif
· motif · 156741150–156741163 · motif
· motif · 156741152–156741163 · motif
· motif · 156741221–156741234 · motif
· motif · 156741223–156741234 · motif
· motif · 156741225–156741234 · motif
· motif · 156741248–156741268 · motif
· motif · 156741326–156741337 · motif
· motif · 156741331–156741342 · motif
· motif · 156741331–156741342 · motif
· motif · 156741485–156741495 · motif
· motif · 156741588–156741608 · motif
· motif · 156741666–156741676 · motif
· motif · 156741753–156741768 · motif
· motif · 156741929–156741937 · motif
· motif · 156742183–156742194 · motif
· motif · 156742714–156742725 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:216 aa
MRPL24 的前體長 216 個胺基酸,N 端第 1–9 位為粒線體轉運胜肽;第 56–89 位含有 KOW 結構域。此蛋白屬於 universal ribosomal protein uL24 家族。
蛋白質三維結構
細胞內定位
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
MRPL24 是粒線體大型核糖體亞基(mt-LSU)的組成成分。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小亞基與 39S 大亞基構成;小亞基含有 12S 粒線體核糖體 RNA(12S mt-rRNA)及 30 種不同蛋白質,大亞基則含有 16S mt-rRNA、1 個具重要結構作用的粒線體纈胺酸轉運 RNA(mt-tRNA(Val)),以及 52 種不同蛋白質。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 交互作用 | MRPL24 是粒線體大型核糖體亞基(mt-LSU)的組成成分。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小亞基和 39S 大亞基組成;前者含有 12S mt-rRNA 與 30 種不同蛋白質,後者含有 16S mt-rRNA、具重要結構作用的 1 個 mt-tRNA(Val),以及 52 種不同蛋白質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the mitochondrial large ribosomal subunit (mt-LSU). Mature mammalian 55S mitochondrial ribosomes consist of a small (28S) and a large (39S) subunit. The 28S small subunit contains a 12S ribosomal RNA (12S mt-rRNA) and 30 different proteins. The 39S large subunit contains a 16S rRNA (16S mt-rRNA), a copy of mitochondrial valine transfer RNA (mt-tRNA(Val)), which plays an integral structural role, and 52 different proteins PMID 25278503 ↗ · PMID 25838379 ↗ · PMID 28892042 ↗ · PMID 35177605 ↗ |
| 細胞定位 | MRPL24 位於粒線體。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
ATGTGCTGAAAATCCGAAGTGCCGCGGAAAGTGGAGGTGA40GGGCCGCCCGCCCTAGAGGTGCCCGTCCGAGAGGCAGAGC80TGACAAGGAAGGTTTCGAGCGTTTTGCTGGCAAAGGGATT120TCTTACAACCTCCAGGCATGCGTCTTTCTGCCCTGCTGGC160CTTGGCATCCAAGGTCACTCTGCCCCCCCATTACCGCTAT200GGGATGAGCCCCCCAGGCTCTGTTGCAGACAAGAGGAAGA240ACCCCCCATGGATCAGGCGGCGCCCAGTGGTTGTGGAACC280CATCTCTGATGAAGACTGGTATCTGTTCTGTGGGGACACG320GTGGAGATCCTAGAAGGCAAGGATGCCGGGAAGCAGGGCA360AAGTGGTTCAAGTTATCCGGCAGCGAAACTGGGTGGTCGT400GGGAGGGCTGAACACACATTACCGCTACATTGGCAAGACC440ATGGATTACCGGGGAACCATGATCCCTAGTGAAGCCCCCT480TGCTCCACCGCCAGGTCAAACTTGTGGATCCTATGGACAG520GAAACCCACTGAGATCGAGTGGAGATTTACTGAAGCAGGA560GAGCGGGTACGAGTCTCCACACGATCAGGGAGAATTATCC600CTAAACCCGAATTTCCCAGAGCTGATGGCATCGTCCCTGA640AACGTGGATTGATGGCCCCAAAGACACATCAGTGGAAGAT680GCTTTAGAAAGAACCTATGTGCCCTGTCTAAAGACACTGC720AGGAGGAGGTGATGGAGGCCATGGGGATCAAGGAGACCCG760GAAATACAAGAAGGTCTATTGGTATTGAGCCTGGGGCAGA800GCAGCTCCTCCCCAACTTCTGTCCCAGCCTTGAAGGCTGA840GGCACTTCTTTTTCAGATGCCAATAAAGAGCACTTTATGA880GTC883cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。