基因總覽
MRPL22 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 mitochondrial ribosomal protein L22。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 5q33.2。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000523037 ★ | 154,941,073–154,969,411 | 7 |
| ENST00000522038 | 154,941,064–154,971,241 | 7 |
| ENST00000906691 | 154,941,064–154,971,241 | 6 |
| ENST00000998376 | 154,941,064–154,966,968 | 8 |
| ENST00001015036 | 154,941,064–154,966,968 | 7 |
| ENST00001083486 | 154,941,064–154,971,241 | 7 |
| ENST00001103737 | 154,941,064–154,971,241 | 3 |
| ENST00001103738 | 154,941,064–154,971,241 | 7 |
| ENST00001136006 | 154,941,064–154,971,241 | 7 |
| ENST00000265229 | 154,941,093–154,971,241 | 6 |
| ENST00000439747 | 154,941,095–154,971,241 | 6 |
顯示 11/11 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>MRPL22 ENST00000523037 GRCh38 chr5:154940073-154941173 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CTACCTGTTATTCTAATACAGAGGGGTCAAATACATATATTTGAAGGCGTCTAGGGGCACAAATTTGGAG GCACCTAGTCGTAGATTGATCACTGGTTTGCCAGTTGTTAGTTGAGAGACTTTAACATATCCTAAATATG TTTCCTCATTTGAAGAAGGAAAATGATAATCCATGCCTTGTTGGATTGCTGTGAGGAATAAATGAGATTT AGTGAAATACCTGCCTGACATAAGGCAGTAAATGCCAGATGAATATAAACTCATTCTTGAAGGTCAACCA GATTAGTAGGGATTAGGACAGCATACATCATATTTGAACTATTTGCTCTTTAAAAGAGATTTTAGGCTAG GTTTCGTGGCTCATACCTCTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCCGAGGAGGGCAGATTGCTTGAGCCCAGGA ATTCGAGATCAGCCTGGGCAATTTGGGGAAACTCCTTATCTATAAAAAATACAAAAATTAGCCGGGCGTG GTGATGTGCGCCTGTAGTCACAGCTACTTGGGAGGCTGAGGTAAGAGGGTGGCTTGAGCCCGGGGTCGAG GCTGCAGTGAGACTAGGTCATTGCTACCACACTCCAGCCTAAGCGAGAGAGAGACCCTGTTTCAATAAAA TGAAATAAAATAGCTTTCACACTATTTCAACTGATCTTTACAACAAGCTTGTGCCCTAAGGTTAGTCATT TCTGATAAGAAAACTGAGGACCACCGGATTAGGTGGCTTGTTCACGGATTCTGTTCCCCTACTCCTTTCT AGTTTGTGAGTTGGGACTTTAGTTTTTCTGAATCCAGGTGAATTTTCGGAAGCCCACGTGCTTTCGGCCT TTATTAATTAATTCATTCCCAAGCCAGGTTCGCCTGACCACACCTCGAGCGCCGGCCCAGTGCTTGCGAT CTTCGTGACGGCACCTGGGGTGTAAGTACTGCTTGTGGGAGAGCCCCACAGGAAATCCAGAGTATTGCGC ATGCGTGCTGTCCAGAAGGCGCTTGAACTCGGCGGCTTCCGTAGCGGGAGGGCGAAAGATGGCGGCGGCA GTACTGGGACAGTTGGGTAAGGATTTCTTAGTGGTTAAGCGACAGAAGGGA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MRPL22_1 ↗ | 5:154,941,093 | 正股 | 154,941,044–154,941,103 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:206 aa
MRPL22 的蛋白質長度為 206 個胺基酸,屬於 universal ribosomal protein uL22 家族。其 N 端第 1 至 40 位胺基酸被註記為粒線體轉運肽,與粒線體導入相關。
蛋白質三維結構
細胞內定位
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- GLP1RP43220 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
MRPL22 是粒線體大型核糖體次單位(mt-LSU)的組成成分。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小型次單位與 39S 大型次單位構成;前者含有 12S mt-rRNA 及 30 種蛋白質,後者則含有 16S mt-rRNA、具有重要結構作用的 mt-tRNA(Val),以及 52 種蛋白質。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 交互作用 | MRPL22 是粒線體大型核糖體次單位(mt-LSU)的組成成分。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小型與 39S 大型次單位組成;小型次單位含 12S mt-rRNA 和 30 種不同蛋白質,大型次單位含 16S mt-rRNA、具有重要結構作用的一份粒線體纈胺酸轉運 RNA(mt-tRNA(Val)),以及 52 種不同蛋白質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the mitochondrial large ribosomal subunit (mt-LSU). Mature mammalian 55S mitochondrial ribosomes consist of a small (28S) and a large (39S) subunit. The 28S small subunit contains a 12S ribosomal RNA (12S mt-rRNA) and 30 different proteins. The 39S large subunit contains a 16S rRNA (16S mt-rRNA), a copy of mitochondrial valine transfer RNA (mt-tRNA(Val)), which plays an integral structural role, and 52 different proteins PMID 25278503 ↗ · PMID 28892042 ↗ · PMID 35177605 ↗ |
| 細胞定位 | MRPL22 位於粒線體。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GCTTGAACTCGGCGGCTTCCGTAGCGGGAGGGCGAAAGAT40GGCGGCGGCAGTACTGGGACAGTTGGGTGCGTTATGGATA80CATAACCTGAGGAGCCGGGGGAAGCTGGCCTTGGGTGTTT120TACCTCAATCATATATCCACACAAGTGCTTCTCTTGACAT160TTCTCGAAAATGGGAGAAGAAGAATAAAATTGTTTATCCT200CCACAACTGCCTGGAGAACCTCGGAGACCAGCAGAAATCT240ACCACTGTCGAAGACAAATAAAATATAGCAAAGACAAGAT280GTGGTATTTGGCAAAATTGATACGAGGAATGTCTATTGAC320CAGGCTTTGGCTCAGTTGGAATTCAATGACAAAAAAGGGG360CCAAAATAATTAAAGAGGTTCTCTTAGAAGCACAAGATAT400GGCAGTGAGAGACCATAACGTGGAATTCAGGTCCAATTTA440TATATAGCTGAGTCCACCTCAGGACGAGGCCAGTGCCTGA480AACGCATCCGCTACCATGGCAGAGGTCGCTTTGGGATCAT520GGAGAAGGTTTATTGCCATTATTTTGTGAAGTTGGTGGAA560GGGCCCCCACCTCCACCTGAGCCACCAAAGACGGCAGTTG600CCCATGCCAAAGAGTATATTCAGCAGCTTCGCAGCCGGAC640CATCGTTCACACTCTATGATGAGGAGATTCAGACTCCACA680GTGTATATATTTTGCCATTTATTTTCTAAAAATAAACAAA720AATTGAAGGCAAATGCTTTTTATGATTTCTCATTGAATTA760TTGAAACAGTGTATAACTGCTAGTTGTAAATGAATATTTA800TAAGGCTTTGCCCATTTCTTTTGAGCCTCTGGGCATATTT840GTATGCATTTGCGACTTGGAAGGGGAAATCAGCTTTAAAC880ATAGTAACAGACTATATTTCAAAAGGCTTTTGGAGTAACT920TTGAAAGGGAATGTTAACTTTCCAACTAGTGTCCTGCAGG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。