基因總覽
MRPL20 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 mitochondrial ribosomal protein L20。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 1p36.33。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000344843 ★ | 1,401,909–1,407,293 | 4 |
| ENST00000872276 | 1,401,908–1,407,306 | 4 |
| ENST00000872277 | 1,401,908–1,407,306 | 3 |
| ENST00000914256 | 1,401,908–1,407,306 | 4 |
| ENST00000914257 | 1,401,908–1,407,306 | 3 |
| ENST00000914258 | 1,401,908–1,407,306 | 3 |
| ENST00000914259 | 1,401,908–1,407,306 | 4 |
| ENST00001144713 | 1,401,908–1,407,306 | 4 |
| ENST00000872275 | 1,401,909–1,407,306 | 4 |
| ENST00000983180 | 1,401,909–1,407,306 | 4 |
| ENST00000983181 | 1,401,909–1,407,306 | 5 |
| ENST00001060374 | 1,401,909–1,407,306 | 4 |
顯示 12/18 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>MRPL20 ENST00000344843 GRCh38 chr1:1407193-1408293 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AAAACTTCTTATTTTTTTGGGACAGACTCTGGCTCCGCTGCCCAGGCTGTTGTGCGGTGGTGCAATCTGA GCTCACTGCAGCCTCCACCTCCAGAGCTCAGGCGAGCCTCCCGTCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGACCT CAGGCGCGCGCCACCACCGCTCCCGGCTAATTTCTTTTTGATTTTTTGTAGAGATGGGGTCTCACTATGT TGCCCAGGCTGGTATTGAACTCCTGGACTCAAGTGTTCCTCCCCCCTCGGCCTCCGAAAGTGCTGGGATT ACAGGCATCAGCACCACAGCGATCACATTTACCATTTCGAAGCTGAGAATTTCCAGGCATGGCGCGGTGG CTCAGGCCTGTAATCCCAGCAGAAGCCAGCAGTCCGAGAACAGCCTGGCCAACGCGGGAAGACGCCCCCT CTACAAAAAACACAAAAAATTAGCCGGGCGTGGCGGCGCGCGCCTGACGTCCCAGCTACTAGGAAGGCAG AGGCCGCGGCGAGCCGAGGTCGGGCCGCTGCACCCCAGCCAGGGCGACCGGGCGAGACCCCGTCTCAAAA TGAGTAAGTAAACAAAGTGCAAGGTTCAGAGGCAACGGGCACTTTCACACCGATGCGACCATCTCCACCT CGGTTCCTGAACATCCTCGTGGCCCCAGGGGGCGGCCTGCCCCTCCCCGCCCGCGCCGCACCCGAGCTCC CCGGCCGCGGGGCCCCCGACCCGGGTCCGCTGCCCTCACGGTGCCCTCGGAGCCACAGCTGCGGCCGGGG CCGTGCTCCGGGACGGTCCGCGTGCGCTGCTGTTTATCCATCGTCCGCGAATAGCCACGGGCGCTGCGGC CCCGTTCTCCTTTCAGTCCCCGCCGCGGCCCCACATCCGCTCCCCAACACGCACCACCACCGCGAGTTCA GGAGCACAACTGGGCACCCGCGGGCTGACGGGAGACGACCTTCGCCCCGGAAGTATCGCAGGGGCTGACC CGGAAGCGCTCGTGACCACCATTTCCGACCCGGGCAAGATGGCAGCGGCGCTGCGCGTGCGTTGTTGAGT GTTCGGGACGCCGGCCTGCAGGCGCCATGGTCTTCCTCACCGCGCAGCTCT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MRPL20_1 ↗ | 1:1,407,293 | 負股 | 1,407,283–1,407,342 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR1_748BS · promoter · 1407280–1407368 · regulatory
ENSR1_B9JN · enhancer · 1407369–1408250 · regulatory
· motif · 1403775–1403795 · motif
· motif · 1403811–1403825 · motif
· motif · 1406251–1406262 · motif
· motif · 1407008–1407019 · motif
· motif · 1407008–1407019 · motif
· motif · 1407010–1407019 · motif
· motif · 1407144–1407153 · motif
· motif · 1407251–1407262 · motif
· motif · 1407251–1407262 · motif
· motif · 1407290–1407300 · motif
· motif · 1407306–1407315 · motif
· motif · 1407306–1407317 · motif
· motif · 1407306–1407317 · motif
· motif · 1407329–1407338 · motif
· motif · 1407329–1407340 · motif
· motif · 1407329–1407340 · motif
· motif · 1407335–1407348 · motif
· motif · 1407335–1407349 · motif
· motif · 1407413–1407422 · motif
· motif · 1407432–1407452 · motif
· motif · 1407706–1407719 · motif
· motif · 1407839–1407855 · motif
· motif · 1410866–1410877 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：149 aa
mitochondrial ribosomal protein L20 長 149 個胺基酸，具有位於第 1 至第 9 位的粒線體轉運胜肽；其家族歸屬為細菌核糖體蛋白 bL20 家族。
蛋白質三維結構
細胞內定位
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
MRPL20 是粒線體大型核糖體次單元（mt-LSU）的組成成分。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小型次單元與 39S 大型次單元構成；後者含有 16S 粒線體核糖體 RNA、1 個具結構作用的粒線體纈胺酸轉運 RNA，以及 52 種不同蛋白質。另有資料指出 MRPL20 與 OXA1L 互作，此互作為相似性推論。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 交互作用 | MRPL20 是粒線體大型核糖體次單元（mt-LSU）的組成成分。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小型次單元與 39S 大型次單元構成；小型次單元含 12S 粒線體核糖體 RNA 及 30 種蛋白質，大型次單元含 16S 粒線體核糖體 RNA、1 個具結構作用的粒線體纈胺酸轉運 RNA 及 52 種蛋白質。另有相似性推論指出 MRPL20 與 OXA1L 互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the mitochondrial large ribosomal subunit (mt-LSU). Mature mammalian 55S mitochondrial ribosomes consist of a small (28S) and a large (39S) subunit. The 28S small subunit contains a 12S ribosomal RNA (12S mt-rRNA) and 30 different proteins. The 39S large subunit contains a 16S rRNA (16S mt-rRNA), a copy of mitochondrial valine transfer RNA (mt-tRNA(Val)), which plays an integral structural role, and 52 different proteins. Interacts with OXA1L (By similarity) PMID 25278503 ↗ · PMID 25838379 ↗ · PMID 28892042 ↗ · PMID 35177605 ↗ |
| 細胞定位 | MRPL20 定位於粒線體。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
ATTTCCGACCCGGGCAAGATGGCAGCGGCGCTGCGCGTGC40GTTGTTGAGTGTTCGGGACGCCGGCCTGCAGGCGCCATGG80TCTTCCTCACCGCGCAGCTCTGGCTGCGGAATCGCGTCAC120CGACCGCTACTTTCGGATCCAGGAGGTGCTGAAGCACGCC160AGGCACTTCCGGGGAAGGAAAAATCGCTGCTACAGGTTGG200CGGTCAGAACCGTGATTCGAGCCTTTGTGAAATGCACCAA240AGCCCGATACCTGAAGAAAAAGAACATGAGGACCCTCTGG280ATTAATCGAATTACAGCTGCTAGCCAGGAACATGGACTGA320AGTATCCAGCGCTCATTGGGAATTTAGTTAAGTGCCAGGT360GGAGCTCAACAGGAAAGTCCTAGCGGATCTGGCCATCTAC400GAGCCAAAGACTTTCAAATCTTTGGCTGCCTTGGCCAGTA440GGAGGCGACACGAAGGATTTGCTGCTGCCTTGGGGGATGG480GAAGGAACCTGAAGGCATTTTTTCCAGAGTGGTGCAGTAC520CACTGAGGACTGTTGCTGTATTGATTAGGAAAAGAGACAG560AGTAATTTGCAGTTTGTTTGATTTATACTTTTGTTTATCT600ACAACCCAATAACAGACATGAGGGATGGCCCTGTCTCTCT640GGGACAGAGCCTCACAGATGATGTCCATGTTTTGTGTGAA680TGAAACTCAAACACTCTTCA700cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。