基因總覽
MRPL18 是蛋白質編碼基因，其產物為 mitochondrial ribosomal protein L18，屬於 universal ribosomal protein uL18 家族。此蛋白質是粒線體大型核糖體次單元的組成成分；成熟哺乳類粒線體核糖體由小型與大型兩個次單元構成，MRPL18 所屬的大型次單元含有多種蛋白質及核糖體 RNA。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000367034 ★ | 159,790,467–159,798,429 | 4 |
| ENST00000857674 | 159,789,867–159,799,027 | 4 |
| ENST00000953331 | 159,789,867–159,799,027 | 4 |
| ENST00001083142 | 159,789,867–159,798,429 | 4 |
| ENST00001096436 | 159,789,867–159,799,027 | 4 |
| ENST00001096437 | 159,789,867–159,799,027 | 3 |
| ENST00001096438 | 159,789,867–159,798,429 | 4 |
| ENST00001124126 | 159,789,867–159,798,427 | 3 |
| ENST00001141777 | 159,789,867–159,799,027 | 4 |
顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
MRPL18 的前驅形式與 thiosulfate sulfurtransferase（TST）共同參與細胞質 5S rRNA 輸入粒線體的過程。前驅蛋白具有 RNA 伴護活性，可協助 5S rRNA 折疊成適合輸入的構形；此構形可被 rhodanese（TST）辨識。
細胞質形式與粒線體形式的 MRPL18 都能結合 5S rRNA 的 gamma domain 中 helix IV-loop D 區域。這些觀察支持 MRPL18 在 5S rRNA 的構形調整及其粒線體輸入過程中具有作用；來源未提供其他功能或其作用效應的細節。
Promoter 與基因調控
>MRPL18 ENST00000367034 GRCh38 chr6:159789467-159790567 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ATCTTGACGGCAGCGATACACGTCGAATTCTGCTTACACCGCGGGCAACCAGTATCGCGGCCCCTCGGCC GACCGGCGACCACAGCAGTGGCTGCGACGGCGTGGAGCGTACCCGAGCGATGTCCCAGGAGCTACTGGGT AACACACCACCCCACCCGCTTCCCGGCTGCCCCGGCCCGGCCGCGGGGCACGGCGGGAAGGAAAAAGAGG CAGGGACAACAGGGAGAGAAACAGGACTGTGACGGAAGTGAGGCTCCGGGGAAGGGGCGGGGTCGGCATT TTTGTCCAATTAGATAGCCGATGGGAAGGGCGCGAAAGCGGAGAACGGAAGTCGGATGTTGGACCGCTGG GAAGAGGTTGAACCTTCGCCTCAAACGATGTTGCGCAGACGCAGTGGGCCATTCTAGTGCCTTCTAGAAA AGGTTGTAAGAAGGGTGGAGCTTGGAGCTGGGGTGTAACTGGAGGGGCGGGCCCTTCTCCAAGTTAGAGT TGGGGTTCTGAGCGAGTCGTGCGTTTTAGGTTTAGTGTCTTTTCCTTGTCCCTGCTCGGGGAGCGTGAGG CAGATCGGCCGGCTTTGCTCCAGGCCTCAGGAGTGTAAGTTTAAGGGCGCGAACCTGGGTGGGACGGGGC AGTTTTTCCAGCGGGCCATACGGGAAAATTTTTGGTTCGAGGAAGACAACCACCCTTTTTAAGGAGAAAA CTGCATCTTGCCCTGCCTTATTCCTACGCGGTGCCCAGGTGGGGTGTGTGTGGACCAGTCGATGACCGCC CAAGCTCTCCGAGTAGAAAACCCAAACATGGTTTTGTGGGGTGTGTGCCTTTGACCCCGGACTTAAGCAA CAAGCGTGGTCTTGGGCGTAGCTACGAGGTGGTTGGTGGGCTCCAGGGCCTGCGTGCCCCTCGACGTGAG CGATGATTGGCGATGAAGGATAACAGATCGCCTTCTCGGCCACTCAGTGGCAGGGGACTTGCTACTTCCG GGTCGGTGGCGTCTGGCGTGGAGAGTTTGGGGATCTACAGCAGCCAAAGGCTTGTCCCTGACTTTATATG GCTGCTCCTGGCGAGCGACTGAGTCGTCCGTGAGGAAAAAGAGGCGAGGCT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MRPL18_2 ↗ | 6:159,789,867 | 正股 | 159,789,818–159,789,877 |
| MRPL18_1 ↗ | 6:159,790,500 | 正股 | 159,790,451–159,790,510 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：180 aa
MRPL18 蛋白質長 180 個胺基酸，屬於 universal ribosomal protein uL18 家族。序列註解標示其第 1 位起始的區段為粒線體轉運胜肽，註解未提供該區段的終點。
蛋白質三維結構
細胞內定位
來源未指出其定位會隨條件或異構型而改變。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- LAPTM5Q13571 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MRPL38Q96DV4 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
MRPL18 是粒線體大型核糖體次單元（mt-LSU）的組成成分。成熟哺乳類粒線體核糖體為 55S，由 28S 小型次單元與 39S 大型次單元組成；大型次單元含 16S mt-rRNA、1 個 mt-tRNA(Val) 及 52 種蛋白質。來源支持其複合體組成關係，未列出其他實體結合夥伴。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | MRPL18 前驅形式與 thiosulfate sulfurtransferase（TST）共同參與細胞質 5S rRNA 輸入粒線體；前驅蛋白可協助 5S rRNA 折疊成可輸入的構形，供 rhodanese（TST）辨識。細胞質與粒線體形式皆能結合 5S rRNA gamma domain 的 helix IV-loop D。 | 含實驗來源 | 證據與來源Together with thiosulfate sulfurtransferase (TST), acts as a mitochondrial import factor for the cytosolic 5S rRNA. The precursor form shows RNA chaperone activity; is able to fold the 5S rRNA into an import-competent conformation that is recognized by rhodanese (TST). Both the cytoplasmic and mitochondrial forms are able to bind to the helix IV-loop D in the gamma domain of the 5S rRNA PMID 21685364 ↗ |
| 交互作用 | MRPL18 是粒線體大型核糖體次單元（mt-LSU）的組成成分。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小型次單元與 39S 大型次單元構成；大型次單元含 16S mt-rRNA、1 個 mt-tRNA(Val) 及 52 種蛋白質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the mitochondrial large ribosomal subunit (mt-LSU). Mature mammalian 55S mitochondrial ribosomes consist of a small (28S) and a large (39S) subunit. The 28S small subunit contains a 12S ribosomal RNA (12S mt-rRNA) and 30 different proteins. The 39S large subunit contains a 16S rRNA (16S mt-rRNA), a copy of mitochondrial valine transfer RNA (mt-tRNA(Val)), which plays an integral structural role, and 52 different proteins PMID 25278503 ↗ · PMID 28892042 ↗ · PMID 35177605 ↗ |
| 細胞定位 | MRPL18 定位於粒線體。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GAGAGTTTGGGGATCTACAGCAGCCAAAGGCTTGTCCCTG40ACTTTATATGGCTGCTCCTGGCGAGCGACTGAGTCGTCCG80TGAGGAAAAAGAGGCGAGGCTTTTCCGAGATCGTCTCAGC120GATGGCGCTTCGGTCGCGGTTTTGGGGGTTGTTCTCGGTT160TGCAGGAACCCTGGGTGCAGGTTCGCAGCCCTGTCAACCA200GCTCCGAGCCGGCAGCGAAACCTGAAGTGGACCCTGTGGA240AAATGAAGCTGTCGCCCCAGAATTCACCAACCGGAACCCC280CGGAACCTGGAGCTTTTATCTGTAGCCAGGAAAGAGCGGG320GCTGGCGGACGGTGTTTCCCTCCCGTGAGTTCTGGCACAG360GTTGCGAGTTATAAGGACTCAGCATCATGTAGAAGCACTT400GTGGAGCATCAGAATGGCAAGGTTGTGGTTTCGGCCTCCA440CTCGTGAGTGGGCTATTAAAAAGCACCTTTATAGTACCAG480AAATGTGGTGGCTTGTGAGAGTATAGGACGAGTGCTGGCA520CAGAGATGCTTAGAGGCGGGAATCAACTTCATGGTCTACC560AACCAACCCCGTGGGAGGCAGCCTCAGACTCGATGAAACG600ACTACAAAGTGCCATGACAGAAGGTGGTGTGGTTCTACGG640GAACCTCAGAGAATCTATGAATAAATGGAAGCATTAATTG680TTTTGAACATGTAAATATAAATCTGTCAGCCACTACAGCC720ATCAAAAGAGAGCATCTGGAAGAACAGCCAGCTTGGAAGT760TTTACAGCAATAATGTTGCAGTGGAATATTATTTGTAGTT800AAGGTCATCCTCCTCCCCTTTCTGTTTTTTTAAATCAAGA840ACTACGTTCTGCCCCTCTCTTGGGCTTCAGAAGCATCTAA880GAAAAGCAGTCATCAATTATAATTAACTTTCAAAGGGCAA920GTCAGAAGTTGTTTATAAATTACAAAATAAAGGCATATTA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。