基因總覽
MRPL16 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 mitochondrial ribosomal protein L16。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 11q12.1。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000300151 ★ | 59,806,140–59,810,778 | 4 |
| ENST00000884381 | 59,806,140–59,811,377 | 4 |
| ENST00000923616 | 59,806,140–59,811,377 | 3 |
| ENST00000923617 | 59,806,140–59,811,377 | 4 |
| ENST00001142909 | 59,806,140–59,811,377 | 4 |
| ENST00000534340 | 59,806,535–59,810,300 | 4 |
| ENST00001080969 | 59,808,495–59,811,377 | 3 |
顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>MRPL16 ENST00000300151 GRCh38 chr11:59810678-59811778 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GTCAGATAAAAAAACAATTTACAACAGTCTTTCTCTAAAGTCTGCTATCTAAGAGCTTCCTCTGCATAAT AAAACTTGGTCTCTACAATCATTTATGTTTAACCTGAACATTCCTTTCTATCCATCCCAGGTCTTTGGAC AAACTCAACCAATTGTCAACCAGAAAATGTTTACATTTACCTATAGCCTAGAAGCCCACCTTGACTTGTC CCGCCTTTCTGAACCAAACCAATGTATTTCTTAAATGCATTTGATTGATGTCTCATGCCCCTCTAATATG TATAAAGCCAAGCTGCACTTCTACCACCTTGGGCACATGTTCTCAGGACCCCCTGAGGGCTGTGTCACAG GCCATGGTTGCTCATATTTGGCTCAGAATAAATCTCTTCCAATATCTTACAGAATTTCACTCTTTTCATC AACAATATTGTTCATTCACTGAGATCTCTGGAATCACAGACTGTGCTCAAATTCTGATGGTACTGTTTTC CTGTTGTATGACCCAGAACAAGTTAAATTATTTCACCCTCAGGATGGAATCTGCAAAATAAGTATAATGA CTTATCTCACAGATTCGTTGGCAGGACTAACGAATGAGGTACTCAATGACACATTGCAATTGCCCTATAC ATGTTAAACCATTGCTAAATCTGGTATTCTCCTAATGTCTTTGAGGGGTCCCCTAGAAAATCATCTCAAA GGCTGTGAATCGTAAGGGACCACCTTGCTAAGCAACCGGCAGGCACTAACAGTTGTACTCCGCAGAAAAA TAAATAAATAAAACAAAAGACTCCCCGCCCCGCCGCCCTCTTCTTCTGGGGAAAGACTGGAGATTGGAAG GAGAACCCTAGAGAGCCAACAGGGCCCCTGGGCGTGGCTGGGCGGACGGCGCCTTTGACCGCAGGAACTC AACCTCCCCCGGAACTCAACCCCCGTCGCTCGAGTTTCTTTCGCTTCCGTCGGGACTCTGCGGAGTGGAC CCGAGTGAACACAACTTCCGGCCCCACTGAGCGGTGTCCTGAGCCGATTACAGCTAGGTAGTGGAGCGCC GCTGCTTACCTGGGTGCAGGAGACAGCCGGAGTCGCTGGGGGAGCTCCGCG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MRPL16_1 ↗ | 11:59,810,776 | 負股 | 59,810,766–59,810,825 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR11_9TPZF · promoter · 59810768–59811268 · regulatory
· motif · 59807263–59807278 · motif
· motif · 59809658–59809678 · motif
· motif · 59810227–59810242 · motif
· motif · 59810232–59810244 · motif
· motif · 59810235–59810242 · motif
· motif · 59810503–59810516 · motif
· motif · 59810503–59810516 · motif
· motif · 59810549–59810559 · motif
· motif · 59810566–59810581 · motif
· motif · 59810590–59810605 · motif
· motif · 59810775–59810786 · motif
· motif · 59810775–59810786 · motif
· motif · 59810777–59810786 · motif
· motif · 59810901–59810911 · motif
· motif · 59812407–59812416 · motif
· motif · 59812407–59812416 · motif
· motif · 59815134–59815145 · motif
· motif · 59815136–59815147 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：251 aa
MRPL16 的蛋白質前體長 251 個胺基酸，屬於 universal ribosomal protein uL16 家族。其第 1 至 29 位胺基酸為粒線體轉運肽；此區段的註解依據為序列相似性。
蛋白質三維結構
細胞內定位
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
MRPL16 是粒線體大型核糖體次單位（mt-LSU）的組成成員。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小次單位和 39S 大次單位構成；前者含 12S mt-rRNA 與 30 種蛋白質，後者含 16S mt-rRNA、具結構作用的 mt-tRNA(Val) 一份，以及 52 種蛋白質。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 交互作用 | MRPL16 是粒線體大型核糖體次單位（mt-LSU）的組成成員。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小次單位與 39S 大次單位組成：小次單位含 12S mt-rRNA 和 30 種蛋白質；大次單位含 16S mt-rRNA、在結構上具有重要作用的一份粒線體纈胺酸轉運 RNA（mt-tRNA(Val)），以及 52 種蛋白質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the mitochondrial large ribosomal subunit (mt-LSU). Mature mammalian 55S mitochondrial ribosomes consist of a small (28S) and a large (39S) subunit. The 28S small subunit contains a 12S ribosomal RNA (12S mt-rRNA) and 30 different proteins. The 39S large subunit contains a 16S rRNA (16S mt-rRNA), a copy of mitochondrial valine transfer RNA (mt-tRNA(Val)), which plays an integral structural role, and 52 different proteins PMID 25278503 ↗ · PMID 25838379 ↗ · PMID 28892042 ↗ · PMID 35177605 ↗ |
| 細胞定位 | MRPL16 位於粒線體。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GCCCCACTGAGCGGTGTCCTGAGCCGATTACAGCTAGGTA40GTGGAGCGCCGCTGCTTACCTGGGTGCAGGAGACAGCCGG80AGTCGCTGGGGGAGCTCCGCGCCGCCGGACGCCCGTGACC120ATGTGGAGGCTGCTGGCTCGCGCTAGTGCGCCGCTCCTGC160GGGTGCCCTTGTCAGATTCCTGGGCACTCCTCCCCGCCAG200TGCTGGCGTAAAGACACTGCTCCCAGTACCAAGTTTTGAA240GATGTTTCCATTCCTGAAAAACCCAAGCTTAGATTTATTG280AAAGGGCACCACTTGTGCCAAAAGTAAGAAGAGAACCTAA320AAATTTAAGTGACATACGGGGACCTTCCACTGAAGCTACG360GAGTTTACAGAAGGCAATTTTGCAATCTTGGCATTGGGTG400GTGGCTACCTGCATTGGGGCCACTTTGAAATGATGCGCCT440GACAATCAACCGCTCTATGGACCCCAAGAACATGTTTGCC480ATATGGCGAGTACCAGCCCCTTTCAAGCCCATCACTCGCA520AAAGTGTTGGGCATCGCATGGGGGGAGGCAAAGGTGCTAT560TGACCACTACGTGACACCTGTGAAGGCTGGCCGCCTTGTT600GTAGAGATGGGTGGGCGTTGTGAATTTGAAGAAGTGCAAG640GTTTCCTTGACCAGGTTGCCCACAAGTTGCCCTTCGCAGC680AAAGGCTGTGAGCCGCGGGACTCTAGAGAAGATGCGAAAA720GATCAAGAGGAAAGAGAACGTAACAACCAGAACCCCTGGA760CATTTGAGCGAATAGCCACTGCCAACATGCTGGGCATACG800GAAAGTACTGAGCCCATATGACTTGACCCACAAGGGGAAA840TACTGGGGCAAGTTCTACATGCCCAAACGTGTGTAGTGAG880TGTAGGAGATAACTGTATATAGGCTACTGAAAGAAGGATT920CTGCATTTCTATTCCCCTCAGCCTACCCACTGAAGTCTTT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。