基因總覽
MRPL13 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 mitochondrial ribosomal protein L13。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 8q24.12。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000306185 ★ | 120,395,437–120,445,150 | 7 |
| ENST00001132985 | 120,395,437–120,445,156 | 7 |
| ENST00000932629 | 120,395,844–120,445,156 | 7 |
| ENST00000932630 | 120,395,844–120,445,156 | 4 |
| ENST00000862519 | 120,395,845–120,445,156 | 8 |
| ENST00000978054 | 120,395,845–120,445,156 | 6 |
| ENST00001013225 | 120,395,845–120,445,156 | 7 |
| ENST00000518918 | 120,413,991–120,445,092 | 6 |
| ENST00001107858 | 120,417,105–120,445,156 | 5 |
顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>MRPL13 ENST00000306185 GRCh38 chr8:120445050-120446150 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AACCACATACATTTACTCCTCAAAATGCCTGTTTGATCGAAACAAATGAACACATAAAATGCAATATTGA ATCTAGACGGGTGCACCAAAAAGCAGTGCAATCGCAAACAATTAAAATCATTTAAAATTCATCATTTGTT TTTAAAACTTAGGTTATATGTGGGATGTCTCCTCCCATTAGATGTAAATTGTAGGACAGCAAGATCTTTG TCCATCTTGCTCCTTTCCGTATTATTTGCATGTGAAACACAGGAGCAGAAATAATAAATGCATATATTTC CAAAAAGCAGGAAATTCCATTACTAAGGCATAGAAAATTTATTAAGTTAAACATTTACTATGCCAAGAAC TTCTAAGGGCTGGAATCTTGCATCCACAAATTTGTCCCTGTTTTTCCATGAAGATGCTATTTTTGCAGCC CTCATTAACTCTATCCCAGATAGAGTCCCAGCTTCGTGGGACAACTACATATTGATCCCTCTTCAGCAGA ACTTGATCACAAAACTCAAACTTCTTCCCCTCTCCACAAGCCGTTCCCGCTCTTTCTCATCCCAGCGCTT ACCCGGCTGATTCTCAGTACCCTCACCCGACGACACCTCTGGCCCATGTTCTGCCTCCCTACTGGCCGCC GACGGGAATTTTCCTTCCCCCCAGATCACCAGCAGCAGGTACCGATCCATCTCCTCAGAGATCACCCCCC AACTTTAGGTCTCGGCTTCCACATCCAAACAGACGCGCGCTATGACGCATTTCCGGTTCCCTTCGTTTAG GTCGGCTGGAAATTATGTCCTCCGTCGGTTTTCCGCAGTTTTTCCACCAAGCGAGATATTTTTGGGAGTT ATTCCCTAAATAACTGCATTATATGCTCCTTTCATGACGAAATTGCTGCCGTGGAGAAGACTGGAGGAAA CTCGAGGAAGAGGGAGAAGCCGACAAGTGCTCGACGGGCTAGGAACTGTCCTGCTTGGGTGTTAGCGTTT CCCGCCGGGCCAGTAAGGCTGAGTGACCCGGCGTGGCTACTAGGAGAAGGACGTACGGTCCTGCTAGTAG AGGAATATGTCGAGTTTCTCTAGGGCGCCCCAGGTGAGCTCGGACTCTTAT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MRPL13_1 ↗ | 8:120,445,150 | 負股 | 120,445,140–120,445,199 |
| MRPL13_2 ↗ | 8:120,445,404 | 負股 | 120,445,394–120,445,453 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR8_BTWDG · enhancer · 120444242–120445139 · regulatory
ENSR8_93QRR3 · promoter · 120445140–120445429 · regulatory
· motif · 120442522–120442531 · motif
· motif · 120442522–120442531 · motif
· motif · 120444228–120444237 · motif
· motif · 120444228–120444239 · motif
· motif · 120445330–120445341 · motif
· motif · 120445392–120445403 · motif
· motif · 120445392–120445403 · motif
· motif · 120445394–120445403 · motif
· motif · 120446199–120446210 · motif
蛋白質結構域與序列
蛋白質三維結構
細胞內定位
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- HTTP42858 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
MRPL13 是粒線體大型核糖體次單位（mt-LSU）的組成成員。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小型與 39S 大型次單位構成；大型次單位含 16S mt-rRNA、具結構作用的 mt-tRNA(Val)，以及 52 種不同蛋白質。MRPL13 也被報告與 OXA1L 互作，但此互作註記為 By similarity。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 交互作用 | MRPL13 是粒線體大型核糖體次單位（mt-LSU）的組成成員。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體分為 28S 小型與 39S 大型次單位；小型次單位含 12S mt-rRNA 和 30 種不同蛋白質，大型次單位含 16S mt-rRNA、具有結構作用的 mt-tRNA(Val) 及 52 種不同蛋白質。另有與 OXA1L 互作的註記，但證據屬 By similarity。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the mitochondrial large ribosomal subunit (mt-LSU). Mature mammalian 55S mitochondrial ribosomes consist of a small (28S) and a large (39S) subunit. The 28S small subunit contains a 12S ribosomal RNA (12S mt-rRNA) and 30 different proteins. The 39S large subunit contains a 16S rRNA (16S mt-rRNA), a copy of mitochondrial valine transfer RNA (mt-tRNA(Val)), which plays an integral structural role, and 52 different proteins. Interacts with OXA1L (By similarity) PMID 25278503 ↗ · PMID 25838379 ↗ · PMID 28892042 ↗ · PMID 35177605 ↗ |
| 細胞定位 | MRPL13 位於粒線體。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GAGTGACCCGGCGTGGCTACTAGGAGAAGGACGTACGGTC40CTGCTAGTAGAGGAATATGTCGAGTTTCTCTAGGGCGCCC80CAGCAATGGGCCACTTTTGCTAGAATATGGTATCTCTTAG120ATGGGAAAATGCAGCCACCTGGCAAACTTGCTGCTATGGC160ATCTATAAGACTTCAGGGATTACATAAACCTGTGTACCAT200GCACTGAGTGACTGTGGGGATCATGTTGTTATAATGAACA240CAAGACACATTGCATTTTCTGGAAACAAATGGGAACAAAA280AGTATACTCTTCGCATACTGGCTACCCAGGTGGATTTAGA320CAAGTAACAGCTGCTCAGCTTCACCTGAGGGATCCAGTGG360CAATTGTAAAACTAGCTATTTATGGCATGCTGCCAAAAAA400CCTTCACAGAAGAACAATGATGGAAAGGTTGCATCTTTTT440CCAGATGAGTATATTCCAGAAGATATTCTTAAGAATTTAG480TAGAGGAGCTTCCTCAACCACGAAAAATACCTAAACGTCT520AGATGAGTACACACAAGAAGAAATAGACGCCTTCCCAAGA560TTGTGGACTCCACCTGAAGATTATCGGCTATAAGAGAATA600AGAATTGCAGAAAATAACAGTGAAGTGATTGAAACTTTCT640TCTGATGAGTTTCTCTAACCTACAGGATGGAGTAAAACAA680CTGCTACAGTTCAGCACCTGTTTTATGTGCCGAATCACTG720TGGGGAAAGGTCAGGAAGGTATAGTCCTTCAATAGGAAAT760TGTAATTAAAATATAATTTTATAGAACCATTTTTATGTAA800TCTGATTTGAATGTTATAGTTGATAATAATAAAATCACTT840ACTTGGTTGACTATTTAGTGTTGCATTTAATGATAAAAAA880CAGACCCTGTGTATAGAATTGCAGTTACACATTCCAAAAA920TGCCTCTCCATGCAGATTTTCTCAAGTTTGCAGGTCACTA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。