基因總覽
MRPL11 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 mitochondrial ribosomal protein L11。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 11q13.2。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000310999 ★ | 66,435,075–66,438,848 | 5 |
| ENST00000430466 | 66,435,075–66,438,848 | 5 |
| ENST00000901138 | 66,435,075–66,438,848 | 5 |
| ENST00000901139 | 66,435,075–66,438,848 | 5 |
| ENST00000916482 | 66,435,075–66,438,848 | 5 |
| ENST00000916483 | 66,435,075–66,438,848 | 4 |
| ENST00000916484 | 66,435,075–66,438,848 | 5 |
| ENST00000943610 | 66,435,075–66,438,848 | 4 |
| ENST00000916481 | 66,435,833–66,438,848 | 5 |
| ENST00001098814 | 66,435,833–66,438,848 | 5 |
| ENST00000528272 | 66,435,834–66,437,222 | 3 |
| ENST00000983921 | 66,435,834–66,438,848 | 6 |
顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>MRPL11 ENST00000310999 GRCh38 chr11:66438748-66439848 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CAAGAACCCACCAATTCCGGACACACTAGGGAAGTTTAATTACTTTTCAATTCCTCAGATAAGGAGTTTT TGTCTCTGGTCACCAGGTGATTTTTGCTCTCCTCATGATTCAAAGGTCACCAGGTGATTTTTGCTCTCCT CATGATACAATAAGATGCTGGCTTATTTGGTCACAGATGATATATCGAATGTTCTGGGTCTGTTAAGCCT CACAACAACTCAGGTTTTATCTTAATCGTACGGTTAATAATAGCACATGCTGACTAGGTGCCGGGCATTG TTTTAAGCACTTTGCTAACTTAGTCCTCACAGCAATCCTAAGAGGTAGGTGCTACATATTACAATACCTG CTGTAGTGGGGAGGAGACAAAGCATAAGAAACTTGATTAAGTTCACATGCAGTGGCGCAATCCTGGCTTA CTGCCGCCTCCAACTTCTGGACTCAACTGATCTTCCCGCCCAGTAGAGATGGGGTCTTGCTGTGTTGCCC AGGCTGGTCTCAAACTCCTGGGCTCAAGCGATCCTCCTGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTACAGG CGTAAGTTACCGTGCCCAGCTCAGGGTCTACACTCAACCGTACTGCCTTTCAACAGCATGTGAGGAACAG AGAGAGGAGAGACTTCCATTACCAATCAGGAGCTCCAGGTGTATTTCAAACCCTAGGATTATCACCGTGT GCAGCAGATGGCGCCCTGGCGCATAGCAATTGGCCGGACCTGCACACGGAGTCAAAACTACCATACCCAC AATGCTATGGGGTATCAAGGTCCCACCCTACTGGTTAGCTGTCCGAGGTAGTGCCTGTGCGCGTTCCTGT GGGAATGTGTGTACCTAGGCCATTCGGGCCCTTCCTTTATCTGCATAAAACAAGTTAAAAAGTGTTTTAT CCTCCTCTCATCCTCCTTGTCTTACTAGTTGGCGAGCAATAGGGTTGAAACAAGGCTGCTGTTTGTTGGC CTCACCTGCCCTAGCCTAACGTGAGGACCCTTGACCTCTGGCCCAAGATGGTGGCGCCCAGAGCTTCGCT CTTGCTGCTCCCCTGAGGTGAACTGAAGCCAGCAGCCCCGCATCATGTCAA
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MRPL11_1 ↗ | 11:66,438,842 | 負股 | 66,438,832–66,438,891 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR11_BH725 · promoter · 66438824–66439338 · regulatory
ENSR11_5KLX6L · CTCF_binding_site · 66439132–66439153 · regulatory
ENSR11_BH72S · enhancer · 66443619–66444153 · regulatory
· motif · 66438824–66438837 · motif
· motif · 66438829–66438841 · motif
· motif · 66438831–66438838 · motif
· motif · 66438831–66438844 · motif
· motif · 66438900–66438911 · motif
· motif · 66439003–66439016 · motif
· motif · 66439003–66439016 · motif
· motif · 66439134–66439150 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：192 aa
MRPL11 的蛋白質前 1 至 192 位胺基酸序列中，註解指出第 1 位起有一段粒線體轉運胜肽；來源未提供其終止位置。此蛋白質歸屬於 universal ribosomal protein uL11 家族。
蛋白質三維結構
細胞內定位
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 31 個夥伴
- AGTRAPQ6RW13-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CAMK2AQ9UQM7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
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- THAP1Q9NVV9 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- VPS52Q8N1B4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
MRPL11 是粒線體大型核糖體次單元（mt-LSU）的組成成分。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小次單元與 39S 大次單元構成；大次單元含有 16S 粒線體核糖體 RNA、具結構作用的粒線體 valine transfer RNA，以及 52 種不同蛋白質。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 交互作用 | MRPL11 是粒線體大型核糖體次單元（mt-LSU）的組成成分。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小次單元與 39S 大次單元組成；小次單元含 12S 粒線體核糖體 RNA 及 30 種不同蛋白質，大次單元則含 16S 粒線體核糖體 RNA、具有重要結構作用的一份粒線體 valine transfer RNA，以及 52 種不同蛋白質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the mitochondrial large ribosomal subunit (mt-LSU). Mature mammalian 55S mitochondrial ribosomes consist of a small (28S) and a large (39S) subunit. The 28S small subunit contains a 12S ribosomal RNA (12S mt-rRNA) and 30 different proteins. The 39S large subunit contains a 16S rRNA (16S mt-rRNA), a copy of mitochondrial valine transfer RNA (mt-tRNA(Val)), which plays an integral structural role, and 52 different proteins PMID 25278503 ↗ · PMID 25838379 ↗ · PMID 28892042 ↗ |
| 細胞定位 | MRPL11 的細胞內定位為粒線體；此項定位資料未進一步說明特定粒線體區域、異構型差異或定位變化條件。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GTGAGGACCCTTGACCTCTGGCCCAAGATGGTGGCGCCCA40GAGCTTCGCTCTTGCTGCTCCCCTGAGGTGAACTGAAGCC80AGCAGCCCCGCATCATGTCAAAGCTCGGCCGGGCCGCCCG120GGGCCTCAGGAAGCCCGAGGTCGGCGGTGTGATCCGGGCG160ATCGTGCGGGCAGGCCTGGCCATGCCCGGGCCCCCACTAG200GCCCAGTGCTGGGTCAGAGAGGCGTTTCCATCAACCAGTT240TTGCAAGGAGTTCAATGAGAGGACAAAGGACATCAAGGAA280GGCATTCCTCTGCCTACCAAGATTTTAGTGAAGCCTGACA320GGACATTTGAAATTAAGATTGGACAGCCCACTGTTTCCTA360CTTCCTGAAGGCAGCAGCTGGGATTGAAAAGGGGGCCCGG400CAAACAGGGAAAGAGGTGGCAGGCCTGGTGACCTTGAAGC440ATGTGTATGAGATTGCCCGCATCAAAGCTCAGGATGAGGC480ATTTGCCCTGCAGGATGTACCCCTGTCGTCTGTTGTCCGC520TCCATCATCGGGTCTGCCCGTTCTCTGGGCATTCGCGTGG560TGAAGGACCTCAGTTCAGAAGAGCTTGCAGCTTTCCAGAA600GGAACGAGCCATCTTCCTGGCTGCTCAGAAGGAGGCAGAT640TTGGCTGCCCAAGAAGAAGCTGCCAAGAAGTGACCCTTGC680CCCACCAACTCCCAGATTTCAAAGGAGGTAGTTGCAAAAG720CTGTGCCCAAGGGGAGGAAGGAGGTCACACCAATATGATG760ATGGTTTTCATGACTTTGAATGATATATTTTTGTACATCT800AGCTGTATCGAGGCATCAGGCCTGAATAAACATCCTTTCT840TACCCACTGTCATCTTCTATCTTGGGACCTCAGGGAAGGG880AACCAGTACTGGTGGTAGCCAATATGGGCAGACATTAGGA920AATTGGGGTCTTCATACTGCTTCTCAGATGTGCAAACTGA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。