基因總覽
MRPL10 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 mitochondrial ribosomal protein L10。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 17q21.32。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000351111 ★ | 47,823,272–47,831,541 | 5 |
| ENST00000290208 | 47,823,272–47,829,673 | 5 |
| ENST00000414011 | 47,823,272–47,831,534 | 6 |
| ENST00000928398 | 47,823,272–47,831,541 | 5 |
| ENST00000959995 | 47,823,272–47,831,541 | 5 |
| ENST00000975067 | 47,823,272–47,831,541 | 4 |
| ENST00000975068 | 47,823,272–47,831,541 | 5 |
| ENST00001092582 | 47,823,272–47,831,541 | 6 |
顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>MRPL10 ENST00000351111 GRCh38 chr17:47831441-47832541 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter AGTTTATTTTTATTTTTTAGAGATAGGATTCTGTCTCTATTGCCCAGGCTGGTCTCAAACTCCTGGGCTC AAGTGATCCTCCTGCCTCAGCCTCCCAAAGTGGTGGGTGTGTAGGAGAGAGGTGAACACGGCCTTATCTA AGACAGTTGAGTGAGGATGGTGAAAAAGAAATGGAATTATTTTGAAGAAGGGAAAATCAGCTGGGCATTA CCACTGATTGAATGTGTGGAGTAAGGAGAGAAACAAAGATCAGTTGACAAATCAGTACACGTCAGGGACC TGGTCATCCTGAGTGTTTCAGCCTTCTAGCACCCCTTTTCTCCCCCATGCACTCACATCTTCTCTGACAG TTCCCCATCTTCAGGGAAAGTCAAGTTCCGCTTAGTGATAAGGGCTTCAGTGATGCAGACGCCCCCTTCC TCTGGACCCTGGGCTGACTTCCCTGTGAAAAGATGAGTCCAACTGTGACACTTCCTCACTCTTGGAGGCC TTACCCCGCTGTTTTCCAACTGCTCTACCCACCGTCCCACCTCCCTACTCACCTCCAGACATGATCTAAA ATAAAAGGCTGCTGGTCTGAGGCGGGAGAGGAACGAAAAGAGAGGTCTTGGCGGCCCCTAAGGATGGCAG AACTCAGGATGGCAGGAGGAGAGAGAAACTCAGAGACTTAGGAGAGGAGGAAAGGGGGTTGATTCAGAGA AAATTGCTGGGGTGAGGTCGAAGAAAACAGTAAATTGATGTGAAGGGTCTGGAGTTTGAGGGGTGTGGAG GGGCTTTGCTGGCAGCAAGCTGGGGTGTTGTGGGCAGGAATGGTTGAGAAAGGAGCAGTTCCTAGGAAGC CGGAGTCGTTGCTAAGAGACTGGACGCCGAGTGGGGAGGTAAAGGCGGGCTCCGTTGGCCCGGCCTAGCG CATGCGTCTTACGGCTACAGCCGGCGGGTACGCCCACTGCTTCCGGCCCCGGGGTTCGCTACCCCACAAT CCTTAGCTCTTTCCGTCTCCACTCGGCTTCCGTCCATTCTTCCGGTGGAGATGGCTGCGGCCGTGGCGGG GATGCTGCGAGGGGGTCTCCTGCCCCAGGCGGGTAAGGAGTGGCCCAGGTC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MRPL10_1 ↗ | 17:47,831,523 | 負股 | 47,831,513–47,831,572 |
| MRPL10_2 ↗ | 17:47,837,731 | 負股 | 47,837,721–47,837,780 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR17_BCHB2 · enhancer · 47830782–47831523 · regulatory
ENSR17_5F8QH5 · CTCF_binding_site · 47831061–47831082 · regulatory
ENSR17_83DZ7B · promoter · 47831524–47831680 · regulatory
ENSR17_5F8QN2 · CTCF_binding_site · 47832116–47832137 · regulatory
· motif · 47829575–47829586 · motif
· motif · 47829956–47829970 · motif
· motif · 47829956–47829970 · motif
· motif · 47829963–47829974 · motif
· motif · 47830825–47830836 · motif
· motif · 47831063–47831079 · motif
· motif · 47831490–47831507 · motif
· motif · 47831516–47831525 · motif
· motif · 47831585–47831594 · motif
· motif · 47831624–47831635 · motif
· motif · 47831624–47831635 · motif
· motif · 47832118–47832134 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:261 aa
MRPL10 的產物屬於 universal ribosomal protein uL10 家族,含有粒線體轉運胜肽,位置在胺基酸 1–28。蛋白質全長 261 個胺基酸;第 242–261 位被註記為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 6 個夥伴
- ACTN2P35609 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FAM9BQ8IZU0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- KLHL12Q53G59 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PNMA1Q8ND90 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RELQ04864 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TCF4P15884 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
MRPL10 是粒線體大型核糖體次單元(mt-LSU)的組成成分。哺乳類成熟的 55S 粒線體核糖體由 28S 小次單元與 39S 大次單元組成;大型次單元含有 16S 粒線體 rRNA、粒線體纈胺酸轉運 RNA,以及 52 種蛋白質。uL10m 的一個半胱胺酸殘基與 mL66 共同構成鋅結合位點。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 交互作用 | MRPL10 是粒線體大型核糖體次單元(mt-LSU)的組成成分。哺乳類成熟的 55S 粒線體核糖體包含 28S 小次單元與 39S 大次單元;後者含有 16S 粒線體 rRNA、粒線體纈胺酸轉運 RNA及 52 種蛋白質。uL10m 以一個半胱胺酸殘基與 mL66 共同形成鋅結合位點。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the mitochondrial large ribosomal subunit (mt-LSU). Mature mammalian 55S mitochondrial ribosomes consist of a small (28S) and a large (39S) subunit. The 28S small subunit contains a 12S ribosomal RNA (12S mt-rRNA) and 30 different proteins. The 39S large subunit contains a 16S rRNA (16S mt-rRNA), a copy of mitochondrial valine transfer RNA (mt-tRNA(Val)), which plays an integral structural role, and 52 different proteins. uL10m contributes a single cysteine residue to a zinc-binding site with mL66 PMID 25278503 ↗ · PMID 25838379 ↗ · PMID 28892042 ↗ · PMID 35177605 ↗ · PMID 11551941 ↗ |
| 細胞定位 | MRPL10 定位於粒線體。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
ACTCGGCTTCCGTCCATTCTTCCGGTGGAGATGGCTGCGG40CCGTGGCGGGGATGCTGCGAGGGGGTCTCCTGCCCCAGGC80GGGCCGGCTGCCTACCCTCCAGACTGTCCGCTATGGCTCC120AAGGCTGTTACCCGCCACCGTCGTGTGATGCACTTTCAGC160GGCAGAAGCTGATGGCTGTGACTGAATATATCCCCCCGAA200ACCAGCCATCCACCCATCATGCCTGCCATCTCCTCCCAGC240CCCCCACAGGAGGAGATAGGCCTCATCAGGCTTCTCCGCC280GGGAGATAGCAGCAGTTTTCCAGGACAACCGAATGATAGC320CGTCTGCCAGAATGTGGCTCTGAGTGCAGAGGACAAGCTT360CTTATGCGACACCAGCTGCGGAAACACAAGATCCTGATGA400AGGTCTTCCCCAACCAGGTCCTGAAGCCCTTCCTGGAGGA440TTCCAAGTACCAAAATCTGCTGCCCCTTTTTGTGGGGCAC480AACATGCTGCTGGTCAGTGAAGAGCCCAAGGTCAAGGAGA520TGGTACGGATCTTAAGGACTGTGCCATTCCTGCCGCTGCT560AGGTGGCTGCATTGATGACACCATCCTCAGCAGGCAGGGC600TTTATCAACTACTCCAAGCTCCCCAGCCTGCCCCTGGTGC640AGGGGGAGCTTGTAGGAGGCCTCACCTGCCTCACAGCCCA680GACCCACTCCCTGCTCCAGCACCAGCCCCTCCAGCTGACC720ACCCTGTTGGACCAGTACATCAGAGAGCAACGCGAGAAGG760ATTCTGTCATGTCGGCCAATGGGAAGCCAGATCCTGACAC800TGTTCCGGACTCGTAGCCAGCCTGTTTAGCCAGCCCTGCG840CATAAATACACTCTGCGTTATTGGCTGTGCTCTCCTCAAT880GGGACATGTGGAAGAACTTGGGGTCGGGGAGTGTGTTTGT920CACTTGGTTTTCACTAGTAATGATATTGTCAGGTATAGGG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。