基因總覽
MRPL1 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 mitochondrial ribosomal protein L1。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 4q21.1。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000315567 ★ | 77,862,830–77,952,785 | 9 |
| ENST00000865377 | 77,862,139–77,952,791 | 9 |
| ENST00000865378 | 77,862,139–77,952,791 | 9 |
| ENST00000865379 | 77,862,139–77,952,791 | 8 |
| ENST00000915229 | 77,862,139–77,952,791 | 8 |
| ENST00000915230 | 77,862,139–77,952,791 | 7 |
| ENST00001118863 | 77,862,139–77,879,449 | 3 |
| ENST00001138646 | 77,862,139–77,952,791 | 9 |
| ENST00000502384 | 77,883,239–77,952,749 | 6 |
顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>MRPL1 ENST00000315567 GRCh38 chr4:77861830-77862930 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GGTAGATTGTATGCTATGTAAATTATATCTCAAAACTGTTTAAAAGAAACACAGCCTGAGGCGAAATCTT TAAAAAGTTACCTAGGTGATGTAGGGTACGGTACACACGAAGCAGAGAAGATAGAATGAACCAAGTTATG GAGGTGAGAAACGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTGTGGGGGAGGTAAGCTG GGAAGTGATAAAATCCGTAATCAGATTTGTTTTAGATAAACCACACCGACAGCTGTGACGTAATGGAAAG TACACTCATTCTGTTTTGTTTTTGTTTTTTTTTCCTATCAGAATAACTTGTGCGTGGGTCTTGGAGCTGC CATTTTAAAACTAGAAATGTTTTATAAATGTCAAGTATTATTATTCAATTGATCCTAATGGTAAGTCTAC TCGCTTGCCAGCAGGGGGTAAATGTAGAGATTAATTTAAGATTTTAAAGCTAAGGTTGATCTTGCGCTGA CAGAAAGTTTGACAATTAGCAAAAAAAGTTTGTCAGTGAGTTGGACACCTCCCTCGGGTAGCGGCGAAAA CGCCTAGAGAATTTTTAAAATAAGTCTTTCCAAGGCCGGAAAAGTGGCGGAGGAAGCTAGTGGGTTTCAG GGTTCCTGTTTTTCAAGATTTTACGTTGGGTATTAAGTACTCTCACAGCCTGTTAAAATTGTCGCTCTGA GTACACTTGCAGGATCAAAAAAGAAAAAGAATAAGAAGGAAGGATTAAAATAATCACAGCATCGCCAACA GGATCGTATTTTCCCGAAGGTGGTTAACCAGCCATACCGGAACCACGAAACACACAGGGTCCTGGGCAAC ACGGAGGACTAACAGTAACACCGCCACGCCGGCAGCAAAGCTCATTTTGGTCCCCGCCCCGTTCCTCTTT CTCTTTTTAACTCCTTCCCTCTTTGCGGATTCTAGAACGGAACCTTTTTTTAATTCTTCCCAGTAGAAAC GTAGGAACAATTTCGTGAACGCAATCCGGAGTGCCCAACATGGCGGCGGCCGTAAGGTGCATGGGTAGAG GTAAGGCGAGGGGTTGTCTTGCAGGGGAAATGGCTCTGGCACCGAGTCTCT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 3 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MRPL1_3 ↗ | 4:77,861,785 | 正股 | 77,861,736–77,861,795 |
| MRPL1_2 ↗ | 4:77,862,149 | 正股 | 77,862,100–77,862,159 |
| MRPL1_1 ↗ | 4:77,862,837 | 正股 | 77,862,788–77,862,847 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR4_5NBGTF · CTCF_binding_site · 77862253–77862274 · regulatory
ENSR4_935WFN · promoter · 77862340–77862840 · regulatory
ENSR4_BKG7X · enhancer · 77862841–77863811 · regulatory
· motif · 77861688–77861699 · motif
· motif · 77861970–77861982 · motif
· motif · 77862077–77862085 · motif
· motif · 77862077–77862094 · motif
· motif · 77862085–77862098 · motif
· motif · 77862092–77862105 · motif
· motif · 77862092–77862105 · motif
· motif · 77862255–77862271 · motif
· motif · 77862459–77862472 · motif
· motif · 77862635–77862644 · motif
· motif · 77862639–77862654 · motif
· motif · 77862639–77862656 · motif
· motif · 77862720–77862730 · motif
· motif · 77862728–77862741 · motif
· motif · 77862825–77862840 · motif
· motif · 77862847–77862857 · motif
· motif · 77862898–77862909 · motif
· motif · 77862982–77862997 · motif
· motif · 77863010–77863020 · motif
· motif · 77863167–77863182 · motif
· motif · 77866247–77866262 · motif
· motif · 77866270–77866285 · motif
· motif · 77866275–77866287 · motif
· motif · 77866278–77866285 · motif
· motif · 77866557–77866569 · motif
· motif · 77866560–77866567 · motif
· motif · 77866566–77866578 · motif
· motif · 77866569–77866576 · motif
· motif · 77866569–77866584 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：325 aa
MRPL1 蛋白全長為 325 個胺基酸，N 端第 1 至 50 位胺基酸被註記為粒線體轉運胜肽；其家族歸屬為 universal ribosomal protein uL1 family。
蛋白質三維結構
細胞內定位
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- GOPCQ9HD26 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- SPAG16Q8N0X2-4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- VPS52Q8N1B4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
MRPL1 是粒線體大型核糖體次單元（mt-LSU）的組成成分。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體由 28S 小型次單元與 39S 大型次單元構成；前者含 12S mt-rRNA 和 30 種蛋白質，後者含 16S mt-rRNA、具結構作用的 mt-tRNA(Val)，以及 52 種蛋白質。來源支持 MRPL1 屬於大型次單元，未指出其與特定分子的直接結合關係。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 交互作用 | MRPL1 是粒線體大型核糖體次單元（mt-LSU）的組成成分。成熟哺乳類 55S 粒線體核糖體分為 28S 小型與 39S 大型次單元；小型次單元含 12S mt-rRNA 和 30 種蛋白質，大型次單元含 16S mt-rRNA、具結構作用的 mt-tRNA(Val)及 52 種蛋白質。 | 推論支持 | 證據與來源Component of the mitochondrial large ribosomal subunit (mt-LSU). Mature mammalian 55S mitochondrial ribosomes consist of a small (28S) and a large (39S) subunit. The 28S small subunit contains a 12S ribosomal RNA (12S mt-rRNA) and 30 different proteins. The 39S large subunit contains a 16S rRNA (16S mt-rRNA), a copy of mitochondrial valine transfer RNA (mt-tRNA(Val)), which plays an integral structural role, and 52 different proteins PMID 11279069 ↗ · PMID 25278503 ↗ |
| 細胞定位 | MRPL1 的細胞內定位為粒線體；此註記僅提供其所在位置，未進一步說明定位條件、異構型差異或動態變化。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
GCAATCCGGAGTGCCCAACATGGCGGCGGCCGTAAGGTGC40ATGGGTAGAGCCTTGATACATCATCAAAGGCATAGCCTTT80CCAAGATGGTTTATCAGACATCACTTTGTTCTTGTTCTGT120AAACATCCGAGTGCCCAACAGACATTTTGCTGCTGCTACA160AAGTCTGCAAAGAAAACAAAAAAAGGTGCTAAAGAAAAAA200CACCAGATGAGAAAAAAGATGAAATAGAAAAAATAAAAGC240ATATCCCTATATGGAAGGCGAACCTGAGGATGATGTCTAT280TTAAAACGCTTATACCCGAGACAGATATATGAGGTGGAGA320AAGCTGTTCACTTACTTAAGAAATTTCAAATTCTTGACTT360TACTAGTCCAAAGCAAAGTGTTTATCTTGATTTGACACTG400GATATGGCACTGGGAAAGAAGAAAAACGTGGAGCCATTTA440CCAGTGTTCTTAGTTTGCCATACCCATTTGCTTCCGAAAT480CAATAAAGTTGCTGTATTTACAGAGAATGCATCAGAGGTC520AAAATAGCGGAAGAAAATGGAGCTGCATTTGCAGGAGGCA560CTAGTCTGATACAGAAGATTTGGGATGATGAAATTGTTGC600AGACTTTTACGTAGCTGTTCCAGAAATAATGCCTGAACTT640AATCGATTAAGGAAGAAACTGAATAAAAAATATCCAAAGC680TTTCTCGAAATTCCATTGGCCGTGACATCCCCAAAATGCT720TGAATTATTTAAAAATGGACATGAAATTAAGGTAGATGAA760GAAAGGGAGAACTTTCTCCAGACCAAAATAGCAACATTGG800ATATGTCAAGTGACCAGATAGCTGCCAATCTGCAAGCAGT840TATTAATGAAGTTTGTAGGCACAGACCGCTGAATTTGGGT880CCCTTTGTGGTACGTGCTTTCCTTCGTAGTTCAACAAGTG920AAGGTTTATTACTGAAGATTGATCCATTGTTGCCTAAAGA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。