基因總覽
MRAP 是一個蛋白質編碼基因,產物名稱為 melanocortin 2 receptor accessory protein,屬於 MRAP 家族。這種膜蛋白是 melanocortin receptors 的調節因子,與多種受體互作。其蛋白質含有一段跨膜區,並具有多段預測為無序的區域;這些結構特徵構成其膜相關蛋白質的基本輪廓。MRAP 的特色在於同時涉及受體調節與膜運輸相關功能,尤其與 MC2R 在腎上腺細胞中的定位及訊號反應有關。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000303645 ★ | 32,298,855–32,312,290 | 3 |
| ENST00000399784 | 32,291,813–32,314,781 | 5 |
| ENST00000961467 | 32,298,850–32,312,286 | 3 |
| ENST00001097199 | 32,298,850–32,314,781 | 3 |
| ENST00001125455 | 32,298,850–32,314,781 | 2 |
| ENST00001131527 | 32,298,850–32,314,781 | 3 |
| ENST00000339944 | 32,298,972–32,314,784 | 3 |
顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
MRAP 是 melanocortin receptors 的調節蛋白,可作用於 MC1R、MC2R、MC3R、MC4R 與 MC5R。它能提高這些受體對配體的敏感性,並增強受體所促進的 cAMP 生成,因而調節受體活化後的訊號輸出。來源將其描述為受體活性的調節因子,未指出所有受體上的作用是否完全相同。
在腎上腺細胞中,MRAP 對 MC2R 具有兩項必要作用:協助受體運送至細胞表面,以及支持細胞對促腎上腺皮質激素(ACTH)的訊號反應。這表示 MRAP 的功能不只涉及受體抵達細胞表面的運輸步驟,也關係到 MC2R 對 ACTH 刺激的反應能力。來源未進一步限定這些作用所需的分子步驟。
此外,MRAP 可能參與脂肪細胞中的細胞內運輸途徑。此項描述屬於可能的功能,資料並未交代具體運輸標的或調控方式,因此不能據此認定其在脂肪細胞中的作用細節。整體而言,已提供的功能資訊聚焦於 melanocortin receptors 的配體敏感性與 cAMP 訊號,以及 MC2R 在腎上腺細胞中的表面運輸和 ACTH 反應。
Promoter 與基因調控
>MRAP ENST00000303645 GRCh38 chr21:32297855-32298955 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TCAAAGTGCTCCCCAAGGAATGCCTCAGGCGTGGCAGGCCTCAGCAAAACCAGCGGAGGGGCTCAAGTTA TCTGGGTGGACTGTCTACACTGTCAATACCCAGGTTTACTCTGATACTGTAGACCTGAATCAAGAACACA AGAAAGCTGGGCGTATTGGAGGGAAAGGCCATGTAAGCCGTGTGTTTTGGCCTCCTAATTCTCAAAGGCT AAATTCTAGGGTTCCTCTCACCTGTGGTCCTGCTCATTCCAGATGTTCAGAATGTTCCTCTTGTTAGTGT CTGAGGATCTCAGAGGAGGGTGTATAATTTGGAGTCAAGCTCTACAGAAACCCAGAAGAATCTGCGTCAC GTGTGGTATCAGCCAAGAGCTGAGTGGACTCTATTTCCCAAGAGCTTGGACCACATGGGGTTGTGTCAGA GATAAACAGCCTTTTGAGTCTGAACAAATGCAGCCGGCTGGTTGGTTCTTGGGGGGCTTAGATATAAGTG GAGAGGTGCACTCTGTTGGGGCAGGGGGCTCTCTTTTGGTTTTAATTAACTGGCTATGAGTACATGACAG AGGTTTACAAGTTCACGGCTGGCATCACTCGATTTCTGCCCTCAGATATTGAATCTAAGCCAGCAGTTTG GTGGTTGCTCAATAGCATCCAGAATTGCTTAAATGTAAGTCAAGGGCACTGTCGGGCTTACATTTTGGTT CTTTTAACTTTTCAAGTATTTAAGACAAAAAGCGATTGTCTTTCCAGCCCTATTGGGCATCTTCTAAGGG GCCCTGGGCGACTATTTCCCGCCCAGCTCCCTGTCCTCACACAGAGAGGGATCCTAGGGCTGCCCTGGAA AGCCGTTCTCCTGCCTCTCTGCTCTGTGTGCTTTGGAGTTTTATCAAGAAGGGGCAGATGGGAAGCTCTG CTGGATGCTGGCGTTGTGAGACACACCCCCCTGACCTTTCTTCCAGCCAAATAGCTCTGATAAGTGGGCA GACCTTGAGCCTAGAGACCCACAGACACACTTGGACGATTCCTGCAGAAATCAGTGAGGCAGTCTCCTCC CAGGGGCTTGGCGCCTGGCTCGAGGCGAGGCTGCCGGCCCGGACGCTGACT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MRAP_2 ↗ | 21:32,298,855 | 正股 | 32,298,806–32,298,865 |
| MRAP_1 ↗ | 21:32,298,960 | 正股 | 32,298,911–32,298,970 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
· motif · 32298488–32298497 · motif
· motif · 32300308–32300316 · motif
· motif · 32300315–32300323 · motif
· motif · 32300428–32300436 · motif
· motif · 32300539–32300547 · motif
· motif · 32300629–32300637 · motif
· motif · 32300788–32300796 · motif
· motif · 32300915–32300923 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:172 aa
melanocortin 2 receptor accessory protein 長 172 個胺基酸,屬於 MRAP 家族。蛋白質第 38–58 位胺基酸為螺旋型跨膜區;第 105–136 位及第 151–172 位則被註記為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
MRAP 位於細胞膜及內質網膜。 其反向平行同源二聚體與異源二聚體的形成,暗示 N 端與 C 端在不同情境下都可能朝向細胞質側或細胞外側。 胰島素刺激後,MRAP 會重新分布至細胞質中呈斑點狀的結構。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 8 個夥伴
- CHATP28329-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- FGFR3P22607 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MC1RQ01726 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MC2RQ01718 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- MC3RP41968 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MC4RP32245 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MC5RP33032 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MRAP2Q96G30 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
MRAP 可形成反向平行的同源二聚體,也可與 MRAP2 形成異源二聚體;此外,資料指出它與 MC1R、MC2R、MC3R、MC4R 及 MC5R 互作。來源未進一步說明這些受體互作是否代表同一複合體或其功能後果。
疾病與遺傳關聯
影響 MRAP 的變異與 glucocorticoid deficiency 2(GCCD2)相關。此病為罕見的常染色體隱性疾病,特徵包括腎上腺皮質對 ACTH 作用具抗性、腎上腺功能不足及無法產生 cortisol。患者通常在新生兒期或幼年出現低血糖,也可能有生長不良、反覆感染、抽搐或休克;少數患者的低血糖嚴重且持續,可能導致長期神經損傷或死亡。診斷特徵為血漿 cortisol 偏低、ACTH 偏高,且 aldosterone 與血漿 renin 正常。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | MRAP 可調節 MC1R、MC2R、MC3R、MC4R 與 MC5R,提升 melanocortin receptors 對配體的敏感性,並增強受體促進的 cAMP 生成。在腎上腺細胞中,MRAP 對 MC2R 到達細胞表面及其對促腎上腺皮質激素(ACTH)的訊號反應皆不可或缺;此外,它可能參與脂肪細胞的細胞內運輸途徑。 | 含實驗來源 | 證據與來源Modulator of melanocortin receptors (MC1R, MC2R, MC3R, MC4R and MC5R). Acts by increasing ligand-sensitivity of melanocortin receptors and enhancing generation of cAMP by the receptors. Required both for MC2R trafficking to the cell surface of adrenal cells and for signaling in response to corticotropin (ACTH). May be involved in the intracellular trafficking pathways in adipocyte cells PMID 15654338 ↗ · PMID 19329486 ↗ · PMID 20371771 ↗ |
| 交互作用 | MRAP 可形成同源二聚體,也可與 MRAP2 形成異源二聚體;其中同源二聚體及與 MRAP2 的異源二聚體均為反向平行排列。MRAP 另與 MC1R、MC2R、MC3R、MC4R 及 MC5R 互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homodimer and heterodimer. Forms antiparallel homodimers and heterodimers with MRAP2. Interacts with MC1R, MC2R, MC3R, MC4R and MC5R PMID 15654338 ↗ · PMID 19329486 ↗ · PMID 20371771 ↗ |
| 細胞定位 | MRAP 位於細胞膜與內質網膜,且為單次跨膜蛋白。反向平行二聚體的形成暗示其 N 端與 C 端的朝向可能依情境而異,分別可位於細胞質側或細胞外側。受到胰島素刺激後,MRAP 會重新分布至細胞質中呈斑點狀的結構。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cell membrane / Single-pass membrane protein; Endoplasmic reticulum membrane / Single-pass membrane protein; The formation of antiparallel homo- and heterodimers suggest that N- and C-terminus can both localize in the cytoplasmic and extracellular parts, depending on the context. Upon insulin stimulation, it is redistributed into spotty structures throughout the cytoplasm PMID 15654338 ↗ |
| 疾病關聯 | 影響 MRAP 的變異會造成 glucocorticoid deficiency 2(GCCD2),這是一種罕見的常染色體隱性疾病,患者對腎上腺皮質 ACTH 作用具抗性,並有腎上腺功能不足及 cortisol 生成障礙。疾病通常在新生兒期或幼年以低血糖等 cortisol 缺乏症狀出現;少數患者可能因嚴重且持續的低血糖而發生長期神經損傷或死亡。診斷可見低 cortisol、高 ACTH,並有正常的 aldosterone 與血漿 renin。 | 含實驗來源 | 證據與來源Glucocorticoid deficiency 2 GCCD2 A form of glucocorticoid deficiency, a rare autosomal recessive disorder characterized by resistance to ACTH action on the adrenal cortex, adrenal insufficiency and an inability of the adrenal cortex to produce cortisol. It usually presents in the neonatal period or in early childhood with episodes of hypoglycemia and other symptoms related to cortisol deficiency, including failure to thrive, recurrent illnesses or infections, convulsions, and shock. In a small number of patients hypoglycemia can be sufficiently severe and persistent that it leads to serious long-term neurological damage or death. The diagnosis is readily confirmed with a low plasma cortisol measurement in the presence of an elevated ACTH level, and normal aldosterone and plasma renin measurements. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 607398 PMID 15654338 ↗ |
核酸與蛋白質序列
ACAGACACACTTGGACGATTCCTGCAGAAATCAGTGAGGC40AGTCTCCTCCCAGGGGCTTGGCGCCTGGCTCGAGGCGAGG80CTGCCGGCCCGGACGCTGACTGCCCAGTGCCACAGACATG120GCCAACGGGACCAACGCCTCTGCCCCATACTACAGCTATG160AATACTACCTGGACTATCTGGACCTCATTCCCGTGGACGA200GAAGAAGCTGAAAGCCCACAAACATTCCATCGTGATCGCA240TTCTGGGTGAGCCTGGCTGCCTTCGTGGTGCTGCTCTTCC280TCATCTTGCTCTACATGTCCTGGTCCGCCTCCCCGCAGAT320GAGGAACAGCCCCAAGCACCACCAAACATGCCCCTGGAGT360CACGGCCTCAACCTCCACCTCTGCATCCAGAAGTGCCTGC400CGTGCCACAGGGAACCCCTGGCAACCTCACAGGCTCAGGC440GAGCTCAGTGGAGCCAGGGAGCAGAACTGGCCCTGACCAG480CCGCTACGACAGGAGAGCTCCTCCACCTTGCCCCTCGGGG520GTTTCCAGACCCACCCCACTCTCCTCTGGGAACTGACCCT560CAATGGGGGTCCCCTCGTCAGGAGCAAGCCCAGCGAGCCT600CCCCCTGGAGACAGGACCTCTCAATTGCAGAGCTGATGTC640AGTAAATCGTGGCCATAGCTGAGTGAACTGGTGAAATCAA680GCCAACCTGGACACATACGTTCCTCGTTCTTCTTAGAGGC720CATTTGCATGTAGCAGAAAGGGCACCTAGGTCAAGTGCAA760CTAGAGCAGGAGCATCCTATGCCTTTGACAAAGATTGCAG800TGGCCCCTCGAGTGCAGAGGTCATCCCAGGTGTTGCTGAG840TTTATTGAGCACACCTAGCCTGCTTGCTTACTGCTTATAT880TTGCTCAGGGAAGAGTAGGAAAATAAAATATATGCAAATC920AAGAGGAAAA930cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。