基因總覽
MPPED2(metallophosphoesterase domain containing 2)是人類的蛋白質編碼基因,產物名稱為 Metallophosphoesterase domain-containing protein 2。其蛋白質屬於 UPF0046 family。現有資料指出,該蛋白質在體外具有低度 metallophosphoesterase 活性,並可能參與神經系統發育;目前提供的資料未描述其序列長度或其他結構特色。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000358117 ★ | 30,410,224–30,586,353 | 7 |
| ENST00000448418 | 30,384,493–30,586,693 | 7 |
| ENST00000904185 | 30,410,071–30,584,781 | 7 |
| ENST00000904183 | 30,410,224–30,586,927 | 7 |
| ENST00000904186 | 30,410,224–30,584,774 | 7 |
| ENST00000904187 | 30,410,224–30,584,760 | 7 |
| ENST00001143977 | 30,410,224–30,586,693 | 7 |
| ENST00000904184 | 30,410,227–30,586,693 | 7 |
| ENST00000943647 | 30,410,227–30,584,781 | 7 |
| ENST00001037681 | 30,410,229–30,586,693 | 6 |
| ENST00000943646 | 30,410,956–30,585,988 | 7 |
| ENST00000528686 | 30,536,059–30,586,872 | 3 |
顯示 12/14 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
MPPED2 的蛋白質產物在體外顯示低度 metallophosphoesterase 活性。這項觀察指出其具有相關酵素活性,但現有資料未進一步說明活性所作用的底物、反應機制或該活性在細胞內的情形,因此不宜據此推定其體內作用方式。
此外,MPPED2 可能參與神經系統發育。此處的資料僅支持其可能具有這項角色,未指出參與發育的具體階段、作用途徑或影響,也未提供可將此發育角色與體外酵素活性直接連結的資訊。
Promoter 與基因調控
>MPPED2 ENST00000358117 GRCh38 chr11:30586253-30587353 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CATAACATCACAGGGCCACCTCATCTTTCACAGACAACCCTGCCAACCAAGTTTTCTAAAAGCCTTCTCT CCCTTGTTTTCTGTCTTCCAGCATTTCAGCGGCATTTCCTTTCCTTGTGTTGTTTGTACAAAATTCTGAA AACCTTTTCTTCCATTTTCCAAAGTAGCAGACAAAACTGGACTAAGTTTGATTTTTAAAATGCTTTTGAC ATGCTTATCTTTTGGGGAAAATTTTATCCAAAAGACGAAAATGGAAACAATTAGAGTCTTTGCCTCTCCT CACCTTCCTGTCCTGAATCTGCCTTAATTCATGGAGGTAAAAAAAATGATCAGCTGGGTTGGCCTTTTCT TTCTCAGCAACATTGCAGAGAGAAAGAGGTGAGTGTGTGAGTGAGTGAGTGAGCGTGTGTGTGTGTGTGT GTGTCTGTCGTGTTGAAAGGCTTGGGGAAAAAGGAGCACAGCTCTCCCCCAGGAAAGCCTCAGATCAGCA GATGGGAGGGAACCTAGGGTCGCCTTCCTAGGTCTGAGCGAAGTGTCCCAGCCGCTCCCCTTACCCCTGC GGTGAGCCCTGCGTCCTGGAACGGTGCCAGGACTCCTGACAGAGCCTGGCAGGTCGGTGGGTGGCGGGGA GCTGGGTGTTCTCTTTGCAGAAGAACACCATTTGGGAGAAAGCTCCCTTCTTTTCCTGGGGCACCGTAGC CCGCCTTCCTTCCCCTATCATTTTTTACGCAGATCGCACTCATGATGATGAACTTGCAGCTCAGCTTCCT GCCGCCTGCTTGACCCGGGAGCACCAGCAGGCTACCGGGCCTCGCCCTCGGCTCCCTCCTCCTCTCGAAA CCCTGGGGCTTCGGGGCACCGGTGGGGGTCCGAGTGGGCAGGGACTGCGGGAGGGGCGTGCAGGGGCGCG GGGTCCCGCCGGGGAGCGCGCACGGAGCGGCGCCTCGGCCGCCCTGCTTCCTGGAGCTGTGCTCCTTTGA CCCCAGTGGCAGTCCCTGTCACTGCACCGCTCGCTCTCCCTCCGGCTCGCCGCGCCCTCGCTCCCTCTCC TCGCCCCCTCGCTCGCTCTCTCCCCAGATCGAGGCTGCTCGGGTCCTTTCT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MPPED2_2 ↗ | 11:30,584,200 | 負股 | 30,584,190–30,584,249 |
| MPPED2_1 ↗ | 11:30,586,353 | 負股 | 30,586,343–30,586,402 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR11_9G5QH · promoter · 30583715–30584055 · regulatory
ENSR11_9G5QT · promoter · 30584914–30585414 · regulatory
ENSR11_B83W2 · enhancer · 30585415–30586270 · regulatory
ENSR11_5978JX · CTCF_binding_site · 30586228–30586249 · regulatory
ENSR11_B83W5 · promoter · 30586271–30586843 · regulatory
· motif · 30582035–30582049 · motif
· motif · 30582035–30582049 · motif
· motif · 30586230–30586246 · motif
· motif · 30586368–30586380 · motif
· motif · 30586370–30586377 · motif
· motif · 30586370–30586385 · motif
蛋白質結構域與序列
蛋白質三維結構
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 11 個夥伴
- BEX4Q9NWD9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CAGE1Q8TC20 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- FAM72AQ5TYM5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HOOK2Q96ED9-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MBD3L1Q8WWY6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- NUP93Q8N1F7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- POMPQ9Y244 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RIBC1Q8N443 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RXRGP48443 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- TRIP13Q15645 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- VAC14Q08AM6 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
MPPED2 形成 homodimer。現有資料未提供其他互作對象或複合體資訊。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
ACTGCACCGCTCGCTCTCCCTCCGGCTCGCCGCGCCCTCG40CTCCCTCTCCTCGCCCCCTCGCTCGCTCTCTCCCCAGATC80GAGGCTGCTCGGGTCCTTTCTCCCCCCGCCTCCCTCTAGC120GCCGCGCCCCCTGGCCCCCAGCCCCAGCCTGCGGCGGGAC160CTCCGGGGTCGAAGGTTCTGGCCCGCTCGCGCCCCTCGCC200GCCCCCGCGCGCCCCCAGCGCTCCTCCAGCCGGCTCGGGC240CGCTCGGCTATGGATCGCCTGCTCGCCGGGCGCTGAAGGC280ATCCCCGGGATCCGGAGCGCAGCCCGGGAAAGAAATGCAC320AGCGGTATTGATGAGTAGATCCTTGGATTCAGAGGTTGGC360TGAAACGCACCATGCCTGCTTCCATCTTTTGCTCTGTAAA400GTTGTGAATTGCTCATGCCTATAGGGAGGAAGGATGGCAC440ATGGGATTCCTTCTCAAGGCAAAGTTACCATAACGGTGGA480TGAGTACAGCTCAAACCCCACCCAGGCATTCACGCACTAC520AACATCAACCAGAGCAGATTCCAGCCTCCACATGTACATA560TGGTCGACCCCATCCCATATGACACTCCAAAACCAGCGGG600CCACACGCGGTTTGTCTGCATCTCAGACACACACTCCAGA640ACAGATGGTATCCAGATGCCTTATGGGGACATCCTTCTCC680ACACAGGCGATTTCACCGAGCTGGGACTGCCCTCAGAGGT720TAAGAAGTTTAATGACTGGTTAGGAAACCTGCCATATGAA760TATAAAATAGTGATTGCTGGGAATCATGAACTGACATTTG800ATAAGGAATTCATGGCAGACCTTGTTAAACAGGACTACTA840CCGTTTCCCCTCTGTGTCCAAATTGAAACCAGAGGACTTT880GACAATGTTCAGTCCCTCCTGACAAACAGTATTTACTTAC920AAGATTCGGAGGTAACAGTGAAGGGATTCAGGATATACGG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。