演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

MPPED2239FB

metallophosphoesterase domain containing 2

MPPED2(metallophosphoesterase domain containing 2)是蛋白質編碼基因,其產物體外具有低度 metallophosphoesterase 活性,並可能參與神經系統發育。

Homo sapiens11p14.1UniProt Q15777
OFFICIAL SYMBOL
MPPED2
CHROMOSOME
11
UNIPROT
Q15777
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

MPPED2(metallophosphoesterase domain containing 2)是人類的蛋白質編碼基因,產物名稱為 Metallophosphoesterase domain-containing protein 2。其蛋白質屬於 UPF0046 family。現有資料指出,該蛋白質在體外具有低度 metallophosphoesterase 活性,並可能參與神經系統發育;目前提供的資料未描述其序列長度或其他結構特色。

Official symbol
MPPED2
Gene name
metallophosphoesterase domain containing 2
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1180
UniProt
Q15777
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
239FBD11S302EHs.46638FAM1BdJ873F21.1dJ1024C24.1C11orf8

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1111p14.1
chr11 · 135,086,622 bp · GRCh38chr11p15.5 · 1–2800000 · gnegchr11p15.4 · 2800001–11700000 · gpos50chr11p15.3 · 11700001–13800000 · gnegchr11p15.2 · 13800001–16900000 · gpos50chr11p15.1 · 16900001–22000000 · gnegchr11p14.3 · 22000001–26200000 · gpos100chr11p14.2 · 26200001–27200000 · gnegchr11p14.1 · 27200001–31000000 · gpos75chr11p13 · 31000001–36400000 · gnegchr11p12 · 36400001–43400000 · gpos100chr11p11.2 · 43400001–48800000 · gnegchr11p11.12 · 48800001–51000000 · gpos75chr11p11.11 · 51000001–53400000 · acenchr11q11 · 53400001–55800000 · acenchr11q12.1 · 55800001–60100000 · gpos75chr11q12.2 · 60100001–61900000 · gnegchr11q12.3 · 61900001–63600000 · gpos25chr11q13.1 · 63600001–66100000 · gnegchr11q13.2 · 66100001–68700000 · gpos25chr11q13.3 · 68700001–70500000 · gnegchr11q13.4 · 70500001–75500000 · gpos50chr11q13.5 · 75500001–77400000 · gnegchr11q14.1 · 77400001–85900000 · gpos100chr11q14.2 · 85900001–88600000 · gnegchr11q14.3 · 88600001–93000000 · gpos100chr11q21 · 93000001–97400000 · gnegchr11q22.1 · 97400001–102300000 · gpos100chr11q22.2 · 102300001–103000000 · gnegchr11q22.3 · 103000001–110600000 · gpos100chr11q23.1 · 110600001–112700000 · gnegchr11q23.2 · 112700001–114600000 · gpos50chr11q23.3 · 114600001–121300000 · gnegchr11q24.1 · 121300001–124000000 · gpos50chr11q24.2 · 124000001–127900000 · gnegchr11q24.3 · 127900001–130900000 · gpos50chr11q25 · 130900001–135086622 · gnegMPPED2pq1 bp135,086,622 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr11:30,384,493–30,586,927
Gene span
202,435 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000358117 ★30,410,224–30,586,3537
ENST0000044841830,384,493–30,586,6937
ENST0000090418530,410,071–30,584,7817
ENST0000090418330,410,224–30,586,9277
ENST0000090418630,410,224–30,584,7747
ENST0000090418730,410,224–30,584,7607
ENST0000114397730,410,224–30,586,6937
ENST0000090418430,410,227–30,586,6937
ENST0000094364730,410,227–30,584,7817
ENST0000103768130,410,229–30,586,6936
ENST0000094364630,410,956–30,585,9887
ENST0000052868630,536,059–30,586,8723

顯示 12/14 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

MPPED2 的蛋白質產物在體外顯示低度 metallophosphoesterase 活性。這項觀察指出其具有相關酵素活性,但現有資料未進一步說明活性所作用的底物、反應機制或該活性在細胞內的情形,因此不宜據此推定其體內作用方式。

此外,MPPED2 可能參與神經系統發育。此處的資料僅支持其可能具有這項角色,未指出參與發育的具體階段、作用途徑或影響,也未提供可將此發育角色與體外酵素活性直接連結的資訊。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 30586353 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>MPPED2 ENST00000358117 GRCh38 chr11:30586253-30587353 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CATAACATCACAGGGCCACCTCATCTTTCACAGACAACCCTGCCAACCAAGTTTTCTAAAAGCCTTCTCT
CCCTTGTTTTCTGTCTTCCAGCATTTCAGCGGCATTTCCTTTCCTTGTGTTGTTTGTACAAAATTCTGAA
AACCTTTTCTTCCATTTTCCAAAGTAGCAGACAAAACTGGACTAAGTTTGATTTTTAAAATGCTTTTGAC
ATGCTTATCTTTTGGGGAAAATTTTATCCAAAAGACGAAAATGGAAACAATTAGAGTCTTTGCCTCTCCT
CACCTTCCTGTCCTGAATCTGCCTTAATTCATGGAGGTAAAAAAAATGATCAGCTGGGTTGGCCTTTTCT
TTCTCAGCAACATTGCAGAGAGAAAGAGGTGAGTGTGTGAGTGAGTGAGTGAGCGTGTGTGTGTGTGTGT
GTGTCTGTCGTGTTGAAAGGCTTGGGGAAAAAGGAGCACAGCTCTCCCCCAGGAAAGCCTCAGATCAGCA
GATGGGAGGGAACCTAGGGTCGCCTTCCTAGGTCTGAGCGAAGTGTCCCAGCCGCTCCCCTTACCCCTGC
GGTGAGCCCTGCGTCCTGGAACGGTGCCAGGACTCCTGACAGAGCCTGGCAGGTCGGTGGGTGGCGGGGA
GCTGGGTGTTCTCTTTGCAGAAGAACACCATTTGGGAGAAAGCTCCCTTCTTTTCCTGGGGCACCGTAGC
CCGCCTTCCTTCCCCTATCATTTTTTACGCAGATCGCACTCATGATGATGAACTTGCAGCTCAGCTTCCT
GCCGCCTGCTTGACCCGGGAGCACCAGCAGGCTACCGGGCCTCGCCCTCGGCTCCCTCCTCCTCTCGAAA
CCCTGGGGCTTCGGGGCACCGGTGGGGGTCCGAGTGGGCAGGGACTGCGGGAGGGGCGTGCAGGGGCGCG
GGGTCCCGCCGGGGAGCGCGCACGGAGCGGCGCCTCGGCCGCCCTGCTTCCTGGAGCTGTGCTCCTTTGA
CCCCAGTGGCAGTCCCTGTCACTGCACCGCTCGCTCTCCCTCCGGCTCGCCGCGCCCTCGCTCCCTCTCC
TCGCCCCCTCGCTCGCTCTCTCCCCAGATCGAGGCTGCTCGGGTCCTTTCT
MPPED2 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
MPPED2_2 ↗11:30,584,200負股30,584,190–30,584,249
MPPED2_1 ↗11:30,586,353負股30,586,343–30,586,402

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR11_9G5QH · promoter · 30583715–30584055 · regulatory

ENSR11_9G5QT · promoter · 30584914–30585414 · regulatory

ENSR11_B83W2 · enhancer · 30585415–30586270 · regulatory

ENSR11_5978JX · CTCF_binding_site · 30586228–30586249 · regulatory

ENSR11_B83W5 · promoter · 30586271–30586843 · regulatory

· motif · 30582035–30582049 · motif

· motif · 30582035–30582049 · motif

· motif · 30586230–30586246 · motif

· motif · 30586368–30586380 · motif

· motif · 30586370–30586377 · motif

· motif · 30586370–30586385 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:294 aa

MPPED2 蛋白質屬於 UPF0046 family。現有資料未提供更詳細的結構域、功能區域或序列註解。

07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q15777…

AlphaFold · Q15777

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 11 個夥伴 · 最多顯示 50 個
239FBMPPED2BEX4CAGE1FAM72AHOOK2MBD3L1NUP93POMPRIBC1RXRGTRIP13VAC14
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 11 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

MPPED2 形成 homodimer。現有資料未提供其他互作對象或複合體資訊。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能MPPED2 的蛋白質產物在體外具有低度 metallophosphoesterase 活性;此外,它可能參與神經系統發育。資料未進一步說明其底物、細胞內活性或在神經系統發育中的具體作用。推論支持
證據與來源

Displays low metallophosphoesterase activity (in vitro). May play a role in the development of the nervous system

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用Homodimer推論支持
證據與來源

Homodimer

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000358117 · 2,562 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ACTGCACCGCTCGCTCTCCCTCCGGCTCGCCGCGCCCTCG40
41CTCCCTCTCCTCGCCCCCTCGCTCGCTCTCTCCCCAGATC80
81GAGGCTGCTCGGGTCCTTTCTCCCCCCGCCTCCCTCTAGC120
121GCCGCGCCCCCTGGCCCCCAGCCCCAGCCTGCGGCGGGAC160
161CTCCGGGGTCGAAGGTTCTGGCCCGCTCGCGCCCCTCGCC200
201GCCCCCGCGCGCCCCCAGCGCTCCTCCAGCCGGCTCGGGC240
241CGCTCGGCTATGGATCGCCTGCTCGCCGGGCGCTGAAGGC280
281ATCCCCGGGATCCGGAGCGCAGCCCGGGAAAGAAATGCAC320
321AGCGGTATTGATGAGTAGATCCTTGGATTCAGAGGTTGGC360
361TGAAACGCACCATGCCTGCTTCCATCTTTTGCTCTGTAAA400
401GTTGTGAATTGCTCATGCCTATAGGGAGGAAGGATGGCAC440
441ATGGGATTCCTTCTCAAGGCAAAGTTACCATAACGGTGGA480
481TGAGTACAGCTCAAACCCCACCCAGGCATTCACGCACTAC520
521AACATCAACCAGAGCAGATTCCAGCCTCCACATGTACATA560
561TGGTCGACCCCATCCCATATGACACTCCAAAACCAGCGGG600
601CCACACGCGGTTTGTCTGCATCTCAGACACACACTCCAGA640
641ACAGATGGTATCCAGATGCCTTATGGGGACATCCTTCTCC680
681ACACAGGCGATTTCACCGAGCTGGGACTGCCCTCAGAGGT720
721TAAGAAGTTTAATGACTGGTTAGGAAACCTGCCATATGAA760
761TATAAAATAGTGATTGCTGGGAATCATGAACTGACATTTG800
801ATAAGGAATTCATGGCAGACCTTGTTAAACAGGACTACTA840
841CCGTTTCCCCTCTGTGTCCAAATTGAAACCAGAGGACTTT880
881GACAATGTTCAGTCCCTCCTGACAAACAGTATTTACTTAC920
921AAGATTCGGAGGTAACAGTGAAGGGATTCAGGATATACGG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。