演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

MPPED1239AB

metallophosphoesterase domain containing 1

MPPED1 是蛋白質編碼基因,名稱為 metallophosphoesterase domain containing 1;其產物在體外可能具有 metallophosphoesterase 活性。

Homo sapiens22q13.2UniProt O15442
OFFICIAL SYMBOL
MPPED1
CHROMOSOME
22
UNIPROT
O15442
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

MPPED1 的正式名稱為 metallophosphoesterase domain containing 1,屬於蛋白質編碼基因。現有資料將其產物稱為 Metallophosphoesterase domain-containing protein 1,並指出它屬於 UPF0046 family。這些資訊界定了基因產物的名稱與家族歸屬;目前提供的資料未進一步描述其蛋白質結構、胺基酸序列或其他基本性質。

Official symbol
MPPED1
Gene name
metallophosphoesterase domain containing 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1306
UniProt
O15442
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
239ABFAM1AC22orf1

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 2222q13.2
chr22 · 50,818,468 bp · GRCh38chr22p13 · 1–4300000 · gvarchr22p12 · 4300001–9400000 · stalkchr22p11.2 · 9400001–13700000 · gvarchr22p11.1 · 13700001–15000000 · acenchr22q11.1 · 15000001–17400000 · acenchr22q11.21 · 17400001–21700000 · gnegchr22q11.22 · 21700001–23100000 · gpos25chr22q11.23 · 23100001–25500000 · gnegchr22q12.1 · 25500001–29200000 · gpos50chr22q12.2 · 29200001–31800000 · gnegchr22q12.3 · 31800001–37200000 · gpos50chr22q13.1 · 37200001–40600000 · gnegchr22q13.2 · 40600001–43800000 · gpos50chr22q13.31 · 43800001–48100000 · gnegchr22q13.32 · 48100001–49100000 · gpos50chr22q13.33 · 49100001–50818468 · gnegMPPED1pq1 bp50,818,468 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr22:43,411,196–43,507,850
Gene span
96,655 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000443721 ★43,412,014–43,507,8487
ENST0000041766943,411,196–43,507,8507
ENST0000113537643,411,914–43,507,8507
ENST0000033420943,412,013–43,435,1673
ENST0000044756743,416,455–43,425,2093
ENST0000089670043,417,868–43,507,8507
ENST0000089670143,424,825–43,507,8506

顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

MPPED1 產物可能具有 metallophosphoesterase 活性,但此功能描述限於體外觀察,不能據此確定其在細胞或生物體內的實際作用。現有資料未提供其反應底物、作用機制或參與的生物學過程,因此無法進一步說明其生理功能。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 43412014 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>MPPED1 ENST00000443721 GRCh38 chr22:43411014-43412114 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GGAGCCACAGCCCCTTTTCATCTTCCTCTCAGTCTGGGAGGCCCAGGCCAGAGTGATCTGCACCCTAACT
ATACAAGGCCCTGGAATCCCCGTCCCACCCGCGGCAAGGGGCTGGAAGCCACAGGGCCTTAAACTCCCCA
GGGTGACCCCCGACACTGAAGGCGATGGTCTCTGCTCTTCCCAGCAAGGCAGGGCCTCTTTACACTGGGT
GTCGCGCCGTCTGAGTTCCTGACTTGTTTACCCATCCCGTTGGGGCTCCGGCCGCTGCAGGCTACCTGCT
GTGCCCGGGATTGGGGACCTGTGACTCCCGAGTGGAAGAGATGGTGGCCCAGGAGGAGGACCCCGACCTA
TTCAGACTGGGAGCTGGGGTCAGAGTGTCTCCGTCTCCGGAGGGGGACCTTCCAGACCCCGGGCGGGAGG
GGCCCACAGCAGGGTGCCCCGGCGGCCCCAGGAGGGGGTCCGGGCCTCGGGCGAAGGCTGCGGCGCCCCG
GAAGGAGCCGCGCACGCCCCTGCACGCGGTGCCCGCTGCGGAGGCCACGGATCCGGAGGTGAGAGCGCCC
CCGCCCCGCTCCCTGCCCAGCCCGCGCGCGGCCCGGTCCGGGGCTGGGGGCGGGCGCCAAGAGGGGCGCC
GGGCGCAGTGGGGCGGCCCCCTCCCTTTTCCGCAGCGCGGGCCCCGCTCCTCCTCCCGCGTCCAGGCCCG
CGGCCGCGCTCCCTGTCCCTCCGCAGCGGGATGCGGACTCCGAGCCCGGGCGGGGGCCGAGGGCCGAGGC
CTGGCGGGCCTGGCGGGGGCCCCGGCGGGTGGCGGCGCAAGGGCCGGGACCGAGGCCGCGAGCGCGCCCC
TCCCGGCGGCCGGGCGCGGAGAGGCGGGGAGGGCGGGCGTGGGGAGGCGGGCGGCGGCGGGCGGGGGGAG
CCAAGGAGGCTCGGAGCCTCGCGGCGCGCGGGCGGGCGGCGGAGGGGGCGCGGGGAGCCCCCCGCCCCAC
GAAGGAGGAGTCTGGCTCCCACTTGCAGCCTCGGACGCGCGGCGAGGCGGCCGCCGCCGGAGGAGCCCCC
GCCCCTGCGCGCCTCCCTCCCGGGAGCCCCTGCCTCCCTCGGTGCGCGCTG
MPPED1 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆

封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR22_839GCZ · enhancer · 43407210–43407404 · regulatory

· motif · 43408198–43408213 · motif

· motif · 43408198–43408213 · motif

· motif · 43408199–43408213 · motif

· motif · 43408200–43408213 · motif

· motif · 43408723–43408734 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:326 aa

Metallophosphoesterase domain-containing protein 1 屬於 UPF0046 family。現有資料未提供其結構域位置、蛋白質序列特徵或其他功能區域註解。

07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · O15442…

AlphaFold · O15442

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 2 個夥伴 · 最多顯示 50 個
239ABMPPED1PHAF1ZRANB1
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

1 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 1 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能MPPED1 產物在體外可能具有 metallophosphoesterase 活性;此描述保留可能性與體外條件,不能延伸為已證實其在體內具有相同功能。推論支持
證據與來源

May have metallophosphoesterase activity (in vitro)

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 1 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000443721 · 3,436 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ACTTGCAGCCTCGGACGCGCGGCGAGGCGGCCGCCGCCGG40
41AGGAGCCCCCGCCCCTGCGCGCCTCCCTCCCGGGAGCCCC80
81TGCCTCCCTCGGTGCGCGCTGCTGCTCGCAGCCGCCGCGG120
121CCGCCGAAGAGGAGCCCGGGGCCAGTCTGTTTCCAGGTCT160
161GGCGGGGGGCCGGGCTGCGGTGGCGGCAGCGGTGGGAGAT200
201GCCGGGGCGGCCGGCGGAGGTCCATGTGGCGCTCTAGGTG240
241GGATGCCAGCGTCCTGAAGGCGGAGGCCCTGGCCCTCCTC280
281CCCTGCGGCCTGGGCATGGCATTCTCCCAGTCCCACGTGA320
321TGGCCGCTCGGCGGCACCAGCACAGCCGGCTCATCATCGA360
361GGTGGACGAGTACAGCTCCAACCCCACCCAGGCCTTCACC400
401TTCTACAACATCAACCAGGGCCGCTTCCAGCCACCGCATG440
441TGCAGATGGTGGACCCGGTGCCTCACGATGCCCCCAAACC480
481TCCAGGCTACACCCGCTTCGTCTGCGTCTCTGATACCCAC520
521TCGAGGACGGACCCCATCCAGATGCCGTACGGCGACGTGC560
561TGATCCACGCTGGGGACTTCACTGAGCTGGGGCTCCCGAG600
601CGAGGTGAAGAAGTTCAACGAGTGGCTGGGCAGCCTGCCC640
641TACGAGTACAAGATCGTGATCGCAGGCAACCACGAGCTGA680
681CCTTTGACCAGGAGTTCATGGCCGACCTCATCAAGCAGGA720
721CTTTTACTACTTCCCATCTGTGTCGAAGCTGAAGCCGGAG760
761AACTATGAGAATGTGCAGTCGCTGCTGACCAACTGCATCT800
801ACCTTCAGGACTCGGAGGTCACCGTGCGGGGCTTCCGGAT840
841CTATGGCTCCCCATGGCAGCCCTGGTTCTACGGCTGGGGC880
881TTCAACCTCCCGCGAGGCCAAGCCCTGCTGGAGAAATGGA920
921ACCTCATTCCCGAAGGCGTAGACATCCTGATAACCCATGG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。