基因總覽
MPPED1 的正式名稱為 metallophosphoesterase domain containing 1,屬於蛋白質編碼基因。現有資料將其產物稱為 Metallophosphoesterase domain-containing protein 1,並指出它屬於 UPF0046 family。這些資訊界定了基因產物的名稱與家族歸屬;目前提供的資料未進一步描述其蛋白質結構、胺基酸序列或其他基本性質。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000443721 ★ | 43,412,014–43,507,848 | 7 |
| ENST00000417669 | 43,411,196–43,507,850 | 7 |
| ENST00001135376 | 43,411,914–43,507,850 | 7 |
| ENST00000334209 | 43,412,013–43,435,167 | 3 |
| ENST00000447567 | 43,416,455–43,425,209 | 3 |
| ENST00000896700 | 43,417,868–43,507,850 | 7 |
| ENST00000896701 | 43,424,825–43,507,850 | 6 |
顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
MPPED1 產物可能具有 metallophosphoesterase 活性,但此功能描述限於體外觀察,不能據此確定其在細胞或生物體內的實際作用。現有資料未提供其反應底物、作用機制或參與的生物學過程,因此無法進一步說明其生理功能。
Promoter 與基因調控
>MPPED1 ENST00000443721 GRCh38 chr22:43411014-43412114 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GGAGCCACAGCCCCTTTTCATCTTCCTCTCAGTCTGGGAGGCCCAGGCCAGAGTGATCTGCACCCTAACT ATACAAGGCCCTGGAATCCCCGTCCCACCCGCGGCAAGGGGCTGGAAGCCACAGGGCCTTAAACTCCCCA GGGTGACCCCCGACACTGAAGGCGATGGTCTCTGCTCTTCCCAGCAAGGCAGGGCCTCTTTACACTGGGT GTCGCGCCGTCTGAGTTCCTGACTTGTTTACCCATCCCGTTGGGGCTCCGGCCGCTGCAGGCTACCTGCT GTGCCCGGGATTGGGGACCTGTGACTCCCGAGTGGAAGAGATGGTGGCCCAGGAGGAGGACCCCGACCTA TTCAGACTGGGAGCTGGGGTCAGAGTGTCTCCGTCTCCGGAGGGGGACCTTCCAGACCCCGGGCGGGAGG GGCCCACAGCAGGGTGCCCCGGCGGCCCCAGGAGGGGGTCCGGGCCTCGGGCGAAGGCTGCGGCGCCCCG GAAGGAGCCGCGCACGCCCCTGCACGCGGTGCCCGCTGCGGAGGCCACGGATCCGGAGGTGAGAGCGCCC CCGCCCCGCTCCCTGCCCAGCCCGCGCGCGGCCCGGTCCGGGGCTGGGGGCGGGCGCCAAGAGGGGCGCC GGGCGCAGTGGGGCGGCCCCCTCCCTTTTCCGCAGCGCGGGCCCCGCTCCTCCTCCCGCGTCCAGGCCCG CGGCCGCGCTCCCTGTCCCTCCGCAGCGGGATGCGGACTCCGAGCCCGGGCGGGGGCCGAGGGCCGAGGC CTGGCGGGCCTGGCGGGGGCCCCGGCGGGTGGCGGCGCAAGGGCCGGGACCGAGGCCGCGAGCGCGCCCC TCCCGGCGGCCGGGCGCGGAGAGGCGGGGAGGGCGGGCGTGGGGAGGCGGGCGGCGGCGGGCGGGGGGAG CCAAGGAGGCTCGGAGCCTCGCGGCGCGCGGGCGGGCGGCGGAGGGGGCGCGGGGAGCCCCCCGCCCCAC GAAGGAGGAGTCTGGCTCCCACTTGCAGCCTCGGACGCGCGGCGAGGCGGCCGCCGCCGGAGGAGCCCCC GCCCCTGCGCGCCTCCCTCCCGGGAGCCCCTGCCTCCCTCGGTGCGCGCTG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR22_839GCZ · enhancer · 43407210–43407404 · regulatory
· motif · 43408198–43408213 · motif
· motif · 43408198–43408213 · motif
· motif · 43408199–43408213 · motif
· motif · 43408200–43408213 · motif
· motif · 43408723–43408734 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:326 aa
Metallophosphoesterase domain-containing protein 1 屬於 UPF0046 family。現有資料未提供其結構域位置、蛋白質序列特徵或其他功能區域註解。
蛋白質三維結構
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- PHAF1Q9BSU1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZRANB1Q9UGI0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | MPPED1 產物在體外可能具有 metallophosphoesterase 活性;此描述保留可能性與體外條件,不能延伸為已證實其在體內具有相同功能。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
ACTTGCAGCCTCGGACGCGCGGCGAGGCGGCCGCCGCCGG40AGGAGCCCCCGCCCCTGCGCGCCTCCCTCCCGGGAGCCCC80TGCCTCCCTCGGTGCGCGCTGCTGCTCGCAGCCGCCGCGG120CCGCCGAAGAGGAGCCCGGGGCCAGTCTGTTTCCAGGTCT160GGCGGGGGGCCGGGCTGCGGTGGCGGCAGCGGTGGGAGAT200GCCGGGGCGGCCGGCGGAGGTCCATGTGGCGCTCTAGGTG240GGATGCCAGCGTCCTGAAGGCGGAGGCCCTGGCCCTCCTC280CCCTGCGGCCTGGGCATGGCATTCTCCCAGTCCCACGTGA320TGGCCGCTCGGCGGCACCAGCACAGCCGGCTCATCATCGA360GGTGGACGAGTACAGCTCCAACCCCACCCAGGCCTTCACC400TTCTACAACATCAACCAGGGCCGCTTCCAGCCACCGCATG440TGCAGATGGTGGACCCGGTGCCTCACGATGCCCCCAAACC480TCCAGGCTACACCCGCTTCGTCTGCGTCTCTGATACCCAC520TCGAGGACGGACCCCATCCAGATGCCGTACGGCGACGTGC560TGATCCACGCTGGGGACTTCACTGAGCTGGGGCTCCCGAG600CGAGGTGAAGAAGTTCAACGAGTGGCTGGGCAGCCTGCCC640TACGAGTACAAGATCGTGATCGCAGGCAACCACGAGCTGA680CCTTTGACCAGGAGTTCATGGCCGACCTCATCAAGCAGGA720CTTTTACTACTTCCCATCTGTGTCGAAGCTGAAGCCGGAG760AACTATGAGAATGTGCAGTCGCTGCTGACCAACTGCATCT800ACCTTCAGGACTCGGAGGTCACCGTGCGGGGCTTCCGGAT840CTATGGCTCCCCATGGCAGCCCTGGTTCTACGGCTGGGGC880TTCAACCTCCCGCGAGGCCAAGCCCTGCTGGAGAAATGGA920ACCTCATTCCCGAAGGCGTAGACATCCTGATAACCCATGG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。