演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

MPIG6BG6b

megakaryocyte and platelet inhibitory receptor G6b

MPIG6B 編碼 megakaryocyte and platelet inhibitory receptor G6b;其不同異構型具有不同的膜定位與可能功能,其中 Isoform B 被認為可能具有抑制性受體作用。

Homo sapiens6p21.33UniProt O95866
OFFICIAL SYMBOL
MPIG6B
CHROMOSOME
6
UNIPROT
O95866
PDB / ALPHAFOLD
6R0X
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

MPIG6B 是蛋白質編碼基因,產物為 megakaryocyte and platelet inhibitory receptor G6b。此受體有多種異構型;其中 Isoform B 是此處描述的形式,具有跨膜區與兩個免疫受體酪胺酸抑制基序(ITIMs),因此被認為可能是具有抑制作用的受體。Isoform A 則可能是 Isoform B 的活化型對應形式。不同異構型的結構與細胞定位並不完全相同,顯示不能將單一異構型的特徵直接套用至所有形式。

Official symbol
MPIG6B
Gene name
megakaryocyte and platelet inhibitory receptor G6b
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:13937
UniProt
O95866
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
G6bNG31G6b-BC6orf25

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 66p21.33
chr6 · 170,805,979 bp · GRCh38chr6p25.3 · 1–2300000 · gnegchr6p25.2 · 2300001–4200000 · gpos25chr6p25.1 · 4200001–7100000 · gnegchr6p24.3 · 7100001–10600000 · gpos50chr6p24.2 · 10600001–11600000 · gnegchr6p24.1 · 11600001–13400000 · gpos25chr6p23 · 13400001–15200000 · gnegchr6p22.3 · 15200001–25200000 · gpos75chr6p22.2 · 25200001–27100000 · gnegchr6p22.1 · 27100001–30500000 · gpos50chr6p21.33 · 30500001–32100000 · gnegchr6p21.32 · 32100001–33500000 · gpos25chr6p21.31 · 33500001–36600000 · gnegchr6p21.2 · 36600001–40500000 · gpos25chr6p21.1 · 40500001–46200000 · gnegchr6p12.3 · 46200001–51800000 · gpos100chr6p12.2 · 51800001–53000000 · gnegchr6p12.1 · 53000001–57200000 · gpos100chr6p11.2 · 57200001–58500000 · gnegchr6p11.1 · 58500001–59800000 · acenchr6q11.1 · 59800001–62600000 · acenchr6q11.2 · 62600001–62700000 · gnegchr6q12 · 62700001–69200000 · gpos100chr6q13 · 69200001–75200000 · gnegchr6q14.1 · 75200001–83200000 · gpos50chr6q14.2 · 83200001–84200000 · gnegchr6q14.3 · 84200001–87300000 · gpos50chr6q15 · 87300001–92500000 · gnegchr6q16.1 · 92500001–98900000 · gpos100chr6q16.2 · 98900001–100000000 · gnegchr6q16.3 · 100000001–105000000 · gpos100chr6q21 · 105000001–114200000 · gnegchr6q22.1 · 114200001–117900000 · gpos75chr6q22.2 · 117900001–118100000 · gnegchr6q22.31 · 118100001–125800000 · gpos100chr6q22.32 · 125800001–126800000 · gnegchr6q22.33 · 126800001–130000000 · gpos75chr6q23.1 · 130000001–130900000 · gnegchr6q23.2 · 130900001–134700000 · gpos50chr6q23.3 · 134700001–138300000 · gnegchr6q24.1 · 138300001–142200000 · gpos75chr6q24.2 · 142200001–145100000 · gnegchr6q24.3 · 145100001–148500000 · gpos75chr6q25.1 · 148500001–152100000 · gnegchr6q25.2 · 152100001–155200000 · gpos50chr6q25.3 · 155200001–160600000 · gnegchr6q26 · 160600001–164100000 · gpos50chr6q27 · 164100001–170805979 · gnegMPIG6Bpq1 bp170,805,979 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr6:31,718,594–31,726,714
Gene span
8,121 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000649779 ★31,723,373–31,726,7146
ENST0000048003931,723,344–31,724,9735
ENST0000037581031,723,344–31,725,0745
ENST0000037580531,723,370–31,725,0745
ENST0000037580931,723,373–31,726,7146
ENST0000037580431,723,384–31,725,0744
ENST0000037581431,723,384–31,725,0744

顯示 7/7 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

megakaryocyte and platelet inhibitory receptor G6b 是造血細胞譜系分化、巨核細胞功能與血小板生成的重要調節因子。資料指出其具有抑制性受體作用,可限制血小板受到 ADP 或 collagen-related peptide 等促效劑刺激後的活化與凝集。此調節作用也涉及巨核細胞功能及血小板生成,並與受體訊號受到抑制相關。

其抑制作用透過兩個 ITIMs 影響 CLEC1B 與 GP6:FcRgamma 的訊號傳遞。來源指出,這類調節看來不依賴 calcium;此描述保留為來源所述的作用特性,並不延伸為其他細胞條件或分子機制的結論。

異構型差異可能影響受體功能判讀。Isoform B 是唯一同時具有跨膜區與兩個 ITIMs 的形式,因此被推測是唯一可能具有抑制性受體作用的異構型;相對地,Isoform A 可能是 Isoform B 的活化型對應形式。這項功能指派帶有推測性,不能視為 Isoform A 的活化作用已被確立。綜合而言,來源支持 MPIG6B 參與巨核細胞與血小板相關調控,並指出抑制性訊號可能限制特定促效劑引發的血小板反應。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 31723373 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>MPIG6B ENST00000649779 GRCh38 chr6:31722373-31723473 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TGTCACCCGTGCTCCACTTGCGCTTGGTGTGGCCTTGTTGCTCCAGTCCAGCAGCAGCAATTGTCCTAGG
TGTGGCTGTGTGCACCTGCTCCAAAGCACCTCCCCAGTCAAAACCTGCCAACTTGGGCAGGGTACCAAGC
CAGGAGGAACAGCATGGGCACAGAGAGGTGAGGTAGAAGCTAAAATAAGAATAGAAATAGTAGGCCGGGT
GTGGTGGCTCACACCTGTAATCTCAGCACTTTGGGAGGCCGAGGTGGGTGGATCACAAGGTCAAGAGATC
GAGACCATCCTGGCCAACATGGTGAAACCCCATCTCTACTGAAAATACAAAAATTAGTCAGGTGTGGTGG
CATGCACCTGTAGTTCCAGCTACTCAGGAGGCTGAGACAGGAGACTCACTTGAATCCAGGAGCCGGAGGC
TGCAGTGAGTCGAGATTGCACTCCAGCCTGGCCACAGAGCAAGACTCTGACTCAAAAAAAAAAAAAAAAA
AAAGAATAGAAATAGTAATAATAATGGCAAGCACTTACATAGTGATCCTATGTATTCTAAGCAGTTTACA
TGTATTACTTTATTTCGTTATCACAATCCCCTACAAAACAGGAGTTTTTTTTGTTGTTGTTTTTGAGACA
GGGTCTGGCTGGCTCTGTCGCCCAGGCTGGAGTGCAATGGCCTGATCACAGTTCACTGCAACCTCGACCT
CCTGAGCTCAAGCGATCCTCCCTCCTCAGCCTCCTAAGTAGCTGGGATTACAGGCGCACCTGAAAAGTTA
AGCAGGCCAAAGCATTTGTGTAAATGGCCCGAGCACACATTTTAAGTGAGAACCATTTGAAGACTCCGAG
TTTGCCTGCGAGGATTCCCAAAGGGATCTGGGCAGCTGGTGGCCCCGCCCCCTCTCTTATCGGAGCCCCC
CAGCCCCTCCGTTCTCCCCACGCCTAACTTCCCTCCGGTCCCCCCCCAACCGGCCCCACGCCGCTGATTC
GCTCGCAGCTTCTCCTCACCACATCCTAACCATGGCTGTGTTTCTGCAGCTGCTACCGCTGCTGCTCTCG
AGGGCCCAAGGGAACCCTGGGGGTAAGCGATCCCTGGGAGAGTTGTGATAG
MPIG6B 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
MPIG6B_1 ↗6:31,723,373正股31,723,324–31,723,383

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR6_B89XW · enhancer · 31718260–31718864 · regulatory

ENSR6_59GFNR · CTCF_binding_site · 31718462–31718483 · regulatory

ENSR6_8X6TN · enhancer · 31720253–31720490 · regulatory

ENSR6_8X6XD · promoter · 31723165–31723394 · regulatory

ENSR6_59GHCK · CTCF_binding_site · 31728136–31728157 · regulatory

· motif · 31718429–31718439 · motif

· motif · 31718464–31718480 · motif

· motif · 31718530–31718540 · motif

· motif · 31727145–31727159 · motif

· motif · 31727145–31727159 · motif

· motif · 31727698–31727711 · motif

· motif · 31728027–31728040 · motif

· motif · 31728138–31728154 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:241 aa

1 aa241 aa基序訊號胜肽跨膜區拓樸區域
依 O95866 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Isoform B 長 241 個胺基酸,具有 N 端訊號序列(第 1–17 位)、胞外區(第 18–142 位)、螺旋型跨膜區(第 143–163 位)及胞質區(第 164–241 位)。胞質區含兩個 ITIM,分別位於第 209–214 位及第 235–240 位。

訊號胜肽1–17 aa
拓樸區域Extracellular18–142 aa
跨膜區Helical143–163 aa
拓樸區域Cytoplasmic164–241 aa
基序ITIM motif209–214 aa
基序ITIM motif235–240 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 6R0X…

PDB · 6R0X

X-ray · 3.13 A · E/F=18-133

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Endoplasmic reticulum;Golgi apparatus;Cell membrane

Isoform A 與 Isoform B 位於細胞膜,屬單次穿膜的第一型膜蛋白;Isoform D 與 Isoform E 則記載於內質網及高基氏體。 這些定位資料按異構型區分,不應將 Isoform D、E 的胞器定位推及其他形式。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
G6bMPIG6B
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

megakaryocyte and platelet inhibitory receptor G6b 透過 ITIM 與 PTPN6、PTPN11 互作;另有資料記載其可結合 heparin。來源未將 heparin 結合描述為蛋白質複合體,也未提供其與前述互作相同的功能關係。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

MPIG6B 相關變異可造成常染色體隱性疾病 thrombocytopenia, anemia, and myelofibrosis(THAMY)。此病通常在幼年期發病,特徵包括血小板減少、巨大血小板數目增加及貧血;骨髓切片可見巨核細胞增加與符合骨髓纖維化的網狀纖維化。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

8 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 8 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能megakaryocyte and platelet inhibitory receptor G6b 是造血細胞譜系分化、巨核細胞功能及血小板生成的重要調節因子。它可抑制 ADP 或 collagen-related peptide 等促效劑引發的血小板活化與凝集,並透過兩個 ITIMs 抑制 CLEC1B 和 GP6:FcRgamma 的訊號,調節巨核細胞功能、血小板生成與活化;其作用看來不依賴 calcium。含實驗來源
證據與來源

Inhibitory receptor that acts as a critical regulator of hematopoietic lineage differentiation, megakaryocyte function and platelet production. Inhibits platelet aggregation and activation by agonists such as ADP and collagen-related peptide. This regulation of megakaryocate function as well as platelet production ann activation is done through the inhibition (via the 2 ITIM motifs) of the receptors CLEC1B and GP6:FcRgamma signaling. Appears to operate in a calcium-independent manner

PMID 12665801 ↗ · PMID 17311996 ↗ · PMID 27743390 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

功能Isoform B 是此條目呈現的異構型,也是唯一同時具有跨膜區與兩個免疫受體酪胺酸抑制基序(ITIMs)的形式,因此被推測為唯一可能具有抑制性受體作用的異構型。Isoform A 則可能是 Isoform B 的活化型對應形式;這項功能關係仍屬可能性描述。推論支持
證據與來源

Isoform B, displayed in this entry, is the only isoform to contain both a transmembrane region and 2 immunoreceptor tyrosine-based inhibitor motifs (ITIMs) and, thus, the only one which probably has a role of inhibitory receptor. Isoform A may be the activating counterpart of isoform B

PMID 11544253 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用megakaryocyte and platelet inhibitory receptor G6b 透過 ITIM 與 PTPN6、PTPN11 互作,並可結合 heparin。來源未進一步說明 heparin 結合與這兩種蛋白質互作之間的功能關係。含實驗來源
證據與來源

Interacts (via ITIM motif) with PTPN6 and PTPN11. Binds to heparin

PMID 11544253 ↗ · PMID 15848171 ↗ · PMID 23112346 ↗ · PMID 18955485 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Isoform E 的定位記載於內質網與高基氏體。含實驗來源
證據與來源

Isoform E; Endoplasmic reticulum; Golgi apparatus

PMID 11544253 ↗

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細胞定位Isoform D 的定位記載於內質網與高基氏體。含實驗來源
證據與來源

Isoform D; Endoplasmic reticulum; Golgi apparatus

PMID 11544253 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Isoform B 位於細胞膜,屬單次穿膜的第一型膜蛋白。含實驗來源
證據與來源

Isoform B; Cell membrane / Single-pass type I membrane protein

PMID 11544253 ↗

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細胞定位Isoform A 位於細胞膜,屬單次穿膜的第一型膜蛋白。含實驗來源
證據與來源

Isoform A; Cell membrane / Single-pass type I membrane protein

PMID 11544253 ↗

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疾病關聯MPIG6B 相關變異可造成常染色體隱性疾病 thrombocytopenia, anemia, and myelofibrosis(THAMY),通常在幼年期發病。疾病特徵包括血小板減少、巨大血小板數目增加及貧血;骨髓切片可見巨核細胞數目增加及符合骨髓纖維化的網狀纖維化。含實驗來源
證據與來源

Thrombocytopenia, anemia, and myelofibrosis THAMY An autosomal recessive disorder characterized by thrombocytopenia, increased number of giant platelets, and anemia manifesting in early childhood. Bone marrow biopsy shows increased number of megakaryocytes and reticular fibrosis consistent with myelofibrosis. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 617441

PMID 27743390 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 8 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000649779 · 2,377 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1ACATCCTAACCATGGCTGTGTTTCTGCAGCTGCTACCGCT40
41GCTGCTCTCGAGGGCCCAAGGGAACCCTGGGGCTTCTCTG80
81GACGGCCGCCCTGGGGACCGGGTGAATCTCTCCTGCGGAG120
121GAGTCTCTCATCCCATCCGCTGGGTCTGGGCACCCAGCTT160
161CCCGGCCTGCAAGGGCCTGTCCAAAGGACGCCGACCGATC200
201CTGTGGGCCTCTTCGAGCGGGACCCCCACCGTGCCTCCCC240
241TCCAGCCTTTCGTCGGCCGCCTACGCTCCCTGGACTCTGG280
281TATCCGGCGGCTGGAGCTCCTCTTGAGCGCGGGGGACTCG320
321GGCACTTTTTTCTGCAAGGGCCGCCACGAGGACGAGAGCC360
361GTACAGTGCTTCACGTGCTGGGGGACAGGACCTATTGCAA400
401GGCCCCCGGGCCTACCCATGGGTCCGTGTATCCCCAGCTC440
441CTGATCCCGCTGCTGGGCGCTGGGTTGGTGCTCGGACTGG480
481GAGCTTTGGGCCTGGTCTGGTGGCTGCACAGGCGCCTGCC520
521CCCGCAACCGATTCGACCACTCCCTAGATTTGCTCCACTT560
561GTGAAAACCGAGCCCCAGAGGCCAGTAAAGGAGGAAGAGC600
601CCAAGATTCCAGGGGACCTGGACCAGGAACCGAGCCTGCT640
641CTATGCGGATCTGGACCATCTAGCCCTCAGCAGGCCCCGC680
681CGGCTGTCCACAGCGGACCCTGCTGATGCCTCCACCATCT720
721ATGCAGTTGTAGTTTGAAGGGAAGCCCTTACTCCAAACCT760
761CCCAAGCTAGGGGATCCCAGCTCCCCATAATCCCTCTCCC800
801CTCCTTGGTTCCTCACCTGGAAGAGGAAGGCACCATGGTA840
841TAGAAATAAGTGCTAGACTGGGAGTTGGGAGACCTGGGTT880
881CCAGGCTGTCTCTGCCACTGGTCTTACTTCTAAACTTACT920
921CCCATCTCTCCTATAACCTCCATGTCTCCCTCACCACCAG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。