基因總覽
MMS19 是蛋白質編碼基因，產物名稱為 MMS19 cytosolic iron-sulfur assembly component，屬於 MET18/MMS19 family。此蛋白是細胞質鐵硫蛋白組裝複合體 CIA 的重要成員，主要參與鐵硫簇向特定蛋白質的裝配與轉移。它也屬於與有絲分裂紡錘體相關的 MMXD 複合體，因而與細胞內鐵硫蛋白組裝及染色體維護相關。其 C 端具有四個 HEAT 重複序列；這些結構特徵與其作為多蛋白複合體成員的身分相符。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000438925 ★ | 97,458,324–97,498,422 | 31 |
| ENST00000370782 | 97,458,083–97,498,811 | 32 |
| ENST00000355839 | 97,458,083–97,498,609 | 30 |
| ENST00000896588 | 97,458,083–97,499,500 | 32 |
| ENST00000896589 | 97,458,083–97,498,609 | 31 |
| ENST00000896590 | 97,458,083–97,498,609 | 31 |
| ENST00000896591 | 97,458,083–97,498,609 | 31 |
| ENST00000896592 | 97,458,083–97,498,609 | 31 |
| ENST00000896593 | 97,458,083–97,498,609 | 31 |
| ENST00000896594 | 97,458,083–97,498,609 | 30 |
| ENST00000896595 | 97,458,083–97,498,609 | 30 |
| ENST00000896596 | 97,458,083–97,498,609 | 30 |
顯示 12/39 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
MMS19 在 CIA 複合體中充當接合者，連結較早作用的 CIA 組件與一部分需要鐵硫簇的目標蛋白。這些目標包括 ERCC2/XPD、FANCJ 與 RTEL1；CIA 複合體所促進的鐵硫簇裝配，特別關聯於 DNA 代謝及基因組完整性所需的蛋白質。藉由這項角色，MMS19 參與核苷酸切除修復、同源重組介導的 DNA 雙股斷裂修復、DNA 複製，以及 RNA polymerase II 的轉錄作用。
MMS19 也參與與有絲分裂紡錘體相關的 MMXD 複合體，並與染色體分離有關。其作用可能是促進鐵硫簇裝配至 ERCC2/XPD；此機制在來源中以可能性描述。另一方面，MMS19 與 CIAO2 一同促進鐵硫簇轉移至馬達蛋白 KIF4A，使 KIF4A 能適當定位於有絲分裂機制的組成部分，進而促進有絲分裂進程。
MMS19 另與雌激素受體（ER）的轉錄共活化作用有間接關聯。這項作用被歸因於 MMS19 協助將鐵硫簇插入 TFIIH 機制中的某個組成部分；來源並未指定該組成部分。因此，MMS19 的功能涵蓋鐵硫蛋白成熟與轉移，並由此連結 DNA 修復、複製、轉錄及有絲分裂相關過程。
Promoter 與基因調控
>MMS19 ENST00000438925 GRCh38 chr10:97498322-97499422 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GGGAGCGGCCCCCTCTGGCTGCGGAGCAGCCCATCGGGGAAACCCAAGCGCCAGCACCAGTGGGGAGTCC ATCGGTAAGCCCAGGACTCGGGCGAGGAGGGGGACAACTGGCGGGATGCCCGAGGCCCTGCTCCCTTCCC CATCGTTACCTGCTCGCTTGCGGGGGTGTCCCGGGGCTGCCGGCCTCTCCCGGCGCTGTCTCCCCACGCA GTTGCCCATGCTGGCTCCTCAGCCAGTCCCCATGCACCGGAGGCGGCGGGGTGGTCGGCTGCTCAGCGGA CGGCGGCGTCCCGGGTCAATGGCTCCGGCCGCCCGGCATCGGGCGCTCCCCGATCTCCCCCCGGGGGCGC GCTCAGCCCCAGCGATGGCTCCGCCAAAACTTTGCGGGCCAGGGGAGAGAGGGAAGTGGCAGACTCCCCA GCACGGTCCCAGGTGGCCGGGCCAGGGGGGCCCGCGACGGTGCCCGGCCGGAGACCAGCTCCGCTGGAGG GGCGGAGAGAGGGGGCGGGCACCGCCGCAGCTACTCCCGGCTCGCTCGGGGCACCAGGCAGGGGCCGGCC CCCTGGAGCCTGTCACTCACCTGCCTAACCCCGCCCCAGGCCGGCCCCTCTCCCTTCCGCCGGCTCGCGG TGCCCGCGCCGCCGCCACCACCCGCCCCAGGTGCGCATGTGACCGACAGCACCGCCCCCTAGGGCTGGGC CTGATTTTCTCATTGGCTTCCCCCGTGGTGCGTACCGCCCCTCTCCCCACCCAGCCAGGTGCCCGCCCCG CAGCCCGTCTCCCGGGGAGCCGGGCTGGGAATTATTCGCCCTCAATCGCCTCCGGCTGCGTGCCCAGCAG CCGCCTTCCCTCTCGGTGCCACCGCCCCATTTCAGGCCCCGCCCCTCCCTGGAACTGCCTAGGCAGAAGC CGGCAGGCACGTGACCCCGGCGCCCCGCCCCCTTGCGCTTCCCCGGAGATTGGCTCGGGAGGCGCATGCG CGGAGAGCCCGTCTCGAGCCACCGCCCATATCCCCTCCCACGGTCTCTAGTTCGCGTTATGGCCGCTGCC GCGGCTGTGGAGGCGGCGGCGCCTATGGGTGCCCTATGGGGCCTCGTGCAC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MMS19_1 ↗ | 10:97,498,403 | 負股 | 97,498,393–97,498,452 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR10_BPCF7 · enhancer · 97494931–97495511 · regulatory
ENSR10_5SX6RT · CTCF_binding_site · 97498254–97498275 · regulatory
ENSR10_BPCFP · promoter · 97498374–97498934 · regulatory
ENSR10_5SX6ST · CTCF_binding_site · 97498471–97498492 · regulatory
ENSR10_CCN7X · enhancer · 97498935–97500427 · regulatory
· motif · 97497891–97497906 · motif
· motif · 97498240–97498256 · motif
· motif · 97498240–97498256 · motif
· motif · 97498256–97498272 · motif
· motif · 97498441–97498452 · motif
· motif · 97498441–97498452 · motif
· motif · 97498462–97498475 · motif
· motif · 97498462–97498475 · motif
· motif · 97498473–97498489 · motif
· motif · 97498481–97498491 · motif
· motif · 97498498–97498507 · motif
· motif · 97498498–97498507 · motif
· motif · 97498537–97498547 · motif
· motif · 97498734–97498744 · motif
· motif · 97498750–97498761 · motif
· motif · 97498758–97498767 · motif
· motif · 97498764–97498774 · motif
· motif · 97498825–97498835 · motif
· motif · 97498912–97498922 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：1030 aa
MMS19 蛋白長 1,030 個胺基酸，屬於 MET18/MMS19 family。序列註解列出四個位於 C 端的 HEAT 重複序列：HEAT 1 至 HEAT 4，位置分別為 866–904、908–946、949–987 與 990–1028。
蛋白質三維結構
細胞內定位
MMS19 位於細胞核，也見於細胞質的細胞骨架相關區域，包括紡錘體與中心體。 有絲分裂期間，其定位隨階段改變：前期在中心體富集，中期位於紡錘體，末期則分布於已壓縮的紡錘體中區微管周圍。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 6 個夥伴
- BRIP1Q9BX63 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
- CIAO1O76071 · UniProt INTERACTION · 15 experiments · 2 筆來源紀錄
- CIAO2BQ9Y3D0 · UniProt INTERACTION · 17 experiments
- CIAO3Q9H6Q4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ERCC2P18074 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- RTEL1Q9NZ71 · UniProt INTERACTION · 4 experiments
MMS19 是 CIA 與 MMXD 複合體的組成部分。它在 CIA 複合體中直接結合 CIAO2B 和 CIAO3；在 MMXD 複合體中，則與 CIAO1、ERCC2、CIAO2B 及 SLC25A5 同屬一個複合體。MMS19 也直接結合 ERCC2/XPD，並與 ERCC3/XPB、NCOA3/RAC3、RTEL1、BRIP1 及 KIF4A 有互作；其中 MMS19 促成 RTEL1 與 CIA 複合體的關聯，並協助鐵硫簇轉移至 KIF4A。它與 CCDC117 的互作則屬間接。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | MMS19 是細胞質鐵硫蛋白組裝（CIA）複合體的重要成員，協助將鐵硫簇裝入參與 DNA 代謝與基因組完整性的目標蛋白。它連結較早作用的 CIA 組件與 ERCC2/XPD、FANCJ、RTEL1 等蛋白，參與核苷酸切除修復、同源重組介導的 DNA 雙股斷裂修復、DNA 複製及 RNA polymerase II 轉錄。MMS19 也是 MMXD 複合體成員，可能藉由促進鐵硫簇裝配至 ERCC2/XPD 參與染色體分離；它與 CIAO2 一同協助鐵硫簇轉移至 KIF4A，促進其定位於有絲分裂機制組件。此外，MMS19 透過協助鐵硫簇插入 TFIIH 機制中的某個組成部分，間接參與雌激素受體的轉錄共活化。 | 含實驗來源 | 證據與來源Key component of the cytosolic iron-sulfur protein assembly (CIA) complex, a multiprotein complex that mediates the incorporation of iron-sulfur cluster into apoproteins specifically involved in DNA metabolism and genomic integrity. In the CIA complex, MMS19 acts as an adapter between early-acting CIA components and a subset of cellular target iron-sulfur proteins such as ERCC2/XPD, FANCJ and RTEL1, thereby playing a key role in nucleotide excision repair (NER), homologous recombination-mediated double-strand break DNA repair, DNA replication and RNA polymerase II (POL II) transcription. As part of the mitotic spindle-associated MMXD complex, plays a role in chromosome segregation, probably by facilitating iron-sulfur (Fe-S) cluster assembly into ERCC2/XPD. Together with CIAO2, facilitates the transfer of Fe-S clusters to the motor protein KIF4A, which ensures proper localization of KIF4A to mitotic machinery components to promote the progression of mitosis. Indirectly acts as a transcriptional coactivator of estrogen receptor (ER), via its role in iron-sulfur insertion into some component of the TFIIH-machinery PMID 11279242 ↗ · PMID 20797633 ↗ · PMID 22678361 ↗ · PMID 22678362 ↗ · PMID 23585563 ↗ · PMID 29225034 ↗ · PMID 29848660 ↗ |
| 交互作用 | MMS19 是 CIA 複合體及由 CIAO1、ERCC2、CIAO2B、MMS19、SLC25A5 組成的 MMXD 複合體成員。在 CIA 複合體中，它直接結合 CIAO2B 與 CIAO3，也直接結合 ERCC2/XPD；另與 ERCC3/XPB、NCOA3/RAC3、RTEL1、BRIP1 及 KIF4A 有互作。MMS19 與 RTEL1 的互作促成 RTEL1 關聯於 CIA 複合體；與 KIF4A 的互作則協助鐵硫簇轉移，確保 KIF4A 適當定位於有絲分裂機制組件。MMS19 與 CCDC117 的互作為間接。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the CIA complex. In the CIA complex, interacts directly with CIAO2B and CIAO3. Component of the MMXD complex, composed of CIAO1, ERCC2, CIAO2B, MMS19 and SLC25A5. Interacts with CIAO2B; the interaction is direct. Interacts with ERCC2/XPD; the interaction is direct. Interacts with ERCC3/XPB and NCOA3/RAC3. Interacts with RTEL1; the interaction mediates the association of RTEL1 with the CIA complex. Interacts with BRIP1. Interacts with KIF4A; the interaction facilitates the transfer of Fe-S clusters to KIF4A to ensure proper localization of KIF4A to the mitotic machinery components. Interacts with CCDC117; the interaction is indirect PMID 11071939 ↗ · PMID 11279242 ↗ · PMID 20797633 ↗ · PMID 22678361 ↗ · PMID 22678362 ↗ · PMID 23585563 ↗ · PMID 29848660 ↗ · PMID 30742009 ↗ |
| 細胞定位 | MMS19 位於細胞核，也分布於細胞質的細胞骨架區域，包括紡錘體及微管組織中心的中心體。有絲分裂期間，其定位具有階段性變化：前期在中心體富集，中期定位於紡錘體，末期則位於已壓縮的紡錘體中區微管周圍。 | 含實驗來源 | 證據與來源Nucleus; Cytoplasm, cytoskeleton, spindle; Cytoplasm, cytoskeleton, microtubule organizing center, centrosome; In mitosis, enriched on centrosomes during prophase, localizes to the spindle during metaphase and surrounds compacted spindle midzone microtubules during telophase PMID 20797633 ↗ · PMID 29848660 ↗ |
核酸與蛋白質序列
ACCGCCCATATCCCCTCCCACGGTCTCTAGTTCGCGTTAT40GGCCGCTGCCGCGGCTGTGGAGGCGGCGGCGCCTATGGGT80GCCCTATGGGGCCTCGTGCACGACTTCGTCGTGGGTCAGC120AAGAGGGCCCCGCTGACCAGGTGGCTGCAGATGTGAAATC160TGGCAACTATACAGTGTTACAAGTTGTGGAAGCCCTTGGG200TCCTCTCTAGAGAATCCAGAACCCCGAACTCGGGCACGAG240CAATCCAGCTTTTGTCACAGGTGCTACTCCACTGTCACAC280CTTGCTCCTGGAGAAGGAAGTGGTACACCTGATACTGTTC320TATGAGAACCGGCTGAAGGACCATCATCTTGTGATCCCAT360CTGTCCTGCAGGGTTTGAAGGCACTTAGCCTGTGTGTGGC400CCTGCCCCCAGGGCTGGCTGTTTCTGTGCTTAAAGCCATC440TTCCAGGAAGTGCATGTACAGTCCCTGCCACAGGTGGACC480GACACACAGTCTACAATATCATCACCAATTTTATGCGAAC520CCGGGAAGAAGAGCTAAAGAGCCTAGGAGCTGACTTCACC560TTTGGCTTCATCCAGGTGATGGATGGGGAAAAGGATCCCC600GTAATCTTCTGGTGGCCTTCCGCATCGTCCATGACCTCAT640CTCCAGGGACTATAGCCTGGGACCCTTTGTGGAGGAGTTG680TTTGAAGTGACATCCTGTTATTTCCCTATCGATTTTACCC720CTCCACCTAATGATCCCCATGGTATCCAGAGAGAAGACCT760CATCCTGAGTCTTCGCGCTGTGCTGGCTTCTACACCACGA800TTTGCTGAGTTTCTGCTGCCCCTGTTGATTGAGAAAGTGG840ATTCTGAGGTTCTGAGTGCCAAGTTGGATTCTCTACAGAC880TCTGAATGCTTGCTGTGCTGTGTATGGACAGAAGGAACTG920AAGGACTTCCTCCCCAGCCTTTGGGCTTCTATCCGCAGAG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。