基因總覽
MMP28 是蛋白質編碼基因，產物為 matrix metallopeptidase 28，屬於 peptidase M10A 家族。此蛋白質長 520 個胺基酸，具有 N 端訊號序列，以及位於蛋白質後段的四個 Hemopexin 重複區；序列中另有 Cysteine switch 基序。這些序列特徵構成其蛋白質的基本架構。來源指出，MMP28 蛋白質能分解 casein；至於其在組織中的角色，資料僅提示可能與組織恆定及修復有關，未提供更具體的作用機制。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000605424 ★ | 35,765,865–35,795,641 | 8 |
| ENST00000615317 | 35,756,249–35,768,326 | 3 |
| ENST00000991303 | 35,765,856–35,795,707 | 8 |
| ENST00001027047 | 35,765,856–35,795,707 | 8 |
| ENST00000863250 | 35,765,857–35,795,707 | 6 |
| ENST00000863251 | 35,765,857–35,795,707 | 8 |
| ENST00000863252 | 35,765,857–35,795,707 | 7 |
| ENST00000863253 | 35,765,857–35,795,707 | 8 |
| ENST00000863254 | 35,765,857–35,795,707 | 8 |
| ENST00000863255 | 35,765,857–35,795,707 | 7 |
| ENST00000863256 | 35,765,857–35,795,614 | 6 |
| ENST00000959303 | 35,765,857–35,795,707 | 6 |
顯示 12/28 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
MMP28 蛋白質具有分解 casein 的能力，這是來源所列出的具體底物作用。現有資料未進一步說明此分解作用發生的條件、對應的生理底物，或其在細胞與組織中的調控方式，因此不宜將這項能力延伸解讀為對其他特定分子的作用。
來源也提出，MMP28 可能參與組織恆定與修復。此描述保留了可能性，並未確定它在這些過程中的具體角色、作用方向或因果關係，也沒有指出相關組織、情境或實驗系統。因此，較合適的理解是：MMP28 的功能資料涵蓋一項可觀察到的蛋白質分解能力，以及一項尚待釐清的組織層級可能角色。
在分子特性方面，每個亞基可結合一個鋅離子。這項資訊描述其結合鋅離子的化學計量，但來源沒有交代鋅離子與 casein 分解活性之間的直接關係，也未提供反應機制或其他底物資訊。綜合而言，現有資料支持 MMP28 能分解 casein、每個亞基結合一個鋅離子，並可能參與組織恆定與修復；其更完整的生物學作用仍無法由這些資料確定。
Promoter 與基因調控
>MMP28 ENST00000605424 GRCh38 chr17:35795541-35796641 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter CTTAGGGTTGGAACACAGCATTATTTTTGTTCAGCACTTTAGGGATTCTAGATTATTTTTACACACATTA ACTCATCTAATCCCACAATGACCCCCAGAGCTCAGTATCATTTTCCATTTGCATTTTACAATGTAGTGAA TTGGGTAGAAGTGAGACAGCAACCAGCTCTCAGTTACACAGACAGATAATGAAAATAGTTTACTTTTTGC TCAATATGAGTTTAGCAAAGGCTTTCACGTAAACCGTTTCACTCCAACCTTATGGGGTATATAAAATCAG GCACTTTACACTCATTTTCTCTTTTCATCCTCATGCAACGCTGGGCACTAAATATCGTATGCTGTCATTT TATTGATGAGGAAACTGACGCTCGAAGTAGTTAAATCCTTTGCCAAAGATCACACAGCTGCAGCCTGCCC CTTATTAAGTGCACACTTCGTGATGCCATGCACCCTGTTCAGTAATTTACAGGCGTTATTATCTCCCCAA CAGTCACAGAATATCGGTATTCTTATTATCCCATTTACTGATGAGAAAAGTGGGTTCAGAGAGGGTGAGT GACTGGTCCAAGACCACACAGCCAGCAGGTGGCTGAGGCAGGACTCAAAGGGCTAGCAAAGGAGCAAGTC TGGAACTCAAACCCAGTTCTGACTCCAGCTCTGTGCTGCTTCTCTCGCACCCCGACCCTGGGTGGGGGCC TCGCTCCCCACCCAGCTGAAACAATCAACGACCCTCTGGTAGACCAGGACCTCTCTTCATCGAAGTCTTA GGTAGCCACGCTTGCCAGGAGAAGGCCTTTCTTCCTTCACCCTCCCTGGACAGATCCGGGTCAACTGGAG GTGGCGGGCGAGAGGACCGATCCGCAGGGCGGTGGCGGGCGCAGGGCGAGGCTGTGCAGCGAACGGAAGA GGCTCCGGGACCGCCTCGCGTTCCAGCAGCGGCGCGGGGTGGGTGGGGCGGGAGTGCCGGGCCTCCGCCC CCTCCGCCTGCCTTTCCTTCCTCCCTCCCTCGGTCCCCGGGGCCGGCGGACCCGCGGGCAGGCACTGCCC GGGCTGGACGACGTCTGGCCGGCTCCCGGCGAAGGGCAGCGGAGGAGCGGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MMP28_1 ↗ | 17:35,795,614 | 負股 | 35,795,604–35,795,663 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR17_5BFB2Q · CTCF_binding_site · 35791135–35791156 · regulatory
ENSR17_5BFBPT · CTCF_binding_site · 35795266–35795287 · regulatory
ENSR17_9J7LL · promoter · 35795614–35796098 · regulatory
ENSR17_9J7MS · enhancer · 35799939–35800320 · regulatory
· motif · 35791137–35791153 · motif
· motif · 35791847–35791860 · motif
· motif · 35791847–35791860 · motif
· motif · 35794612–35794621 · motif
· motif · 35794612–35794621 · motif
· motif · 35795268–35795284 · motif
· motif · 35795478–35795491 · motif
· motif · 35795655–35795668 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：520 aa
matrix metallopeptidase 28 長 520 個胺基酸，屬於 peptidase M10A 家族。蛋白質第 1–22 位為訊號序列；第 89–96 位有 Cysteine switch 基序。第 325–369、370–409、415–463 與 464–510 位分別標註為 Hemopexin 1 至 Hemopexin 4 重複區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
matrix metallopeptidase 28 被標註為分泌至細胞外空間，並位於細胞外基質。 來源未提供定位改變的條件、不同異構型之間的差異或動態資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- FURINP09958 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRIM68Q6AZZ1 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | matrix metallopeptidase 28 能分解 casein；來源另指出，它可能參與組織恆定與修復，但未進一步說明這些組織層級作用的具體機制或條件。 | 資料庫紀錄 | |
| 分子活性 | 每個亞基可結合一個鋅離子；來源未補充鋅離子結合的其他條件或其與底物作用的關係。 | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | matrix metallopeptidase 28 被標註為分泌蛋白，定位於細胞外空間與細胞外基質。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
CTCCCTCCCTCGGTCCCCGGGGCCGGCGGACCCGCGGGCA40GGCACTGCCCGGGCTGGACGACGTCTGGCCGGCTCCCGGC80GAAGGGCAGCGGAGGAGCGGCCCAGAGCGCGCAGCTAGGG120CACTGGCGAAACCCCGGGACAGTCCCTCTCCGTGCGGGGG160CGGCGCAGAGCAGTCCCATCCCCGGGGTCCCGGGCGCGGC200TGACTGCCGGCTGGTTCCCTGCGCGCAGTAGCTCCCCGAG240CCGGGCTGCACCGGAGGCGGCGAGATGGTCGCGCGCGTCG280GCCTCCTGCTGCGCGCCCTGCAGCTGCTACTGTGGGGCCA320CCTGGACGCCCAGCCCGCGGAGCGCGGAGGCCAGGAGCTG360CGCAAGGAGGCGGAGGCATTCCTAGAGAAGTACGGATACC400TCAATGAACAGGTCCCCAAAGCTCCCACCTCCACTCGATT440CAGCGATGCCATCAGAGCGTTTCAGTGGGTGTCCCAGCTA480CCTGTCAGCGGCGTGTTGGACCGCGCCACCCTGCGCCAGA520TGACTCGTCCCCGCTGCGGGGTTACAGATACCAACAGTTA560TGCGGCCTGGGCTGAGAGGATCAGTGACTTGTTTGCTAGA600CACCGGACCAAAATGAGGCGTAAGAAACGCTTTGCAAAGC640AAGGTAACAAATGGTACAAGCAGCACCTCTCCTACCGCCT680GGTGAACTGGCCTGAGCATCTGCCGGAGCCGGCAGTTCGG720GGCGCCGTGCGCGCCGCCTTCCAGTTGTGGAGCAACGTCT760CAGCGCTGGAGTTCTGGGAGGCCCCAGCCACAGGCCCCGC800TGACATCCGGCTCACCTTCTTCCAAGGGGACCACAACGAT840GGGCTGGGCAATGCCTTTGATGGCCCAGGGGGCGCCCTGG880CGCACGCCTTCCTGCCCCGCCGCGGCGAAGCGCACTTCGA920CCAAGATGAGCGCTGGTCCCTGAGCCGCCGCCGCGGGCGC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。