基因總覽
MMP27（matrix metallopeptidase 27）是蛋白質編碼基因，產物屬於 peptidase M10A family，並具有基質金屬蛋白酶相關註解。其蛋白質長度為 513 個胺基酸，序列包含 N 端訊號序列、Cysteine switch 基序，以及四個 Hemopexin 重複區。蛋白質 C 端另有一段與留在內質網相關的延伸區。這些序列特徵構成 MMP27 的基本分子概貌；其家族所涉及的基質蛋白分解作用，詳述於功能段落。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000260229 ★ | 102,691,487–102,705,769 | 10 |
| ENST00001144511 | 102,691,487–102,705,778 | 10 |
顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
MMP27 的功能註解來自基質金屬蛋白酶家族：此類酵素可分解細胞外基質中的蛋白質成分。來源列出的例子包括 fibronectin、laminin、gelatins 與 collagens，並以「和／或」表示可能涉及其中一種或多種底物；資料未進一步指出 MMP27 對個別成分的作用偏好或分解效率。
細胞外基質由多種蛋白質成分構成。依據這項家族層級的註解，MMP27 所屬蛋白質家族具有分解此類成分的能力，因此其功能與細胞外基質蛋白質的降解相關。現有資料沒有說明 MMP27 在特定生物過程中的具體作用，也沒有提供其底物辨識方式、催化步驟或不同底物之間的差異；因此不宜將家族的一般功能延伸為 MMP27 已被逐一驗證的特定作用。
資料另指出，每個亞基可結合 4 個 Ca²⁺ 離子及 2 個 Zn²⁺ 離子。這些是蛋白質的離子結合註解，來源未提供離子結合對酵素活性或底物分解的具體影響，故不能據此補述其調控機制。
Promoter 與基因調控
>MMP27 ENST00000260229 GRCh38 chr11:102705669-102706769 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GAAAGGTGTATCGATTGAGGAGTTAACATTTGGGAAGAAAGGGAAGAAAATTTTAATAATTGGTAGAAGA AAAGGGGAGGACAAGTGAGGGAGGACATTGCTGTAACTAAGACTGTTCCTTCATCTAAAAGTAGCCCAAG TAAAGAAGAATATATTGAAATTAATCCAAAAGGCTCTCACTAACTATATTCTCACTTCTGATGTTAATTT TGGCCTTCATCATCCATGACCTCTATGACTCTTCATCTTCCCAGTCAGCTGTCTTGTCCATGAGACCCTC CATCCCATCTTCCATAGCTGTCTACATATGTATTTTGTTCCAGTCAGGCCAGATTTCCTGCAGCTTATTT CTGCTGTGTTACCTCCTTCCCATGGCCTCTTTGCACTCATACTTCTTCTTCCTTCCTCTGTAAATCCAAA TTCTACACATTCTCCAAAACCCAGAGCAAGCCCTAGTGCAAGCCCCAGTGCAGGCTGTATTTAACTTGCA TAAAACCTCAAGGCCACACTCATAAGCAATGATCTGCCTTTGGCCCTTCTTAGTCTTTACAATCTGCACT GTGTATTTGCCCACTTGCCTCCTTTTTGTCCTACATTAATTTCTGTATGTGTCTGAATTCTCCAACAAGA TTGCATTCACAGGGGCAGGCAAACAGTAGGAATTCAATAAACATTTGAAGTTTATCTTAGTTAATAAGGG TAATCTGACTCCTGATTCATTTGTCTTTTTATGATAACATCCTACCAAGATATTCTGAGATTGCCTTCAA AAGAAAACTTTGCAAGGAAAAAAAAATAACTTGGAGGCTCACTTCCCAGTATATTCAATTCAGTAATAAG CACTAACTGTGTTTACTAAACAATTGCAGGCCAAGATTACAAAATCAGCTCAGTCAAAAAAAAAAAAAAA AAAAAGCAAATCATGACACACTTTATGGCAAGTGTCCCTTTCTGTTATTAATTAAATGATGATACAAGCC AATTCATGCCACGTCTCACTATTATTTTCTAAATTCTGTGCTAACAGAACCGGCTTCAGCTGAAGAAAGA GAGGAATGAAGCGCCTTCTGCTTCTGTTTTTGTTCTTTATAACATTTTCTT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MMP27_1 ↗ | 11:102,705,744 | 負股 | 102,705,734–102,705,793 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
· motif · 102709365–102709374 · motif
· motif · 102709365–102709374 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：513 aa
MMP27 長 513 個胺基酸，屬於 peptidase M10A family。其序列註解包含第 1–17 位的訊號序列、第 89–96 位的 Cysteine switch 基序，以及第 276–465 位的四個 Hemopexin 重複區。第 466–513 位為與滯留於內質網相關的 C 端區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
MMP27 位於內質網；其 C 端延伸區與滯留於內質網有關。 來源描述的是 MMP27 本身的定位，未提供不同異構型或定位變動條件的資料。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | 基質金屬蛋白酶可分解細胞外基質中的蛋白質成分，來源列出的例子包括 fibronectin、laminin、gelatins 與 collagens，並以「和／或」保留可能涉及一種或多種成分的表述。 | 推論支持 | 證據與來源Matrix metalloproteinases degrade protein components of the extracellular matrix such as fibronectin, laminin, gelatins and/or collagens |
| 分子活性 | 每個亞基可結合 4 個 Ca²⁺ 離子；來源未提供此結合的其他條件或功能後果。 | 資料庫紀錄 | |
| 分子活性 | 每個亞基可結合 2 個 Zn²⁺ 離子；來源未提供此結合的其他條件或功能後果。 | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | MMP27 留在內質網；來源將此滯留與其 C 端延伸區（CTE）相連，未說明其他定位或動態變化。 | 含實驗來源 | 證據與來源Endoplasmic reticulum; Retained in the endoplasmic reticulum due to a C-terminal extension (CTE) PMID 24548619 ↗ |
核酸與蛋白質序列
ATTATTTTCTAAATTCTGTGCTAACAGAACCGGCTTCAGC40TGAAGAAAGAGAGGAATGAAGCGCCTTCTGCTTCTGTTTT80TGTTCTTTATAACATTTTCTTCTGCATTTCCCTTAGTCCG120GATGACGGAAAATGAAGAAAATATGCAACTGGCTCAGGCA160TATCTCAACCAGTTCTACTCTCTTGAAATAGAAGGGAATC200ATCTTGTTCAAAGCAAGAATAGGAGTCTCATAGATGACAA240AATTCGGGAAATGCAAGCATTTTTTGGATTGACAGTGACT280GGAAAACTGGACTCAAACACCCTTGAGATCATGAAGACAC320CCAGGTGTGGGGTGCCTGATGTGGGCCAGTATGGCTACAC360CCTCCCTGGGTGGAGAAAATACAACCTCACCTACAGAATA400ATAAACTATACTCCGGATATGGCACGAGCTGCTGTGGATG440AGGCTATCCAAGAAGGTTTAGAAGTGTGGAGCAAAGTCAC480TCCACTAAAATTCACCAAGATTTCAAAGGGGATTGCAGAC520ATCATGATTGCCTTTAGGACTCGAGTCCATGGTCGGTGTC560CTCGCTATTTTGATGGTCCCTTGGGAGTGCTTGGCCATGC600CTTTCCTCCTGGTCCGGGTCTGGGTGGTGACACTCATTTT640GATGAGGATGAAAACTGGACCAAGGATGGAGCAGGATTCA680ACTTGTTTCTTGTGGCTGCTCATGAATTTGGTCATGCACT720GGGGCTCTCTCACTCCAATGATCAAACAGCCTTGATGTTC760CCAAATTATGTCTCCCTGGATCCCAGAAAATACCCACTTT800CTCAGGATGATATCAATGGAATCCAGTCCATCTATGGAGG840TCTGCCTAAGGAACCTGCTAAGCCAAAGGAACCCACTATA880CCCCATGCCTGTGACCCTGACTTGACTTTTGACGCTATCA920CAACTTTCCGCAGAGAAGTAATGTTCTTTAAAGGCAGGCA960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。