基因總覽
MMP25（matrix metallopeptidase 25）是蛋白質編碼基因，其產物屬於 peptidase M10A 家族。此蛋白質具有 562 個胺基酸，包含訊號序列、Cysteine switch motif，以及四個 Hemopexin 重複區；部分區段被註記為無序區。這些序列特徵構成其蛋白質的基本架構。來源另指出，MMP25 可能活化 progelatinase A；其具體作用內容見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000336577 ★ | 3,046,561–3,060,726 | 10 |
| ENST00000850602 | 3,046,525–3,060,729 | 10 |
| ENST00000928200 | 3,046,525–3,060,729 | 10 |
| ENST00001087453 | 3,046,525–3,060,729 | 10 |
| ENST00000928201 | 3,046,561–3,060,729 | 10 |
顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
MMP25 的來源功能註記指出，它可能活化 progelatinase A。此描述保留「可能」的限定，表示資料提出其具備這項作用，但未在所提供內容中列出活化所需的條件、反應步驟或實驗結果，因此不宜據此推演更完整的分子機制或生物學效應。
來源也記載，每個 MMP25 次單元可結合一個鋅離子。這是對其金屬離子結合特性的描述；資料沒有進一步說明鋅離子在特定反應中的作用，也沒有提供結合位點或活性測定的細節。
因此，現有資料支持的功能重點限於兩項：MMP25 可能參與 progelatinase A 的活化，以及每個次單元結合一個鋅離子。來源未交代此活化與其他生物學過程之間的關聯，也未說明其發生條件或生理後果，故不延伸推論其在特定組織或情境中的功能。
Promoter 與基因調控
>MMP25 ENST00000336577 GRCh38 chr16:3045561-3046661 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGTCCTTGGTGTTTTGTTCTGGCGGCCCCAGCGAGCGGGCGCGGGATCGCAGTGTTTGCCTTTGCATCTC CAGCTCCGCATCCTGCTCGCTGTTTATTTTGTGAGCAGCTCCGGCGGCTGCCCCTGAACTGCTCCGAGAC TGAGCAGTTTAACTCACACTCGCCCACCCGCCCTCCCCAGGAAGCCTCCCGCCCGCTTCCTCCAGTTCCT TCCCCACCTGTCCGGCCTCCTAGCCCGGTGCTCTCGGCGCGGGAGGAGGCGGCTCGCAGACCCCCAGGTC TCGGCTTCCCGGATCTCCCCCGCCTACTCACTCCCCGGTCCCCGGCTCCCGGCACTGGCAGGCGCTGTGG CTTCCGCGCAGTGGCTGCAGCATTTAAATGTCCGGCACTTAGGGAGAGGGGTGCAGTCGCGGAGCAGCCG CTGCTCCCGGCATCTAGAGGGGCCCAAACCCCCGCGTGCCCAGGCCGAGCCCCGCGCGCAGCCCACGTGG GCTGAGGGACTGAGTATTGGCCCTCGGGCAGCTGCAACCGCGCACAGCTGGAGCTGGCGGGGCGGAGGGC GGGCCGGGACCCCGCGGGGAAGGAGGCTTCCTTCCCAGCCTCCTGCTGCCCGGAAATCCCCCCGGCTCTC AGACAACCTGCCCCACGGGGTCCTGGGGGGAAGGAGAGGGGCGGGATACAGGGATGGGGAGGGCTGGCTG AGCCGAAGGCCCGGGCCGCCCTCCCCCAGGCCGCGCGGCTTCGAGAAAGCAGAAGCGAGCCCTGCCCCGG GGAGTCCCACAGGAGCGGGGATCTGGGAAGAGAAACTTGCGGACGAGGGAGTTAGAGCCGTGGACCCCCG GCCCCCGCCCGGGCGTCCTGCGTCGGAGGAGGGTCTCTGGGTCGGGCAGGGGCCACCTCTTGGCCCGCCC CTTGTCGCTGGACGTCCGAAGATTGGGCCATTTCCCTTGCCGCGCCCTTACCGCATATCGGGGTGCGCCC GGCCCGGCCCGGCCCGCCCCACCCAGCCCTCCGCTCGCGCCCGGAGAGGAGGGGCCGCTGGCGCAGCGCC CCGGGACCCCGAGAGGCCGCCGCGGCACATCCAGACCTCCGCCGCTCCCGC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MMP25_1 ↗ | 16:3,046,561 | 正股 | 3,046,512–3,046,571 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR16_CB6B · enhancer · 3045265–3046413 · regulatory
ENSR16_5PC6Z · CTCF_binding_site · 3045372–3045393 · regulatory
ENSR16_5PC79 · CTCF_binding_site · 3045431–3045452 · regulatory
ENSR16_84FB2 · promoter · 3046414–3046571 · regulatory
ENSR16_5PCFN · CTCF_binding_site · 3046817–3046838 · regulatory
· motif · 3045374–3045390 · motif
· motif · 3045433–3045449 · motif
· motif · 3046033–3046049 · motif
· motif · 3046033–3046049 · motif
· motif · 3046167–3046178 · motif
· motif · 3046169–3046178 · motif
· motif · 3046304–3046317 · motif
· motif · 3046430–3046445 · motif
· motif · 3046452–3046467 · motif
· motif · 3046819–3046835 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：562 aa
MMP25 蛋白質長 562 個胺基酸，屬於 peptidase M10A 家族。序列註記包括第 1–21 位的訊號序列、第 88–95 位的 Cysteine switch motif，以及第 314–508 位分成四段的 Hemopexin 重複區。第 278–313 位與第 490–526 位被標示為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
MMP25 位於細胞膜，並以 GPI-anchor 錨定，定位於細胞外側；來源也記載其可分泌至細胞外空間及細胞外基質。 資料未提供不同定位狀態的條件或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
細胞外定位：圓點散佈於細胞周圍，與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- MEOX2Q6FHY5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
已取得的互作紀錄列於上方網絡與資料卡。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | MMP25 可能活化 progelatinase A；原始註記以「可能」表述，未提供活化的條件、機制或實驗結果。 | 資料庫紀錄 | |
| 分子活性 | 每個 MMP25 次單元結合一個鋅離子；註記未進一步說明其結合位置或功能。 | 資料庫紀錄 | |
| 細胞定位 | MMP25 位於細胞膜並以脂質錨定，其中註明 GPI-anchor，定位於細胞外側；也記載其位於細胞外空間及細胞外基質。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Cell membrane / Lipid-anchor, GPI-anchor / Extracellular side; Secreted, extracellular space, extracellular matrix |
核酸與蛋白質序列
ACCCAGCCCTCCGCTCGCGCCCGGAGAGGAGGGGCCGCTG40GCGCAGCGCCCCGGGACCCCGAGAGGCCGCCGCGGCACAT80CCAGACCTCCGCCGCTCCCGCGCCCTCTCAACCATCCTGG120GATTCCCGGGCCCACCCGACCCAGCGGCGCGACCCTGGCC160CTCCGGGACCCTCCGCTGACTCCACCGCGCACTTCCCGGG200ACCCCCACACACATCCCAGCCCTCCGGCCGATCCCTCCCT240ACTCGGTGCCGGGTGCCCCCCGCCCTCTCCAGGCCCGGAT280CTCCTCCCCCAGGTCCCCGGGGCGGCCCCAGCCAGGCCCC320CTTCGAACCCCGCCGGCGGCCCGGGCTGGGGCGCACCATG360CGGCTGCGGCTCCGGCTTCTGGCGCTGCTGCTTCTGCTGC400TGGCACCGCCCGCGCGCGCCCCGAAGCCCTCGGCGCAGGA440CGTGAGCCTGGGCGTGGACTGGCTGACTCGCTATGGTTAC480CTGCCGCCACCCCACCCTGCCCAGGCCCAGCTGCAGAGCC520CTGAGAAGTTGCGCGATGCCATCAAAGTCATGCAGAGGTT560CGCGGGGCTGCCGGAGACCGGCCGCATGGACCCAGGGACA600GTGGCCACCATGCGTAAGCCCCGCTGCTCCCTGCCTGACG640TGCTGGGGGTGGCGGGGCTGGTCAGGCGGCGTCGCCGGTA680CGCTCTGAGCGGCAGCGTGTGGAAGAAGCGAACCCTGACA720TGGAGGGTACGTTCCTTCCCCCAGAGCTCCCAGCTGAGCC760AGGAGACCGTGCGGGTCCTCATGAGCTATGCCCTGATGGC800CTGGGGCATGGAGTCAGGCCTCACATTTCATGAGGTGGAT840TCCCCCCAGGGCCAGGAGCCCGACATCCTCATCGACTTTG880CCCGCGCCTTCCACCAGGACAGCTACCCCTTCGACGGGTT920GGGGGGCACCCTAGCCCATGCCTTCTTCCCTGGGGAGCAC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。