演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

MMP21

matrix metallopeptidase 21

MMP21 編碼 matrix metallopeptidase 21,屬於 peptidase M10A 家族。此蛋白質在胚胎發育建立左右不對稱的過程中具有專門角色,並可切割 alpha-1-antitrypsin。

Homo sapiens10q26.2UniProt Q8N119
OFFICIAL SYMBOL
MMP21
CHROMOSOME
10
UNIPROT
Q8N119
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

MMP21 是一個蛋白質編碼基因,其產物 matrix metallopeptidase 21 屬於 peptidase M10A 家族。這類蛋白質具有蛋白酶特徵;MMP21 每個次單元可結合一個鋅離子。其序列包含訊號區、Cysteine switch 基序,以及四個 Hemopexin 重複區;其中一段被註記為無序區。這些特徵構成辨識 MMP21 蛋白質性質的基本線索。胚胎發育期間,MMP21 與左右不對稱的形成有關;其可能具有調節 NOTCH 訊號的角色,此外也有切割 alpha-1-antitrypsin 的作用。

Official symbol
MMP21
Gene name
matrix metallopeptidase 21
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14357
UniProt
Q8N119
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
HGNC 未提供其他基因異名。

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1010q26.2
chr10 · 133,797,422 bp · GRCh38chr10p15.3 · 1–3000000 · gnegchr10p15.2 · 3000001–3800000 · gpos25chr10p15.1 · 3800001–6600000 · gnegchr10p14 · 6600001–12200000 · gpos75chr10p13 · 12200001–17300000 · gnegchr10p12.33 · 17300001–18300000 · gpos75chr10p12.32 · 18300001–18400000 · gnegchr10p12.31 · 18400001–22300000 · gpos75chr10p12.2 · 22300001–24300000 · gnegchr10p12.1 · 24300001–29300000 · gpos50chr10p11.23 · 29300001–31100000 · gnegchr10p11.22 · 31100001–34200000 · gpos25chr10p11.21 · 34200001–38000000 · gnegchr10p11.1 · 38000001–39800000 · acenchr10q11.1 · 39800001–41600000 · acenchr10q11.21 · 41600001–45500000 · gnegchr10q11.22 · 45500001–48600000 · gpos25chr10q11.23 · 48600001–51100000 · gnegchr10q21.1 · 51100001–59400000 · gpos100chr10q21.2 · 59400001–62800000 · gnegchr10q21.3 · 62800001–68800000 · gpos100chr10q22.1 · 68800001–73100000 · gnegchr10q22.2 · 73100001–75900000 · gpos50chr10q22.3 · 75900001–80300000 · gnegchr10q23.1 · 80300001–86100000 · gpos100chr10q23.2 · 86100001–87700000 · gnegchr10q23.31 · 87700001–91100000 · gpos75chr10q23.32 · 91100001–92300000 · gnegchr10q23.33 · 92300001–95300000 · gpos50chr10q24.1 · 95300001–97500000 · gnegchr10q24.2 · 97500001–100100000 · gpos50chr10q24.31 · 100100001–101200000 · gnegchr10q24.32 · 101200001–103100000 · gpos25chr10q24.33 · 103100001–104000000 · gnegchr10q25.1 · 104000001–110100000 · gpos100chr10q25.2 · 110100001–113100000 · gnegchr10q25.3 · 113100001–117300000 · gpos75chr10q26.11 · 117300001–119900000 · gnegchr10q26.12 · 119900001–121400000 · gpos50chr10q26.13 · 121400001–125700000 · gnegchr10q26.2 · 125700001–128800000 · gpos50chr10q26.3 · 128800001–133797422 · gnegMMP21pq1 bp133,797,422 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr10:125,753,580–125,775,913
Gene span
22,334 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000368808 ★125,766,453–125,775,8217
ENST00000651977125,757,467–125,775,9135
ENST00000652044125,757,509–125,770,5912

顯示 3/3 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

MMP21 在胚胎發育建立左右不對稱的過程中具有專門角色。左右不對稱是胚胎發育的重要安排,來源指出 MMP21 參與其形成,但未進一步交代它在此過程中的作用步驟或下游結果,因此不宜將其描述為單獨決定器官排列的因子。

MMP21 可能是 NOTCH 訊號路徑的負向調節因子。這項作用以「可能」描述,表示其調節角色帶有不確定性;現有資料沒有詳述它如何影響 NOTCH 訊號,也未指出相關效應發生的細胞類型或發育階段。因此可將其視為可能參與訊號調節的功能線索,而非已完整界定的分子機制。

另一項已記載的分子作用是切割 alpha-1-antitrypsin。資料未提供切割位置、反應條件或此切割對 alpha-1-antitrypsin 活性的影響,因而無法據此延伸其生理後果。MMP21 每個次單元結合一個鋅離子,與其蛋白酶身分相符;但來源未說明鋅離子在上述各項作用中的具體貢獻。

這些資訊共同指向 MMP21 的功能範圍包含胚胎左右不對稱形成、可能的 NOTCH 訊號負向調節,以及 alpha-1-antitrypsin 切割。各項記載涵蓋發育相關角色與分子層級作用,但對彼此是否直接相連、作用順序及其生物學後果,來源並未提供足夠細節。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 125775821 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>MMP21 ENST00000368808 GRCh38 chr10:125775721-125776821 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
ATATTCCCATGGACGGCTGTGACCCAGTCAGTCTGCACTCTCAGGAGGACATCTGCTCAGATAAAAGCCC
AGTTCAGGGGCTCTGTCTTCAGGATCCCAAAGAAACTTGAGGCTTCTCCATGAGGGGAAAAAGTAGTGGG
CTGAGGTGATTCTAGTTTATCCTTCTATAAAAATCTTTACCCACAGAATGGGACGCTGTGCAGTCATTAA
CTAGAACGATAAATACTTACATTCAGAAACAGAAAAGTGCCTGTAACGTTGTGCTGGCTTGTAAGAACAG
AGAATAGAGTTCATGTAAAATGAGAGACACACACAAATACTTCTCTAGGCATCTGTGCATATGTATCTGC
AAGAATGTTCACTGAAATGTCACCACCGGAATCACAGAATGTCTCCTTCATTCTCAGTACTTTTACAATT
TATACTATCTGCTCAGAAGATCTCCTTTATATAAAGATAAACAAAAAGAAGAAAAGCCACACAAAAAATG
TGTGAGAAACAAACTAAAAATCTCCAAACCCCAGTTCACCAAGAAAAAAAAAGTGACCCAAACTGTAAGC
AAACTAACGGTCAGGGTTTTTAAACTCAGGCTCAGCTCTGAGAGGCATGTTGTTAGGGGCGCAGTCTCGT
GCCTCTGTTAATTCCACAGCTCATTTAGCGGCAAACTTGCCCGCAGTATATCTCCATAGAAATGGAACCC
ACAGGCACTGGCAACTGGAGGATGTAATTATCGGAGGACATGGCAAACTCTGGAGGCTGAGAGAAGGAGT
TCTCACACCAACAAGAAAGGTGAGCCTGGGGTCTTCAAAGGCAGCACGCCCAGGGCCTGCCACGTGGCCT
CCTAGCGGGCACACTTCAGGGCTGGGTGAGAAATGCTTGGAAACCTGGGTGCTCCCTCCTGCGTAGCTTA
TAAAAGCCACCCTAGGTCCTGCTCCTTAAGGAGAGGTGACGGGGACGGGGAAGAAGCCAGGCAGGGAGGG
CAAGGGTTCAGACCAGGCCAATGCTCGCCGCCTCCATCTTCCGTCCGACACTGCTGCTCTGCTGGCTGGC
TGCTCCCTGGCCCACCCAGCCCGAGAGTCTCTTCCACAGCCGGGACCGCTC
MMP21 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
MMP21_1 ↗10:125,775,792負股125,775,782–125,775,841

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:569 aa

1 aa569 aa功能區域基序重複區訊號胜肽
依 Q8N119 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

MMP21 蛋白質長 569 個胺基酸,含有位於第 1–24 位的訊號區,以及第 115–122 位的 Cysteine switch 基序。第 330–389、391–447、448–496 與 503–559 位各有一個 Hemopexin 重複區;第 115–166 位則被註記為無序區。

訊號胜肽1–24 aa
重複區Hemopexin 1330–389 aa
重複區Hemopexin 2391–447 aa
重複區Hemopexin 3448–496 aa
重複區Hemopexin 4503–559 aa
功能區域Disordered115–166 aa
基序Cysteine switch115–122 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q8N119…

AlphaFold · Q8N119

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted

MMP21 被註記為分泌型蛋白質。 來源未提供不同異構型或特定條件下定位改變的資訊。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
MMP21MMP21
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

目前未取得此類註解。
10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

MMP21 相關變異可造成常染色體隱性遺傳的內臟異位症 7 型(HTX7)。此病涉及胸腹腔器官正常左右不對稱遭到破壞,心臟、肺、肝、脾與胃等器官可能呈現隨機排列,也可能伴隨先天缺陷,包括心臟畸形。這是變異與疾病的因果關聯描述,並非僅表示風險相關。

個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

4 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 4 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能MMP21 在胚胎發育建立左右不對稱的過程中具有專門角色;它可能是 NOTCH 訊號路徑的負向調節因子,這項調節作用仍帶有不確定性。此外,MMP21 可切割 alpha-1-antitrypsin。含實驗來源
證據與來源

Plays a specialized role in the generation of left-right asymmetry during embryogenesis. May act as a negative regulator of the NOTCH-signaling pathway. Cleaves alpha-1-antitrypsin

PMID 12617721 ↗ · PMID 26429889 ↗ · PMID 26437028 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

分子活性MMP21 的每個蛋白質次單元可結合一個鋅離子。資料庫紀錄
證據與來源

Binds 1 zinc ion per subunit.

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Secreted推論支持
證據與來源

Secreted

開啟資料庫紀錄 ↗

疾病關聯MMP21 相關變異可造成常染色體隱性遺傳的內臟異位症 7 型(HTX7)。此病源於胸腹腔器官正常左右不對稱遭到破壞,器官包括心臟、肺、肝、脾與胃,可能相對左右軸及彼此呈隨機排列;疾病可伴隨多種先天缺陷,例如心臟畸形。含實驗來源
證據與來源

Heterotaxy, visceral, 7, autosomal HTX7 A form of visceral heterotaxy, a complex disorder due to disruption of the normal left-right asymmetry of the thoracoabdominal organs. Visceral heterotaxy or situs ambiguus results in randomization of the placement of visceral organs, including the heart, lungs, liver, spleen, and stomach. The organs are oriented randomly with respect to the left-right axis and with respect to one another. It can be associated with a variety of congenital defects including cardiac malformations. HTX7 inheritance is autosomal recessive. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 616749

PMID 26429889 ↗ · PMID 26437028 ↗ · PMID 26437029 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 4 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000368808 · 1,919 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1ATGCTCGCCGCCTCCATCTTCCGTCCGACACTGCTGCTCT40
41GCTGGCTGGCTGCTCCCTGGCCCACCCAGCCCGAGAGTCT80
81CTTCCACAGCCGGGACCGCTCGGACCTGGAGCCGTCCCCA120
121CTGCGCCAGGCCAAGCCCATTGCCGACCTCCACGCTGCTC160
161AGCGGTTCCTGTCCAGATACGGCTGGTCAGGGGTGTGGGC200
201GGCCTGGGGGCCCAGTCCCGAGGGGCCGCCGGAGACCCCC240
241AAGGGCGCCGCCCTGGCCGAGGCGGTGCGCAGGTTCCAGC280
281GGGCGAACGCGCTGCCGGCCAGCGGGGAGCTGGACGCGGC320
321CACCCTAGCGGCCATGAACCGGCCGCGCTGCGGGGTCCCG360
361GACATGCGCCCACCGCCCCCCTCCGCCCCGCCTTCGCCCC400
401CGGGCCCGCCCCCCAGAGCCCGCTCCAGGCGCTCCCCGCG440
441GGCGCCGCTGTCCTTGTCCCGGCGGGGTTGGCAGCCCCGG480
481GGCTACCCCGACGGCGGAGCTGCCCAGGCCTTCTCCAAGA520
521GGACGCTGAGCTGGCGGCTGCTGGGCGAGGCCCTGAGCAG560
561CCAACTGTCCGTGGCCGACCAGCGGCGCATTGTGGCGCTG600
601GCCTTCAGGATGTGGAGCGAGGTGACGCCGCTGGACTTCC640
641GCGAGGACCTGGCCGCCCCCGGGGCCGCGGTCGACATCAA680
681GCTGGGCTTTGGGAGAGGCCGGCACCTGGGCTGTCCGCGG720
721GCCTTCGATGGGAGCGGGCAGGAGTTTGCACACGCCTGGC760
761GCCTAGGTGACATTCACTTTGACGACGACGAGCACTTCAC800
801ACCTCCCACCAGTGACACGGGCATCAGCCTTCTCAAGGTG840
841GCCGTCCATGAAATTGGCCATGTCCTGGGCTTGCCTCACA880
881CCTACAGGACGGGATCCATAATGCAACCAAATTACATTCC920
921CCAGGAGCCTGCCTTTGAGTTGGACTGGTCAGACAGGAAA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。