演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

MIS18AB28

MIS18 kinetochore protein A

MIS18A(MIS18 kinetochore protein A)是 MIS18 家族的蛋白質,參與 CENPA 招募至著絲點及有絲分裂期間的正常染色體分離。

Homo sapiens21q22.11UniProt Q9NYP9
OFFICIAL SYMBOL
MIS18A
CHROMOSOME
21
UNIPROT
Q9NYP9
PDB / ALPHAFOLD
7SFZ
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

MIS18A(MIS18 kinetochore protein A)是由蛋白質編碼基因 MIS18A 產生的蛋白質,屬於 MIS18 家族,長 233 個胺基酸。其序列包含一段 Mis18 結構域。MIS18A 的主要角色與著絲點相關:它是 CENPA 招募至著絲點所必需的蛋白質,並與有絲分裂期間的正常染色體分離有關。

Official symbol
MIS18A
Gene name
MIS18 kinetochore protein A
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:1286
UniProt
Q9NYP9
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
B28FASP1hMis18alphaC21orf46C21orf45

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 2121q22.11
chr21 · 46,709,983 bp · GRCh38chr21p13 · 1–3100000 · gvarchr21p12 · 3100001–7000000 · stalkchr21p11.2 · 7000001–10900000 · gvarchr21p11.1 · 10900001–12000000 · acenchr21q11.1 · 12000001–13000000 · acenchr21q11.2 · 13000001–15000000 · gnegchr21q21.1 · 15000001–22600000 · gpos100chr21q21.2 · 22600001–25500000 · gnegchr21q21.3 · 25500001–30200000 · gpos75chr21q22.11 · 30200001–34400000 · gnegchr21q22.12 · 34400001–36400000 · gpos50chr21q22.13 · 36400001–38300000 · gnegchr21q22.2 · 38300001–41200000 · gpos50chr21q22.3 · 41200001–46709983 · gnegMIS18Apq1 bp46,709,983 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr21:32,268,221–32,279,098
Gene span
10,878 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000290130 ★32,268,228–32,279,0495
ENST0000092659932,268,224–32,279,0985
ENST0000095639632,268,224–32,279,0864
ENST0000100174132,268,224–32,279,0864
ENST0000113163232,268,224–32,279,0865

顯示 5/5 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

MIS18A 是 CENPA 招募至著絲點所必需的蛋白質。此作用與有絲分裂期間的正常染色體分離相關,說明 MIS18A 參與維持染色體分離所需的著絲點功能。現有資料未進一步描述其作用機制或其他生物學過程。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 32279049 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>MIS18A ENST00000290130 GRCh38 chr21:32278949-32280049 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CCACCAGACTGTCTGTGGTGCAGCTGGCTGGTTCCCCGCCAGCTTTCCCTCCTGACCTACGGTGTTTTAG
GCAGAGGCTGGCTTTCTGGGGCAGCTGAGGAAATCTGTCCTTATCATCAACAAGGGATGCTTCTTCCTTG
CAAGGACGAATTGTTCCTTGATCCAAGCAGCAGGGACACTTCCAGGCTTTCCAGGGGCACTGCTGCTTCC
TCAACTTTTTCCTTGCAGTGACAGCCTGAGTGATCCGGGGCCCTTCCCAGGGTCTCATTCCAGGGATAGC
AGTGCGCAAAAGGACCCTGTGATGAGGGACTCCTCTATCCCCTTCCTTCTCCACTTCATGGAAAGGAGGT
CCCCAGGAGCCGACAAAATAGAGCAGTGGTCATCAAAAGTGGAGCTGCTTATATACAACTATAATTAGTC
CACTTACAAAAAAGAAGAAAAAGGGTGGTGGTCTGGCACAGTGGCTTACGCTTGCGATCCTGGCATTTTG
GGAGGCCGAGTAGGGAAGATCGCTTAAGGCTAGGAGTTCGAGACCGGCAACATAGAAAAACTCCCCCCCC
CACCCCCCAAAAAAGGTTGGGCTGCCAATACTGACAGCGTGGGCACGCCTAGGAGCTTGTTAGAAATGCA
GATTCTCGGGCTAACCTGCTACCTGCTGAACCAGAGTCTGCGAAGATGGAACCTGGCGATCTGCTTAAGA
AGCTCGCCAGGCGGTTCTTAGACACTCAAGCTTGCAACCCGTAACTTTCTCAGTGACGCTGCCCCTCCCA
CGGAAAGGGGTGAATAATCCTTAGGAAGACAAGCAAACAGGTCTGCATCATCAATTTCTTCAGGCTGGAA
AACCTGACGCAGGCGCAGTGACTATCACGCTTGGCCAAGGCCGCACGGCGCGCATGCGCACTAGAGGCCG
CCCGCCGTCCCGCCCCCTTCAGGCTTTTGCCCCTTCTCGGCCTCCGCCACCGCTCCCCGCCCCGCGCATG
AGCAGCGGCGGTTTTTTTTCCCATGGCGCTCTGGGGCGCGGGCGATTTGTAGGTAATGGCAGGCGTTCGG
TCACTGAGGTGTAGCAGAGGATGCGCTGGCGGCTGTGAGTGCGGCGACAAG
MIS18A 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
MIS18A_1 ↗21:32,279,026負股32,279,016–32,279,075

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR21_59KZQZ · CTCF_binding_site · 32278810–32278831 · regulatory

ENSR21_59KZRB · CTCF_binding_site · 32278878–32278899 · regulatory

ENSR21_59KZRH · CTCF_binding_site · 32278921–32278942 · regulatory

ENSR21_8XLT3 · promoter · 32279039–32279217 · regulatory

ENSR21_59KZSD · CTCF_binding_site · 32279113–32279134 · regulatory

ENSR21_B8DZ4 · enhancer · 32279218–32280094 · regulatory

· motif · 32278611–32278624 · motif

· motif · 32278648–32278661 · motif

· motif · 32278812–32278828 · motif

· motif · 32278880–32278896 · motif

· motif · 32278923–32278939 · motif

· motif · 32278988–32279005 · motif

· motif · 32279066–32279077 · motif

· motif · 32279066–32279077 · motif

· motif · 32279115–32279131 · motif

· motif · 32279150–32279161 · motif

· motif · 32279150–32279161 · motif

· motif · 32279193–32279204 · motif

· motif · 32279193–32279204 · motif

· motif · 32279274–32279287 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:233 aa

1 aa233 aa結構域
依 Q9NYP9 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

MIS18A 長 233 個胺基酸,屬於 MIS18 家族。其第 80 至 178 個胺基酸區段註解為 Mis18 結構域。

結構域Mis1880–178 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 7SFZ…

PDB · 7SFZ

X-ray · 3.00 A · A/B/C/D/E/F/G/H=77-190

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Nucleus;Chromosome;Chromosome, centromere

MIS18A 與染色質相關,並在細胞間期的著絲點出現;其著絲點關聯自後期晚期延續至 G1 期。 在有絲分裂較早階段,未檢測到 MIS18A 位於著絲點。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

未繪示構造:Chromosome;Chromosome, centromere。這些構造未在通用細胞圖中標點,仍保留來源定位名稱。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 31 個夥伴 · 最多顯示 50 個
B28MIS18AABI3AIMP2AMOTATG14BRD8C1orf216CNGA3DMAP1FNDC11GCSHGLYCTKIFT20KIF1BKLF11MBIPNDEL1NTAQ1NUP58OIP5PPP1R13BPRPS1RTP5STX11TEDC2THAP1TSGA10IPTXLNAVMA22WFS1ZNF655B4DJ69
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 31 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

MIS18A 可形成同源二聚體,也可與 OIP5/MIS18B 形成異源二聚體。另有研究在包含 MIS18A、OIP5/MIS18B、MIS18BP1、RBBP7 與 RBBP4 的複合體中鑑定到 MIS18A;這項複合體觀察與二聚體關係為不同層次的互作描述。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能MIS18A 是 CENPA 招募至著絲點所必需的蛋白質,並與有絲分裂期間的正常染色體分離相關。含實驗來源
證據與來源

Required for recruitment of CENPA to centromeres and normal chromosome segregation during mitosis

PMID 17199038 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用MIS18A 可形成同源二聚體,也能與 OIP5/MIS18B 形成異源二聚體。此外,研究在含有 MIS18A、OIP5/MIS18B、MIS18BP1、RBBP7 與 RBBP4 的複合體中鑑定到 MIS18A。含實驗來源
證據與來源

Homodimer, and heterodimer with OIP5/MIS18B. Identified in a complex containing MIS18A, OIP5/MIS18B, MIS18BP1, RBBP7 and RBBP4

PMID 17199038 ↗ · PMID 26921242 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位MIS18A 與染色質相關,並在細胞間期及有絲分裂後期晚期至 G1 期與著絲點相關;在有絲分裂較早階段,未檢測到其位於著絲點。含實驗來源
證據與來源

Nucleus; Chromosome; Chromosome, centromere; Associated with centromeres in interphase cells, from late anaphase to the G1 phase. Not detected on centromeres during earlier phases of mitosis. Associated with chromatin

PMID 17199038 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000290130 · 1,546 nt · GRCh38
完整拼接轉錄本,保留來源註解的 5′ UTR、CDS 和 3′ UTR。
1CCATGGCGCTCTGGGGCGCGGGCGATTTGTAGGTAATGGC40
41AGGCGTTCGGTCACTGAGGTGTAGCAGAGGATGCGCTGGC80
81GGCTGTGAGTGCGGCGACAAGGGCAAATGCAGCGACTCCT120
121CGCTGTTGGGCAAGAGACTCTCCGAAGACTCGAGCCGCCA160
161CCAGCTGTTGCAGAAGTGGGCGAGCATGTGGAGCTCCATG200
201AGCGAAGACGCGTCGGTGGCCGACATGGAGAGGGCGCAGC240
241TGGAGGAGGAGGCGGCGGCTGCGGAGGAGAGGCCGCTGGT280
281GTTCCTGTGCTCCGGCTGCCGGCGGCCGCTGGGCGACTCG320
321CTGAGCTGGGTGGCCAGCCAGGAGGACACCAACTGCATCC360
361TGCTTCGCTGTGTTTCCTGTAATGTTTCTGTGGATAAGGA400
401ACAGAAGCTATCCAAACGTGAAAAGGAAAATGGTTGCGTC440
441CTTGAGACTTTGTGCTGCGCGGGGTGCTCACTCAATCTTG480
481GCTACGTGTACAGATGCACGCCCAAGAATCTTGATTACAA520
521GAGAGACTTGTTTTGCCTCAGTGTTGAAGCCATTGAAAGT560
561TATGTTTTAGGGTCCTCTGAAAAGCAAATTGTGTCAGAAG600
601ATAAAGAGCTTTTTAATCTTGAAAGCAGAGTTGAAATAGA640
641AAAGTCTCTAACACAGATGGAAGATGTCTTGAAAGCATTA680
681CAAATGAAGCTGTGGGAGGCCGAATCCAAATTGTCCTTTG720
721CCACTTGTAAAAGCTGAACTCTAGTCTGTGTCCTCCATTC760
761TGCCCCCGCCCTTCCTCCCCTTATTTGTTAAATGAAGCAA800
801CATAGTGAGACGTCGTCTCTACAAAAAAAAAAAGAAAAAA840
841AAAATTAGCCAGGCATGCGAAACGCTGAGGTGGGAGGATC880
881AGATGAGCTTGGGAGGTTGAGGCTGCAGTGAGCCTTGGTC920
921ATGCCACTACTGTGTTCTAGTCTGGGCAACAGAGTGAGAC960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。