演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN NON-CODING RNA GENE

MIR99AHGMONC

mir-99a-let-7c cluster host gene

MIR99AHG 是非編碼 RNA,預測可能參與 miRNA 介導的轉錄後基因沉默,並可能是 RISC 複合體的一部分。

Homo sapiens21q21.1
OFFICIAL SYMBOL
MIR99AHG
CHROMOSOME
21
RNA TYPE
lncRNA
TRANSCRIPTS
317
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

MIR99AHG 的正式名稱為 mir-99a-let-7c cluster host gene,屬於非編碼 RNA。現有資料未提供其 RNA 結構或家族特徵;功能註釋則將其與 miRNA 介導的轉錄後基因沉默及 RISC 複合體相連,但兩項描述均為預測。

Official symbol
MIR99AHG
Gene name
mir-99a-let-7c cluster host gene
Organism
Homo sapiens
Gene type
Non-coding RNA
HGNC ID
HGNC:1274
RNA type
RNA, long non-coding
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
MONCDILA1C21orf35FLJ38295C21orf34LINC00478

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 2121q21.1
chr21 · 46,709,983 bp · GRCh38chr21p13 · 1–3100000 · gvarchr21p12 · 3100001–7000000 · stalkchr21p11.2 · 7000001–10900000 · gvarchr21p11.1 · 10900001–12000000 · acenchr21q11.1 · 12000001–13000000 · acenchr21q11.2 · 13000001–15000000 · gnegchr21q21.1 · 15000001–22600000 · gpos100chr21q21.2 · 22600001–25500000 · gnegchr21q21.3 · 25500001–30200000 · gpos75chr21q22.11 · 30200001–34400000 · gnegchr21q22.12 · 34400001–36400000 · gpos50chr21q22.13 · 36400001–38300000 · gnegchr21q22.2 · 38300001–41200000 · gpos50chr21q22.3 · 41200001–46709983 · gnegMIR99AHGpq1 bp46,709,983 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr21:15,928,296–16,646,364
Gene span
718,069 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000653129 ★15,928,429–16,622,35011
ENST0000063584515,928,296–16,488,3366
ENST0000070138915,928,382–16,071,7102
ENST0000069800015,928,383–16,522,33414
ENST0000070144715,928,383–15,972,8205
ENST0000070101915,928,386–15,972,8253
ENST0000073142715,928,414–16,071,7134
ENST0000073142815,928,425–16,071,7113
ENST0000065870815,928,449–16,488,3367
ENST0000069781715,928,451–16,488,3368
ENST0000068631215,928,456–16,071,7103
ENST0000073143515,928,465–15,972,8184

顯示 12/317 個RNA轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

MIR99AHG 預測可能參與 miRNA 介導的轉錄後基因沉默。這項註釋指出其可能與 miRNA 相關的基因表現調控有關,但未提供其作用方式、調控對象或實驗條件,因此不能據此進一步確定具體分子機制。

此外,MIR99AHG 預測可能是 RISC 複合體的一部分。此項複合體關聯同樣屬於預測,現有資料未說明參與的條件、具體組成或對功能的影響;因此,對其在該複合體中的角色應維持此不確定性。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 15928429 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>MIR99AHG ENST00000653129 GRCh38 chr21:15927429-15928529 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CATATTGATGATAAGGAGTGGCTTTTCATTCCGGTAAATTCATTCTGCTTTGAATTATGTAATTTAACAT
GTATTCAAATTACTTCTATTTAAAAGTACACAAATTGATCTCATTTTCACTTGGCATTTTAATTTATCAA
TACCTGTGTGGATATTTCACAGTATTTTCAGTACAGGAAATTTCCTTCCAAACAGTAGAGATTAGATACA
TGTATTGTATAAGATGGTATATTTATATTGCCATAAATGGATACGTTAAAAATAATGTCTACTTCAAGAA
AGATTGTGGGACTTTATTTTGTTAAAGTAATATTTTGGATTTCCTACATTTTTATGTCATTATTTTGAAA
CAAATTTATATGCGTACCATTAATTATTATTGAATTTAAAACTGCTTGAAGATGTATATCATTCTGGGAT
CAATTAGGATACAAGACCCACATTGTAATTTTAACAGAGAAAGTTTAATATAAAAATTAATAACTATAAC
CTACCTACGTTACCAACCAAGTGAAAAAAGAACTCTAAACAATAGTGGAATTGTAGATATAGGAAACAGC
CATTACCTGTGGGCCTAAGGCAAGAGCATCAAAGGAAGAAACAAATCTGGAGTAAGTACCCTTCTCTGCC
ATTTGAGAGGCTGGGGTCACGGCCATGGCCCATTGATTAGTGGAAAAGTTCTCTGAGGAATATTGCCAGC
AGAAATTGCTAAGAAGTTGTCTTCTGGGATGCTTGGGAAACTATCCACAGGGGCAGTTGCTTCATGGAAT
TTGCTAGTAAGCTGCTTGAAGGGAGGCTGCCCTCTGAAATGCCAGGGGAAGCTGCCCATGCAAAGGTGCC
ATGCAGCAGAGCTCACTGGAGGGTGGCCCTACTGCATTTTCCGTGCCCTGCTATATGCTGTGTACCACAG
GAGCAAGCAGAGAAAAACACTGGAAACAAGCCCTGTTTTCCTTCAGTGTTTCCTAGAGCCATCTGCTGAC
AACACGAACATTGGGCATCTGACAGAGGAGAAATATTTATAAGGTTTAGCTCCAGTATCACAGGCAGAGC
AATGGAGGATGGATTTGGAGCTGCAAGGCAATAAACTGGTAACTGAACAAA
MIR99AHG 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 3 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
MIR99AHG_1 ↗21:16,194,540正股16,194,491–16,194,550
MIR99AHG_2 ↗21:16,419,563正股16,419,514–16,419,573
MIR99AHG_3 ↗21:16,588,704正股16,588,655–16,588,714

EPDnewNC human v001 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR21_55Q6FS · CTCF_binding_site · 15929736–15929757 · regulatory

· motif · 15929738–15929754 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / RNA TRANSCRIPTS

RNA 轉錄本與序列

Non-coding RNA

MIR99AHG 依 HGNC/Ensembl 分類為 Non-coding RNA。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。

轉錄本Biotype拼接長度Exons
ENST00000653129 ★lncRNA2,116 nt11
ENST00000635845lncRNA1,595 nt6
ENST00000701389lncRNA745 nt2
ENST00000698000lncRNA1,612 nt14
ENST00000701447lncRNA1,088 nt5
ENST00000701019lncRNA735 nt3
ENST00000731427lncRNA994 nt4
ENST00000731428lncRNA761 nt3
ENST00000658708lncRNA1,647 nt7
ENST00000697817lncRNA1,721 nt8
ENST00000686312lncRNA876 nt3
ENST00000731435lncRNA777 nt4

拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

RNA 細胞內定位

動物細胞結構與RNA定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

1 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 1 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能MIR99AHG 預測可能參與 miRNA 介導的轉錄後基因沉默,也預測可能是 RISC 複合體的一部分;這兩項功能與複合體關聯均為預測。推論支持
證據與來源

Predicted to be involved in miRNA-mediated post-transcriptional gene silencing. Predicted to be part of RISC complex.

開啟資料庫紀錄 ↗

· CC BY 4.0
情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 1 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

DNA 與 RNA 序列

完整非編碼轉錄本 · FASTA
ENST00000653129 · 2,116 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GACAGAGGAGAAATATTTATAAGGTTTAGCTCCAGTATCA40
41CAGGCAGAGCAATGGAGGATGGATTTGGAGCTGCAAGGCA80
81ATAAACTGGTAACTGAACAAACATGCAACCTCAAAGAGAA120
121AAGTTTGAGGAAATCACTTCAAGGACAAAAAATTGCAATG160
161TAAAGAGAATTATTTATCTCCAAATTCCAGATTACCCCCC200
201TGCCCAACCCCTGCCAGCAGCACCGTCCACATGGTTTCTC240
241ATTTAGTTTTGTGTTAGTTTAACAAAGTAGACTCTGCAAT280
281CTGGATAAAATAGTAAGTCACCTCAGATGGATCTGAGAAC320
321GCTGTCTGGGCTTGGTACCAAGAGCTGGTATTTCACAGCA360
361GCGACCGCCTCACAGACGAGCTGTGGGAAGCAGGAGGGAG400
401ACTCTCTCTTAGGGTGCCACTACTATGGAGACACAGCTGG440
441GCTGAACAAGATTTGCTTCAAACGACAACAAGAGAGACAG480
481AAAGTATCTGGTTCAACCGCTGCCCGAGCAGGCAGGCACC520
521AGAAGAGCTAGCAGCCAATCCGGCCATGCTCGAAGCCAGC560
561TCTGCAGCTCAGCCAATCAGTGACATCATTGCTTTCTTTA600
601GCTTGCCCATGGTGATGTGAAGATGAGAAGAAATAGCAAG640
641GCCCAACCAGTTCTTCATCTGGAGACAGTTCAACGTTCTG680
681CAAACCAGATCTTCAGGAATTTTACTGGGATAATTATCCA720
721AATAAATTGCAAGCATTCTATCCAAATGGAGCTCTTTCTG760
761AGATGAAGAGAATTCTCAATGTCAAGATTTGAACAAGAAG800
801AGAATGGAATACACAATATGGACATCCATAAAAATTCATC840
841AGAGAGCATTTTACTACTGAGCTGCAAAGGGAAAAACTTA880
881AAATGGATATGAAAAGTGAAGAAAGTGATCATAGGAGAAA920
921ACCATTTCAGATGACAAGAGCACCTCAAAGGCAGCAGCCT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。