基因總覽
MIOX(myo-inositol oxygenase)是蛋白質編碼基因,其產物屬於 myo-inositol oxygenase 家族。這項家族資訊指出其蛋白質分類;現有資料未提供序列長度、結構域或其他結構特色,因此不作進一步描述。關於其具體催化反應與代謝角色,見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000216075 ★ | 50,486,859–50,490,648 | 10 |
| ENST00000395733 | 50,486,784–50,490,648 | 8 |
| ENST00000395732 | 50,486,784–50,490,648 | 10 |
| ENST00001134053 | 50,486,784–50,490,648 | 10 |
| ENST00000899223 | 50,486,859–50,490,648 | 10 |
| ENST00000451761 | 50,487,385–50,489,976 | 9 |
顯示 6/6 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
MIOX 的產物參與多元醇代謝,負責 myo-inositol 的分解;資料將這段代謝路徑標示為由 myo-inositol 形成 D-glucuronate 的單一步驟。這說明其功能與 myo-inositol 的代謝去向相連,產物為 D-glucuronate。
反應式顯示,myo-inositol 與 O2 反應後生成 D-glucuronate,同時產生 H2O 與 H⁺。因此,該反應包含氧氣作為反應物,並明確列出生成物與伴隨產物;現有資料未提供更細緻的反應機制或反應條件,不宜據此延伸描述。
每個次單元可結合兩個鐵離子。此項註解提供了蛋白質與鐵離子的結合數量資訊,但未說明鐵離子的具體作用方式,也未提供其與反應步驟間的詳細關係。整體而言,來源支持的功能範圍集中於 myo-inositol 經單一步驟轉化為 D-glucuronate,以及每個次單元結合兩個鐵離子。
Promoter 與基因調控
>MIOX ENST00000216075 GRCh38 chr22:50485859-50486959 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TGCCCTCTCTCCTGCCCCAGCCGACTGCTGTTCCCAGACTTCCCTGGCCACGCTCCAAGACGCCAGCTCT GCCGCGGGCACTTTGTTCTCACGGTGTCCTCCATGCCTGCAGGGCCCATGCATGGGAAGTTGCGTTGGCG GCCTGGGTGTTGGCGGTTCCGTGCCTGCTCCAACTCTCCGTGAGGCCCCTCTCCCAGAGCCTGACACACT CTGTGGCCGAACTCTAGGCAGGTGCCCCTGAGTCCTTTCCTCGACGAGGCCTGACCCCATCCCCATCCTC GCTGGGCCCGCCGACCCCGGTGTTAGCAAGAATCCTCTAAATCAGTTTATGGAGAATTACCCACCCTCGA TATCTGATCCCATTCCTCATCTCCCACCCTTGATCTCATCACCCTGCCGGCCTCCTGCAAGATCCTCATT GAGCCACTCCAGTGAGAATCCCCCTACCCTCGAAGGCCGCCCTAACAACTTCCCATCCGCTGACCCCTCC AACGCCATCAATCTCCAGCTGTGGTTGTTGAACTCGGAGGTGAGCTCCTCTCACCACTCTCTTGAATAAA GCTTTTCTCACCATTTTAACAAGTCCTCAGAATCATCTTTTCTTAACAAGCTCCTGCCCCACCCAGAATC ACGGGGGGCCTGGGGACAAGTTTTCACCTCCTGAGATCCAGTGGGGCAGCCGGGGAAGGGGTGGTGCAGA GGGGGCGTGTGCTTGAGGGTGGGGTCTTGGGTCTGCCCCTACTTGTGGGACCCCACAGAGGGGTCTAAGG CCAGGGCCCAAGTGGGAGGCTGGGCCCACAGATAACCCTAGGCAGGTCAGCGGCTCGGGACAGGAGTGTG AGGCTGAGTCAGGGCCAGAGGATGTGGGACTGCTGGGGGCTGCTGCTGTGCTGACACATTAACTCCCTGA GGCCGGGAGGAGGGTGGATGGTCATTTATTACTGCGGACACTTATGTAACCTGGGGTGTATATAGGAGCC TGGCTGAGGACACACTCGCCAGCCTGTGCTTTGCCACCTGAGCGCCGCTCCCTCTCAGGATGAAGGTGAC GGTGGTGAGTACCCAGACCCCATGCAGAGAGGCTCTGCTGACTGCTCTCCT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MIOX_1 ↗ | 22:50,486,859 | 正股 | 50,486,810–50,486,869 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:285 aa
MIOX 蛋白質屬於 myo-inositol oxygenase 家族。現有資料未提供其結構域、功能區域或序列註解,因此無法進一步描述蛋白質的結構組成。
蛋白質三維結構
細胞內定位
MIOX 的定位資料指出其位於細胞質。 來源未提供定位改變的條件、異構型差異或動態變化資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 分子活性 | myo-inositol + O2 = D-glucuronate + H2O + H(+) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | 每個次單元可結合兩個鐵離子;此註解提供了結合數量,但未說明鐵離子的作用方式或其與催化反應的詳細關係。 | 資料庫紀錄 | |
| 分子活性 | MIOX 參與多元醇代謝,將 myo-inositol 分解並形成 D-glucuronate;此轉化在資料中列為由 myo-inositol 生成 D-glucuronate 的單一步驟。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Polyol metabolism; myo-inositol degradation into D-glucuronate; D-glucuronate from myo-inositol: step 1/1 |
| 細胞定位 | MIOX 的細胞內定位資料標示為細胞質;來源未提供定位變化、條件或異構型差異。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
AGCCTGTGCTTTGCCACCTGAGCGCCGCTCCCTCTCAGGA40TGAAGGTGACGGTGGGCCCAGACCCTTCCCTGGTCTACCG80ACCTGATGTGGACCCAGAGGTGGCCAAAGACAAGGCCAGC120TTCCGGAACTACACGTCAGGTCCCCTCCTGGACCGTGTCT160TCACCACCTACAAGCTCATGCACACGCACCAGACAGTGGA200CTTCGTCAGGAGCAAGCATGCCCAGTTTGGGGGCTTCTCC240TACAAGAAAATGACAGTCATGGAGGCCGTGGACCTGCTGG280ATGGGCTGGTGGATGAGTCGGACCCGGACGTAGATTTCCC320CAACTCCTTCCATGCCTTCCAGACAGCGGAGGGCATCCGG360AAGGCCCACCCAGACAAGGACTGGTTCCACCTCGTCGGGC400TCCTGCACGACCTGGGGAAGGTCCTGGCCCTGTTCGGGGA440GCCCCAGTGGGCTGTCGTCGGCGACACCTTCCCCGTCGGA480TGCCGTCCGCAGGCCTCCGTGGTTTTCTGCGACTCCACCT520TCCAGGACAACCCTGACCTCCAGGATCCTCGATACAGCAC560AGAGCTCGGGATGTATCAGCCCCACTGTGGGCTCGACAGG600GTCCTCATGTCCTGGGGCCATGATGAGTACATGTACCAGG640TGATGAAGTTTAACAAGTTCTCACTGCCCCCTGAGGCTTT680CTACATGATCCGGTTCCACTCCTTCTACCCCTGGCACACG720GGCCGCGACTACCAGCAGCTGTGCAGCCAGCAGGACCTGG760CCATGCTGCCCTGGGTGCGGGAGTTCAACAAGTTCGACCT800CTACACCAAGTGCCCGGACCTGCCGGACGTGGACAAGCTG840CGGCCCTACTACCAGGGGCTCATTGACAAGTACTGCCCTG880GCATCCTGAGCTGGTGACCCTCCTGCCACCCAAGCTGCTG920CTGGACCTAGGCCTGGCCCTCCGCCTGCCTGGAGAGGCCT960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。