基因總覽
METTL26 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 methyltransferase like 26。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 16p13.3。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000301686 ★ | 634,430–636,305 | 6 |
| ENST00000614890 | 634,412–636,378 | 5 |
| ENST00000338401 | 634,412–636,378 | 3 |
| ENST00000397666 | 634,412–636,378 | 5 |
| ENST00000397664 | 634,412–636,378 | 4 |
| ENST00000861830 | 634,412–636,378 | 6 |
| ENST00000861831 | 634,412–636,378 | 6 |
| ENST00000861832 | 634,412–636,378 | 6 |
| ENST00000861833 | 634,412–636,378 | 5 |
| ENST00000861834 | 634,412–636,378 | 6 |
| ENST00000861835 | 634,412–636,378 | 4 |
| ENST00000861836 | 634,412–636,378 | 6 |
顯示 12/31 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>METTL26 ENST00000301686 GRCh38 chr16:636205-637305 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GCCCTCTGCCGCCCCTGCCGCCCCTGCCGCCCCTGCCGCCCCTGCCGCAACCCCGCTCTGGCCCCGCCCC AACCCGCCAGTCCACACTCATGTCCCGCCCCCCAGCCCCGCCTCCCCTCTCGGACCCGCCCCGATATGGC CCCGCCCCTCCGGCAACCCCGCCCTAAACTCGGACCAACAGGGGGCCCCAGCCCAGCCCCGCCCTCTCCC CAGCCCCGCCCCGACAGGGCCTCGCCCCCATCGGCTCACGAAGGCCAACGGCTTCCACGGCTCAGGCCCG AATCGAGACTGTCCTCCAGCTCGCGTCCTTCACGCCCGCTCCTTCCCCTCCGGCACTGGGGGGCACCGCG AGACTCTTACCCTCGCGGTCCCGCCAGCTGGGTCCTCCTATGCAGTCGCCAGCTCCCTTGCGCTGAGCCC GGCGCCAGCGGCGGCGCACGCCCGGAGGACTTCCCGCGTCACAGTCTCTTGTCTCCGCGGGCAGCAACTG TCTTAGACAGCGCCGCTGGTGTAGTGGTATCATGCAAGATTCCCATTCTTGCGACCCGGGTTCGATTCCC GGGCGGCGCACTTAGTTTTTTTTCCCATTTGAACATCGAACTCTCGCTAACGCCAGAAATTTAAAAGTAG AGAAAACCCGAAACCAAGGGAAGGCGCCCAGTCTGGCGCAGCGCTGACACAAATTTCGGAGAGTGACACA GGTGCCCTGAAAACCCTGGACGGCCATGGGCGACAGGGTGCCTGAGCTGAGGCGCCTGTAAACCAGCAAG CCAAGCTCGCCGTTCAGTCCCCTGCCTGGGACCGCCACACACCGCTGAGCCGCTCCCCACCGTGCCTCTG GCGACTGCTGGTCCTTTAACAGGAGGCGCGCGTGCTCCTGGGAGTTGTAGTTTATCAGCTTCCGACGTGC CCCGCGGTATCTGGACTACAGCTCCCGACGTGCCCCGCGGAAGCCCGGCCACCGCCCCCGACGCGACCCG CGCCGCGTCCGCGGCGGGGAGTTGTTGCTGCCGCGATGCTGGTGGCGGCGGCCGCGGAGCGGAACAAGGA TCCCATCTTGCACGTGCTGCGGCAGTACCTGGATCCGGCCCAGCGTGGCGT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| C16orf13_1 ↗ | 16:636,302 | 負股 | 636,292–636,351 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR16_B5F4 · promoter · 636280–636856 · regulatory
ENSR16_5637W · CTCF_binding_site · 636957–636978 · regulatory
ENSR16_5639G · CTCF_binding_site · 637290–637311 · regulatory
ENSR16_C3P6 · enhancer · 637857–639036 · regulatory
ENSR16_B5FR · enhancer · 641092–641767 · regulatory
· motif · 631296–631308 · motif
· motif · 631299–631306 · motif
· motif · 635715–635724 · motif
· motif · 635919–635930 · motif
· motif · 635927–635944 · motif
· motif · 636089–636098 · motif
· motif · 636238–636247 · motif
· motif · 636238–636247 · motif
· motif · 636959–636975 · motif
· motif · 637292–637308 · motif
· motif · 637653–637662 · motif
· motif · 637653–637662 · motif
· motif · 640023–640038 · motif
蛋白質結構域與序列
蛋白質三維結構
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
核酸與蛋白質序列
GTTGTTGCTGCCGCGATGCTGGTGGCGGCGGCCGCGGAGC40GGAACAAGGATCCCATCTTGCACGTGCTGCGGCAGTACCT80GGATCCGGCCCAGCGTGGCGTCCGCGTCCTCGAGGTGGCC120TCGGGCTCCGGCCAGCACGCAGCGCACTTCGCGCGGGCCT160TCCCCCTGGCCGAGTGGCAGCCGTCGGACGTGGACCAGCG200CTGCCTGGACAGCATCGCGGCCACCACGCAAGCCCAGGGC240CTGACCAACGTGAAGGCCCCGCTACACCTGGACGTGACGT280GGGGCTGGGAGCACTGGGGCGGGATCCTGCCACAGTCGCT320GGACCTGTTGCTCTGCATCAACATGGCCCATGTCAGCCCC360CTGCGCTGCACGGAGGGGCTCTTCAGAGCAGCAGGACACC400TGCTCAAACCCAGGGCCCTGCTCATCACCTACGGGCCCTA440TGCCATCAATGGGAAGATCTCCCCCCAGAGCAACGTGGAC480TTTGACCTGATGCTCAGATGCAGGAACCCAGAATGGGGGC520TTCGGGACACAGCCCTCCTGGAGGACCTGGGAAAGGCCAG560TGGCCTGCTCCTGGAGAGGATGGTGGACATGCCAGCCAAC600AACAAATGCCTGATCTTCCGGAAAAACTAAGCCCCTCCTT640CACCCCCGCACACCTGCATCCCTGCCGGAGGCTCTGTGAG680GCACGAACCCTGCCTCCCTAGGCCGGACCTTGTGGACGAC720AGCCCCACCCAGTCTGTGCTCTCAGCCGCTGGCCGAAGGG760CCCAGCCTGCTCAGAATAAAGCATGTCCTGCTGCCGG797cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。