演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

METRNMGC2601

meteorin, glial cell differentiation regulator

METRN 編碼 Meteorin family 的分泌型蛋白,參與神經新生期間的膠細胞分化與軸突網絡形成;相關功能依序列相似性推定。

Homo sapiens16p13.3UniProt Q9UJH8
OFFICIAL SYMBOL
METRN
CHROMOSOME
16
UNIPROT
Q9UJH8
PDB / ALPHAFOLD
AlphaFold
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

METRN 的正式名稱為 meteorin, glial cell differentiation regulator,屬於蛋白質編碼基因,其產物 Meteorin 歸於 Meteorin family。來源所列蛋白質長度為 293 個胺基酸,序列包含位於第 1 至 23 位的訊號胜肽,並註記為分泌型蛋白。其名稱與家族分類指出它與膠細胞分化相關;更具體的生物學作用及證據限制見功能說明。

Official symbol
METRN
Gene name
meteorin, glial cell differentiation regulator
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14151
UniProt
Q9UJH8
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
MGC2601C16orf23

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1616p13.3
chr16 · 90,338,345 bp · GRCh38chr16p13.3 · 1–7800000 · gnegchr16p13.2 · 7800001–10400000 · gpos50chr16p13.13 · 10400001–12500000 · gnegchr16p13.12 · 12500001–14700000 · gpos50chr16p13.11 · 14700001–16700000 · gnegchr16p12.3 · 16700001–21200000 · gpos50chr16p12.2 · 21200001–24200000 · gnegchr16p12.1 · 24200001–28500000 · gpos50chr16p11.2 · 28500001–35300000 · gnegchr16p11.1 · 35300001–36800000 · acenchr16q11.1 · 36800001–38400000 · acenchr16q11.2 · 38400001–47000000 · gvarchr16q12.1 · 47000001–52600000 · gnegchr16q12.2 · 52600001–56000000 · gpos50chr16q13 · 56000001–57300000 · gnegchr16q21 · 57300001–66600000 · gpos100chr16q22.1 · 66600001–70800000 · gnegchr16q22.2 · 70800001–72800000 · gpos50chr16q22.3 · 72800001–74100000 · gnegchr16q23.1 · 74100001–79200000 · gpos75chr16q23.2 · 79200001–81600000 · gnegchr16q23.3 · 81600001–84100000 · gpos50chr16q24.1 · 84100001–87000000 · gnegchr16q24.2 · 87000001–88700000 · gpos25chr16q24.3 · 88700001–90338345 · gnegMETRNpq1 bp90,338,345 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr16:715,093–719,796
Gene span
4,704 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000568223 ★715,118–719,6554
ENST00000936477715,093–719,6554
ENST00000994593715,093–719,6554
ENST00000994594715,093–717,4783
ENST00001041427715,093–719,7942
ENST00001041430715,093–719,6555
ENST00001126684715,093–717,4783
ENST00001136945715,093–719,6554
ENST00000219542715,338–717,3903
ENST00000567076715,641–717,4774
ENST00000568415716,574–719,6553

顯示 11/11 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

METRN 產物 Meteorin 參與神經新生期間的膠細胞分化,也與軸突網絡形成有關。這些功能描述的證據標註為依序列相似性推定,因此應視為推定的功能關聯,而非此處已直接證實的作用。

在膠細胞分化方面,來源指出 Meteorin 可促進星狀膠細胞分化,並使小腦星狀膠細胞轉變為放射狀膠細胞。這些描述涵蓋星狀膠細胞分化及細胞類型轉變,但來源未提供相關實驗條件或分子作用機制,因而無法進一步說明其如何引發這些變化。

在感覺神經節中,Meteorin 也被描述為可藉由活化附近的衛星膠細胞,誘導小型及中型神經元的軸突延伸。此處的功能關係包含鄰近衛星膠細胞的活化與神經元軸突延伸,但來源沒有交代活化方式、作用分子或具體量測結果。

上述資料將膠細胞分化與軸突網絡形成並列為神經新生期間相關的功能面向,並提供小腦與感覺神經節中的具體描述。由於所有相關功能均以依序列相似性作為證據標註,對其生物學作用的解讀應保留此證據限制;來源不足以支持更廣泛的機制或功能推論。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 715118 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>METRN ENST00000568223 GRCh38 chr16:714118-715218 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
CCACCCATGCCCTGGGGTTTCACTGGGCTGCCAAGAGCTCCTTCCTCAGGCCCTTGACCCAGGCTGTCTG
CTCTCCCCCATTCTCTTCCTGTCCACCTGGCCAGCCACTGCCCACTTCCTCCCATCAGGCCAACTCAGCA
GTCCCGGATGCTGGGAATCCCACACTGCTCCAGCCTGAGGCTACAGTGTGTTTGCGAATCGCCTGTTTCT
GCTTGTTTCATCTTGGTGGGGGCTGCTCCTGTGGCCCAGGGGTGTCCTCCCAGCTCCTGTGTCTCCACGT
GCTGCAGGCCTGCAGGGGTGCCCGTGGCTGCTCCATTCACGCCCCTCCAGGAGCCCCGTCTGGCCCGGGG
TCGGTCATCCGGCAACTATGGGGTGCCGCTAGGTCTGAGGAAAGGGGCCTAAGCCTGCGGGCTGCGCGCT
CTTCAGCAGGACCCCCTCCTGCAGACGGCCTTACCAAAACCCGAGGCCTGGCCCCGCTCCAAGGCGCAGC
CCCCAGGCCAGGCCTTCCCCGCCTCTGGAGTCATGACCCCTCTCCTCTGGGGCTCCACCGGCCTCTGGTC
AGCAGGACCGGACCTGGTTGGGAGGGATGTGGCCAACAGGCCCAGGTCCCAGTGTTAGGAAGGAGCAGGC
CCGGCCGCCCGCGAGGCGGAACCACCAGGTGGGCCACCTTCCCTACCGCCACCCCGAGGTTCCAGTGGAC
ATCAAAACCTCGGCTCCATCAGAGGCTCCAGGACTCCGATCGGGACAGCGCGGGGGGCGAGGCCAGGGTG
AGGGCGCGGCGAAGGAGAGACGCACAGCGCGGGGCGGGCAAGGAGCCTCCCTTCCGCGCCAAGGCCCCCC
CCAACCCTCGAGGCGCTTGGACCGTGGGATAGTCCTCCGGCGGCGCCCGAGCTCCGGCCCCGCCCCCGCT
CCGCCCCGCGCCTGCTATTGGCGGAAAGTTCCGGGCCGCGCCGCGACTGGCCGACACGCCGCAGGCCCCG
CCCCCTTCCCGACCCGCTCCAAGGCGGCCCCGGCGCTGGGGCTGCGCGGCAGGCGGAGCGGCCGCGGGCT
TGGGGGCTTCGCCGGGGCCGGGCGGCCGGCGCCCCCGGCTGCTCCCGCCGC
METRN 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
METRN_1 ↗16:715,118正股715,069–715,128
METRN_2 ↗16:716,378正股716,329–716,388

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR16_B5RQ · enhancer · 709823–710601 · regulatory

ENSR16_735GQ · enhancer · 710797–710902 · regulatory

ENSR16_99LT · promoter · 711267–711767 · regulatory

ENSR16_56J3S · CTCF_binding_site · 711887–711908 · regulatory

ENSR16_B5S5 · enhancer · 712636–713179 · regulatory

ENSR16_56J95 · CTCF_binding_site · 713032–713053 · regulatory

ENSR16_99MS · promoter · 714628–715128 · regulatory

ENSR16_56JM5 · CTCF_binding_site · 715193–715214 · regulatory

ENSR16_99N9 · promoter · 716084–716584 · regulatory

ENSR16_56JWX · CTCF_binding_site · 716883–716904 · regulatory

ENSR16_B5SS · enhancer · 717322–718281 · regulatory

ENSR16_8KDT · enhancer · 718516–718693 · regulatory

ENSR16_B5T3 · enhancer · 718864–719481 · regulatory

ENSR16_56KG5 · CTCF_binding_site · 719946–719967 · regulatory

· motif · 711889–711905 · motif

· motif · 712781–712790 · motif

· motif · 713034–713050 · motif

· motif · 715195–715211 · motif

· motif · 715675–715687 · motif

· motif · 716326–716338 · motif

· motif · 716329–716344 · motif

· motif · 716330–716343 · motif

· motif · 716457–716469 · motif

· motif · 716492–716505 · motif

· motif · 716885–716901 · motif

· motif · 719948–719964 · motif

· motif · 720086–720101 · motif

· motif · 720093–720108 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:293 aa

1 aa293 aa訊號胜肽
依 Q9UJH8 的 UniProt 殘基座標與蛋白質長度繪製;結構域、DNA 結合區、功能區域與基序分列,重疊註解分行顯示。區域色彩區分類型,並非活性或信心分數。

Meteorin 長 293 個胺基酸,屬於 Meteorin family。蛋白質序列第 1 至 23 位註記為訊號胜肽;來源未提供其他結構域或功能區域的註解。

訊號胜肽1–23 aa
07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 AlphaFold · Q9UJH8…

AlphaFold · Q9UJH8

現有 AlphaFold DB 預測;低信心區域與多構形狀態需分別解讀

查看原始結構紀錄 ↗

預測模型;依 pLDDT 著色。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。細胞外定位以細胞周圍、與細胞膜保持距離的圓點表示。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:Secreted

Meteorin 被註記為分泌型蛋白。 來源未提供其他細胞內位置、定位改變條件或異構型差異。

深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。

細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 0 個夥伴 · 最多顯示 50 個
MGC2601METRN
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 0 個夥伴
  • 目前沒有已匯入的夥伴。
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

來源將 Meteorin 的亞基狀態標註為單體;未列出其實體結合夥伴或所屬複合體。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

3 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 3 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能METRN 產物參與神經新生期間的膠細胞分化與軸突網絡形成;可促進星狀膠細胞分化,使小腦星狀膠細胞轉變為放射狀膠細胞。此外,依序列相似性推定,它可藉由活化鄰近的衛星膠細胞,誘導感覺神經節中小型及中型神經元的軸突延伸。推論支持
證據與來源

Involved in both glial cell differentiation and axonal network formation during neurogenesis. Promotes astrocyte differentiation and transforms cerebellar astrocytes into radial glia. Also induces axonal extension in small and intermediate neurons of sensory ganglia by activating nearby satellite glia (By similarity)

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用Monomer推論支持
證據與來源

Monomer

開啟資料庫紀錄 ↗

細胞定位Secreted推論支持
證據與來源

Secreted

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 3 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000568223 · 3,322 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1AAGGCGGCCCCGGCGCTGGGGCTGCGCGGCAGGCGGAGCG40
41GCCGCGGGCTTGGGGGCTTCGCCGGGGCCGGGCGGCCGGC80
81GCCCCCGGCTGCTCCCGCCGCCGCCCGGACCCGCGCCCCG120
121CCGGGGCAGCGGTGGTGAGAGCCCCGACTCCCCGGACGCC160
161GCCCGCCGTGCCATGGGGTTCCCGGCCGCGGCGCTGCTCT200
201GCGCGCTGTGCTGCGGCCTCCTGGCCCCGGCTGCCCGCGC240
241CGGCTACTCCGAGGAGCGCTGCAGCTGGAGGGGCAGCGGC280
281CTCACCCAGGAGCCCGGCAGCGTGGGGCAGCTGGCCCTGG320
321CCTGTGCGGAGGGCGCGGTTGAGTGGCTGTACCCGGCTGG360
361GGCGCTGCGCCTGACCCTGGGCGGCCCCGATCCCAGAGCG400
401CGGCCCGGCATCGCCTGTCTGCGGCCGGTGCGGCCCTTCG440
441CGGGCGCCCAGGTCTTCGCGGAGCGCGCAGGGGGCGCCCT480
481GGAGCTGCTGCTGGCCGAGGGCCCGGGCCCGGCAGGGGGC520
521CGCTGCGTGCGCTGGGGTCCCCGCGAGCGCCGGGCCCTCT560
561TCCTGCAGGCCACGCCGCACCAGGACATCAGCCGCCGCGT600
601GGCCGCCTTCCGCTTTGAGCTGCGCGAGGACGGGCGCCCC640
641GAGCTGCCCCCGCAGGCCCACGGTCTCGGCGTAGACGGTG680
681CCTGCAGGCCCTGCAGCGACGCTGAGCTGCTCCTGGCCGC720
721ATGCACCAGCGACTTCGTAATTCACGGGATCATCCATGGG760
761GTCACCCATGACGTGGAGCTGCAGGAGTCTGTCATCACTG800
801TGGTGGCCGCCCGTGTCCTCCGCCAGACACCGCCGCTGTT840
841CCAGGCGGGGCGATCCGGGGACCAGGGGCTGACCTCCATT880
881CGTACCCCACTGCGCTGTGGCGTCCACCCGGGCCCAGGCA920
921CCTTCCTCTTCATGGGCTGGAGCCGCTTTGGGGAGGCCCG960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。