基因總覽
METRN 的正式名稱為 meteorin, glial cell differentiation regulator,屬於蛋白質編碼基因,其產物 Meteorin 歸於 Meteorin family。來源所列蛋白質長度為 293 個胺基酸,序列包含位於第 1 至 23 位的訊號胜肽,並註記為分泌型蛋白。其名稱與家族分類指出它與膠細胞分化相關;更具體的生物學作用及證據限制見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000568223 ★ | 715,118–719,655 | 4 |
| ENST00000936477 | 715,093–719,655 | 4 |
| ENST00000994593 | 715,093–719,655 | 4 |
| ENST00000994594 | 715,093–717,478 | 3 |
| ENST00001041427 | 715,093–719,794 | 2 |
| ENST00001041430 | 715,093–719,655 | 5 |
| ENST00001126684 | 715,093–717,478 | 3 |
| ENST00001136945 | 715,093–719,655 | 4 |
| ENST00000219542 | 715,338–717,390 | 3 |
| ENST00000567076 | 715,641–717,477 | 4 |
| ENST00000568415 | 716,574–719,655 | 3 |
顯示 11/11 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
METRN 產物 Meteorin 參與神經新生期間的膠細胞分化,也與軸突網絡形成有關。這些功能描述的證據標註為依序列相似性推定,因此應視為推定的功能關聯,而非此處已直接證實的作用。
在膠細胞分化方面,來源指出 Meteorin 可促進星狀膠細胞分化,並使小腦星狀膠細胞轉變為放射狀膠細胞。這些描述涵蓋星狀膠細胞分化及細胞類型轉變,但來源未提供相關實驗條件或分子作用機制,因而無法進一步說明其如何引發這些變化。
在感覺神經節中,Meteorin 也被描述為可藉由活化附近的衛星膠細胞,誘導小型及中型神經元的軸突延伸。此處的功能關係包含鄰近衛星膠細胞的活化與神經元軸突延伸,但來源沒有交代活化方式、作用分子或具體量測結果。
上述資料將膠細胞分化與軸突網絡形成並列為神經新生期間相關的功能面向,並提供小腦與感覺神經節中的具體描述。由於所有相關功能均以依序列相似性作為證據標註,對其生物學作用的解讀應保留此證據限制;來源不足以支持更廣泛的機制或功能推論。
Promoter 與基因調控
>METRN ENST00000568223 GRCh38 chr16:714118-715218 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CCACCCATGCCCTGGGGTTTCACTGGGCTGCCAAGAGCTCCTTCCTCAGGCCCTTGACCCAGGCTGTCTG CTCTCCCCCATTCTCTTCCTGTCCACCTGGCCAGCCACTGCCCACTTCCTCCCATCAGGCCAACTCAGCA GTCCCGGATGCTGGGAATCCCACACTGCTCCAGCCTGAGGCTACAGTGTGTTTGCGAATCGCCTGTTTCT GCTTGTTTCATCTTGGTGGGGGCTGCTCCTGTGGCCCAGGGGTGTCCTCCCAGCTCCTGTGTCTCCACGT GCTGCAGGCCTGCAGGGGTGCCCGTGGCTGCTCCATTCACGCCCCTCCAGGAGCCCCGTCTGGCCCGGGG TCGGTCATCCGGCAACTATGGGGTGCCGCTAGGTCTGAGGAAAGGGGCCTAAGCCTGCGGGCTGCGCGCT CTTCAGCAGGACCCCCTCCTGCAGACGGCCTTACCAAAACCCGAGGCCTGGCCCCGCTCCAAGGCGCAGC CCCCAGGCCAGGCCTTCCCCGCCTCTGGAGTCATGACCCCTCTCCTCTGGGGCTCCACCGGCCTCTGGTC AGCAGGACCGGACCTGGTTGGGAGGGATGTGGCCAACAGGCCCAGGTCCCAGTGTTAGGAAGGAGCAGGC CCGGCCGCCCGCGAGGCGGAACCACCAGGTGGGCCACCTTCCCTACCGCCACCCCGAGGTTCCAGTGGAC ATCAAAACCTCGGCTCCATCAGAGGCTCCAGGACTCCGATCGGGACAGCGCGGGGGGCGAGGCCAGGGTG AGGGCGCGGCGAAGGAGAGACGCACAGCGCGGGGCGGGCAAGGAGCCTCCCTTCCGCGCCAAGGCCCCCC CCAACCCTCGAGGCGCTTGGACCGTGGGATAGTCCTCCGGCGGCGCCCGAGCTCCGGCCCCGCCCCCGCT CCGCCCCGCGCCTGCTATTGGCGGAAAGTTCCGGGCCGCGCCGCGACTGGCCGACACGCCGCAGGCCCCG CCCCCTTCCCGACCCGCTCCAAGGCGGCCCCGGCGCTGGGGCTGCGCGGCAGGCGGAGCGGCCGCGGGCT TGGGGGCTTCGCCGGGGCCGGGCGGCCGGCGCCCCCGGCTGCTCCCGCCGC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| METRN_1 ↗ | 16:715,118 | 正股 | 715,069–715,128 |
| METRN_2 ↗ | 16:716,378 | 正股 | 716,329–716,388 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR16_B5RQ · enhancer · 709823–710601 · regulatory
ENSR16_735GQ · enhancer · 710797–710902 · regulatory
ENSR16_99LT · promoter · 711267–711767 · regulatory
ENSR16_56J3S · CTCF_binding_site · 711887–711908 · regulatory
ENSR16_B5S5 · enhancer · 712636–713179 · regulatory
ENSR16_56J95 · CTCF_binding_site · 713032–713053 · regulatory
ENSR16_99MS · promoter · 714628–715128 · regulatory
ENSR16_56JM5 · CTCF_binding_site · 715193–715214 · regulatory
ENSR16_99N9 · promoter · 716084–716584 · regulatory
ENSR16_56JWX · CTCF_binding_site · 716883–716904 · regulatory
ENSR16_B5SS · enhancer · 717322–718281 · regulatory
ENSR16_8KDT · enhancer · 718516–718693 · regulatory
ENSR16_B5T3 · enhancer · 718864–719481 · regulatory
ENSR16_56KG5 · CTCF_binding_site · 719946–719967 · regulatory
· motif · 711889–711905 · motif
· motif · 712781–712790 · motif
· motif · 713034–713050 · motif
· motif · 715195–715211 · motif
· motif · 715675–715687 · motif
· motif · 716326–716338 · motif
· motif · 716329–716344 · motif
· motif · 716330–716343 · motif
· motif · 716457–716469 · motif
· motif · 716492–716505 · motif
· motif · 716885–716901 · motif
· motif · 719948–719964 · motif
· motif · 720086–720101 · motif
· motif · 720093–720108 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:293 aa
Meteorin 長 293 個胺基酸,屬於 Meteorin family。蛋白質序列第 1 至 23 位註記為訊號胜肽;來源未提供其他結構域或功能區域的註解。
蛋白質三維結構
細胞內定位
Meteorin 被註記為分泌型蛋白。 來源未提供其他細胞內位置、定位改變條件或異構型差異。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
來源將 Meteorin 的亞基狀態標註為單體;未列出其實體結合夥伴或所屬複合體。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | METRN 產物參與神經新生期間的膠細胞分化與軸突網絡形成;可促進星狀膠細胞分化,使小腦星狀膠細胞轉變為放射狀膠細胞。此外,依序列相似性推定,它可藉由活化鄰近的衛星膠細胞,誘導感覺神經節中小型及中型神經元的軸突延伸。 | 推論支持 | 證據與來源Involved in both glial cell differentiation and axonal network formation during neurogenesis. Promotes astrocyte differentiation and transforms cerebellar astrocytes into radial glia. Also induces axonal extension in small and intermediate neurons of sensory ganglia by activating nearby satellite glia (By similarity) |
| 交互作用 | Monomer | 推論支持 | |
| 細胞定位 | Secreted | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
AAGGCGGCCCCGGCGCTGGGGCTGCGCGGCAGGCGGAGCG40GCCGCGGGCTTGGGGGCTTCGCCGGGGCCGGGCGGCCGGC80GCCCCCGGCTGCTCCCGCCGCCGCCCGGACCCGCGCCCCG120CCGGGGCAGCGGTGGTGAGAGCCCCGACTCCCCGGACGCC160GCCCGCCGTGCCATGGGGTTCCCGGCCGCGGCGCTGCTCT200GCGCGCTGTGCTGCGGCCTCCTGGCCCCGGCTGCCCGCGC240CGGCTACTCCGAGGAGCGCTGCAGCTGGAGGGGCAGCGGC280CTCACCCAGGAGCCCGGCAGCGTGGGGCAGCTGGCCCTGG320CCTGTGCGGAGGGCGCGGTTGAGTGGCTGTACCCGGCTGG360GGCGCTGCGCCTGACCCTGGGCGGCCCCGATCCCAGAGCG400CGGCCCGGCATCGCCTGTCTGCGGCCGGTGCGGCCCTTCG440CGGGCGCCCAGGTCTTCGCGGAGCGCGCAGGGGGCGCCCT480GGAGCTGCTGCTGGCCGAGGGCCCGGGCCCGGCAGGGGGC520CGCTGCGTGCGCTGGGGTCCCCGCGAGCGCCGGGCCCTCT560TCCTGCAGGCCACGCCGCACCAGGACATCAGCCGCCGCGT600GGCCGCCTTCCGCTTTGAGCTGCGCGAGGACGGGCGCCCC640GAGCTGCCCCCGCAGGCCCACGGTCTCGGCGTAGACGGTG680CCTGCAGGCCCTGCAGCGACGCTGAGCTGCTCCTGGCCGC720ATGCACCAGCGACTTCGTAATTCACGGGATCATCCATGGG760GTCACCCATGACGTGGAGCTGCAGGAGTCTGTCATCACTG800TGGTGGCCGCCCGTGTCCTCCGCCAGACACCGCCGCTGTT840CCAGGCGGGGCGATCCGGGGACCAGGGGCTGACCTCCATT880CGTACCCCACTGCGCTGTGGCGTCCACCCGGGCCCAGGCA920CCTTCCTCTTCATGGGCTGGAGCCGCTTTGGGGAGGCCCG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。