基因總覽
MESD（mesoderm development LRP chaperone）是蛋白質編碼基因，產物屬於 MESD 家族，具有分子伴護蛋白的性質。其胺基端包含訊號序列，蛋白質特徵註解另標示 Chaperone domain 與 Escort domain；序列中也有無序區域，以及一段與避免自內質網分泌相關的基序。這些特徵構成其作為受體伴護蛋白的基本背景。MESD 的主要角色是協助低密度脂蛋白受體家族（LDLRs）成員成熟，並參與若干受體到細胞表面的運送；相關功能涵蓋 LRP5、LRP6 與 LRP4。其胚胎發育與其他生物學作用則依各項功能證據分別描述。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000261758 ★ | 80,975,752–80,989,819 | 3 |
| ENST00001063215 | 80,946,292–80,989,848 | 2 |
| ENST00000561312 | 80,947,329–80,989,848 | 5 |
| ENST00001133329 | 80,975,752–80,989,848 | 3 |
| ENST00000866863 | 80,978,167–80,989,834 | 3 |
| ENST00000866864 | 80,978,205–80,989,848 | 3 |
| ENST00001090723 | 80,978,654–80,989,848 | 2 |
| ENST00000913247 | 80,978,660–80,989,848 | 3 |
顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
MESD 可協助低密度脂蛋白受體家族（LDLRs）中的 beta-propeller／EGF 模組摺疊，屬於針對受體結構模組的伴護作用。此功能與受體蛋白的成熟相關，使 MESD 不只是一般的細胞內蛋白，而能對特定受體的形成提供協助。
在典型 Wnt 路徑中，MESD 伴護共受體 LRP5 與 LRP6，協助它們運送至質膜，因此可調節 Wnt 路徑。這項作用連結了受體的伴護與細胞表面可用性；來源並未進一步說明 MESD 對路徑活性的具體方向或程度。
MESD 也被描述為胚胎極性指定與中胚層誘導所必需。另據相似性推論，它可藉由促進 LRP4 的細胞表面表現，對神經肌肉接合處（NMJ）的形成發揮必要作用；此項敘述保留 By similarity 的證據性質。來源亦指出，MESD 可能調節凋亡視網膜色素上皮（RPE）細胞的吞噬作用，但這是可能的功能，不能視為已確立的調控結果。
Promoter 與基因調控
>MESD ENST00000261758 GRCh38 chr15:80989719-80990819 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AAACTGTGCAGCAGTATAAAGAATGAAGCGTTTTTTGTTGTTGTTTTTGAGATGCGGGTCTTGCTTTATT GCCCAGTCTGGTCTCAAACTCCTAAACTCAAATTATCGTCCTACCTCAGCCTCCCAAAGTGCTGGGATTA TAAAGGCTTAAGCCACCGTGCGGCCTTTGGTTTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTAAGGTCTTATGTAATTAA ACATTTTAAAGACATCAGCTGATGAGCCGTTTAAAACAAGAAGAATCTCAAAGCATCTTTGGCCAAAATC TTTTTAAGAAACAAAAAGTAGCGTGATTCAGCCTTGAAAAGGATTAGTTAGAGCCTACAGTATTAGGTTG AAATCAAAGAAAGGCAAGCTTTTTTTTTTTTGGATGAATAGTAATGATCTTTTTGGAAAAAAAAAACAAA TATTGAAAGCTGGTTGAACTGAATCCTCTTTATTGATGAGGAAAGCAGTGGACTCGAACTATTTATGACT TTCTGAAAAAAGTTGCCCTACCTGCCACTCACTTCTTTTTAACTGGCTGTTCTCAAAGGAAATTGCAAGA GACTGAGGATAAACGTCCGACATCCAGAAATGGGCTTTTTTAGAGCCGAGGCAGCCTCCAGAACTTCCAG TTCCAATTTATTTCACAGGCGAGAAACTGAGGTCAACAGGGACGTTGGTTAGTGGTTCCTGGAGGCCCTG AAGGAACTTTTGGACCTGGCTTGTGCGTTCCAGAGAAAAAGGTCGGCCTCTGACGGAAAACGAAAAATGA GCACTCAGGGACCCACCCAGCCGGGACAGAGCGCCTCAGCCGGACCAAGAGGAGGAGCCAGTGGGGCGGG GCCAAAATGGCGGAGGGGCGGGGCTTCCAGAGGCGGGGGTTAGGAAATGGTACGGGGCGGGGCCCGGTAG GCTAGCGAGGGCCGGGAGGCGGGGCCTCGGAAAGGCGGACAGGAAGGCGTGTGCAAGGCGGGGTCCGGCC CGCGCAGGTCGGGTAAGCGCGTCTAGGGCGCTGCGCGGCGCAGCGAAAATGGCGGCTTCCAGGTGGGCGC GCAAGGCCGTGGTCCTGCTTTGTGCCTCTGACCTGCTGCTGCTGCTGCTAC
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MESDC2_1 ↗ | 15:80,989,815 | 負股 | 80,989,805–80,989,864 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR15_BL3XL · enhancer · 80984864–80985448 · regulatory
ENSR15_9375XC · promoter · 80988843–80989343 · regulatory
ENSR15_9375XL · promoter · 80989809–80990318 · regulatory
ENSR15_5P3C6N · CTCF_binding_site · 80989989–80990010 · regulatory
ENSR15_BL3ZH · enhancer · 80991021–80991846 · regulatory
ENSR15_5P3CGC · CTCF_binding_site · 80991640–80991661 · regulatory
· motif · 80988860–80988868 · motif
· motif · 80989036–80989053 · motif
· motif · 80989163–80989178 · motif
· motif · 80989170–80989178 · motif
· motif · 80989170–80989185 · motif
· motif · 80989320–80989337 · motif
· motif · 80989385–80989397 · motif
· motif · 80989387–80989402 · motif
· motif · 80989421–80989433 · motif
· motif · 80989423–80989430 · motif
· motif · 80989475–80989490 · motif
· motif · 80989483–80989490 · motif
· motif · 80989509–80989522 · motif
· motif · 80989514–80989526 · motif
· motif · 80989516–80989523 · motif
· motif · 80989516–80989529 · motif
· motif · 80989640–80989651 · motif
· motif · 80989773–80989782 · motif
· motif · 80989783–80989793 · motif
· motif · 80989885–80989895 · motif
· motif · 80989917–80989927 · motif
· motif · 80989941–80989951 · motif
· motif · 80989956–80989966 · motif
· motif · 80989965–80989975 · motif
· motif · 80989978–80989988 · motif
· motif · 80989991–80990007 · motif
· motif · 80990132–80990147 · motif
· motif · 80991642–80991658 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：234 aa
MESD 蛋白長 234 個胺基酸，屬於 MESD family。註解標示胺基端 1–33 為訊號序列，1–164 為 Chaperone domain，165–204 為 Escort domain；31–95 與 187–234 為無序區域。末端 231–234 的基序與避免自內質網分泌相關。
蛋白質三維結構
細胞內定位
MESD 定位於內質網；另有資料記載它可由凋亡細胞及脫落的光感受器外節釋出。 來源未提供這些定位或釋出情形的條件差異，也未描述異構型間的定位差別。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 65 個夥伴
- ABCG8Q9H221 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ABITRAMQ9NX38 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ACBD7Q8N6N7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ADALQ6DHV7-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- AKIRIN2Q53H80 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- AKNAD1Q5T1N1-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- AKT1P31749 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ARB2AQ8WUF8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ASH2LQ9UBL3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ATP6V1E2Q96A05 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BAG6P46379-2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- BORCS8Q96FH0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- C17orf75Q9HAS0 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CDR2LQ86X02 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CENATACQ86UT8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CENPHQ9H3R5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CHCHD1Q96BP2 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CLP1Q92989 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CNOT9Q92600-3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- COL10A1Q03692 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- COL1A2P08123 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- COX14Q96I36 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- COX5AP20674 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CUTCQ9NTM9 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CYP4F11Q9HBI6 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
MESD 以單體形式存在，並與 LRP5、LRP6 及 LRP4 互作。與 LRP5 或 LRP6 的互作可避免各自形成聚集體，並伴護 LRP6 到達質膜；與 LRP4 的互作則促進其糖基化及細胞表面表現，後者為相似性推論。
疾病與遺傳關聯
MESD 的變異與常染色體隱性遺傳的骨形成不全症 20（OI20）相關。此病為進行性變形型，表現可從骨量低、骨脆弱及輕微創傷後骨折，到骨骼變形、骨折反覆發生，嚴重者可有子宮內骨折或圍產期致死。部分患者另有牙本質形成不全、聽力損失或藍鞏膜；有些患者可能因呼吸衰竭死亡。來源將疾病描述為由影響 MESD 的基因變異所致。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | MESD 協助低密度脂蛋白受體家族（LDLRs）的 beta-propeller／EGF 模組摺疊，並伴護典型 Wnt 路徑共受體 LRP5、LRP6 到達質膜，因而調節 Wnt 路徑。它對胚胎極性指定與中胚層誘導不可或缺；依相似性推論，也藉促進 LRP4 細胞表面表現參與神經肌肉接合處形成。MESD 可能調節凋亡視網膜色素上皮細胞的吞噬作用。 | 含實驗來源 | 證據與來源Chaperone specifically assisting the folding of beta-propeller/EGF modules within the family of low-density lipoprotein receptors (LDLRs). Acts as a modulator of the Wnt pathway through chaperoning the coreceptors of the canonical Wnt pathway, LRP5 and LRP6, to the plasma membrane. Essential for specification of embryonic polarity and mesoderm induction. Plays an essential role in neuromuscular junction (NMJ) formation by promoting cell-surface expression of LRP4 (By similarity). May regulate phagocytosis of apoptotic retinal pigment epithelium (RPE) cells (By similarity) PMID 15014448 ↗ · PMID 17488095 ↗ · PMID 23572575 ↗ |
| 交互作用 | MESD 以單體形式存在，並與 LRP5、LRP6 及 LRP4 互作。與 LRP5 或 LRP6 的互作可防止該受體形成聚集體，並伴護 LRP6 到達質膜；來源對兩者均描述了這些作用。MESD 與 LRP4 的互作可促進 LRP4 糖基化及其細胞表面表現，此項描述依相似性推論。 | 含實驗來源 | 證據與來源Monomer. Interacts with LRP5; the interaction prevents LRP5 from forming aggregates and chaperones LRP6 to the plasma membrane. Interacts with LRP6; the interaction prevents LRP6 from forming aggregates and chaperones LRP6 to the plasma membrane. Interacts with LRP4; the interaction promotes glycosylation of LRP4 and its cell-surface expression (By similarity) PMID 17488095 ↗ |
| 細胞定位 | MESD 位於內質網；來源也記載 MESD 可由凋亡細胞及脫落的光感受器外節釋出。 | 含實驗來源 | 證據與來源Endoplasmic reticulum; Released from apoptotic cells and shed photoreceptor outer segments PMID 15014448 ↗ · PMID 17488095 ↗ |
| 疾病關聯 | 骨形成不全症 20（OI20）為常染色體隱性疾病，與影響 MESD 的基因變異有關，屬進行性變形型骨形成不全症。病情可由輕微至嚴重，特徵包括骨量低、骨脆弱、輕微創傷後骨折、骨骼變形及新舊骨折；嚴重者可發生子宮內骨折或圍產期死亡。部分患者有牙本質形成不全、聽力損失或藍鞏膜，也有患者可能死於呼吸衰竭。 | 含實驗來源 | 證據與來源Osteogenesis imperfecta 20 OI20 An autosomal recessive form of osteogenesis imperfecta, a disorder of bone formation characterized by low bone mass, bone fragility and susceptibility to fractures after minimal trauma. Disease severity ranges from very mild forms without fractures to intrauterine fractures and perinatal lethality. Extraskeletal manifestations, which affect a variable number of patients, are dentinogenesis imperfecta, hearing loss, and blue sclerae. OI20 is a progressive deforming form characterized by osteopenia, skeletal deformity, healed fractures, and newly-acquired fractures. Death due to respiratory failure can occur in some patients. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 618644 PMID 31564437 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GTCTAGGGCGCTGCGCGGCGCAGCGAAAATGGCGGCTTCC40AGGTGGGCGCGCAAGGCCGTGGTCCTGCTTTGTGCCTCTG80ACCTGCTGCTGCTGCTGCTACTGCTACCACCGCCTGGGTC120CTGCGCGGCCGAAGGCTCGCCCGGGACGCCCGACGAGTCT160ACCCCACCTCCCCGGAAGAAGAAGAAGGATATTCGCGATT200ACAATGATGCAGACATGGCGCGTCTTCTGGAGCAATGGGA240GAAAGATGATGACATTGAAGAAGGAGATCTTCCAGAGCAC280AAGAGACCTTCAGCACCTGTCGACTTCTCAAAGATAGACC320CAAGCAAGCCTGAAAGCATATTGAAAATGACGAAAAAAGG360GAAGACTCTCATGATGTTTGTCACTGTATCAGGAAGCCCT400ACTGAGAAGGAGACAGAGGAAATTACGAGCCTCTGGCAGG440GCAGCCTTTTCAATGCCAACTATGACGTCCAGAGGTTCAT480TGTGGGATCAGACCGTGCTATCTTCATGCTTCGCGATGGG520AGCTACGCCTGGGAGATCAAGGACTTTTTGGTCGGTCAAG560ACAGGTGTGCTGATGTAACTCTGGAGGGCCAGGTGTACCC600CGGCAAAGGAGGAGGAAGCAAAGAGAAAAATAAAACAAAG640CAAGACAAGGGCAAAAAAAAGAAGGAAGGAGATCTGAAAT680CTCGGTCTTCCAAGGAAGAAAATCGAGCTGGGAATAAAAG720AGAAGACCTGTGATGGGGCAGCAGTGACGCGCTGTGGGGG760GACAGGTGGACGTGGAGAGCTCTTTGCCCAGCTCCTGGGG800TGGGAGTGGTCTCAGGCAACTGCACACCGGATGACATTCT840AGTGTCTTCTAGAAAGGGTCTGCCACATGACCAGTTTGTG880GTCAAAGAATTACTGCTTAATAGGCTTCAAGTAAGAAGAC920AGATGTTTTCTAATTAATACTGGACACTGACAAATTCATG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。