基因總覽
MEPE 是由蛋白質編碼基因產生的分泌型糖蛋白,正式名稱為 matrix extracellular phosphoglycoprotein,屬於 PF07175/osteoregulin 家族。其蛋白質具有訊號序列,並含有多段預測為無序的區域;其中包括 Dentonin 區域與 C 端的 ASARM motif。這些序列特色構成其細胞外蛋白質特徵,ASARM motif 亦與 PHEX 的鋅依賴性互作相關。MEPE 的主要生物學角色與磷酸鹽平衡及骨、軟骨和牙齒等組織的礦化調節有關。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000361056 ★ | 87,832,969–87,846,792 | 4 |
| ENST00000424957 | 87,821,398–87,846,814 | 4 |
| ENST00000395102 | 87,832,917–87,846,814 | 5 |
| ENST00000515821 | 87,832,917–87,846,814 | 5 |
| ENST00000560249 | 87,832,917–87,846,814 | 6 |
| ENST00000511670 | 87,832,917–87,846,814 | 5 |
| ENST00001010282 | 87,832,917–87,846,814 | 6 |
| ENST00001139180 | 87,832,917–87,846,814 | 4 |
| ENST00000497649 | 87,832,950–87,846,814 | 6 |
顯示 9/9 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
MEPE 與磷酸鹽調節有關:它促進腎臟排出磷酸鹽,並抑制腸道對磷酸鹽的吸收。這些作用分別涉及腎臟排泄與腸道吸收,來源未進一步說明其調控機制,因此不宜據此推定更細部的分子路徑。
在骨骼相關組織中,MEPE 促進成骨細胞進行骨礦化,也促進軟骨細胞進行軟骨礦化。這表示其功能涉及不同細胞所形成組織的礦物質沉積;來源支持這些促進作用,但未提供作用方向以外的細胞內機制細節。
MEPE 也與顱顏複合體細胞外基質的礦化調節有關,涵蓋牙齒、骨與軟骨。這項作用依據相似性推定,證據屬於 By similarity,應視為推論而非直接證實的結論。另有研究指出,MEPE 可促進牙髓幹細胞增殖與分化,顯示其作用還涉及牙髓幹細胞的細胞行為。
綜合來源所述,MEPE 的功能涵蓋磷酸鹽的腎臟排泄與腸道吸收,以及骨、軟骨和顱顏組織的礦化,並與牙髓幹細胞增殖及分化相關。這些資料支持其參與磷酸鹽調節與多種組織形成相關過程,但不據此延伸為來源未提及的疾病或生理機制。
Promoter 與基因調控
>MEPE ENST00000361056 GRCh38 chr4:87831969-87833069 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter ACACAGTTCTGGAGGCTGGGAATTCCGCAATGAAGAGGCCAGCATGTTCATTGCCTGACGAGGGCTGTCT ATCTCTTCTTCCAATTTGGCACCTTGCTACTGCATCTCCAGAGGGGACAAATGCTGTGTCTTCACACTGC AGACAAGCAGAAGGGCAAAAAGGGACTAGCTAGTTTCTTCTTGCCCTTTTATAAGGTCATTAATCCCATT CATACTGGGGTCTGCCTTCATGACTTAATCACCTTCTAAAGAGCCCATCTCTCAATACTGTCACCTTGGG TTTAAGTTCTAACATGGGAATTTTGGAGGGACACGTACATTGAAACCATAACAAGGTCTTTACTCAAAAG TTGCCTTCTCATTGAGGCCTTCCCAGGACTTCCTATCTAAAATTTCAACCCAGTGTCCCCACCCCCAATG CTTGTTACTCCCCAACAATACTTTTTCTCCTTAGACTTAGTATATGTCACTATCTAATCTATTTAACTCA TTTATCTTGTTTATTATCTGTCTCCCTTATTGGATTCTAAGCTCCAGGAAGACAGGGATTTTTTTCTGTC TTGTTTTGTTCACTGCAGTTTCGCCAATGCCTGTCACACAGTAGGCACCTAAAACATTTTTGTTAAATGT TGCTGAATTTCACTTAGATAAAATTGACATCATAAACTTTCTACATAAAAGGATAGCAAAAATGTTTTCC ATTTCTAAACTTGTTAGGTATTCAGTCAGTCCTAATTAGCAGTTCTGAAATCAATTTTGATTATCTGACA ACATGATGTCCAAACTGAGGTATTTATATTTTCTGTTTATCCCACTTTCTGGAACATTTGATAGTAGCTT TCTACCACAAACACATTTTTAGATTAAAATTACTTCACCCCCTATGGTTATCTGTGGGCGCTTGTAACAA ATTGTTTGCTAGCGCTGAGTGAGCCAGTGCTGATTGGCCATTGGGAACTCTAACAAACTTTAAATTTCAG CAAAATGCCCAGAGACTTCTAATCCTGCAACAAGAAGCCAGGTATTCTGAAGGTGAAAGATACCAGGTAA TTTGGCTTTCATGTTCTTGACAGCAAATAGCTTTATATCATAGTTGTTTAC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MEPE_1 ↗ | 4:87,832,969 | 正股 | 87,832,920–87,832,979 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
· motif · 87835391–87835402 · motif
· motif · 87835803–87835814 · motif
· motif · 87835907–87835921 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:525 aa
MEPE 蛋白長 525 個胺基酸,N 端第 1–17 位為訊號序列。多段區域被註記為無序:第 24–95、187–216 及 237–525 位。第 242–264 位為 Dentonin 區域;第 247–249 位另註記為細胞附著位點。C 端第 507–525 位含 ASARM motif,與 PHEX 互作相關。
蛋白質三維結構
細胞內定位
MEPE 為分泌型蛋白,定位於細胞外空間及細胞外基質。 來源未提供定位隨條件改變或不同異構型間差異的資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
細胞外定位:圓點散佈於細胞周圍,與細胞膜保持距離。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 3 個夥伴
- NCK1P16333 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PHEXP78562 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- ZXDCQ2QGD7 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
MEPE 透過 ASARM motif 與 PHEX 互作,且此互作依賴鋅。來源描述的是兩者之間的互作,未指出其形成特定複合體,也未說明此互作所造成的功能結果。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | MEPE 促進腎臟排出磷酸鹽,並抑制腸道吸收磷酸鹽;它也促進成骨細胞介導的骨礦化及軟骨細胞介導的軟骨礦化。其與顱顏複合體細胞外基質(包括牙齒、骨與軟骨)的礦化調節有關,但此項依據相似性推定。此外,MEPE 促進牙髓幹細胞增殖與分化。 | 含實驗來源 | 證據與來源Promotes renal phosphate excretion and inhibits intestinal phosphate absorption. Promotes bone mineralization by osteoblasts and cartilage mineralization by chondrocytes. Regulates the mineralization of the extracellular matrix of the craniofacial complex, such as teeth, bone and cartilage (By similarity). Promotes dental pulp stem cell proliferation and differentiation PMID 14962809 ↗ · PMID 18162525 ↗ · PMID 19005008 ↗ · PMID 19998030 ↗ · PMID 22341070 ↗ · PMID 22766095 ↗ |
| 交互作用 | MEPE 透過 ASARM motif 與 PHEX 互作;此互作依賴鋅。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts (via the ASARM motif) with PHEX; the interaction is zinc-dependent PMID 15664000 ↗ · PMID 18162525 ↗ |
| 細胞定位 | MEPE 是分泌型蛋白,位於細胞外空間及細胞外基質。 | 含實驗來源 | 證據與來源Secreted, extracellular space, extracellular matrix; Secreted PMID 11414762 ↗ · PMID 15108058 ↗ · PMID 37453717 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AATCCTGCAACAAGAAGCCAGGTATTCTGAAGGTGAAAGA40TACCAGAGATTCTCAAAGATGCGAGTTTTCTGTGTGGGAC80TACTCCTTTTCAGTGTGACCTGGGCAGCACCAACATTTCA120ACCACAGACTGAGAAAACTAAGCAAAGCTGTGTGGAAGAG160CAGAGGCAGGAAGAAAAAAACAAAGACAATATTGGTTTTC200ACCATTTGGGCAAGAGAATAAATCAAGAGCTATCATCTAA240AGAAAATATTGTCCAGGAAAGAAAGAAAGATTTGTCCCTT280TCTGAAGCCAGTGAGAATAAGGGAAGTAGTAAATCTCAAA320ATTATTTCACAAATAGACAGAGACTGAATAAAGAATATAG360TATCAGTAACAAAGAGAATACTCACAATGGCCTGAGGATG400TCAATTTATCCTAAGTCAACTGGGAATAAAGGGTTTGAGG440ATGGAGATGATGCTATCAGCAAACTACATGACCAAGAAGA480ATATGGCGCAGCTCTCATCAGAAATAACATGCAACATATA520ATGGGGCCAGTGACTGCGATTAAACTCCTGGGGGAAGAAA560ACAAAGAGAACACACCTAGGAATGTTCTAAACATAATCCC600AGCAAGTATGAATTATGCTAAAGCACACTCGAAGGATAAA640AAGAAGCCTCAAAGAGATTCCCAAGCCCAGAAAAGTCCAG680TAAAAAGCAAAAGCACCCATCGTATTCAACACAACATTGA720CTACCTAAAACATCTCTCAAAAGTCAAAAAAATCCCCAGT760GATTTTGAAGGCAGCGGTTATACAGATCTTCAAGAGAGAG800GGGACAATGATATATCTCCTTTCAGTGGGGACGGCCAACC840TTTTAAGGACATTCCTGGTAAAGGAGAAGCTACTGGTCCT880GACCTAGAAGGCAAAGATATTCAAACAGGGTTTGCAGGCC920CAAGTGAAGCTGAGAGTACTCATCTTGACACAAAAAAGCC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。