基因總覽
MEMO1(mediator of cell motility 1)是蛋白質編碼基因,所屬蛋白質家族為 MEMO1 family。其產物與 ERBB2 訊號傳遞及細胞移動相關;現有資料未提供蛋白質的長度、結構域或其他結構特徵。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000404530 ★ | 31,867,823–32,011,008 | 10 |
| ENST00000295065 | 31,865,060–32,010,928 | 9 |
| ENST00000379383 | 31,865,060–31,963,298 | 9 |
| ENST00000426310 | 31,865,060–32,010,928 | 8 |
| ENST00000908848 | 31,865,060–32,010,928 | 7 |
| ENST00000908849 | 31,865,060–32,010,928 | 10 |
| ENST00000908850 | 31,865,060–32,011,029 | 9 |
| ENST00000908851 | 31,865,060–32,010,951 | 10 |
| ENST00000908852 | 31,865,060–32,010,928 | 6 |
| ENST00000908853 | 31,865,060–32,010,928 | 8 |
| ENST00000924200 | 31,865,060–32,011,029 | 11 |
| ENST00000924201 | 31,865,060–32,010,928 | 10 |
顯示 12/36 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
MEMO1 可能協助將細胞外趨化訊號傳遞至微管細胞骨架,進而調控細胞移動;它也是 ERBB2 訊號傳遞的媒介。資料指出,MEMO1-RHOA-DIAPH1 訊號路徑對 ERBB2 依賴的細胞皮質微管穩定具有重要作用。
在此路徑中,MEMO1 透過調節 GSK3B 活性,控制 APC 與 CLASP2 是否定位至細胞膜。膜上的 APC 接著使 MACF1 得以定位於細胞膜;這項定位是微管捕捉與穩定所必需的。這些環節將訊號傳遞與細胞膜附近的微管組織連結起來。
MEMO1 也被指出是乳癌細胞移動所必需。此敘述提供了細胞移動功能的條件性證據,但來源未進一步說明其適用的細胞背景或實驗操作,因此不宜延伸推論至其他細胞類型或情境。
Promoter 與基因調控
>MEMO1 ENST00000404530 GRCh38 chr2:32010908-32012008 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TCATGGCTCACTGTAGCCTCGACCTCCTGGGCTCAAGTGATCCTCCCGCCTCCGCCTACCAAGTAGCTAG GACCACAGGCGAAGCCACCACGCCCGGATAATTAAAAAATAAAAAATTCATAGAAACAGGGTCTCCTATG TTCCCCAGGCTGGTCTAGAACTCCTGGCCTCAGGCAGTCCTACTGCCTCAGGCCCCCAAAGTGCTGGGAT TATAGGCAGGAGGTACCATGCCCATGCAGTTACAAACATTTTATAGTGTTTGCCCCAAAACTTTCATTGG ATGTATGCAACTTTCTCTTCCTCTATTCCTACTTTTGCAATGGTGTACTTTGTAACAATAACACTTCCTC AGAGGTCCAAGATAGCCTCCTTTGCTGTGATTCTTATACAATTGTAAAAAAATTATTTGTTCCTGACATT TATGTGGAATACTGGGATTTATAAGATGACAAAGGTGAAAATAATATTTGTTGTAGGCTTACCCTGTCAG GCTGTTCACATTCAACAGCTCTTATAATCGTAGGTACACTCCTTGAGTGTCCCCATTTTACAGCTGAGGA TAACGAGGCTAGTTATATCAAACACCTTAGTTAGGGAGATATGACATACACCTACATAAATACAACATGA AACAAGATAAATGGTTACAGTGTCAAAGCCACCATTAGGTGGTAAGAGTGACCCTGTGAAGCAAAAACTA GTATTTGCATGACCACAGGCACACTTTACCACGCGCCTGCTTCTACAGATGAACTTCCCGGCGTGCCACC CTAGGAATGAGACCTTGGGGGTGCAAATCGATGAGAGATGCCTGTATATGATGGATACCCGCGGGACTGT CCTCGTGGAAAGCCGCATCCGCGAGCCCTAGGTGCTCTCCATTTGAGGAAGTTGGCTGGGGGAGGGGGCT TGCCTTGCGGCTGCGTCCTGCTCCCCGCGCCCTGCCCCCACCTCCCAGCCTCTGCTGCCGCTAAACCCCG GAGAGCGGAGCGTGCACGTTGAGATTCCTCGGCGGGTAGGCAGCGGTGCTGGGCATGCTCAGTGGGCAGG ACCCGTTAGAGTGGCGAGTAAGGAAGCGTTGGCTCTTCTCCGGGTCTGCCT
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 6 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MEMO1_6 ↗ | 2:31,868,265 | 負股 | 31,868,255–31,868,314 |
| MEMO1_5 ↗ | 2:31,891,990 | 負股 | 31,891,980–31,892,039 |
| MEMO1_1 ↗ | 2:32,010,285 | 負股 | 32,010,275–32,010,334 |
| MEMO1_3 ↗ | 2:32,010,465 | 負股 | 32,010,455–32,010,514 |
| MEMO1_4 ↗ | 2:32,010,643 | 負股 | 32,010,633–32,010,692 |
| MEMO1_2 ↗ | 2:32,010,968 | 負股 | 32,010,958–32,011,017 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR2_C56QH · enhancer · 32008532–32010364 · regulatory
ENSR2_59J9PX · CTCF_binding_site · 32010315–32010336 · regulatory
ENSR2_C56QL · promoter · 32010365–32011498 · regulatory
ENSR2_59J9S2 · CTCF_binding_site · 32010760–32010781 · regulatory
· motif · 32006151–32006166 · motif
· motif · 32006396–32006410 · motif
· motif · 32006690–32006705 · motif
· motif · 32007164–32007179 · motif
· motif · 32007165–32007179 · motif
· motif · 32007166–32007179 · motif
· motif · 32009530–32009552 · motif
· motif · 32009530–32009552 · motif
· motif · 32009734–32009749 · motif
· motif · 32010283–32010296 · motif
· motif · 32010289–32010302 · motif
· motif · 32010317–32010333 · motif
· motif · 32010468–32010483 · motif
· motif · 32010590–32010603 · motif
· motif · 32010647–32010660 · motif
· motif · 32010667–32010680 · motif
· motif · 32010749–32010762 · motif
· motif · 32010762–32010778 · motif
· motif · 32010791–32010808 · motif
· motif · 32010968–32010979 · motif
· motif · 32010968–32010979 · motif
· motif · 32011054–32011064 · motif
· motif · 32011060–32011070 · motif
· motif · 32011095–32011105 · motif
· motif · 32011101–32011111 · motif
· motif · 32011116–32011129 · motif
· motif · 32011171–32011184 · motif
· motif · 32011171–32011184 · motif
· motif · 32011266–32011277 · motif
· motif · 32011316–32011331 · motif
· motif · 32011701–32011714 · motif
· motif · 32013106–32013119 · motif
蛋白質結構域與序列
蛋白質三維結構
細胞內定位
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 19 個夥伴
- CAMTA2O94983-5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- CT55Q8WUE5 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- DDIT4LQ96D03 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- EMILIN3Q9NT22 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ERBB2P04626 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- GGA2Q9UJY4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- LNX1Q8TBB1 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- LZTS2Q9BRK4 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PROSER2Q86WR7 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- RBM45Q8IUH3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RELQ04864 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- RFX6Q8HWS3 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TACC1O75410 · UniProt INTERACTION · 4 experiments · 2 筆來源紀錄
- TCF4P15884 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- TRIM27P14373 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TRIP6Q15654 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- WDR54Q9H977 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- ZBTB22O15209 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- ZNF655Q8N720 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
MEMO1 與 ERBB2 存在實體互作;此互作對象是經 Tyr-1248 磷酸化的 ERBB2。來源未描述兩者形成的複合體或其他互作關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | MEMO1 可能將細胞外趨化訊號傳至微管細胞骨架,並介導 ERBB2 訊號。MEMO1-RHOA-DIAPH1 路徑參與 ERBB2 依賴的細胞皮質微管穩定;該路徑藉由調節 GSK3B 活性控制 APC 與 CLASP2 的細胞膜定位,膜上 APC 再促成 MACF1 定位,而此定位為微管捕捉及穩定所需。MEMO1 亦為乳癌細胞移動所必需。 | 含實驗來源 | 證據與來源May control cell migration by relaying extracellular chemotactic signals to the microtubule cytoskeleton. Mediator of ERBB2 signaling. The MEMO1-RHOA-DIAPH1 signaling pathway plays an important role in ERBB2-dependent stabilization of microtubules at the cell cortex. It controls the localization of APC and CLASP2 to the cell membrane, via the regulation of GSK3B activity. In turn, membrane-bound APC allows the localization of the MACF1 to the cell membrane, which is required for microtubule capture and stabilization. Is required for breast carcinoma cell migration PMID 15156151 ↗ · PMID 20937854 ↗ |
| 交互作用 | MEMO1 與 ERBB2 互作;所述 ERBB2 帶有 Tyr-1248 磷酸化。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GAGATTCCTCGGCGGGTAGGCAGCGGTGCTGGGCATGCTC40AGTGGGCAGGACCCGTTAGAGTGGCGAGCGGCACAGGCAC80CAAGATGTCCAACCGAGTGGTCTGCCGAGAAGCCAGTCAC120GCCGGGAGCTGGTACACAGCCTCAGGACCGCAGCTGAATG160CACAGCTAGAAGGTTGGCTTTCACAAGTACAGTCTACAAA200AAGACCTGCTAGAGCCATTATTGCCCCCCATGCAGGATAT240ACGTACTGTGGGTCTTGTGCTGCCCATGCTTATAAACAAG280TGGATCCGTCTATTACCCGGAGAATTTTCATCCTTGGGCC320TTCTCATCATGTGCCCCTCTCTCGATGTGCACTTTCCAGT360GTGGATATATATAGGACACCTCTGTATGACCTTCGTATTG400ACCAAAAGATTTACGGAGAACTGTGGAAGACAGGAATGTT440TGAACGCATGTCTCTGCAGACAGATGAAGATGAACACAGT480ATTGAAATGCATTTGCCTTATACAGCTAAAGCCATGGAAA520GCCATAAGGATGAGTTTACCATTATTCCTGTACTGGTTGG560AGCTCTGAGTGAGTCAAAAGAACAGGAATTCGGAAAACTC600TTCAGTAAATATCTAGCGGATCCTAGTAATCTCTTTGTGG640TTTCTTCTGATTTCTGCCATTGGGGTCAAAGGTTCCGTTA680CAGTTACTATGATGAATCCCAGGGGGAGATTTATAGATCC720ATTGAACATCTAGATAAAATGGGTATGAGTATTATAGAAC760AATTAGACCCTGTATCTTTTAGCAATTACTTGAAGAAATA800CCATAATACTATATGTGGAAGACATCCCATTGGGGTGTTA840TTAAATGCTATCACAGAGCTCCAGAAGAATGGAATGAATA880TGAGTTTTTCGTTTTTGAATTATGCCCAGTCGAGCCAGTG920TAGAAACTGGCAAGACAGTTCAGTGAGTTATGCAGCTGGA960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。