演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN PROTEIN-CODING GENE

MEMO1CGI-27

mediator of cell motility 1

MEMO1(mediator of cell motility 1)是蛋白質編碼基因,其產物參與 ERBB2 訊號與細胞移動調控。

Homo sapiens2p22.3UniProt Q9Y316
OFFICIAL SYMBOL
MEMO1
CHROMOSOME
2
UNIPROT
Q9Y316
PDB / ALPHAFOLD
7KQ8
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

MEMO1(mediator of cell motility 1)是蛋白質編碼基因,所屬蛋白質家族為 MEMO1 family。其產物與 ERBB2 訊號傳遞及細胞移動相關;現有資料未提供蛋白質的長度、結構域或其他結構特徵。

Official symbol
MEMO1
Gene name
mediator of cell motility 1
Organism
Homo sapiens
Gene type
Protein coding
HGNC ID
HGNC:14014
UniProt
Q9Y316
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
CGI-27MEMOC2orf4

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 22p22.3
chr2 · 242,193,529 bp · GRCh38chr2p25.3 · 1–4400000 · gnegchr2p25.2 · 4400001–6900000 · gpos50chr2p25.1 · 6900001–12000000 · gnegchr2p24.3 · 12000001–16500000 · gpos75chr2p24.2 · 16500001–19000000 · gnegchr2p24.1 · 19000001–23800000 · gpos75chr2p23.3 · 23800001–27700000 · gnegchr2p23.2 · 27700001–29800000 · gpos25chr2p23.1 · 29800001–31800000 · gnegchr2p22.3 · 31800001–36300000 · gpos75chr2p22.2 · 36300001–38300000 · gnegchr2p22.1 · 38300001–41500000 · gpos50chr2p21 · 41500001–47500000 · gnegchr2p16.3 · 47500001–52600000 · gpos100chr2p16.2 · 52600001–54700000 · gnegchr2p16.1 · 54700001–61000000 · gpos100chr2p15 · 61000001–63900000 · gnegchr2p14 · 63900001–68400000 · gpos50chr2p13.3 · 68400001–71300000 · gnegchr2p13.2 · 71300001–73300000 · gpos50chr2p13.1 · 73300001–74800000 · gnegchr2p12 · 74800001–83100000 · gpos100chr2p11.2 · 83100001–91800000 · gnegchr2p11.1 · 91800001–93900000 · acenchr2q11.1 · 93900001–96000000 · acenchr2q11.2 · 96000001–102100000 · gnegchr2q12.1 · 102100001–105300000 · gpos50chr2q12.2 · 105300001–106700000 · gnegchr2q12.3 · 106700001–108700000 · gpos25chr2q13 · 108700001–112200000 · gnegchr2q14.1 · 112200001–118100000 · gpos50chr2q14.2 · 118100001–121600000 · gnegchr2q14.3 · 121600001–129100000 · gpos50chr2q21.1 · 129100001–131700000 · gnegchr2q21.2 · 131700001–134300000 · gpos25chr2q21.3 · 134300001–136100000 · gnegchr2q22.1 · 136100001–141500000 · gpos100chr2q22.2 · 141500001–143400000 · gnegchr2q22.3 · 143400001–147900000 · gpos100chr2q23.1 · 147900001–149000000 · gnegchr2q23.2 · 149000001–149600000 · gpos25chr2q23.3 · 149600001–154000000 · gnegchr2q24.1 · 154000001–158900000 · gpos75chr2q24.2 · 158900001–162900000 · gnegchr2q24.3 · 162900001–168900000 · gpos75chr2q31.1 · 168900001–177100000 · gnegchr2q31.2 · 177100001–179700000 · gpos50chr2q31.3 · 179700001–182100000 · gnegchr2q32.1 · 182100001–188500000 · gpos75chr2q32.2 · 188500001–191100000 · gnegchr2q32.3 · 191100001–196600000 · gpos75chr2q33.1 · 196600001–202500000 · gnegchr2q33.2 · 202500001–204100000 · gpos50chr2q33.3 · 204100001–208200000 · gnegchr2q34 · 208200001–214500000 · gpos100chr2q35 · 214500001–220700000 · gnegchr2q36.1 · 220700001–224300000 · gpos75chr2q36.2 · 224300001–225200000 · gnegchr2q36.3 · 225200001–230100000 · gpos100chr2q37.1 · 230100001–234700000 · gnegchr2q37.2 · 234700001–236400000 · gpos50chr2q37.3 · 236400001–242193529 · gnegMEMO1pq1 bp242,193,529 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: reverse strand (−)
Genomic coordinates
chr2:31,865,060–32,011,230
Gene span
146,171 bp
Strand
Reverse (−)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000404530 ★31,867,823–32,011,00810
ENST0000029506531,865,060–32,010,9289
ENST0000037938331,865,060–31,963,2989
ENST0000042631031,865,060–32,010,9288
ENST0000090884831,865,060–32,010,9287
ENST0000090884931,865,060–32,010,92810
ENST0000090885031,865,060–32,011,0299
ENST0000090885131,865,060–32,010,95110
ENST0000090885231,865,060–32,010,9286
ENST0000090885331,865,060–32,010,9288
ENST0000092420031,865,060–32,011,02911
ENST0000092420131,865,060–32,010,92810

顯示 12/36 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

MEMO1 可能協助將細胞外趨化訊號傳遞至微管細胞骨架,進而調控細胞移動;它也是 ERBB2 訊號傳遞的媒介。資料指出,MEMO1-RHOA-DIAPH1 訊號路徑對 ERBB2 依賴的細胞皮質微管穩定具有重要作用。

在此路徑中,MEMO1 透過調節 GSK3B 活性,控制 APC 與 CLASP2 是否定位至細胞膜。膜上的 APC 接著使 MACF1 得以定位於細胞膜;這項定位是微管捕捉與穩定所必需的。這些環節將訊號傳遞與細胞膜附近的微管組織連結起來。

MEMO1 也被指出是乳癌細胞移動所必需。此敘述提供了細胞移動功能的條件性證據,但來源未進一步說明其適用的細胞背景或實驗操作,因此不宜延伸推論至其他細胞類型或情境。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 32011008 · 負股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>MEMO1 ENST00000404530 GRCh38 chr2:32010908-32012008 strand=-1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
TCATGGCTCACTGTAGCCTCGACCTCCTGGGCTCAAGTGATCCTCCCGCCTCCGCCTACCAAGTAGCTAG
GACCACAGGCGAAGCCACCACGCCCGGATAATTAAAAAATAAAAAATTCATAGAAACAGGGTCTCCTATG
TTCCCCAGGCTGGTCTAGAACTCCTGGCCTCAGGCAGTCCTACTGCCTCAGGCCCCCAAAGTGCTGGGAT
TATAGGCAGGAGGTACCATGCCCATGCAGTTACAAACATTTTATAGTGTTTGCCCCAAAACTTTCATTGG
ATGTATGCAACTTTCTCTTCCTCTATTCCTACTTTTGCAATGGTGTACTTTGTAACAATAACACTTCCTC
AGAGGTCCAAGATAGCCTCCTTTGCTGTGATTCTTATACAATTGTAAAAAAATTATTTGTTCCTGACATT
TATGTGGAATACTGGGATTTATAAGATGACAAAGGTGAAAATAATATTTGTTGTAGGCTTACCCTGTCAG
GCTGTTCACATTCAACAGCTCTTATAATCGTAGGTACACTCCTTGAGTGTCCCCATTTTACAGCTGAGGA
TAACGAGGCTAGTTATATCAAACACCTTAGTTAGGGAGATATGACATACACCTACATAAATACAACATGA
AACAAGATAAATGGTTACAGTGTCAAAGCCACCATTAGGTGGTAAGAGTGACCCTGTGAAGCAAAAACTA
GTATTTGCATGACCACAGGCACACTTTACCACGCGCCTGCTTCTACAGATGAACTTCCCGGCGTGCCACC
CTAGGAATGAGACCTTGGGGGTGCAAATCGATGAGAGATGCCTGTATATGATGGATACCCGCGGGACTGT
CCTCGTGGAAAGCCGCATCCGCGAGCCCTAGGTGCTCTCCATTTGAGGAAGTTGGCTGGGGGAGGGGGCT
TGCCTTGCGGCTGCGTCCTGCTCCCCGCGCCCTGCCCCCACCTCCCAGCCTCTGCTGCCGCTAAACCCCG
GAGAGCGGAGCGTGCACGTTGAGATTCCTCGGCGGGTAGGCAGCGGTGCTGGGCATGCTCAGTGGGCAGG
ACCCGTTAGAGTGGCGAGTAAGGAAGCGTTGGCTCTTCTCCGGGTCTGCCT
MEMO1 位於負股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 6 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
MEMO1_6 ↗2:31,868,265負股31,868,255–31,868,314
MEMO1_5 ↗2:31,891,990負股31,891,980–31,892,039
MEMO1_1 ↗2:32,010,285負股32,010,275–32,010,334
MEMO1_3 ↗2:32,010,465負股32,010,455–32,010,514
MEMO1_4 ↗2:32,010,643負股32,010,633–32,010,692
MEMO1_2 ↗2:32,010,968負股32,010,958–32,011,017

EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR2_C56QH · enhancer · 32008532–32010364 · regulatory

ENSR2_59J9PX · CTCF_binding_site · 32010315–32010336 · regulatory

ENSR2_C56QL · promoter · 32010365–32011498 · regulatory

ENSR2_59J9S2 · CTCF_binding_site · 32010760–32010781 · regulatory

· motif · 32006151–32006166 · motif

· motif · 32006396–32006410 · motif

· motif · 32006690–32006705 · motif

· motif · 32007164–32007179 · motif

· motif · 32007165–32007179 · motif

· motif · 32007166–32007179 · motif

· motif · 32009530–32009552 · motif

· motif · 32009530–32009552 · motif

· motif · 32009734–32009749 · motif

· motif · 32010283–32010296 · motif

· motif · 32010289–32010302 · motif

· motif · 32010317–32010333 · motif

· motif · 32010468–32010483 · motif

· motif · 32010590–32010603 · motif

· motif · 32010647–32010660 · motif

· motif · 32010667–32010680 · motif

· motif · 32010749–32010762 · motif

· motif · 32010762–32010778 · motif

· motif · 32010791–32010808 · motif

· motif · 32010968–32010979 · motif

· motif · 32010968–32010979 · motif

· motif · 32011054–32011064 · motif

· motif · 32011060–32011070 · motif

· motif · 32011095–32011105 · motif

· motif · 32011101–32011111 · motif

· motif · 32011116–32011129 · motif

· motif · 32011171–32011184 · motif

· motif · 32011171–32011184 · motif

· motif · 32011266–32011277 · motif

· motif · 32011316–32011331 · motif

· motif · 32011701–32011714 · motif

· motif · 32013106–32013119 · motif

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / PROTEIN ANATOMY

蛋白質結構域與序列

參考蛋白質長度:297 aa

MEMO1 產物屬於 MEMO1 family。現有資料未提供其結構域、功能區域或序列註解。

07 / STRUCTURAL BIOLOGY

蛋白質三維結構

自動載入 · 可拖曳旋轉與縮放
正在載入 PDB · 7KQ8…

PDB · 7KQ8

X-ray · 2.15 A · A/B/C/D=4-297

查看原始結構紀錄 ↗

實驗模型;依序列位置著色,可能只覆蓋局部區域。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

細胞內定位

動物細胞結構與蛋白質定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

09 / PROTEIN NETWORK

交互作用與訊號網絡

圖中 19 個夥伴 · 最多顯示 50 個
CGI-27MEMO1CAMTA2CT55DDIT4LEMILIN3ERBB2GGA2LNX1LZTS2PROSER2RBM45RELRFX6TACC1TCF4TRIM27TRIP6WDR54ZBTB22ZNF655
來源支持的結構/直接結合關係其他來源關係紀錄

拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。

更多交互作用夥伴 · 已取得 19 個夥伴
第 1 頁

查看 UniProt 完整互作來源 ↗

MEMO1 與 ERBB2 存在實體互作;此互作對象是經 Tyr-1248 磷酸化的 ERBB2。來源未描述兩者形成的複合體或其他互作關係。

10 / HUMAN HEALTH

疾病與遺傳關聯

目前未取得此類註解。
個別變異的臨床意義取決於其證據;基因層級的疾病關聯不能套用至所有變異。
11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

2 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 2 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能MEMO1 可能將細胞外趨化訊號傳至微管細胞骨架,並介導 ERBB2 訊號。MEMO1-RHOA-DIAPH1 路徑參與 ERBB2 依賴的細胞皮質微管穩定;該路徑藉由調節 GSK3B 活性控制 APC 與 CLASP2 的細胞膜定位,膜上 APC 再促成 MACF1 定位,而此定位為微管捕捉及穩定所需。MEMO1 亦為乳癌細胞移動所必需。含實驗來源
證據與來源

May control cell migration by relaying extracellular chemotactic signals to the microtubule cytoskeleton. Mediator of ERBB2 signaling. The MEMO1-RHOA-DIAPH1 signaling pathway plays an important role in ERBB2-dependent stabilization of microtubules at the cell cortex. It controls the localization of APC and CLASP2 to the cell membrane, via the regulation of GSK3B activity. In turn, membrane-bound APC allows the localization of the MACF1 to the cell membrane, which is required for microtubule capture and stabilization. Is required for breast carcinoma cell migration

PMID 15156151 ↗ · PMID 20937854 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

交互作用MEMO1 與 ERBB2 互作;所述 ERBB2 帶有 Tyr-1248 磷酸化。含實驗來源
證據與來源

Interacts with ERBB2 phosphorylated on 'Tyr-1248'

PMID 15156151 ↗ · PMID 18045866 ↗

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 2 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

核酸與蛋白質序列

完整轉錄本 · UTR / CDS 著色 · FASTA
ENST00000404530 · 1,516 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GAGATTCCTCGGCGGGTAGGCAGCGGTGCTGGGCATGCTC40
41AGTGGGCAGGACCCGTTAGAGTGGCGAGCGGCACAGGCAC80
81CAAGATGTCCAACCGAGTGGTCTGCCGAGAAGCCAGTCAC120
121GCCGGGAGCTGGTACACAGCCTCAGGACCGCAGCTGAATG160
161CACAGCTAGAAGGTTGGCTTTCACAAGTACAGTCTACAAA200
201AAGACCTGCTAGAGCCATTATTGCCCCCCATGCAGGATAT240
241ACGTACTGTGGGTCTTGTGCTGCCCATGCTTATAAACAAG280
281TGGATCCGTCTATTACCCGGAGAATTTTCATCCTTGGGCC320
321TTCTCATCATGTGCCCCTCTCTCGATGTGCACTTTCCAGT360
361GTGGATATATATAGGACACCTCTGTATGACCTTCGTATTG400
401ACCAAAAGATTTACGGAGAACTGTGGAAGACAGGAATGTT440
441TGAACGCATGTCTCTGCAGACAGATGAAGATGAACACAGT480
481ATTGAAATGCATTTGCCTTATACAGCTAAAGCCATGGAAA520
521GCCATAAGGATGAGTTTACCATTATTCCTGTACTGGTTGG560
561AGCTCTGAGTGAGTCAAAAGAACAGGAATTCGGAAAACTC600
601TTCAGTAAATATCTAGCGGATCCTAGTAATCTCTTTGTGG640
641TTTCTTCTGATTTCTGCCATTGGGGTCAAAGGTTCCGTTA680
681CAGTTACTATGATGAATCCCAGGGGGAGATTTATAGATCC720
721ATTGAACATCTAGATAAAATGGGTATGAGTATTATAGAAC760
761AATTAGACCCTGTATCTTTTAGCAATTACTTGAAGAAATA800
801CCATAATACTATATGTGGAAGACATCCCATTGGGGTGTTA840
841TTAAATGCTATCACAGAGCTCCAGAAGAATGGAATGAATA880
881TGAGTTTTTCGTTTTTGAATTATGCCCAGTCGAGCCAGTG920
921TAGAAACTGGCAAGACAGTTCAGTGAGTTATGCAGCTGGA960

cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。