演化之聲
THE SOUND OF EVOLUTION
Human Gene AtlasHOMO SAPIENS
HUMAN NON-CODING RNA GENE

MEG8NCRNA00024

maternally expressed 8, small nucleolar RNA host gene

MEG8 是位於染色體 14q32.31 的非蛋白質編碼 RNA 基因,屬於印記基因群;其轉錄本在骨骼肌中較常由母源等位基因表現。

Homo sapiens14q32.31
OFFICIAL SYMBOL
MEG8
CHROMOSOME
14
RNA TYPE
lncRNA
TRANSCRIPTS
65
01 / GENE OVERVIEW

基因總覽

MEG8(maternally expressed 8, small nucleolar RNA host gene)是非蛋白質編碼 RNA 基因,位於染色體 14q32.31,屬於一群基因組印記基因所在區域。其轉錄本在骨骼肌中較常由母源等位基因表現;現有資料將其描述為非蛋白質編碼轉錄本,未提供更多 RNA 結構或家族特徵。

Official symbol
MEG8
Gene name
maternally expressed 8, small nucleolar RNA host gene
Organism
Homo sapiens
Gene type
Non-coding RNA
HGNC ID
HGNC:14574
RNA type
RNA, long non-coding
02 / NOMENCLATURE

基因異名與舊稱

Alternative gene names & synonyms
NCRNA00024IrmRianBsrLINC00024AL132709.8lnc-MGCSNHG23SNHG24

異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱。

03 / GENOMIC CONTEXT

染色體位置與基因結構

Chromosome 1414q32.31
chr14 · 107,043,718 bp · GRCh38chr14p13 · 1–3600000 · gvarchr14p12 · 3600001–8000000 · stalkchr14p11.2 · 8000001–16100000 · gvarchr14p11.1 · 16100001–17200000 · acenchr14q11.1 · 17200001–18200000 · acenchr14q11.2 · 18200001–24100000 · gnegchr14q12 · 24100001–32900000 · gpos100chr14q13.1 · 32900001–34800000 · gnegchr14q13.2 · 34800001–36100000 · gpos50chr14q13.3 · 36100001–37400000 · gnegchr14q21.1 · 37400001–43000000 · gpos100chr14q21.2 · 43000001–46700000 · gnegchr14q21.3 · 46700001–50400000 · gpos100chr14q22.1 · 50400001–53600000 · gnegchr14q22.2 · 53600001–55000000 · gpos25chr14q22.3 · 55000001–57600000 · gnegchr14q23.1 · 57600001–61600000 · gpos75chr14q23.2 · 61600001–64300000 · gnegchr14q23.3 · 64300001–67400000 · gpos50chr14q24.1 · 67400001–69800000 · gnegchr14q24.2 · 69800001–73300000 · gpos50chr14q24.3 · 73300001–78800000 · gnegchr14q31.1 · 78800001–83100000 · gpos100chr14q31.2 · 83100001–84400000 · gnegchr14q31.3 · 84400001–89300000 · gpos100chr14q32.11 · 89300001–91400000 · gnegchr14q32.12 · 91400001–94200000 · gpos25chr14q32.13 · 94200001–95800000 · gnegchr14q32.2 · 95800001–100900000 · gpos50chr14q32.31 · 100900001–102700000 · gnegchr14q32.32 · 102700001–103500000 · gpos50chr14q32.33 · 103500001–107043718 · gnegMEG8pq1 bp107,043,718 bp
GRCh38 / 1-based inclusiveDirection: forward strand (+)
Genomic coordinates
chr14:100,883,057–101,038,859
Gene span
155,803 bp
Strand
Forward (+)
Gene assembly
GRCh38
查看實際轉錄本與 exon 註解
TranscriptGenomic coordinatesExons
ENST00000638012 ★100,897,922–100,986,93837
ENST00000699458100,883,057–100,907,4906
ENST00000699459100,884,030–100,960,21426
ENST00000789029100,884,308–100,890,0902
ENST00000789030100,889,437–100,893,3832
ENST00000553584100,894,770–100,913,7436
ENST00000554852100,894,889–100,907,0065
ENST00000668102100,894,964–100,967,05326
ENST00000636052100,894,964–100,967,05425
ENST00000668725100,897,922–100,967,05324
ENST00000553465100,897,949–100,929,1627
ENST00000741821100,898,788–100,913,7425

顯示 12/65 個RNA轉錄本;canonical 優先。

帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。

04 / BIOLOGICAL FUNCTION

分子功能與生物學過程

MEG8 的轉錄本不編碼蛋白質。資料指出,它在骨骼肌中較常由母源等位基因表現,顯示其表現具有親本來源偏向;此描述限於骨骼肌,未提供其他組織中的表現情形或表現程度資訊。

MEG8 位於染色體 14q32.3 的印記基因群中,並且似乎與該區域其他印記基因受到協同調控。來源以「似乎」描述這種調控關係,並未進一步說明調控方式或其分子機制,因此不能據此推定具體的調控因子或作用途徑。

05 / GENE REGULATION

Promoter 與基因調控

到

以 TSS = 0 為基準:負數為上游、正數為下游,包含起點與終點。每次最多取得 100,000 bp。

TSS: 100897922 · 正股
依所選 TSS 來源,取得指定上、下游範圍的基因組序列。
擷取區間依所選 TSS 計算;調控註解與實驗支持的 TSS 可在下方查閱。
>MEG8 ENST00000638012 GRCh38 chr14:100896922-100898022 strand=1 5′→3′
相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp
依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter
GGTCTCATTCCACTCGGCTAATCTCCAAGAACACCGGCCAGGGCATTGGCTTTCGGGTCCTTTTAAAGAC
CAAAAAGTAAAGCACTCCCCCGTGGGTGCTGGACAGCTTGGGAGGGATTTGGGGCTGTGGGTGGTGAAAT
CACAGCCCTGGGCACACACCTGCCAGCCCGATGTCACTGACAGGCTGCTCGGAGGCTTGGGGCTCCAGTG
AGAGCATATAGATATTTTTTAAAAAACATATTCGCGATAAAATAAATCCCCTGTGTCTGCAGAACTTGCT
CTGGGCATGTACCCACTCCCAATCCATCAGGAAACATGCCCTTTGCTTTGTATTTGTAAAAACAGAAACA
AAAACAAAAACAACCCACAGGCGAACAAGCAAATTAAATCCCCCCCACACAAAATGTTTATTCTAATTAT
GCAAGAAATGGATTGATAATTAATACACGCATTAGTAAAAATCAAACACTGCAGATAAAGCCATCTTTAA
TGCTTCCCTCGATCCCTCCCCATCACCCCCCAGCAAATTAACTGCTCTTCTCAGTTTCAGGCGTCTGGTT
CCAGATATTTTTTTCTGTGCATTTGCATATGTAGATAAATATACCTCTAAAATCTATGACTTTGTTTATT
TTTTACATAAACTATATCATAGTGTACATTTCCTCTCGCAGCAGCTTGTGTTTCTTCCTTCAAGAGTCTG
CTTAGAGATAATAAAGATCAACACTATTCCTTATAACAACACCTCAGTATCCTGCGAGCTGTACACACCA
GAGTTTATTTAACCACCTTGCTGCTGGCATGAAAGCCTCAGGTCCTTTACCCTGGTTGGCGGGGGGGGGG
GTGGGGGGGTGGGGGGCGGGGGGGGGCAGTGAATTGGTGGCGGCAGGTGTAAGTAATTGCTGAGATTTGG
GTTTGGGGAGTGGGCTCACGAGTGTTTATGACATTATTATAAATGAATATATGAGTGCATAAATTAGCAA
AATAAAAGGGGGCTTTTCTGGACCAATGATGAGACAGTGTTTATGAACAAAAGATCATGATTAATCCAGT
TCTGCACAAAACACTGAGGTCCATTAGAAGACAATAGGTCTTGGCTGTTTC
MEG8 位於正股。上下游依轉錄方向計算,序列一律以該方向的 5′→3′ 顯示;負股會取得反向互補序列。
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
EPDnew IDTSS(1-based)股向來源顯示區間
MEG8_2 ↗14:100,897,921正股100,897,872–100,897,931
MEG8_1 ↗14:100,936,492正股100,936,443–100,936,502

EPDnewNC human v001 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。

EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0

查看已取得的調控/motif 註解

ENSR14_BQ2MQ · enhancer · 100899364–100899995 · regulatory

ENSR14_CD2BX · enhancer · 100900110–100901369 · regulatory

ENSR14_BQ2N6 · enhancer · 100902203–100903037 · regulatory

目前未取得此類註解。
序列擷取依所選 TSS 與相對範圍計算;該區間的調控功能需參照相應的實驗證據。
06 / RNA TRANSCRIPTS

RNA 轉錄本與序列

Non-coding RNA

MEG8 依 HGNC/Ensembl 分類為 Non-coding RNA。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。

轉錄本Biotype拼接長度Exons
ENST00000638012 ★lncRNA5,163 nt37
ENST00000699458lncRNA2,511 nt6
ENST00000699459lncRNA2,395 nt26
ENST00000789029lncRNA503 nt2
ENST00000789030lncRNA382 nt2
ENST00000553584lncRNA1,046 nt6
ENST00000554852lncRNA557 nt5
ENST00000668102lncRNA3,862 nt26
ENST00000636052lncRNA2,532 nt25
ENST00000668725lncRNA5,299 nt24
ENST00000553465lncRNA1,723 nt7
ENST00000741821lncRNA944 nt5

拼接長度由已註解 exon 長度加總,單位為 nt;不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。

08 / SUBCELLULAR LOCALIZATION

RNA 細胞內定位

動物細胞結構與RNA定位細胞膜包圍細胞質;細胞核內有核仁,粗面內質網鄰接核膜,粒線體含內膜摺疊,高基氏體由堆疊扁平囊組成。深綠色圓點依來源註解標記定位,器官大小與數量為示意。圓點數量不表示含量;未繪示構造列於圖旁文字。 細胞質 細胞膜 粗面內質網與核糖體 細胞核與核膜 核仁 粒線體:外膜與含摺疊的內膜 高基氏體與運輸囊泡 胞內體、溶體與其他囊泡(示意)
定位:尚未取得定位註解

動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。

11 / CONTEXTUAL FUNCTIONAL EVIDENCE MATRIX

Contextual Functional Evidence Matrix

功能證據與細胞情境矩陣

矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。

1 筆功能證據/註解
目前尚無同時具備實驗情境與干預/量測資訊的證據列。可查核的功能敘述列於「功能註解總覽」,空白實驗欄位不以推測補齊。
功能註解總覽 · 1 筆
功能面向功能敘述證據類型可查核來源
功能MEG8 位於染色體 14q32.3 的印記基因群中,產生不編碼蛋白質的轉錄本;在骨骼肌中,該轉錄本較常由母源等位基因表現。它似乎與此區域其他印記基因受到協同調控,但來源未說明調控機制。資料庫紀錄
證據與來源

This gene is located in a cluster of imprinted genes on chromosome 14q32.3. It encodes a a non-protein coding transcript that is preferentially expressed from the maternal allele in skeletal muscle, and appears to be coordinately regulated with other imprinted genes in this region.

開啟資料庫紀錄 ↗

情境矩陣 0 筆 · 一般功能註解 1 筆。互作清單與機器格式紀錄不列入本區。
證據分項判讀,不加總為單一可信度分數。「含實驗來源」依資料庫證據標記辨識;未逐篇核對原始方法的紀錄,不宣稱已完成實驗審查。
12 / SEQUENCE EXPLORER

DNA 與 RNA 序列

完整非編碼轉錄本 · FASTA
ENST00000638012 · 5,163 nt · GRCh38
依 Ensembl exon 註解拼接的 GRCh38 參考序列,保留非編碼區。
1GACCAATGATGAGACAGTGTTTATGAACAAAAGATCATGA40
41TTAATCCAGTTCTGCACAAAACACTGAGGTCCATTAGAAG80
81ACAATAGGTCTTGGCTGTTTCATTCCTTTTAAGAGCTGTT120
121TAATATTCCACGGAGCCCTGGGCTCCCCCAGTGTTGCCTG160
161GGTCTGACTTTGCCTCAGTGAAAACTGCCTCGAATTCTTT200
201CTTGCACCGATGGGCAGATGGGCAGTGTCGGAGGATCGTG240
241TCATCTGTCCCGTGGCGCTGGTTGGCTTGGTCAAGTCAGT280
281GTTCAAACTATCTCCTGCTCTTTCAAGGGGATCTGGGGCT320
321CTAGAAGATTAGAGGACTTGGAGAGGTTAGTGACTTGCTC360
361GAGGTCGGCTAGGAAGCAAGACCCAGGATTCCAACTCAGG400
401TCTGTGTGATTCCTCTGCAAAATGGAGAGGTGGAAGGATG440
441GATGTCAGGTCTGATGGATGGATGGATGCCTACATCAAGA480
481TACATGCATAGATGGAGAGATGGCTGGCTACCTCATGAAT520
521GCTGGACTGTTGTGAGAATCAAACGAGATAATGTATGCTG560
561AGGCATGCTGTGAACACTACGTGCTGGGTACAGGAGAATG600
601GAGGCTCCAGAGTGAAATTAATGACACTTTGTCGATGAAG640
641ATCTTGATTGTGACCTCTGTGGAAAATGAGCCATGAACCA680
681ACCAATGATAAGTCTACTTTTCTTCCACGTAACAACCACA720
721GGATAGATGACATTCATTTTCTAAGAAACAAAATCTTGGC760
761AGTTAGATCCGTGGGGTAAAGAATATAGATACTAATGTAA800
801GTTAACACCTCAAGTTCATGTCCTTGGTTTGGATGCTTTG840
841TTCAGGAGTGTTTAGTGGTATTTCAAAGGAATCAATATCT880
881ATAACAAATTAAAATAACCAGGAATGGACCAGTGATGGAA920
921ATGTGTTCCGAAAATATGTTTAATATAATTTGGCACAACT960

cDNA 使用 DNA 字母 T;RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。