基因總覽
MEG3（maternally expressed 3）是非編碼 RNA 基因，屬於母源表現的印記基因。此基因可轉錄出多種經選擇性剪接形成的轉錄本，且這些轉錄本皆為長鏈非編碼 RNA（lncRNA），並非蛋白質編碼產物。MEG3 在多種正常組織中表現；在來源所述的多種組織來源癌細胞株中，則可觀察到其表現喪失。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000649261 ★ | 100,826,118–100,861,026 | 10 |
| ENST00000824814 | 100,779,206–100,790,866 | 2 |
| ENST00000556407 | 100,779,410–100,829,185 | 3 |
| ENST00000648456 | 100,826,098–100,861,030 | 7 |
| ENST00000654077 | 100,826,108–100,835,422 | 6 |
| ENST00000429159 | 100,826,108–100,861,026 | 7 |
| ENST00000451743 | 100,826,108–100,861,031 | 7 |
| ENST00000522771 | 100,826,116–100,857,624 | 7 |
| ENST00000648802 | 100,826,116–100,860,995 | 8 |
| ENST00000555928 | 100,826,116–100,861,026 | 8 |
| ENST00000556736 | 100,826,116–100,861,026 | 8 |
| ENST00000647780 | 100,826,116–100,861,026 | 8 |
顯示 12/72 個RNA轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
MEG3 的研究結果支持其具有腫瘤抑制功能。體外實驗中，MEG3 可抑制腫瘤細胞增殖，顯示其與癌細胞生長受到限制相關；這項結果描述的是體外觀察，不能直接等同於人體中的治療效果。
MEG3 也與腫瘤抑制因子 p53 互作，並調節 p53 標的基因的表現。來源未進一步說明這種調節的方向、分子細節或所涉及的標的，因此不宜據此推定特定的下游機制。
在體內，刪除 MEG3 會增強血管生成，指出 MEG3 缺失與血管生成增加相關。來源未提供此結果的模型或實驗條件，因而不應延伸推論至特定組織或疾病情境。綜合所列實驗觀察，來源將 MEG3 描述為具有腫瘤抑制作用的 lncRNA。
Promoter 與基因調控
>MEG3 ENST00000649261 GRCh38 chr14:100825118-100826218 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter TTGACGGCCCTGCACGCTCTGCCACTCAGAGCCGGGCAGAGCTGCCGAGGGCTCCCACCTGTTAGGGATT AACTCCCATGTGCCAGCTCCGGAGCCGAGGCCGCGGCAGGGCTCGGCGCAACATGTGTCGCTGCCTGTTT TTCGGGGCGCTGGGGCTCTTTCAAAGGGCATGTGTGTGGGGATCACCCCAACTTTGAGGGGTAGCTCAGG CATCTCCACATGGGACACAGTCCGCCCTCTAAAAGTACTTTCCTTAGAGGGCACGGCTCCTGTCTGGATT CTTATTACAACCCTGGTGTGTGTGGTGGGGGGTACCCCTGGTTAAGGTGGAGGAAGCGGACCCAGTGGAA GAGGAAGGGGCATAGCGGGTTCCGCGAACATGAGTTGTAAGCGGCAGAGCCCGGGACTCCACAGCCAGGG TTTTCTGACTCGGAGACGCGGAGCTCTGTCTCCCATGTCAAAGAGAACCAGTCAGAAACGCACGGGTGGG CTGGGAGGGGGTGACAGCCTCTGGCTTACATCTGGGAACCAGTTATGTCGCCCGGGCATTTTATTTTCCT GAACAATAAGAGAAAGCATGATTTTCTTTCGCTAAGCCCGCATCCTCCGATGGATGTTCCGAAACCGCCA GGTGTGGGATCTGCGCCCCGACAGCCCCACCTTGGCCATCGGCCGCCTGAGGACGGCCAGCCATCGGGGC GATTCCCCCCACACATTGTGCCTGAATTCACCCTGCCTGGCGAGCCGGGCTCACGCAGGGAAAAAGCACC CGCGACCACAGGGTGTTGGTCATGGCGGCCAGGGGCACTGCGGCAGAATTTTTTCCTCCCTTCTTTGCTG CAATCTGGGTGCGGCTAGAGCAATTTGTCATAGAATCTGGGGGGCTCATTTTTCCGGCCAATCACTTTTA GAGAAATGAGCGCATTGCAGCAGAATGCGCTGACGTCAGAGACCACCCCTTCTGCGCCTCCATATAAACC CCACCCAGCCAGCCCCTAGCGCAGACGGCGGAGAGCAGAGAGGGAGCGCGCCTTGGCTCGCTGGCCTTGG CGGCGGCTCCTCAGGAGAGCTGGGGCGCCCACGAGAGGATCCCTCACCCGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MEG3_1 ↗ | 14:100,826,120 | 正股 | 100,826,071–100,826,130 |
EPDnewNC human v001 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR14_84Z2XJ · enhancer · 100820982–100821206 · regulatory
ENSR14_93H2HC · enhancer · 100822883–100823217 · regulatory
ENSR14_93H2HH · enhancer · 100823502–100823772 · regulatory
ENSR14_BQ28S · enhancer · 100823954–100824634 · regulatory
ENSR14_93H2J7 · promoter · 100825822–100826195 · regulatory
ENSR14_CD25L · enhancer · 100826196–100827739 · regulatory
ENSR14_5TPBHK · CTCF_binding_site · 100826537–100826558 · regulatory
ENSR14_5TPBLR · CTCF_binding_site · 100827234–100827255 · regulatory
ENSR14_5TPBM3 · CTCF_binding_site · 100827293–100827314 · regulatory
ENSR14_BQ29G · enhancer · 100828071–100828803 · regulatory
ENSR14_5TPBRD · CTCF_binding_site · 100828228–100828249 · regulatory
ENSR14_5TPBTC · CTCF_binding_site · 100828652–100828673 · regulatory
ENSR14_84Z367 · enhancer · 100830750–100830980 · regulatory
· motif · 100821980–100821993 · motif
· motif · 100821980–100821993 · motif
· motif · 100826539–100826555 · motif
· motif · 100827236–100827252 · motif
· motif · 100827295–100827311 · motif
· motif · 100828230–100828246 · motif
· motif · 100828302–100828315 · motif
· motif · 100828654–100828670 · motif
RNA 轉錄本與序列
MEG3 依 HGNC／Ensembl 分類為 Non-coding RNA。本區依實際資料呈現基因座與轉錄本註解。
| 轉錄本 | Biotype | 拼接長度 | Exons |
|---|---|---|---|
| ENST00000649261 ★ | lncRNA | 1,979 nt | 10 |
| ENST00000824814 | lncRNA | 1,880 nt | 2 |
| ENST00000556407 | lncRNA | 632 nt | 3 |
| ENST00000648456 | lncRNA | 1,647 nt | 7 |
| ENST00000654077 | lncRNA | 1,206 nt | 6 |
| ENST00000429159 | lncRNA | 1,611 nt | 7 |
| ENST00000451743 | lncRNA | 1,600 nt | 7 |
| ENST00000522771 | lncRNA | 13,000 nt | 7 |
| ENST00000648802 | lncRNA | 1,650 nt | 8 |
| ENST00000555928 | lncRNA | 1,707 nt | 8 |
| ENST00000556736 | lncRNA | 1,717 nt | 8 |
| ENST00000647780 | lncRNA | 1,637 nt | 8 |
拼接長度由已註解 exon 長度加總，單位為 nt；不代表所有加工後成熟 RNA 的最終長度。
RNA 細胞內定位
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | MEG3 是母源表現的印記基因，具有多種選擇性剪接轉錄本，且皆為長鏈非編碼 RNA。它在多種正常組織中表現，但在不同組織來源的多種癌細胞株中表現喪失；體外可抑制腫瘤細胞增殖，並與 p53 互作、調節其標的基因表現。體內刪除 MEG3 會增強血管生成；實驗證據支持其具有腫瘤抑制作用。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源This gene is a maternally expressed imprinted gene. Multiple alternatively spliced transcript variants have been transcribed from this gene and all of them are long non-coding RNAs (lncRNAs). This gene is expressed in many normal tissues, but its expression is lost in multiple cancer cell lines of various tissue origins. It inhibits tumor cell proliferation in vitro. It also interacts with the tumor suppressor p53, and regulates p53 target gene expression. Its deletion enhances angiogenesis in vivo. Many experimental evidences demonstrate that this gene is a lncRNA tumor suppressor. |
DNA 與 RNA 序列
GCAGACGGCGGAGAGCAGAGAGGGAGCGCGCCTTGGCTCG40CTGGCCTTGGCGGCGGCTCCTCAGGAGAGCTGGGGCGCCC80ACGAGAGGATCCCTCACCCGGGTCTCTCCTCAGGGATGAC120ATCATCCGTCCACCTCCTTGTCTTCAAGGACCACCTCCTC160TCCATGCTGAGCTGCTGCCAAGGGGCCTGCTGCCCATCTA200CACCTCACGAGGGCACTAGGAGCACGGTTTCCTGGATCCC240ACCAACATACAAAGCAGCCACTCACTGACCCCCAGGACCA280GGATGGCAAAGGATGAAGAGGACCGGAACTGACCAGCCAG320CTGTCCCTCTTACCTAAAGACTTAAACCAATGCCCTAGTG360AGGGGGCATTGGGCATTAAGCCCTGACCTTTGCTATGCTC400ATACTTTGACTCTATGAGTACTTTCCTATAAGTCTTTGCT440TGTGTTCACCTGCTAGCAAACTGGAGTGTTTCCCTCCCCA480AGGGGGTGTCAGTCTTTGTCGACTGACTCTGTCATCACCC520TTATGATGTCCTGAATGGAAGGATCCCTTTGGGAAATTCT560CAGGAGGGGGACCTGGGCCAAGGGCTTGGCCAGCATCCTG600CTGGCAACTCCAAGGCCCTGGGTGGGCTTCTGGAATGAGC640ATGCTACTGAATCACCAAAGGCACGCCCGACCTCTCTGAA680GATCTTCCTATCCTTTTCTGGGGGAATGGGGTCGATGAGA720GCAACCTCCTAGGGTTGTTGTGAGAATTAAATGAGATAAA760AGAGGCCTCAGGCAGGATCTGGCATAGAGGAGGTGATCAG800CAAATGTTTGTTGAAAAGGTTTGACAGGTCAGTCCCTTCC840CACCCCTCTTGCTTGTCTTACTTGTCTTATTTATTCTCCA880ACAGCACTCCAGGCAGCCCTTGTCCACGGGCTCTCCTTGC920ATCAGCCAAGCTTCTTGAAAGGCCTGTCTACACTTGCTGT960cDNA 使用 DNA 字母 T；RNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。