基因總覽
MED22 是蛋白質編碼基因，產物屬於 Mediator complex subunit 22 family，並構成 Mediator complex 的一個次單元。Mediator complex 是參與 RNA polymerase II 依賴性轉錄調控的共活化因子；MED22 因而屬於此轉錄調控複合體的組成部分。此基因產物的基本定位為細胞核。可用資料支持其家族歸屬與複合體成員身分，但未提供更細的結構域或家族內分類資訊。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000343730 ★ | 133,338,312–133,348,131 | 5 |
| ENST00001135863 | 133,338,312–133,348,140 | 5 |
| ENST00000610672 | 133,338,323–133,347,885 | 5 |
| ENST00000983009 | 133,339,498–133,348,140 | 5 |
| ENST00000925578 | 133,340,901–133,347,866 | 5 |
| ENST00000610888 | 133,340,905–133,348,140 | 4 |
| ENST00000904047 | 133,340,905–133,347,898 | 4 |
| ENST00000925577 | 133,340,905–133,348,140 | 5 |
| ENST00001009228 | 133,340,905–133,348,140 | 4 |
| ENST00001009230 | 133,340,905–133,347,898 | 3 |
| ENST00001064589 | 133,340,905–133,347,885 | 4 |
| ENST00001064590 | 133,340,905–133,347,866 | 4 |
顯示 12/20 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
MED22 是 Mediator complex 的組成次單元。Mediator complex 作為共活化因子，參與幾乎所有 RNA polymerase II 依賴性基因的受調控轉錄。其功能之一，是在基因特異性調控蛋白與 RNA polymerase II 的基礎轉錄機器之間傳遞調控資訊，使特定基因的調控訊號能連結至轉錄起始所需的機制。
Mediator complex 可透過與調控蛋白直接互作而被招募至啟動子。到達啟動子後，Mediator 也作為支架，協助 RNA polymerase II 與一般轉錄因子組裝成功能性的轉錄前起始複合體。這些描述是 Mediator complex 整體的作用方式；現有資料未指出 MED22 單獨負責其中哪一個步驟，也未提供其獨立的分子作用機制。
Promoter 與基因調控
>MED22 ENST00000343730 GRCh38 chr9:133348031-133349131 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter ACTAAAACCTACAAGATACAACACAACCCAATTACCACCTTCCCTTGAGAAAAACATAGACCGTTTTCAT TCTGCCGTTTGTTACTTACCAATGCCAAAATTCTTAGGCCTTTTCTCAAACAGGGGATTCACCACTTTCT TAGCCTCCTGCTTCTTCACGACAGCTGGGGCCGGAGCCACCTTCTTTCCCTTGGCCTTCTTTCCTTTCGG CTGGGCAGAAAGAAAACGTCAGTTAAACCGCCGCCTCCACTCGCTTCGTCGGGGGTAGGGCTCAGGCTGG CTCCTCCAAAACAAGGGACGCTGACAGCACCTGCCTGAACTAAGCTGGCGAGCAGCTTTCTGCAACCCCC CAGCACCACCCCTCGACAGGAGCATCTCACATTCAGCCGCACAAGCATGCAGCCCCGGGAACCCCGAGTG GCCAGAGCAAGGCTAAGCCCGAGACCACGCTCTCTTCGCGTCGCCCACCCAGGAGACACCCCGGACTCAT GACTCCTCTGAGTCGCGGCCCCACAGGCTCTAGAAGCAACAGGGGCGGGCTCAGAACTCGTCGCTCACAA GGCCTCTGGAGCGGCCCCCAGCAAGCCCGAGAGACGCTAGGGCTCCGAGCCCCGCACTGCGGTGCTCCAG GCCTGCGACACCCAGCCCTGCGACACCGGGAACAACGCATTCCGCTCTCGGCCGCCCGGGGCTCTAGTCC ATCTCAATGTCTCCGTGCCACACCAAGTGGGGCTCTAATCCACCTCGGTGTCTCCGTGCCACACCGAGTG GGGCTCTCCTAGCGCCAGGAGGAGCAGGAGGCCCTCCGAGGCCGCGCCTGGAGGAGGATGGCAGCGGATA CAGCCGGAACCTGGCTATAGTGCCACGGAACTACAGCTCACTCACCATCTTGGGCGGCGGGAGGAGAGAG AAAGGAAAGGGAATTGTGGGTAATATGTATGCGGCCTCGGAGATCGCGAGAGTTGATACCGGCACGGGAT TTCGGATTTAAAGCAACAGCATTCCTATAAAGCTAAAAATCGAGGCGGGGCCGAGAGGCTGCGGCGGCTG ACTAGGTTTTCGGACCGCGGCGCGGCGGGGAAGAGAGACTGCGGCGGGAGG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MED22_2 ↗ | 9:133,348,096 | 負股 | 133,348,086–133,348,145 |
| MED22_1 ↗ | 9:133,356,468 | 負股 | 133,356,458–133,356,517 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR9_CH893 · enhancer · 133346385–133347692 · regulatory
ENSR9_BZGJ8 · promoter · 133347693–133348228 · regulatory
ENSR9_536CSXG · CTCF_binding_site · 133348334–133348355 · regulatory
ENSR9_93XX3N · promoter · 133348432–133348932 · regulatory
ENSR9_85WT5P · enhancer · 133349164–133349347 · regulatory
ENSR9_536CTL6 · CTCF_binding_site · 133352163–133352184 · regulatory
ENSR9_536CTMG · CTCF_binding_site · 133352440–133352461 · regulatory
· motif · 133347298–133347310 · motif
· motif · 133347300–133347307 · motif
· motif · 133347300–133347315 · motif
· motif · 133347619–133347632 · motif
· motif · 133347840–133347853 · motif
· motif · 133347868–133347881 · motif
· motif · 133347921–133347934 · motif
· motif · 133348336–133348352 · motif
· motif · 133351114–133351125 · motif
· motif · 133351946–133351954 · motif
· motif · 133352165–133352181 · motif
· motif · 133352441–133352452 · motif
· motif · 133352442–133352458 · motif
· motif · 133353013–133353030 · motif
· motif · 133353015–133353030 · motif
· motif · 133353022–133353030 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：200 aa
MED22 蛋白質長 200 個胺基酸，屬於 Mediator complex subunit 22 family。序列註解指出，第 166 至 200 位胺基酸為無序區域；資料未列出其他功能區或結構域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
MED22 的細胞內定位註記為細胞核；來源未提供定位變化的條件或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 15 個夥伴
- MED11Q9P086 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- MED17Q9NVC6 · UniProt INTERACTION · 8 experiments
- MED18Q9BUE0 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- MED27Q6P2C8 · UniProt INTERACTION · 7 experiments
- MED28Q9H204 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- MED29Q9NX70 · UniProt INTERACTION · 9 experiments
- Med11Q9D8C6 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- Med30Q9CQI9 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
- Med8Q9D7W5 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- HGSO14964 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- HTTP42858 · UniProt INTERACTION · 12 experiments
- NTAQ1Q96HA8 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- PRPS1P60891 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- TXNDC9O14530 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- WFS1O76024 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
MED22 是 Mediator complex 的組成次單元；來源列出的其他成員包括 MED1、MED4–MED21、MED23–MED27、MED29–MED31、MED12、MED13、MED13L、CCNC、CDK8 與 CDC2L6/CDK11。MED12、MED13、CCNC 與 CDK8 組成稱為 CDK8 module 的獨立模組。含有此模組的 Mediator complex，在支持轉錄活化方面的活性低於不含該模組的複合體。來源未指出 MED22 與其他蛋白質的個別直接結合關係。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | MED22 是 Mediator complex 的組成部分。Mediator 作為共活化因子，參與幾乎所有 RNA polymerase II 依賴性基因的受調控轉錄，並在基因特異性調控蛋白與基礎轉錄機器之間傳遞資訊。它可由調控蛋白直接招募至啟動子，並協助 RNA polymerase II 與一般轉錄因子組裝成具功能的轉錄前起始複合體。 | 資料庫紀錄 | 證據與來源Component of the Mediator complex, a coactivator involved in the regulated transcription of nearly all RNA polymerase II-dependent genes. Mediator functions as a bridge to convey information from gene-specific regulatory proteins to the basal RNA polymerase II transcription machinery. Mediator is recruited to promoters by direct interactions with regulatory proteins and serves as a scaffold for the assembly of a functional pre-initiation complex with RNA polymerase II and the general transcription factors |
| 交互作用 | Mediator complex 包含多個次單元，其中 MED12、MED13、CCNC 與 CDK8 構成稱為 CDK8 module 的獨立模組。含有此模組的 Mediator complex，在支持轉錄活化方面的活性低於不含此模組者。缺少一個或多個不同次單元的 Mediator complex 製備物，曾使用 ARC、CRSP、DRIP、PC2、SMCC 和 TRAP 等名稱。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the Mediator complex, which is composed of MED1, MED4, MED6, MED7, MED8, MED9, MED10, MED11, MED12, MED13, MED13L, MED14, MED15, MED16, MED17, MED18, MED19, MED20, MED21, MED22, MED23, MED24, MED25, MED26, MED27, MED29, MED30, MED31, CCNC, CDK8 and CDC2L6/CDK11. The MED12, MED13, CCNC and CDK8 subunits form a distinct module termed the CDK8 module. Mediator containing the CDK8 module is less active than Mediator lacking this module in supporting transcriptional activation. Individual preparations of the Mediator complex lacking one or more distinct subunits have been variously termed ARC, CRSP, DRIP, PC2, SMCC and TRAP PMID 15989967 ↗ |
| 細胞定位 | MED22 的細胞內定位註記為細胞核。 | 推論支持 |
核酸與蛋白質序列
ATTCCTATAAAGCTAAAAATCGAGGCGGGGCCGAGAGGCT40GCGGCGGCTGACTAGGTTTTCGGACCGCGGCGCGGCGGGG80AAGAGAGACTGCGGCGGGAGGGCCAGGCCGTGGGAGAGAC120GCGGGAAAGTGCGGGTCGCAGAGGCACTTGACCACCCCGC160CCTAGGCCGACCCGGCGGACGCGGCGTCTGGTGTGCGGGC200GCTGGGGCGGGTCCCAGGTCTCCCCGCTGCGCTGCTTGAG240GCTCGGCCATGGCCCAGCAGAGAGCCCTGCCCCAGAGCAA280GGAGACGCTGCTGCAGTCCTACAACAAGCGGCTGAAGGAC320GACATTAAGTCCATCATGGACAACTTCACCGAGATCATCA360AGACCGCCAAGATTGAGGACGAGACGCAGGTGTCACGGGC400CACTCAGGGTGAACAGGACAATTACGAGATGCATGTGCGA440GCCGCCAACATCGTCCGAGCCGGCGAGTCCCTGATGAAGC480TGGTGTCCGACCTCAAGCAGTTCCTGATCCTCAATGACTT520CCCCTCCGTGAACGAGGCCATTGACCAGCGCAACCAGCAG560CTGCGCACACTGCAGGAGGAGTGCGACCGGAAGCTCATCA600CGCTGCGAGACGAGATCTCCATTGACCTCTACGAGCTGGA640GGAGGAGTATTACTCGTCCAGCTCAAGCCTTTGCGAAGCT680AATGACCTGCCTCTGTGCGAAGCTTACGGGAGGCTGGACC720TCGACACAGACTCTGCTGATGGCCTCTCGGCCCCTCTGCT760GGCGTCCCCGGAGCCCAGTGCTGGCCCCCTACAGGTGGCA800GCCCCTGCCCACTCCCATGCTGGTGGCCCTGGCCCCACTG840AGCACGCCTGAGCCTCCGGGGCCACGCTTCGTTCTCAGGA880ACAAAACCTGAGGCAGCCCTTTGGATGCCCTCACAGCCTT920GCTTCTCTCAGCCTAGGTTCCCATTTGGGGACTTCAGGAC960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。