基因總覽
MED15（mediator complex subunit 15）是蛋白質編碼基因，產物屬於 Mediator complex subunit 15 family，並為 Mediator complex 的組成部分。Mediator complex 是參與 RNA polymerase II 依賴性轉錄調控的共活化因子；MED15 因此是轉錄調控複合體中的一個亞基。來源指出 MED15 參與膽固醇依賴的基因調控及 Nodal 訊息傳遞的正向調節。其蛋白質特徵與細胞定位另見下方相關段落。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000263205 ★ | 20,507,610–20,587,619 | 18 |
| ENST00000445987 | 20,495,913–20,555,135 | 6 |
| ENST00000292733 | 20,507,568–20,587,632 | 17 |
| ENST00000382974 | 20,507,568–20,587,632 | 16 |
| ENST00000853210 | 20,507,568–20,587,632 | 17 |
| ENST00000853211 | 20,507,568–20,587,632 | 15 |
| ENST00000853212 | 20,507,568–20,587,632 | 17 |
| ENST00000853213 | 20,507,568–20,587,632 | 17 |
| ENST00000853214 | 20,507,568–20,587,632 | 17 |
| ENST00000853215 | 20,507,568–20,587,632 | 18 |
| ENST00000853216 | 20,507,568–20,587,632 | 16 |
| ENST00000853217 | 20,507,568–20,587,632 | 18 |
顯示 12/46 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
MED15 是 Mediator complex 的組成亞基。Mediator complex 作為共活化因子，參與幾乎所有 RNA polymerase II 依賴基因的受調控轉錄。它在基因專一性調控蛋白與基礎 RNA polymerase II 轉錄機制之間傳遞調控資訊，將特定調控訊號連接至轉錄機制。
Mediator complex 可透過與調控蛋白直接交互作用而被招募至啟動子，並作為支架，協助 RNA polymerase II 與一般轉錄因子組裝成功能性轉錄起始前複合體。這些描述說明 Mediator 如何把調控蛋白提供的訊息帶到轉錄起始機制；來源將 MED15 列為此複合體的亞基，但未進一步限定 MED15 在上述步驟中的個別作用方式。
此外，MED15 被指出是膽固醇依賴基因調控所必需的，也會正向調節 Nodal 訊息傳遞路徑。這些功能與其作為 Mediator complex 亞基的角色並列於來源；來源未提供其作用細節或條件，因此不宜據此推定更具體的分子機制。
Promoter 與基因調控
>MED15 ENST00000263205 GRCh38 chr22:20506610-20507710 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AAGAGAGGCCTCTTTGGGGAGAGTGCTCACTCCTCTCCCACCCACTCTCTACCACCTTCAACCTCCTGTC TGGGGCACAGTAACAAGGGGTGTAAGGGGTGTACAGTGCCTAGCAGGGGCCTGGCACTTAGGCTTCAGTA GGTGCCAGTCCACAGTCTCCTGAGGCCCATGTTGGTTGGTGTCCACCTGGTGCTTATTGACCACTTGGGC TCCAGATTTTCCTCACGTCACCTCCCTCCCCAGGGTAGCAGATAAAGGCCCCATAGTTCCAAGGAGGCAG AACTTTTACATTCCTAAAAGCATTCTCAGGCCCCCATAACCCCTCATCCCACCTTCAGCTCGCTCACCTT CACCTATCAAATTCGTTTGACATCTGGCCTCCAGCAACTAGCTAGGCTGAGTTCTCCATGAAGGGGACGT GGCTGCTGGTCAAAAGGGAAAGCCCATGTCTAAAAATTAATTAACGTGGTTTAGGGGCCTCACATTCCCA ACCCCCAAATACAGCCATTGTGAGATGTGAGATTCAAAAAATCGAAGAGTGAAGCGGTGATGAGAGTCCA TCTGGTCGCTCTTCGGATGCGGCGCTAGCAGGCAGTTGCATGAAAGCAGATCCCAGATCACGTTGCACTG GCACACAGTAGGTACCCACACATATTTGATAAATAAACACTCTCTCCCTAGCATTACTATAGATAGCTGG CAGCTTGGCCTGGCATCCCGGAGGGGTCTGGATCTCAGGGACTAGATAAGGCCAGCACACTGAAGAGTTG CAGAAAATGCAGGCGGTCAGGCGCAGGTCTGCTGCGGGAGCACCTGCCGTGTCCGACAGCTGCACTGGAA GAGGGGCGTGTGTCTCCCAGCCGGGCGGAACCGAGACCGCTTCGTCCCCGGCGGGGAACTTCATTTCCCA CAAGCCTGTGCGCGAGACTCCATTTCCCACAAGCCCTCCTTCACTTCCGGCTCGGCCGAGGCACTGCGGA CGGCTTCCGGGTTTGGGCCTGGCTCTGTGACTGAGGCGGCGGCGGTGGCGGCCAAGCGGGATACGGGCGG CGGGAGCTGGGGAACAGGCATGGACGTTTCCGGGCAAGAGACCGACTGGCG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MED15_1 ↗ | 22:20,507,616 | 正股 | 20,507,567–20,507,626 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR22_B63TG · enhancer · 20503790–20504723 · regulatory
ENSR22_B63TW · promoter · 20507112–20507651 · regulatory
ENSR22_B63W2 · enhancer · 20507652–20508432 · regulatory
ENSR22_56S8F6 · CTCF_binding_site · 20507710–20507731 · regulatory
ENSR22_C42XL · enhancer · 20508762–20510038 · regulatory
ENSR22_9B5RQ · enhancer · 20510426–20510757 · regulatory
· motif · 20507418–20507427 · motif
· motif · 20507561–20507570 · motif
· motif · 20507561–20507572 · motif
· motif · 20507561–20507572 · motif
· motif · 20507591–20507602 · motif
· motif · 20507591–20507602 · motif
· motif · 20507712–20507728 · motif
· motif · 20508204–20508221 · motif
· motif · 20509515–20509528 · motif
· motif · 20509729–20509738 · motif
· motif · 20509729–20509738 · motif
· motif · 20510110–20510125 · motif
· motif · 20510244–20510259 · motif
· motif · 20510244–20510259 · motif
來源記載 MED15 受 12-O-tetradecanoylphorbol-13-acetate（TPA）調控，但未提供調控方向或作用細節。
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：788 aa
MED15 蛋白質長 788 個胺基酸，屬於 Mediator complex subunit 15 family。來源註記其第 9–73 位胺基酸區段與 SREBF1 交互作用，並將第 95–139、260–329 與 412–530 位區段標示為無序區。第 547–564 位胺基酸區段則被註記為核定位訊號。
蛋白質三維結構
細胞內定位
MED15 被記載位於細胞質與細胞核；來源未說明兩處定位間的變化條件或動態。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 7 個夥伴
- HTTP42858 · UniProt INTERACTION · 3 experiments · 2 筆來源紀錄
- MED14O60244 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- MED25Q71SY5 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- SREBF1P36956-1 · UniProt INTERACTION · 7 experiments · 2 筆來源紀錄
- SREBF2Q12772 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- TRIM11Q96F44 · UniProt INTERACTION · 5 experiments
- ATXN1P54253 · UniProt INTERACTION · 6 experiments
MED15 是 Mediator complex 的組成亞基。該複合體包含多個 MED 亞基，以及 CCNC、CDK8 和 CDC2L6/CDK11；其中 MED12、MED13、CCNC 與 CDK8 組成 CDK8 module。含有此模組的 Mediator complex 在支持轉錄活化方面，活性低於不含該模組者。來源另記載 MED15 與 SMAD2、SMAD3、SREBF1、SREBF2、WWTR1 及 TRIM11 交互作用，但未說明這些交互作用的性質。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | MED15 是 Mediator complex 的組成亞基；此複合體作為共活化因子，參與幾乎所有 RNA polymerase II 依賴基因的受調控轉錄，並在基因專一性調控蛋白與基礎轉錄機制間傳遞資訊。Mediator 可由調控蛋白招募至啟動子，協助組裝轉錄起始前複合體；MED15 亦為膽固醇依賴基因調控所必需，並正向調節 Nodal 訊息傳遞。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the Mediator complex, a coactivator involved in the regulated transcription of nearly all RNA polymerase II-dependent genes. Mediator functions as a bridge to convey information from gene-specific regulatory proteins to the basal RNA polymerase II transcription machinery. Mediator is recruited to promoters by direct interactions with regulatory proteins and serves as a scaffold for the assembly of a functional pre-initiation complex with RNA polymerase II and the general transcription factors. Required for cholesterol-dependent gene regulation. Positively regulates the Nodal signaling pathway PMID 12167862 ↗ · PMID 16630888 ↗ · PMID 16799563 ↗ |
| 交互作用 | MED15 屬於 Mediator complex，該複合體由多個 MED 亞基及 CCNC、CDK8、CDC2L6/CDK11 等組成；MED12、MED13、CCNC 與 CDK8 形成 CDK8 module，含此模組的複合體支持轉錄活化的能力較低。來源也記載 MED15 與 SMAD2、SMAD3、SREBF1、SREBF2、WWTR1 及 TRIM11 交互作用。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the Mediator complex, which is composed of MED1, MED4, MED6, MED7, MED8, MED9, MED10, MED11, MED12, MED13, MED13L, MED14, MED15, MED16, MED17, MED18, MED19, MED20, MED21, MED22, MED23, MED24, MED25, MED26, MED27, MED29, MED30, MED31, CCNC, CDK8 and CDC2L6/CDK11. The MED12, MED13, CCNC and CDK8 subunits form a distinct module termed the CDK8 module. Mediator containing the CDK8 module is less active than Mediator lacking this module in supporting transcriptional activation. Individual preparations of the Mediator complex lacking one or more distinct subunits have been variously termed ARC, CRSP, DRIP, PC2, SMCC and TRAP. Interacts with SMAD2, SMAD3, SREBF1 and SREBF2. Interacts with WWTR1. Interacts with TRIM11 PMID 10235267 ↗ · PMID 12167862 ↗ · PMID 15175163 ↗ · PMID 15989967 ↗ · PMID 16799563 ↗ · PMID 16904669 ↗ · PMID 18568018 ↗ |
| 細胞定位 | MED15 的細胞內定位記載為細胞質及細胞核；此資料未提供特定條件、定位變化或動態資訊。 | 資料庫紀錄 | |
| 調控 | 來源記載 MED15 的調控與 12-O-tetradecanoylphorbol-13-acetate（TPA）有關，但未指出調控方向、作用條件或具體機制。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GGCTCTGTGACTGAGGCGGCGGCGGTGGCGGCCAAGCGGG40ATACGGGCGGCGGGAGCTGGGGAACAGGCATGGACGTTTC80CGGGCAAGAGACCGACTGGCGGAGCACCGCCTTCCGGCAG120AAGCTGGTCAGTCAAATCGAGGATGCCATGAGGAAAGCTG160GTGTGGCACACAGTAAATCCAGCAAGGATATGGAGAGCCA200TGTTTTCCTGAAGGCCAAGACCCGGGACGAATACCTTTCT240CTCGTGGCCAGGCTCATTATCCATTTTCGAGACATTCATA280ACAAGAAATCTCAAGCTTCCGTCAGTGATCCTATGAATGC320ACTCCAGAGCCTGACTGGCGGACCTGCTGCGGGAGCCGCT360GGAATTGGCATGCCTCCTCGGGGCCCGGGACAGTCTCTGG400GCGGGATGGGTAGCCTTGGTGCCATGGGACAGCCAATGTC440TCTCTCAGGGCAGCCGCCTCCTGGGACCTCGGGGATGGCC480CCTCACAGCATGGCTGTCGTGTCTACGGCAACTCCACAGA520CCCAGCTGCAGCTCCAGCAGGTGGCGCTGCAGCAGCAGCA560GCAACAGCAGCAGTTCCAGCAGCAGCAGCAGGCGGCGCTA600CAGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAACAGCAGCAGTTCCAGG640CTCAGCAGAGTGCCATGCAGCAGCAGTTCCAAGCAGTAGT680GCAGCAGCAGCAGCAGCTCCAGCAGCAGCAGCAGCAGCAG720CAGCATCTAATTAAATTGCATCATCAAAATCAGCAACAGA760TACAGCAGCAGCAACAGCAGCTGCAGCGAATAGCACAGCT800GCAGCTCCAACAACAGCAACAGCAGCAGCAGCAGCAGCAG840CAGCAGCAGCAGCAGGCTTTGCAGGCCCAGCCACCAATTC880AGCAGCCACCGATGCAGCAGCCACAGCCTCCGCCCTCCCA920GGCTCTGCCCCAGCAGCTGCAGCAGATGCATCACACACAG960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。