基因總覽
MED12 是蛋白質編碼基因，其產物 mediator complex subunit 12 屬於 Mediator complex subunit 12 family，並為 Mediator complex 的組成次單元。Mediator complex 是參與 RNA polymerase II 依賴基因轉錄調控的共活化因子；MED12 因而是轉錄調控複合體的一部分。其具體分子作用方式與可能參與的訊號路徑靶基因調控，見下方功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000374080 ★ | 71,118,596–71,142,450 | 45 |
| ENST00000690242 | 71,118,543–71,144,103 | 46 |
| ENST00000692304 | 71,118,543–71,144,103 | 45 |
| ENST00000687382 | 71,118,543–71,144,103 | 46 |
| ENST00000333646 | 71,118,543–71,144,103 | 45 |
| ENST00000374102 | 71,118,543–71,144,103 | 45 |
| ENST00000690145 | 71,118,543–71,144,103 | 45 |
| ENST00000938012 | 71,118,543–71,144,103 | 45 |
| ENST00000938013 | 71,118,543–71,144,103 | 45 |
| ENST00001136457 | 71,118,543–71,144,103 | 45 |
| ENST00000693324 | 71,118,703–71,137,383 | 38 |
| ENST00000691468 | 71,118,726–71,137,383 | 38 |
顯示 12/16 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
MED12 是 Mediator complex 的組成部分。Mediator complex 作為共活化因子，參與幾乎所有 RNA polymerase II 依賴基因的受調控轉錄。它協助將基因特異性調控蛋白傳遞的資訊，連結至基礎 RNA polymerase II 轉錄機制，使調控訊號能與轉錄起始過程相銜接。
Mediator complex 可透過與調控蛋白直接互作而被招募至啟動子，並作為支架，促進 RNA polymerase II 與一般轉錄因子組成具功能的轉錄前起始複合體。這些敘述描述的是 Mediator complex 的整體作用；MED12 則以複合體次單元的身分參與其中。
MED12 可能對 Wnt 訊號路徑與 SHH 訊號路徑靶基因的轉錄具有特定調節作用。來源以「可能」描述此作用，因此不能據此視為已確立的普遍功能，也未提供其調節方式或作用條件的進一步細節。
Promoter 與基因調控
>MED12 ENST00000374080 GRCh38 chrX:71117596-71118696 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GCCGTGATAGCGCCACTGCACTCCAGCCTAGGCGACAGAGGGAGAACCTGCCTCAAAATAAACAAATAGC AATACGACAATAGGATATTGGCTCTGGAATTCAGAATCTTAGTGCCAGCTCTGTTACTCAGTAGCTGTAT AATATTGGATAAGTGAATTTTCACACTTTGAAAACCAGCTTCCTCCATCCGCAAAATCGAGCCAATAATA ATCCCTAACTCATGAGGCTGTGAGCAGATTAAAGGAGATAGTGTCTGAAAAGCATCTGACACAATAGGTG CCTCTTTAGCTAGACCAAGGGTTCTTAACCTGGAGTTCATGGACCCTTAGGGGATACATGGATGAACTTC AGGGGATCTAAGAATCTAAAGCAACATTTTGCATGTCAATATATGCATATTATTATTATTATTATTATTA TTTCTGGGAAGAAGGTCCATAGCTTTCATCAGCACCTTTAAGGGTTTGTGAATCAAAAACGTTAGTATGC GGTACCCTTGGGCAGAAAAACAAACAAGAAAAGGTTAGACAACTCGATGGTAGACCTTGAGGGATTAGAG CCAGCCTTTCAGGGTTTAATAGGTTCTTTCTCATGCATACATAGTTTCTAATGTTCACAATAGCCCCTTG AAGGAGGTGTTAGCGCACCTATTTTTCAGATGCCGGAACTAAGAAACGAACTGATCTGTAATAGACGGAG TTCCTAACCAATGCAAATATTATTGAAGACTTTTCTAGGCCAAAACCGAGCTAGGCTATGGGAACCGAAG TCCAGTCAGAACTCAGCACCACAGAGGCCTCCTTCTTCCCTGGTTTGCATCCCCAGCTCATTCTGCGCCT CCGGAACGTTTCATAGATTTTTGCTGAGTGAAATCGACTTGCTGCCGCCACCGCCGAAAAACTCCCGGGG CACAGAGCTCCGCCCCCACCGGGCCAGGCCCCACCTCCTCTGCAGTCGGTATTGTCCGATGGTTCCCGGC GTACCTCGGCTTCCCTCGGTAGTTTCCGGCAATGGTCGAGAGTTTCTAACGTGCCCCCTTGTTGTCTCTC GGCCGCCGTCCTCTCAACCACCGCCCCCCTTTTCGGCTCCCTCTCCCCCTT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MED12_1 ↗ | X:71,118,596 | 正股 | 71,118,547–71,118,606 |
| MED12_2 ↗ | X:71,118,729 | 正股 | 71,118,680–71,118,739 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSRX_BJ545 · promoter · 71118053–71118735 · regulatory
ENSRX_5LPMJX · CTCF_binding_site · 71118623–71118644 · regulatory
ENSRX_5LPMKX · CTCF_binding_site · 71118840–71118861 · regulatory
· motif · 71118625–71118641 · motif
· motif · 71118753–71118763 · motif
· motif · 71118842–71118858 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：2177 aa
MED12 蛋白質長 2177 個胺基酸，屬於 Mediator complex subunit 12 family。序列註解標示多段無序區域，分布於蛋白質不同位置；另有一段區域與 CTNNB1 和 GLI3 的互作相關，位置為胺基酸 1616–2051。
蛋白質三維結構
細胞內定位
MED12 的細胞定位標示為細胞核；來源未提供定位改變的條件、動態或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 5 個夥伴
- APLP1P51693 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- APLP2Q06481 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- APPP05067 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
- MED4Q9NPJ6 · UniProt INTERACTION · 13 experiments
- TGFBR2P37173 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
MED12 與 MED13、CCNC、CDK8 同屬 Mediator complex 的 CDK8 module；此模組包含於 Mediator complex 時，該複合體支持轉錄活化的能力低於不含此模組的 Mediator complex。另有資料記載 MED12 與 CTNNB1、GLI3 及 CDK19 互作，但未在此處詳述其互作方式。
疾病與遺傳關聯
影響 MED12 的變異與多種疾病相關，包括 Opitz-Kaveggia syndrome、Lujan-Fryns type X-linked syndromic intellectual developmental disorder、X-linked Ohdo syndrome，以及 Hardikar syndrome。來源將這些疾病列為由影響該基因的變異所致；未提供各疾病相關變異的細節。前三者的描述包含不同程度的智能障礙或發育特徵；Hardikar syndrome 則涉及多系統先天異常，且來源指出患者神經發育與認知正常。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 7 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | MED12 是 Mediator complex 的一部分；該複合體作為共活化因子，參與幾乎所有 RNA polymerase II 依賴基因的受調控轉錄，並連結基因特異性調控蛋白與基礎轉錄機制。它可由調控蛋白招募至啟動子，協助組裝轉錄前起始複合體；MED12 可能特別調節 Wnt 與 SHH 訊號路徑靶基因的轉錄。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the Mediator complex, a coactivator involved in the regulated transcription of nearly all RNA polymerase II-dependent genes. Mediator functions as a bridge to convey information from gene-specific regulatory proteins to the basal RNA polymerase II transcription machinery. Mediator is recruited to promoters by direct interactions with regulatory proteins and serves as a scaffold for the assembly of a functional pre-initiation complex with RNA polymerase II and the general transcription factors. This subunit may specifically regulate transcription of targets of the Wnt signaling pathway and SHH signaling pathway PMID 16565090 ↗ · PMID 16595664 ↗ · PMID 17000779 ↗ · PMID 29440396 ↗ |
| 交互作用 | MED12 與 MED13、CCNC、CDK8 組成 CDK8 module；含此模組的 Mediator complex 支持轉錄活化的能力低於不含此模組者。Mediator complex 另有多種缺少一個或多個次單元的製備物名稱；MED12 也與 CTNNB1、GLI3 及 CDK19 互作。 | 含實驗來源 | 證據與來源Component of the Mediator complex, which is composed of MED1, MED4, MED6, MED7, MED8, MED9, MED10, MED11, MED12, MED13, MED13L, MED14, MED15, MED16, MED17, MED18, MED19, MED20, MED21, MED22, MED23, MED24, MED25, MED26, MED27, MED29, MED30, MED31, CCNC, CDK8 and CDC2L6/CDK11. The MED12, MED13, CCNC and CDK8 subunits form a distinct module termed the CDK8 module. Mediator containing the CDK8 module is less active than Mediator lacking this module in supporting transcriptional activation. Individual preparations of the Mediator complex lacking one or more distinct subunits have been variously termed ARC, CRSP, DRIP, PC2, SMCC and TRAP. Also interacts with CTNNB1 and GLI3. Interacts with CDK19 PMID 10198638 ↗ · PMID 10235266 ↗ · PMID 10235267 ↗ · PMID 15175163 ↗ · PMID 15989967 ↗ · PMID 16565090 ↗ · PMID 16595664 ↗ · PMID 17000779 ↗ · PMID 29440396 ↗ |
| 細胞定位 | MED12 的細胞定位標示為細胞核。 | 推論支持 | |
| 疾病關聯 | Opitz-Kaveggia syndrome（OKS）是 X-linked disorder，特徵包括智能障礙、相對性巨頭症、肌張力低下與便祕；來源指出，影響 MED12 的基因變異會造成此病。 | 含實驗來源 | 證據與來源Opitz-Kaveggia syndrome OKS X-linked disorder characterized by intellectual disability, relative macrocephaly, hypotonia and constipation. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 305450 PMID 17334363 ↗ |
| 疾病關聯 | Lujan-Fryns type 的 X-linked syndromic intellectual developmental disorder 可有身材高、巨頭症、狹長臉、上顎發育不全、高而窄的顎部、肌張力低下、輕至中度智能障礙及胼胝體發育不全等表現；來源指出，影響 MED12 的變異會造成此病。 | 含實驗來源 | 證據與來源Intellectual developmental disorder, X-linked, syndromic, Lujan-Fryns type MRXSLF A disorder characterized by tall stature with asthenic habitus, macrocephaly, a tall narrow face, maxillary hypoplasia, a high narrow palate with dental crowding, a small or receding chin, long hands with hyperextensible digits, hypernasal speech, hypotonia, mild-to-moderate intellectual disability, behavioral aberrations and dysgenesis of the corpus callosum. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 309520 PMID 17369503 ↗ |
| 疾病關聯 | X-linked Ohdo syndrome 可有智能障礙、餵食問題及特殊面容，亦常見牙齒發育不全與聽力障礙；男性患者可有隱睪與陰囊發育不全。來源指出，影響 MED12 的變異會造成此病。 | 含實驗來源 | 證據與來源Ohdo syndrome, X-linked OHDOX A syndrome characterized by intellectual disability, feeding problems, and distinctive facial appearance with coarse facial features, severe blepharophimosis, ptosis, a bulbous nose, micrognathia and a small mouth. Dental hypoplasia and deafness can be considered as common manifestations of the syndrome. Male patients show cryptorchidism and scrotal hypoplasia. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 300895 PMID 23395478 ↗ |
| 疾病關聯 | Hardikar syndrome 是 X-linked dominant 的多重先天異常症候群，可涉及前腸畸形、腸旋轉不良、肝膽疾病、泌尿生殖異常、顏面裂與色素性視網膜病變；部分患者另有心臟或血管異常。來源指出，影響 MED12 的變異會造成此病，患者神經發育與認知正常。 | 含實驗來源 | 證據與來源Hardikar syndrome HDKR An X-linked dominant, multiple congenital anomaly syndrome characterized by foregut malformations, intestinal malrotation, liver and biliary tract disease, genitourinary abnormalities, facial clefting, and pigmentary retinopathy. Some patients may have congenital cardiac defects or vascular abnormalities, including aortic coarctation and carotid/intracranial aneurysms. Neurodevelopment and cognition is normal. The disease is caused by variants affecting the gene represented in this entry MIM: 301068 PMID 33244166 ↗ |
核酸與蛋白質序列
AGTTTCCGGCAATGGTCGAGAGTTTCTAACGTGCCCCCTT40GTTGTCTCTCGGCCGCCGTCCTCTCAACCACCGCCCCCCT80TTTCGGCTCCCTCTCCCCCTTCCCGTTCCCCCAGTCAGCC120TGGCCCTGCTGGTGCCTCCGGCGCTACGGGCTGGGCAAGA160TGGCGGCCTTCGGGATCTTGAGCTACGAACACCGGCCCCT200GAAGCGGCCGCGGCTGGGGCCTCCCGATGTTTACCCTCAG240GACCCCAAACAGAAGGAGGATGAACTGACGGCCTTGAATG280TAAAACAAGGTTTCAATAACCAGCCTGCTGTCTCTGGGGA320TGAGCATGGCAGTGCCAAGAACGTCAGCTTCAATCCTGCC360AAGATCAGTTCCAACTTCAGCAGCATTATTGCAGAGAAAT400TACGTTGTAATACCCTTCCTGACACTGGTCGCAGGAAGCC440CCAAGTGAACCAGAAGGATAACTTCTGGCTGGTGACTGCA480CGATCCCAGAGTGCCATTAACACTTGGTTCACTGACTTGG520CTGGCACCAAGCCACTCACGCAACTAGCCAAAAAGGTCCC560CATTTTCAGTAAGAAGGAAGAGGTGTTTGGGTACTTAGCC600AAATACACAGTGCCTGTGATGCGGGCTGCCTGGCTCATTA640AGATGACCTGTGCCTACTATGCAGCAATCTCTGAGACCAA680GGTTAAGAAGAGACATGTTGACCCTTTCATGGAATGGACT720CAGATCATCACCAAGTACTTATGGGAGCAGTTACAGAAGA760TGGCTGAATACTACCGGCCAGGGCCTGCAGGAAGTGGGGG800CTGTGGTTCCACGATAGGGCCCTTGCCCCATGATGTAGAG840GTGGCAATCCGGCAGTGGGATTACACCGAGAAGCTGGCCA880TGTTCATGTTTCAGGATGGAATGCTGGACAGACATGAGTT920CCTGACCTGGGTGCTTGAGTGTTTTGAGAAGATCCGCCCT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。