基因總覽
MCRIP2 是人類蛋白質編碼基因，正式名稱為 MAPK regulated corepressor interacting protein 2。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 16p13.3。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000307650 ★ | 641,828–648,474 | 5 |
| ENST00000906955 | 641,820–648,475 | 4 |
| ENST00000914243 | 641,820–648,474 | 5 |
| ENST00000914244 | 641,820–648,475 | 5 |
| ENST00000914245 | 641,820–648,475 | 2 |
| ENST00000914246 | 641,820–648,475 | 3 |
| ENST00001099123 | 641,820–648,475 | 4 |
| ENST00001099128 | 641,820–648,475 | 5 |
| ENST00001119457 | 641,820–648,475 | 5 |
| ENST00001119458 | 641,820–648,474 | 5 |
| ENST00001127966 | 641,820–648,475 | 3 |
| ENST00001140297 | 641,820–648,475 | 5 |
顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>MCRIP2 ENST00000307650 GRCh38 chr16:640828-641928 strand=1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter GAGCTCCCCTGCACACAGCCCCCCTGCACAGACACCCCCAGCACAGAGTCCCCCAGTACAGAGCCCCCAG CGCAGATACCCCCCATAGCACAGAGCCCCCAGAACAGAGACCCACAGCACAGAGTAGCCCCCCAGCACAG GGCCCCCCGGCACAGGGATCCCCAAGCACAGGGACCCCCCCAGCACAGGGATCCCCCCAGCACAGGGCCC CTCAGCACAGGGCCCCCCAGCACAGGGACCCCCCCAGCCCAGGGATCCCCCCAGCACAGGGCCCCCCAGC ACAGGGCCCCCAGCACAGGGATCCCCCCAGCACAGGGCCCGCAGCACAGGGATCCAGCACAGGGACTCCT CCCCAGTACAGGGATCCCCCCAAGCACAGAGACCTCCAGCACAGGGATCCCCCCAGCACAGGGCCCCCCA ATACAGGGATCCCCCCAGCACAGGGATGCCCCCAGCACAGGGCCCGCAGCACAGAGCCCCCCAGCACAGG CACAGGGACCCCCCCCCAGTACAGGGATCCCCCCAGCAGAGAGACCTCCAGCACAGGGATGCCCCCAGCA CAGGGCCCCCCAGCACAGGGATCCCCCCAGCACAGGGATGCCCCCGGCACAGGGCCCGCAGCACAGAGCC CCCCAGCACAGGCACAGGGACCCCCCCACAGTACAGGGATCCCGCCAGCACAGAGACCTCCAGCACAGGG ATGCCCCCAGCACAGGGACCCCCAGCACAGGTTCTCCTCCAGCGCTTGTCAAAGGTGGGCCCTGGGGCTC CGAGGACCCTGCTCGCACATCGCCGCTGACCCCGCAGGGCCCCTGGGTCCTCGCCGCCAGCAGTCTGAGT GCGGTGCCCCGACACTGACATGGCCTCCAGGCAGCAACGGCCTTCCCGGGCAGCAGGGCGCCTCGTCCGC CTTGGCCTCGGGCCTCCGGGGGCTGGGGCGGGGTTGCTGGCGGCTCCGCCCCCGCCTGCCAGTTTCCCAA AGGGCGCAAGCGCCGCCTCCGCCGCGTGTCCGGGGTCAGCCCGAGCCCGTGCGGGCCCTTTAAGGGCCGG GGGCGTGTAGCGGGCCCGCCCCCTCCCCGCGGCGCCCGCAGTCCGTTAAGT
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| FAM195A_1 ↗ | 16:641,833 | 正股 | 641,784–641,843 |
| FAM195A_2 ↗ | 16:641,952 | 正股 | 641,903–641,962 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR16_B5F4 · promoter · 636280–636856 · regulatory
ENSR16_5637W · CTCF_binding_site · 636957–636978 · regulatory
ENSR16_5639G · CTCF_binding_site · 637290–637311 · regulatory
ENSR16_C3P6 · enhancer · 637857–639036 · regulatory
ENSR16_B5FR · enhancer · 641092–641767 · regulatory
ENSR16_732HS · promoter · 641768–641859 · regulatory
ENSR16_5644P · CTCF_binding_site · 642097–642118 · regulatory
ENSR16_C3PP · enhancer · 645176–646225 · regulatory
· motif · 636959–636975 · motif
· motif · 637292–637308 · motif
· motif · 637653–637662 · motif
· motif · 637653–637662 · motif
· motif · 640023–640038 · motif
· motif · 641617–641634 · motif
· motif · 641623–641630 · motif
· motif · 641810–641821 · motif
· motif · 641810–641821 · motif
· motif · 641819–641832 · motif
· motif · 641839–641846 · motif
· motif · 641871–641884 · motif
· motif · 641892–641905 · motif
· motif · 641901–641918 · motif
· motif · 642039–642048 · motif
· motif · 642045–642056 · motif
· motif · 642083–642096 · motif
· motif · 642099–642115 · motif
· motif · 642111–642128 · motif
· motif · 642132–642141 · motif
· motif · 642318–642330 · motif
· motif · 642351–642360 · motif
· motif · 642351–642360 · motif
· motif · 642351–642360 · motif
· motif · 642351–642360 · motif
· motif · 642436–642445 · motif
· motif · 642436–642447 · motif
· motif · 642436–642447 · motif
· motif · 642739–642748 · motif
· motif · 642785–642802 · motif
· motif · 642969–642984 · motif
· motif · 643014–643029 · motif
· motif · 643414–643427 · motif
· motif · 645820–645833 · motif
· motif · 646065–646078 · motif
· motif · 646256–646266 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：160 aa
MAPK regulated corepressor interacting protein 2 為 MCRIP family 成員，蛋白質長度為 160 個胺基酸。其第 1 至 64 位胺基酸區段被註記為無序區域。
蛋白質三維結構
細胞內定位
MCRIP2 被註記位於細胞質、stress granule 與細胞核；來源未提供其定位變化的條件或動態資訊。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
MCRIP2 與 DDX6 及 MCRIP1 有交互作用。現有資料未說明這些關係是否涉及特定複合體，也未提供其作用條件或功能結果。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 2 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 交互作用 | MCRIP2 與 DDX6 有交互作用，也與 MCRIP1 有交互作用；來源未進一步說明交互作用的條件、分子方式或功能結果。 | 含實驗來源 | |
| 細胞定位 | MCRIP2 被註記位於細胞質、stress granule 與細胞核；此定位資料未指出不同位置所對應的條件或變化。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GCCGCGTGTCCGGGGTCAGCCCGAGCCCGTGCGGGCCCTT40TAAGGGCCGGGGGCGTGTAGCGGGCCCGCCCCCTCCCCGC80GGCGCCCGCAGTCCGTTAAGTGCGAGCCCCGGCGCAGGGG120CCGGATCTGGCCGGGGGCCGGCGGCGGTGTGGGAGCGGCG160CGTCATGTACACCATCACCAAGGGGCCCAGCAAGCTGGTC200GCGCAGCGCCGCACAGGTCCCACGCAGCAGCAGGTGGAGG240GCCGGCTCGGCGAGCTCCTGAAATGCCGGCAGCCCGCGCC280GCCGACCTCGCAGCCCCCGCGGGCGCAGCCCTTTGCGCAG320CCGCCGGGACCCTGGCCCCTGTCGAGTCCAGGGCCAAGGC360TTGTGTTCAATCGTGTGAATGGCCGGCGGGCCCCCTCCAC400GTCCCCATCCTTCGAGGGGACCCAGGAGACCTACACAGTG440GCCCACGAGGAGAATGTCCGCTTTGTGTCCGAAGCCTGGC480AGCAGGTGCAACAGCAGCTGGATGGTGGCCCAGCCGGTGA520GGGCGGGCCAAGGCCTGTGCAGTACGTGGAGAGGACCCCC560AATCCCCGGCTGCAGAACTTTGTGCCCATTGACCTAGACG600AGTGGTGGGCGCAGCAGTTCCTGGCGAGAATCACCAGCTG640TTCCTAGTGGCTGCTGGGAGGGGGCGCTGCTACACGGCCG680ACCTGTCGCCAGGAGAGAAGCATGGCGCCCTGCCCACCCA720CTGCGCCTGGCTGGGTGCCGGCCACACCTGAAGTGCCAGC760ATTTGGACTTTTGCACCTTTTTTTCCCTTGGCCCGGCTGT800CCCAACCAAGCTGCCATGGCCAAGGGCCGAACCCGTCTGA840CCTCAGCCCTGCTCACTGTGCCCAGGGACCAGCGACCAGC880CCCTGGGGCTGGCAGGGAGGAGCTCCAGGCTAATAAAGTG920GAGAAACTGTC931cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。