基因總覽
MCOLN2（mucolipin TRP cation channel 2）是蛋白質編碼基因，其產物屬於 transient receptor（TC 1.A.4）家族的 Polycystin subfamily，並歸在 MCOLN2 sub-subfamily。此蛋白質為多次跨膜通道，具有非選擇性陽離子通道性質；來源描述其可通透 Ca(2+) 與 Fe(2+)。它可能參與膜運輸事件的調節，並與細胞內膜系統相關。蛋白質具有多段跨膜螺旋及孔區相關特徵，構成通道的膜內架構；其具體運輸與免疫相關作用仍以來源所述的可能性為限。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC，可能包含歷史名稱；蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000370608 ★ | 84,925,583–84,997,113 | 14 |
| ENST00000945492 | 84,925,583–84,997,115 | 13 |
| ENST00000945493 | 84,925,583–84,997,115 | 14 |
| ENST00000945494 | 84,925,583–84,997,115 | 13 |
| ENST00000945495 | 84,925,583–84,997,115 | 11 |
| ENST00000945496 | 84,925,583–84,997,115 | 14 |
| ENST00000945497 | 84,925,583–84,997,115 | 13 |
| ENST00001145670 | 84,925,583–84,997,115 | 14 |
| ENST00000284027 | 84,926,685–84,997,112 | 14 |
| ENST00001115071 | 84,937,447–84,997,115 | 11 |
| ENST00001115072 | 84,954,731–84,997,115 | 4 |
| ENST00001115073 | 84,971,650–84,997,115 | 2 |
顯示 12/13 個蛋白質編碼轉錄本；canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製；核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置，細小區間加粗以利辨識；實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
MCOLN2 被描述為非選擇性陽離子通道，具有向內整流活性，並可通透 Ca(2+)。資料亦指出其可通透 Fe(2+)，但此項描述屬於相似性推定。這些通道性質與其可能參與膜運輸事件調節的角色相連；目前來源並未將所有相關運輸事件描述為已確立的直接因果機制。
在膜運輸方面，MCOLN2 可能活化 ARF6，並參與 GPI 錨定貨物蛋白經 ARF6 調控的回收途徑運送至細胞表面。此敘述使用「可能」，因此應視為候選功能，而非確定的普遍作用。來源也提出，MCOLN2 可能與 MCOLN1 形成異源組合；此組合可能具有組織特異性，並可能使其參與多種依賴溶體的細胞事件。
免疫相關功能同樣帶有推測性。在適應性免疫中，TRPML2 與 TRPML1 可能在 B 細胞特化溶體的功能上具有冗餘作用；在先天免疫反應中，MCOLN2 可能參與趨化因子分泌及巨噬細胞遷移的調節。這些敘述指出其可能連結離子通道活動、膜交通與免疫細胞相關過程，但來源未提供足以將各項作用概括為確定機制的證據。
Promoter 與基因調控
>MCOLN2 ENST00000370608 GRCh38 chr1:84997013-84998113 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS：-1000 到 +100 bp；1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列；TSS = 0，兩端包含，未驗證為 promoter AGTTTAATGTGAAGTCCTCAAGGGAAAGGACCATGTCTTTGTCATCCCAGAGACCACAGTACCCAACGGT CGGCTTGGCTCTCAGTGAGTGTTTCCCTAAGCATCAAAACAGGAATGACCAAAGCAACGGACAAATTAAT GCATGTGGAAACAAGAAATGAATGCATGAGAGAGTGAAGAAAAGAAGGGGCCAGGCGCAGCGGCTTACAC CTGTAATCCTAGCACTTTGGGAGGCGGAGGCAGGAGAATCGCTTGGGTCCAGGAGTTCAAGACTGCAGTC AGCAGTGATCGCAGGTCAGGCGACAGAGTGAGACCCGGTCTCACCACCACCCCCCCGAAAAAGGCAGGAA CCCCAGAGGGCCGGGAGTGCCAGGTGCGGCCGCCCGGGAGCGGTGTGGAGGGTGCGTGGGCCACTTTGCC GCAGGGCCCACCGCCCGGGTCCCTCTGTAAGGCGCTTCTCCGGCAGACACCCCGAGCCAAAGCGGGCCGT ACCGCAGCGTTGGGCACTTGGGTGGAGAGTGCAAGGGCGGCGGGCCTGCGCCCAGACAGGTGTAGCCGTC CCACGCTAGGTGTCCTCCTGCCGCTCCCTGGCCGCGCCATGCCTCGAGGCATGGAGGTGCTGGACCTGCC GGTGTGCAACCGCGCCTCGGGCCTGTCCTGGGGGCCGCACCACAGGTCAGTGCCCCACGGCGCCCTTGGC GTGCCCCACGCCTCCCTGGGGGCCCCACCGCCGCCCCCTTTTGGGACTGCTTACTTCCTCGGCTCTTCTC GCGCGCGCCTCGGTTCCATCCCCTACGGCCCCCACCCCGCCTCCGCGTCGCCGACCCCCTTCTCCGGGAG CGCGGGGAGGCTGGTCCGCTGAAGCGTGGAATAAGTCCCCTAGGACCCCAACTGGGGAAGCTCCGGTCCC CGGTAGGAGGCGGCGGGGCGGGGCGGGGCGGGGCAGCCCCTTGGGGGCGGGGCGGGAGCGCCTGGCCACG CGCCGCATCCTGCAGGGTGCACACAGAGCCGCCTTTCAGCCGCCCGAGAACTGCCCGCCGCACTCCACGA CTGCGGCGCCTGCTCTCGGGCCGGGGTCTGCGCGCACCACGCGGCCGGCAG
EPDnew 實驗支持 promoter／TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS（1-based） | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MCOLN2_1 ↗ | 1:84,997,109 | 負股 | 84,997,099–84,997,158 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38，GRCh38/hg38，透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE／RAMPAGE 等實驗資料支持；任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能，不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控／motif 註解
ENSR1_CBFPG · enhancer · 84995416–84997101 · regulatory
ENSR1_84HGR6 · promoter · 84997102–84997231 · regulatory
ENSR1_5PZR9J · CTCF_binding_site · 84997188–84997209 · regulatory
ENSR1_CBFPK · enhancer · 84997232–84998754 · regulatory
ENSR1_5PZRBD · CTCF_binding_site · 84997366–84997387 · regulatory
ENSR1_84HGS9 · promoter · 84998937–84999157 · regulatory
ENSR1_84HGSD · enhancer · 84999158–84999343 · regulatory
· motif · 84993803–84993814 · motif
· motif · 84995705–84995719 · motif
· motif · 84996143–84996165 · motif
· motif · 84996143–84996165 · motif
· motif · 84996691–84996704 · motif
· motif · 84997156–84997169 · motif
· motif · 84997156–84997169 · motif
· motif · 84997190–84997206 · motif
· motif · 84997227–84997240 · motif
· motif · 84997227–84997240 · motif
· motif · 84997243–84997259 · motif
· motif · 84997295–84997308 · motif
· motif · 84997368–84997384 · motif
· motif · 84997390–84997403 · motif
· motif · 84997390–84997403 · motif
· motif · 84997493–84997502 · motif
· motif · 84997560–84997569 · motif
· motif · 84997681–84997698 · motif
· motif · 84997736–84997745 · motif
· motif · 84998046–84998063 · motif
· motif · 84998087–84998100 · motif
· motif · 84998087–84998100 · motif
· motif · 85001929–85001942 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度：566 aa
MCOLN2 蛋白質長 566 個胺基酸，屬於 transient receptor 家族的 Polycystin subfamily。序列註解包含多段跨膜螺旋；第 107–123 位為細胞外／腔面孔環，第 461–464 位標註為選擇性濾器。這些結構註解的證據來自相似性資料。
蛋白質三維結構
細胞內定位
MCOLN2 被記錄於細胞膜、晚期胞內體、溶體及回收胞內體膜。 活化的巨噬細胞與小膠質細胞中，該蛋白質定位於回收胞內體；來源未說明此定位變化的其他條件或異構型差異。
深綠色圓點：來源記載的蛋白質定位；數量不表示含量。
動物細胞結構示意；器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化；點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度，圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
MCOLN2 可形成同寡聚複合體，依相似性推定可能為四聚體。它也能與 MCOLN1 形成異寡聚組合；這類組合的通道性質不同於各自的同寡聚體，且可能具有組織特異性。此外，資料記載 MCOLN2 與 TMEM176A 互作，但未進一步說明該互作是否構成複合體或其功能後果。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列，以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄，方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣；一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 5 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | MCOLN2 是非選擇性陽離子通道，具有向內整流活性並可通透 Ca(2+)；另依相似性資料也可通透 Fe(2+)。它可能調節膜運輸，可能活化 ARF6 以協助 GPI 錨定貨物蛋白循回收途徑到達細胞表面；在免疫中也可能參與 B 細胞特化溶體功能、趨化因子分泌及巨噬細胞遷移，部分作用仍屬推測。 | 含實驗來源 | 證據與來源Nonselective cation channel probably playing a role in the regulation of membrane trafficking events. Acts as a Ca(2+)-permeable cation channel with inwardly rectifying activity. May activate ARF6 and be involved in the trafficking of GPI-anchored cargo proteins to the cell surface via the ARF6-regulated recycling pathway. May play a role in immune processes. In adaptive immunity, TRPML2 and TRPML1 may play redundant roles in the function of the specialized lysosomes of B cells (By similarity). In the innate immune response, may play a role in the regulation of chemokine secretion and macrophage migration (By similarity). Through a possible and probably tissue-specific heteromerization with MCOLN1 may be at least in part involved in many lysosome-dependent cellular events. Also functions as a Fe(2+) permeable channel (By similarity) PMID 17662026 ↗ · PMID 19885840 ↗ · PMID 19940139 ↗ |
| 分子活性 | Ca(2+)(in) = Ca(2+)(out) | 含實驗來源 | |
| 分子活性 | Fe(2+)(in) = Fe(2+)(out) | 推論支持 | |
| 交互作用 | MCOLN2 可形成同寡聚複合體，依相似性推定可能為四聚體；也可與 MCOLN1 形成異寡聚組合，其通道性質不同於各自的同寡聚體，且可能具有組織特異性。資料另記載 MCOLN2 與 TMEM176A 互作，未提供此互作的功能說明。 | 含實驗來源 | 證據與來源Forms homooligomeric complexes; probably tetrameric (By similarity). Can heterooligomerize with MCOLN1; heteromeric assemblies have different channel properties as compared to the respective homooligomers and may be tissue-specific. Interacts with TMEM176A PMID 19885840 ↗ · PMID 25130899 ↗ |
| 細胞定位 | MCOLN2 定位於細胞膜、晚期胞內體膜、溶體膜及回收胞內體膜；在活化的巨噬細胞與小膠質細胞中，則記錄到其位於回收胞內體。資料未提供其他定位變化條件或異構型差異。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cell membrane / Multi-pass membrane protein; Late endosome membrane / Multi-pass membrane protein; Lysosome membrane / Multi-pass membrane protein; Recycling endosome membrane / Multi-pass membrane protein; Localizes to recycling endosomes in activated macrophages and microglia PMID 17662026 ↗ |
核酸與蛋白質序列
ACACAGAGCCGCCTTTCAGCCGCCCGAGAACTGCCCGCCG40CACTCCACGACTGCGGCGCCTGCTCTCGGGCCGGGGTCTG80CGCGCACCACGCGGCCGGCAGAAAGGGTAAGAGAAGGGAA120CCCCGCTTTGCAGGGCTCCAACTTCGGCGGACGCGTTACG160GCGAGGGCGAAATGAGTCGGCCGTGAACGGTGTTTCCTGT200TCCGAATCCCGAGAGCCCTGGAAAGTTTTGAAGGAGGAGG240CATGGCCCGGCAGCCTTATCGTTTTCCCCAGGCAAGGATT280CCGGAGAGAGGATCAGGTGTTTTCAGGTTAACCGTCAGAA320ATGCAATGGCACATCGTGATTCTGAGATGAAAGAAGAATG360TCTAAGGGAAGACCTGAAGTTTTACTTCATGAGCCCTTGT400GAAAAATACCGAGCCAGACGCCAGATTCCGTGGAAACTGG440GTTTGCAGATTTTGAAGATAGTCATGGTCACCACACAGCT480TGTTCGTTTTGGTTTAAGTAACCAGCTGGTGGTTGCTTTC520AAAGAAGATAACACTGTTGCTTTTAAGCACTTGTTTTTGA560AAGGATATTCTGGTACAGATGAAGATGACTACAGCTGCAG600TGTATATACTCAAGAGGATGCCTATGAGAGCATCTTTTTT640GCTATTAATCAGTATCATCAGCTAAAGGACATTACCCTGG680GGACCCTTGGTTATGGAGAAAATGAAGACAATAGAATTGG720CTTAAAAGTCTGTAAGCAGCATTACAAGAAAGGGACCATG760TTTCCTTCTAATGAGACACTGAATATTGACAACGACGTTG800AGCTCGATTGTGTTCAATTAGACCTTCAGGACCTCTCCAA840GAAGCCTCCGGACTGGAAGAACTCATCATTCTTCAGACTG880GAATTTTATCGGCTCTTACAGGTTGAAATCTCCTTTCATC920TTAAAGGCATTGACCTACAGACAATTCATTCCCGTGAGTT960cDNA 使用 DNA 字母 T；mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區，未另外加入 poly(A) 尾；非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽，可複製或下載完整轉錄本與蛋白質；基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。