基因總覽
MAS1L 是人類蛋白質編碼基因,正式名稱為 MAS1 proto-oncogene like, G protein-coupled receptor。登錄類型為 gene with protein product。此基因座位於 6p22.1。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000377127 ★ | 29,486,697–29,487,956 | 1 |
顯示 1/1 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
Promoter 與基因調控
>MAS1L ENST00000377127 GRCh38 chr6:29487856-29488956 strand=-1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter GCATTAAAATACTATTCTCTATATTAATATTTATATTAATATTCTTAGGCCTCTTTTGTATTTGTTGCAC CCTAAGTCTGTTCATTTCCTTCTCCTCAGCTGACATTTGGAGCATAGCAGTCGATGATGCCCACACAGAC ACTGCCTGAGACTCACGCCCCTGGAGAAACGCAGATTTCCTTATTTTCCAGGTCAAGTCCTGCCAGCCAT AGAAAGGACTTCTTTGGTGCCAACTGCTGTGAAATGCCTGCCTTGGAAATCTCAGTGCTCCCTTGTACCT GTCTGAGCCCAGGGAAATGCCATACTGTGGCACTGCTGCATCCTGTATGGCTACCCAAGGATGCCCAGGA CTGGGTTTGAAAGAGATGAGACATGGCCAGGTGCCGTGGCTCACGCTTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGG TCAAGGCAGGTGGATCACAAGGTCAGGAGTTTGAGACCAGCCTGGCCAATATGGTGAAACCCCATCTCTA CTAAAAATACAAAAAAATTAGCCGGGCATGGTGGTGGGTGCCTGTAGTTCCAGCTAGTCAGGAGGCCGAG GCAGGAGAATCGCTTGAACCTGGAAGGTGGAGGTTCCAGTGAGCTGAGATCGCGCCACTGCACTCCAGCC TGGGTGACAGAGTGAGACTCCAACTCAAAAAAAAAAAAAAAAAAGAGATGAGACACTAGTGTCTCATGAG TAGAACCTGGACCAGACACAAATCTCCATTCCCAATGTTTAGTGCCTCATTAGTGCCCAACAACAAGATA TTGGGTCTATGTGGGTAGGCCTGGGGCATCCTGTACAACAGGAGATGTGTTAGGGGAGGGAGAACAGATC ACAAATTCATGGAGAGCTATTTGCAGAGCAGATACTCCCATCCACTCTGATATGTAGTTAATGTTCAGCT GTTCCTAAAAAGCACACCCAACAATGGGTGTTCTATTCCAGCCTAGGAAAATGTAGAGGCAAGGGGTCTG AGGCCAGAGGACACCACTAGATGGACCACTGCTCCTGACTGTGATGTTGTGGCCCACTCAGGTCCCAGCA CCCCATGGTCTGGGGGAAAATTTGCTGGTTCAGCCAGAGGGCTGGATGGAC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 0 筆
封存資料的查詢區間內未找到名稱與股向相符的紀錄;不代表此基因沒有 promoter。
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
· motif · 29483980–29483993 · motif
· motif · 29483980–29483995 · motif
· motif · 29489340–29489355 · motif
· motif · 29489340–29489355 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:378 aa
MAS1L 蛋白長 378 個胺基酸,屬於 G protein-coupled receptor 1 family 的 Mas subfamily。其結構包含七段跨膜螺旋,並有分布於細胞外與細胞質側的區域;C 端細胞質區的 344–378 位胺基酸被註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
MAS1L 位於細胞膜,屬於多次跨膜蛋白。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 1 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 細胞定位 | MAS1L 被註記為位於細胞膜的多次跨膜蛋白。 | 資料庫紀錄 |
核酸與蛋白質序列
ATGGACCACTGCTCCTGACTGTGATGTTGTGGCCCACTCA40GGTCCCAGCACCCCATGGTCTGGGGGAAAATTTGCTGGTT80CAGCCAGAGGGCTGGATGGACAGTGTTTGCTGAGTCACAG120ATATCTCTCTCATGTAGCCTTTGTCTCCACAGTGGTGACC160AGGAGGCACAGAACCCAAACCTGGTATCTCAGCTCTGTGG200CGTCTTTCTTCAAAATGAGACGAATGAAACCATACATATG240CAGATGAGCATGGCAGTGGGACAGCAGGCCCTGCCCTTGA280ATATCATTGCCCCCAAGGCTGTGCTGGTCTCCCTCTGTGG320GGTCTTATTGAATGGCACTGTCTTCTGGCTGCTTTGCTGT360GGGGCCACGAATCCCTACATGGTATACATCCTCCACCTGG400TCGCTGCTGACGTGATCTATCTTTGCTGCTCGGCAGTGGG440GTTCTTACAGGTGACTCTGCTAACTTATCATGGAGTCGTG480TTTTTTATCCCTGATTTCCTGGCCATATTGTCTCCCTTCT520CCTTTGAGGTGTGTCTCTGTCTCCTGGTGGCCATCAGCAC560AGAGCGGTGTGTGTGTGTCCTCTTCCCCATCTGGTACAGA600TGCCACCGCCCAAAATACACATCTAATGTTGTCTGCACCC640TCATCTGGGGCCTGCCTTTTTGCATCAACATAGTAAAATC680ACTTTTCCTAACTTACTGGAAACATGTAAAGGCATGTGTC720ATATTTCTAAAGCTTTCTGGGCTCTTCCATGCTATCCTTT760CACTTGTGATGTGTGTGTCGAGTCTGACTCTACTCATTAG800ATTCCTGTGCTGCTCCCAGCAGCAAAAGGCCACCAGGGTC840TATGCGGTGGTGCAGATCTCGGCCCCCATGTTCCTACTCT880GGGCCCTACCCCTGAGCGTGGCACCCCTCATAACAGATTT920CAAAATGTTTGTCACCACCTCCTATTTAATTTCCTTGTTC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。