基因總覽
MAML1 的正式名稱為 mastermind like transcriptional coactivator 1,屬於蛋白質編碼基因,其產物是轉錄共活化因子。現有資料指出,它與 NOTCH 蛋白相關的轉錄調控有關;具體的分子作用方式與生物學過程見功能說明。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000292599 ★ | 179,732,822–179,777,283 | 5 |
| ENST00000933871 | 179,732,672–179,777,280 | 5 |
| ENST00001112293 | 179,732,672–179,771,565 | 4 |
| ENST00001112294 | 179,732,672–179,767,556 | 2 |
| ENST00001122891 | 179,732,672–179,777,283 | 5 |
| ENST00001122892 | 179,732,672–179,777,283 | 5 |
| ENST00001122893 | 179,732,672–179,735,215 | 2 |
| ENST00001132783 | 179,732,672–179,777,283 | 5 |
顯示 8/8 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
MAML1 是 NOTCH 蛋白的轉錄共活化因子,能增強 NOTCH 誘導的 HES1 轉錄,參與調節 NOTCH 相關的基因表現。此作用與其促進轉錄活化的角色相符,但現有資料未進一步說明其對其他基因的影響範圍。
在細胞核中,MAML1 可透過與 CDK8 互作,增強 NOTCH 胞內結構域的磷酸化及蛋白水解周轉。這項作用涉及 NOTCH 胞內結構域的修飾與後續降解;來源未提供其發生條件或對整體轉錄反應的定量影響。
MAML1 也會結合 CREBBP/CBP,促進 NOTCH 增強子處的核小體乙醯化,並活化轉錄。此外,MAML1 會誘導 CREBBP 磷酸化,並使其定位於細胞核內的聚集點。這些作用將轉錄共活化與染色質修飾連結,但資料未詳述兩者之間的先後關係。
在造血發育方面,MAML1 透過調節 NOTCH 介導的淋巴細胞命運決策而發揮作用。這指出其轉錄調控功能與淋巴細胞發育相關;現有資料未指定涉及的細胞類型或發育階段。
Promoter 與基因調控
>MAML1 ENST00000292599 GRCh38 chr5:179731822-179732922 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TTTGCCTATTAGTTTTAATAATGGGGCATAATTTGTCTTGGTTTGGTTTTGTTGAGTAACTCAGTTTTAC CTAAAGGACTGTTTTTGGTCCGGCGCGGCGGCTCACGCCTGTAATCGCGGTACTTTGGCAGGCCGAGGTG GGCGGATCACCTGAGGTCAGGAGTGGGAGACCAGCCTGACCGACATGGAGACACCCCGTCTCTACTAAAA ATACAAAATTAGCCGCGCGTGGTGGCGCATGCCTGTAATCCCAGCTACTGGAGAGGCTGAGGCAGGAGAA TCGCTTGAGCCTGGAAGGCGGTGGTTGTGGTGAAACGTCGTCCTTTGCATTTCCAGTTCCCTCTAATGGA GCTGCACTCTTGCATGCTTTTGCTCACATCTTCTGGACTTTTTTTTTAAGTAGTGAGTAATACTGCACTT TTGAAACTTGCTCGGGCTTTTACAAATAGGTGGAAACTACCAGTGATTCGGAATGTTGCAAGAGGAAACT ACCAGCTCACTAGACGATTCTGACCAATTATGGGGCTGGATACAAGGAATAAGGTCAAAGTAAAACGGCT GACATTAAAATAGCGTGGCTACTTAGAGTTTATCAAAGTCGAAATTTAAAAAATAATTTAAAAAAAAGGT CTCTGTACTGCCAGGCGGGCGACAGGGACTGGCCAGCTGCGCCGCACTCGCCTGCCAGATTCCCCTTTTC TCGGGGTAGCCGGAAGGGCCTGCCTTCAGCGGGTGCTGTGCAGGAAACCAATAGCCGCCTCTTGGACGGG CTCCTGTCAGTCACGCTTAGCTCCGCCCCCAGGATTAAGGCCCGCCCAGGGGCTTCCCTCCGCCCTTCGC TTGAGAATTCCTTTTAAATACCGCTCTGGCGCCCGAGCGCGCCTCTTGCGTGCTCGTCCCCACGCCCTCG GGCGGCCGGTTCTTCCTTCTCTGATTGGCCAGGGCCCCTGCTCATCAGTCGTGATGCACAAGGTCTCTTA CCGAGGCCCCGCCTTCTTCCGAGAGGCCCGAAAACAATTTTAAGATGGCGGCCGCGGCGGTAGCGCGGAA AACAATGGGGCCGGGGCGGTGGGGAGAGGCCGAGGCTTGAGGTAGGCAGCA
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MAML1_1 ↗ | 5:179,732,831 | 正股 | 179,732,782–179,732,841 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR5_53K9F9C · CTCF_binding_site · 179732154–179732175 · regulatory
ENSR5_94MC5X · promoter · 179732332–179732832 · regulatory
ENSR5_53K9FCZ · CTCF_binding_site · 179732720–179732741 · regulatory
· motif · 179732117–179732134 · motif
· motif · 179732156–179732172 · motif
· motif · 179732362–179732377 · motif
· motif · 179732528–179732539 · motif
· motif · 179732528–179732539 · motif
· motif · 179732530–179732539 · motif
· motif · 179732611–179732621 · motif
· motif · 179732720–179732730 · motif
· motif · 179732722–179732738 · motif
· motif · 179732807–179732817 · motif
· motif · 179732844–179732854 · motif
· motif · 179733122–179733131 · motif
· motif · 179733132–179733142 · motif
· motif · 179733215–179733224 · motif
· motif · 179735033–179735044 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:1016 aa
MAML1 長 1,016 個胺基酸,屬於 mastermind family。其第 1 至 123 位胺基酸區域是與 NOTCH 蛋白互作所必需的。資料另將第 65–184、263–487、561–617、658–681 及 796–953 位胺基酸區段註記為無序區。
蛋白質三維結構
細胞內定位
MAML1 位於細胞核,並可呈點狀分布;資料亦將其記錄於細胞核斑點。 來源未提供定位隨條件改變或不同異構型之間存在差異的資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 1 個夥伴
- NOTCH1P46531 · UniProt INTERACTION · 15 experiments
MAML1 的 N 端與 NOTCH1、NOTCH2、NOTCH3、NOTCH4 互作;資料指出相應的 NOTCH 互作區域為 ankyrin repeat region。MAML1 也以 N 端與 p53 的 DNA-binding region 互作。它與 Notch 蛋白及 RBPSUH/RBP-J kappa/CBF1 形成 DNA 結合複合體,並結合 CREBBP/CBP 與 CDK8。此外,MAML1 依賴性地與 PRAG1、NOTCH1 形成複合體;此項關係標註為 By similarity。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | MAML1 是 NOTCH 蛋白的轉錄共活化因子,可增強 NOTCH 誘導的 HES1 轉錄。它透過與 CDK8 互作,促進細胞核內 NOTCH 胞內結構域的磷酸化與蛋白水解周轉;並結合 CREBBP/CBP,促進 NOTCH 增強子處的核小體乙醯化及轉錄活化。MAML1 也誘導 CREBBP 磷酸化並定位至細胞核聚集點,參與調節 NOTCH 介導的淋巴細胞命運決策及造血發育。 | 含實驗來源 | 證據與來源Acts as a transcriptional coactivator for NOTCH proteins. Has been shown to amplify NOTCH-induced transcription of HES1. Enhances phosphorylation and proteolytic turnover of the NOTCH intracellular domain in the nucleus through interaction with CDK8. Binds to CREBBP/CBP which promotes nucleosome acetylation at NOTCH enhancers and activates transcription. Induces phosphorylation and localization of CREBBP to nuclear foci. Plays a role in hematopoietic development by regulating NOTCH-mediated lymphoid cell fate decisions PMID 11101851 ↗ · PMID 11390662 ↗ · PMID 12050117 ↗ · PMID 15546612 ↗ · PMID 17317671 ↗ |
| 交互作用 | MAML1 以 N 端與 NOTCH1、NOTCH2、NOTCH3、NOTCH4 及 p53 互作;相應區域分別為 NOTCH 的 ankyrin repeat region 與 p53 的 DNA-binding region。它與 Notch 蛋白及 RBPSUH/RBP-J kappa/CBF1 形成 DNA 結合複合體,也結合 CREBBP/CBP、CDK8。另有資料指出,MAML1 依賴性地與 PRAG1、NOTCH1 形成複合體,該關係為相似性推定。 | 含實驗來源 | 證據與來源Interacts (via N-terminus) with NOTCH1, NOTCH2, NOTCH3 and NOTCH4 (via ankyrin repeat region). Interacts (via N-terminus) with p53 (via DNA-binding region). Forms a DNA-binding complex with Notch proteins and RBPSUH/RBP-J kappa/CBF1. Also binds CREBBP/CBP and CDK8. Forms a complex with PRAG1, NOTCH1 and MAML1, in a MAML1-dependent manner (By similarity) PMID 11101851 ↗ · PMID 11390662 ↗ · PMID 12050117 ↗ · PMID 15546612 ↗ · PMID 16530044 ↗ · PMID 17317671 ↗ |
| 細胞定位 | MAML1 定位於細胞核,並呈現點狀分布;資料亦將其定位記錄為細胞核斑點。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
GAGAGGCCCGAAAACAATTTTAAGATGGCGGCCGCGGCGG40TAGCGCGGAAAACAATGGGGCCGGGGCGGTGGGGAGAGGC80CGAGGCTTGAGGTAGGCAGCAAGCGCCGGCTGGGGGTCGG120GCCGAGCGGGGCAGGAGGAAAACCCGCCGCCGCGCGCGAG160CCCGCTCCGCTGCCCTCGGGGGCATGGCGCGGCCGTGAGG200CGGAGAGGGGTAGCCGCGGGGAGCGAAGCCCGCAGTGCCA240GCCGGCCCCGAGAGGCCCGGCCCCGGGCCCGGCCCGTGCA280GCCCGCGGCCCATGGTGCTGCCCACCTGCCCCATGGCGGA320GTTCGCGCTGCCGCGGCACAGCGCGGTCATGGAGCGCCTT360CGCCGGCGCATCGAGCTGTGCCGGCGCCACCACAGCACCT400GCGAGGCCCGCTACGAGGCCGTGTCGCCCGAGCGCCTGGA440GCTGGAGCGCCAACACACCTTCGCCCTGCACCAGCGCTGC480ATCCAGGCCAAGGCCAAGCGCGCCGGGAAGCACAGGCAGC520CGCCCGCCGCCACGGCCCCGGCGCCCGCCGCCCCGGCCCC560GCGCCTGGACGCCGCTGACGGCCCCGAGCACGGCCGCCCG600GCCACGCATCTTCATGATACAGTTAAGAGGAATCTTGACA640GCGCCACTTCCCCTCAGAATGGCGATCAACAGAATGGCTA680CGGGGACCTCTTTCCTGGGCATAAGAAGACTCGCCGGGAG720GCCCCTCTGGGAGTTGCCATCTCTTCCAATGGACTGCCTC760CAGCCTCCCCCCTCGGTCAGTCTGACAAGCCTTCTGGAGC800CGACGCCCTGCAGTCCAGTGGGAAGCACTCTCTGGGGCTA840GACTCTCTCAACAAAAAGCGTCTGGCTGACTCCAGCCTTC880ACTTGAATGGAGGCAGTAACCCCAGTGAGTCATTTCCTCT920GAGCCTGAATAAAGAACTGAAGCAGGAGCCTGTCGAAGAC960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。