基因總覽
MAEA(macrophage erythroblast attacher, E3 ubiquitin ligase)是人類的蛋白質編碼基因,產物為 E3 ubiquitin-protein transferase MAEA。此蛋白質具有 LisH、CTLH 與 RING-Gid-type 鋅指結構域,並包含與細胞間接觸相關的區域。它是 CTLH E3 ubiquitin-protein ligase complex 的核心成員,也與紅系細胞及巨噬細胞的生物學過程相關。MAEA 的名稱反映其與巨噬細胞及紅系細胞接觸的關聯;其複合體角色與細胞接觸相關功能,構成此蛋白質的主要特徵。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000303400 ★ | 1,289,891–1,340,137 | 9 |
| ENST00000505177 | 1,289,854–1,340,148 | 10 |
| ENST00000264750 | 1,289,854–1,340,148 | 8 |
| ENST00000514708 | 1,289,854–1,340,148 | 7 |
| ENST00000868651 | 1,289,854–1,340,148 | 9 |
| ENST00000868652 | 1,289,854–1,340,148 | 10 |
| ENST00000868653 | 1,289,854–1,340,148 | 7 |
| ENST00000868654 | 1,289,854–1,340,148 | 9 |
| ENST00000868655 | 1,289,854–1,340,148 | 9 |
| ENST00000868656 | 1,289,854–1,340,148 | 9 |
| ENST00000926209 | 1,289,854–1,340,148 | 7 |
| ENST00000926210 | 1,289,854–1,340,148 | 9 |
顯示 12/28 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
MAEA 是 CTLH E3 ubiquitin-protein ligase complex 的核心組成部分,參與將泛素接到受體蛋白質上。此複合體可選擇性地從 UBE2H 接受泛素,並促進轉錄因子 HBP1 的泛素化及後續蛋白酶體降解。MAEA 與 RMND5A 均為該複合體催化活性所必需,MAEA 也與正常細胞增殖有關。相較之下,該複合體並非降解糖質新生相關酵素(例如 FBP1)所必需,顯示來源所述的作用具有底物選擇性。
在紅系細胞成熟過程中,MAEA 參與紅芽球去核;相關資料亦指出它與成熟巨噬細胞的發育有關。MAEA 介導紅系細胞與成熟巨噬細胞附著,這種細胞接觸可抑制紅系細胞凋亡。它也參與紅系島形成;紅系島是終末造血的功能單位。這些作用將 MAEA 與紅系細胞成熟及其周遭巨噬細胞的關係連結起來。
MAEA 可與 F-actin 結合,並參與調節紅芽球及巨噬細胞中的 actin 分布。另有資料提出,MAEA 可能對核架構及細胞分裂事件有所貢獻;此項描述屬於推論,不能視為已確立的功能。上述不同作用涵蓋泛素化、細胞接觸與細胞骨架相關過程,但來源未指出它們之間存在直接因果關係。
Promoter 與基因調控
>MAEA ENST00000303400 GRCh38 chr4:1288891-1289991 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter TGTCTAAAAGACTGGAGTCTGCAGCCACACACTTGAGGAATAACACTTTCCTTAGTCCCAACTCCTGTTT AAGTAAGACAGAGAAAGATTCCACAGTGCGGGTCGGATGTCTTGCGGCTGTAACATGTAGCAGCCTCCAA GCGGAGGTTCTCCCTTCATCGCTGTGTCACCTTAGATGTTTTTCCTTTGTTTAAACACCAAATATTTTAA AAGTTGTTTAGAAATGTGTTATGTGAAACACAAGGTGGTTTAATTGGGACGTCATTTCCTAATTAATAAA ATCTAATTTCAGTTTTATTTTGGAAAGGAGGGAGACGGGTGGTGTTTGAAAGGCTGAGAATGTGAAGTGG CTGAAATGAAGGCAGCGCACGACCTGGATGCCAGCGCTGCCCGCCCTGCAAGGAGAGGGCGGAGAGGCCA CACGCTTCTCATGCTTCGGGAGTTTCTGTCCATAAATCAGTTTTAGGTACTGGGCCTTTCCTCTTCCGTT GGGAAGTCGGAGGTTCCACATCAGGATTCCAGCAGCTGTAAATCGGTCAAAATAAGGCCAAAGAAAAATA GCTGGCTACAGGCGCATGCGGCCAGGCGTTTTGTTGGCGTTGCCCTTGGTACCGCAGGCACGAGGGACCC ACAGGGGACCACCCCGCGGGAGCCCCAAGTAACTGGACGGACGCCAAGTCCCCCAGCCCGCTCGGCCCCA GCTCCACCCGCCCGGGCCGCAGCCCGCACCCCATCGGCCCGCCCCGGGCCAGGAGCATCCCCAGCTCCGG CGTCTGCGGCCTGAACCCGGTAGCGAATTCAAGGTGGAAACCGCCAGCCGGGGCTATCGTTGATTGGCTG AACGAGAGGAAACCCGGCAGTGATTGGTTCGCGCCTTCTTCCGCCTCCGGCCGACTGGGCGGATACGATT GGTGCAGGGGCATCGGCCCGCCCCCATCCTGCTCCGGCCGGCGCGTGGCGTCATTTCCCGGCGTGCAGCG CGCTCGCGCGTCCCCCGCCCGCTAATGTTTTGGCCGCTTCAAGATGGCGGTGCAGGAGTCGGCGGCTCAG TTGTCCATGACCCTGAAGGTCCAGGAGTACCCGACCCTCAAGGTGGGCGCC
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 1 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| MAEA_1 ↗ | 4:1,289,894 | 正股 | 1,289,845–1,289,904 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
查看已取得的調控/motif 註解
ENSR4_5B6G7 · CTCF_binding_site · 1285669–1285690 · regulatory
ENSR4_5B6GJ · CTCF_binding_site · 1285736–1285757 · regulatory
ENSR4_9HR7 · enhancer · 1286212–1286488 · regulatory
ENSR4_5B6KB · CTCF_binding_site · 1286337–1286358 · regulatory
ENSR4_B8WJ · enhancer · 1288955–1289654 · regulatory
ENSR4_5B73X · CTCF_binding_site · 1289285–1289306 · regulatory
ENSR4_832MD · promoter · 1289655–1289905 · regulatory
ENSR4_5B766 · CTCF_binding_site · 1289758–1289779 · regulatory
ENSR4_C5GC · enhancer · 1289906–1291121 · regulatory
ENSR4_5B77G · CTCF_binding_site · 1290040–1290061 · regulatory
ENSR4_9HTG · enhancer · 1294014–1294283 · regulatory
· motif · 1285671–1285687 · motif
· motif · 1285738–1285754 · motif
· motif · 1286339–1286355 · motif
· motif · 1289115–1289130 · motif
· motif · 1289287–1289303 · motif
· motif · 1289461–1289472 · motif
· motif · 1289461–1289472 · motif
· motif · 1289509–1289525 · motif
· motif · 1289509–1289525 · motif
· motif · 1289531–1289548 · motif
· motif · 1289595–1289612 · motif
· motif · 1289604–1289619 · motif
· motif · 1289655–1289672 · motif
· motif · 1289657–1289672 · motif
· motif · 1289698–1289706 · motif
· motif · 1289698–1289713 · motif
· motif · 1289741–1289752 · motif
· motif · 1289760–1289776 · motif
· motif · 1289766–1289777 · motif
· motif · 1289815–1289825 · motif
· motif · 1289869–1289880 · motif
· motif · 1289869–1289880 · motif
· motif · 1289882–1289892 · motif
· motif · 1289912–1289922 · motif
· motif · 1290042–1290058 · motif
· motif · 1290511–1290523 · motif
· motif · 1290785–1290798 · motif
· motif · 1290890–1290902 · motif
· motif · 1293672–1293687 · motif
· motif · 1293707–1293720 · motif
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:396 aa
MAEA 蛋白質長 396 個胺基酸,包含 LisH 結構域(第 121–153 位)、CTLH 結構域(第 159–216 位)及 RING-Gid-type 鋅指(第 314–381 位)。第 1–124 位區域被註記為位於細胞外且參與細胞間接觸。
蛋白質三維結構
細胞內定位
MAEA 在巨噬細胞中的分布會隨成熟狀態改變:未成熟巨噬細胞中以核內為主,成熟巨噬細胞中則主要見於細胞表面;它也與巨噬細胞中的 F-actin 共定位。 細胞分裂期間,MAEA 會出現在不同結構位置,包括前期的凝縮染色質、分裂中期的紡錘體極,以及末期與胞質分裂時的收縮環。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
MAEA 是 CTLH 複合體的成員;複合體另含 GID4、RANBP9 和/或 RANBP10、MKLN1、RMND5A(或其旁系同源蛋白 RMND5B)、GID8、ARMC8、WDR26 與 YPEL5。MAEA、RMND5A 或 RMND5B、GID8、WDR26,以及 RANBP9 和/或 RANBP10 組成催化核心;GID4、MKLN1、ARMC8 與 YPEL5 則具有輔助角色。此外,MAEA 與 F-actin 有實體交互作用。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 4 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | MAEA 是 CTLH E3 ubiquitin-protein ligase complex 的核心成員,可選擇性接收 UBE2H 傳遞的泛素,促進轉錄因子 HBP1 泛素化及蛋白酶體降解;MAEA 與 RMND5A 對複合體催化活性皆不可或缺,且 MAEA 與正常細胞增殖有關。該複合體不負責降解 FBP1 等糖質新生酵素。MAEA 亦參與紅芽球去核、成熟巨噬細胞發育、紅系細胞與成熟巨噬細胞附著及紅系島形成;該接觸可抑制紅系細胞凋亡。它與 F-actin 相關並調節細胞中的 actin 分布;對核架構及細胞分裂的貢獻則屬可能推論。 | 含實驗來源 | 證據與來源Core component of the CTLH E3 ubiquitin-protein ligase complex that selectively accepts ubiquitin from UBE2H and mediates ubiquitination and subsequent proteasomal degradation of the transcription factor HBP1. MAEA and RMND5A are both required for catalytic activity of the CTLH E3 ubiquitin-protein ligase complex. MAEA is required for normal cell proliferation. The CTLH E3 ubiquitin-protein ligase complex is not required for the degradation of enzymes involved in gluconeogenesis, such as FBP1. Plays a role in erythroblast enucleation during erythrocyte maturation and in the development of mature macrophages (By similarity). Mediates the attachment of erythroid cell to mature macrophages; this MAEA-mediated contact inhibits erythroid cell apoptosis. Participates in erythroblastic island formation, which is the functional unit of definitive erythropoiesis. Associates with F-actin to regulate actin distribution in erythroblasts and macrophages (By similarity). May contribute to nuclear architecture and cells division events (Probable) PMID 29911972 ↗ · PMID 9763581 ↗ · PMID 16510120 ↗ |
| 分子活性 | S-ubiquitinyl-[E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + [acceptor protein]-L-lysine = [E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + N(6)-ubiquitinyl-[acceptor protein]-L-lysine. | 含實驗來源 | 證據與來源S-ubiquitinyl-[E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + [acceptor protein]-L-lysine = [E2 ubiquitin-conjugating enzyme]-L-cysteine + N(6)-ubiquitinyl-[acceptor protein]-L-lysine. PMID 29911972 ↗ |
| 交互作用 | MAEA 位於含 GID4、RANBP9 和/或 RANBP10、MKLN1、RMND5A 或其旁系同源蛋白 RMND5B、GID8、ARMC8、WDR26 與 YPEL5 的 CTLH 複合體中。MAEA、RMND5A 或 RMND5B、GID8、WDR26,以及 RANBP9 和/或 RANBP10 構成催化核心;GID4、MKLN1、ARMC8 與 YPEL5 則具輔助角色。此外,MAEA 與 F-actin 交互作用。 | 含實驗來源 | 證據與來源Identified in the CTLH complex that contains GID4, RANBP9 and/or RANBP10, MKLN1, MAEA, RMND5A (or alternatively its paralog RMND5B), GID8, ARMC8, WDR26 and YPEL5. Within this complex, MAEA, RMND5A (or alternatively its paralog RMND5B), GID8, WDR26, and RANBP9 and/or RANBP10 form the catalytic core, while GID4, MKLN1, ARMC8 and YPEL5 have ancillary roles. Interacts with F-actin PMID 16510120 ↗ · PMID 17467196 ↗ · PMID 29911972 ↗ |
| 細胞定位 | MAEA 可見於細胞質、核質、核基質、細胞膜及細胞骨架,並曾呈核內斑點狀分布。細胞分裂時,它與前期凝縮染色質相關,於中期出現在核紡錘體極,並在末期及胞質分裂時位於收縮環。巨噬細胞中,MAEA 分布於細胞質、核基質及細胞表面;未成熟細胞以核內為主,成熟細胞則主要位於表面,且與 F-actin 共定位。 | 含實驗來源 | 證據與來源Cytoplasm; Nucleus, nucleoplasm; Nucleus matrix; Cell membrane; Cytoplasm, cytoskeleton; Detected in a nuclear, speckled-like pattern. Localized with condensed chromatin at prophase; Detected in nuclear spindle poles at metaphase and in the contractile ring during telophase and cytokinesis. Present in cytoplasm, nuclear matrix and at the cell surface in macrophages; predominantly nuclear in immature macrophages and predominantly detected at the cell surface in mature macrophages. Colocalizes with F-actin in macrophages (By similarity) PMID 17467196 ↗ · PMID 24143168 ↗ · PMID 29911972 ↗ · PMID 16510120 ↗ · PMID 9763581 ↗ |
核酸與蛋白質序列
GCTAATGTTTTGGCCGCTTCAAGATGGCGGTGCAGGAGTC40GGCGGCTCAGTTGTCCATGACCCTGAAGGTCCAGGAGTAC80CCGACCCTCAAGGTGCCCTACGAGACGCTGAACAAACGCT120TTCGCGCCGCTCAGAAGAACATTGACCGGGAGACCAGCCA160CGTCACCATGGTGGTGGCCGAGCTGGAGAAGACGTTGAGC200GGCTGCCCCGCCGTGGACTCCGTGGTCAGCCTGCTGGACG240GCGTGGTGGAGAAGCTCAGCGTCCTCAAGAGGAAGGCGGT280GGAATCCATCCAGGCCGAGGACGAGAGCGCCAAGCTGTGC320AAGCGCCGGATCGAGCACCTCAAAGAGCATAGCAGCGACC360AGCCCGCGGCGGCCAGCGTGTGGAAGAGGAAGCGCATGGA400TCGCATGATGGTGGAGCACCTGCTGCGTTGCGGCTACTAC440AACACGGCTGTCAAGCTGGCGCGCCAGAGCGGCATCGAGG480ACCTAGTGAATATTGAGATGTTCCTGACGGCCAAAGAGGT520GGAGGAGTCCCTGGAGAGGCGTGAGACGGCCACCTGCCTG560GCCTGGTGCCATGACAACAAGTCCCGGCTCCGGAAGATGA600AGAGCTGCCTGGAGTTCAGCCTCAGAATCCAGGAGTTCAT640TGAACTCATCCGGCAGAATAAGAGACTGGACGCTGTGAGA680CATGCAAGAAAGCACTTCAGCCAAGCAGAAGGGAGCCAGC720TGGACGAGGTGCGCCAGGCCATGGGCATGCTGGCCTTCCC760GCCCGACACGCACATCTCCCCGTACAAGGACCTTCTGGAC800CCTGCACGGTGGCGGATGCTGATCCAGCAGTTCCGGTACG840ACAACTACCGACTACACCAGCTGGGAAACAATTCTGTGTT880CACCCTCACCCTGCAGGCTGGCCTCTCAGCCATCAAGACA920CCACAGTGCTACAAGGAGGACGGCAGCTCCAAGAGCCCTG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。