基因總覽
LY6G6F 的正式名稱為 lymphocyte antigen 6 family member G6F,屬於蛋白質編碼基因。現有資料支持其可能參與訊號傳遞,但未提供足以描述其產物家族特性或其他基本生物學性質的資訊。
基因異名與舊稱
異名取自 HGNC,可能包含歷史名稱;蛋白質名稱以 UniProt 註解為準。
染色體位置與基因結構
查看實際轉錄本與 exon 註解
| Transcript | Genomic coordinates | Exons |
|---|---|---|
| ENST00000375832 ★ | 31,706,866–31,710,679 | 6 |
| ENST00001135070 | 31,706,863–31,710,679 | 6 |
顯示 2/2 個蛋白質編碼轉錄本;canonical 優先。
帶型與著絲點依 Ensembl 座標繪製;核染色體長度以 GRCh38 第 1 號染色體為共同尺度。黃色標記表示本基因位置,細小區間加粗以利辨識;實際基因長度與 exon 見下方資料。
分子功能與生物學過程
LY6G6F 可能參與涉及 GRB2 與 GRB7 的下游訊號傳遞路徑。這項功能描述指出它可能與這兩種分子相關的訊號傳遞有關,但沒有進一步說明它在路徑中的具體作用方式。
目前資料未交代相關訊號發生的細胞或生理情境,也未指出 LY6G6F 對訊號的影響方向、作用機制或下游結果。因此,其功能應限於「可能參與涉及 GRB2 與 GRB7 的下游訊號傳遞」這一層級;尚不足以據此描述更具體的生物學過程或功能意義。
Promoter 與基因調控
>LY6G6F ENST00000375832 GRCh38 chr6:31705866-31706966 strand=1 5′→3′ 相對 TSS:-1000 到 +100 bp;1101 bp 依轉錄本 TSS 擷取的基因組序列;TSS = 0,兩端包含,未驗證為 promoter CAGTCTTCTACTCTGTTAAGCATTTATCCATTATATAGTTGTACTTCATATAGTTTTTGGTATGTATGGA ATATTTCATCAAAATAATTTTAAAAATAAATAAATTACACATTAAAACTGTAATAACTGCATGAAGATCT GCCTTAGGAGTTTTTGCCGTTCAGAAGGATGAATCAGCCCGTTAGCCTTGTCCCTGAGTAATAATTTAAT ACACTTATTAGGGTTTCAGGAGAGGTCCGGGGTATGCCAGACAACCACAGGGAAAGTCATTCCAAATCAT TTACGGGACACTGACTCGATACACAGTCTTGTGCTGGGTTCTGTGGAGGACCAACATAAAAACTCAAACT CAGTTTCTTCACTCATAGCTGACATTTCTTTTCTTTTCTTTTCTTTTTCTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTT TTTTTTGAGATGAAGTCTCGCTCTGTCTCCCAGGCTGGAGTGCAGTAGCACGATCTCGGCTCACTGCAAC CTCCACCTCCCGGGTTCAAGCGATTCTGGTGCCTCTCAGCTTCCTAAGTAGCTGGGATTACAGGCACATG TCACCACGCCTGGCTAATTTTTGTATTTTTTGTAGAGACAGGGTTTCGCCATGTTGGCCACGCTGGTCTC GAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCCAACTCATGGCTGACCTTTCTTAGGAGTGAAAGAGACCTCAGAA TGTACTTCCAGACTGACAAGAGCTAGACAGGCAGGACCACTTCTCTGCATGGTTTTTTGCATGGAAAGTC TTTATTTGAGCCCCTTAGCTGATGTGGAATCAGAAGAGCAAAAAGGTCATCTTCAGAGTGGCCTGGGCTG GGTCCTTTTCTCTCCAGGATAGAAAAGTGGTGGTCACTTTATCCCTAGTAGACATGCTGCTGGGCTTTAT CGCCCCAGCATTCCCATCCCCTCCAGAGCCCCTTGTCACTCCAGACCAGCGAGTGTGGGCCTTTATCTGG ACTCTGCTTCCTCCCTGGGGACACCAGGTCTTGGAGCAAGAGAACTTGGCAGGCTCTCCCCATGGCAGTC TTATTCCTCCTCCTGTTCCTATGTGGAACTCCCCAGGCTGCAGGTAAGGGG
EPDnew 實驗支持 promoter/TSS · 2 筆
| EPDnew ID | TSS(1-based) | 股向 | 來源顯示區間 |
|---|---|---|---|
| LY6G6F_1 ↗ | 6:31,706,883 | 正股 | 31,706,834–31,706,893 |
| LY6G6D_1 ↗ | 6:31,715,348 | 正股 | 31,715,299–31,715,358 |
EPDnew human v006 · UCSC hg38,GRCh38/hg38,透過 UCSC 取得。TSS 具有 CAGE/RAMPAGE 等實驗資料支持;任意擷取的上下游區間仍需另行判讀調控功能,不能視為整段皆經功能驗證。
EPD 封存狀態 ↗ · UCSC 資料說明 ↗ · EPD team, SIB Swiss Institute of Bioinformatics; UCSC Genome Browser · CC BY 4.0
蛋白質結構域與序列
參考蛋白質長度:297 aa
LY6G6F 蛋白質長 297 個胺基酸。其 N 端包含 1–16 位的訊號肽,17–235 位為細胞外區域,其中 17–122 位註解為 Ig-like V-type domain;236–256 位是螺旋型跨膜區,257–297 位位於細胞質側。
蛋白質三維結構
細胞內定位
LY6G6F 位於細胞膜,屬於單次穿膜的 I 型膜蛋白。 現有資料未提供其定位隨條件改變或不同異構型間差異的資訊。
深綠色圓點:來源記載的蛋白質定位;數量不表示含量。
動物細胞結構示意;器官大小與數量不按比例。點選細胞構造可查看定位註解。
交互作用與訊號網絡
拖曳節點後放開可帶動位置變化;點選夥伴查看證據。位置與連線長度不代表結合強度,圖中未推定夥伴彼此之間的關係。
更多交互作用夥伴 · 已取得 2 個夥伴
- GRB2P62993 · UniProt INTERACTION · 3 experiments
- GRB7Q14451 · UniProt INTERACTION · 2 experiments
LY6G6F 可形成由二硫鍵連結的同源二聚體。它也會依賴磷酸化狀態與 GRB2、GRB7 互作;資料未進一步說明這些互作是否構成複合體,或其功能後果。
疾病與遺傳關聯
Contextual Functional Evidence Matrix
矩陣以「功能主張」為列,以細胞情境、干預條件、量測結果與證據來源為欄,方便比較同一功能在不同條件下的支持情形。只有含情境與實驗資訊的紀錄會列入矩陣;一般功能註解另列於下方。
功能註解總覽 · 3 筆
| 功能面向 | 功能敘述 | 證據類型 | 可查核來源 |
|---|---|---|---|
| 功能 | LY6G6F 可能參與涉及 GRB2 與 GRB7 的下游訊號傳遞路徑。此描述指出其可能與相關訊號傳遞有關,但未明確說明其在路徑中的具體作用方式、訊號方向或下游結果。 | 含實驗來源 | 證據與來源May play a role in the downstream signal transduction pathways involving GRB2 and GRB7 PMID 12852788 ↗ |
| 交互作用 | LY6G6F 可形成以二硫鍵連結的同源二聚體,並會依賴磷酸化狀態與 GRB2 及 GRB7 互作。資料未進一步交代磷酸化的具體條件,也未說明這些互作是否構成複合體或導致何種功能結果。 | 含實驗來源 | 證據與來源Homodimer; disulfide-linked. Interacts with GRB2 and GRB7 in a phosphorylation-dependent manner PMID 12852788 ↗ |
| 細胞定位 | LY6G6F 位於細胞膜,並被描述為單次穿膜的 I 型膜蛋白。這項註解未提供定位隨細胞條件改變的資訊,也未指出不同異構型之間是否存在定位差異。 | 含實驗來源 |
核酸與蛋白質序列
ACACCAGGTCTTGGAGCAAGAGAACTTGGCAGGCTCTCCC40CATGGCAGTCTTATTCCTCCTCCTGTTCCTATGTGGAACT80CCCCAGGCTGCAGACAACATGCAGGCCATCTATGTGGCCT120TGGGGGAGGCAGTAGAGCTGCCATGTCCCTCACCACCTAC160TCTACATGGGGACGAACACCTGTCATGGTTCTGCAGCCCT200GCAGCAGGCTCCTTCACCACCCTGGTAGCCCAAGTCCAAG240TGGGCAGGCCAGCCCCAGACCCTGGAAAACCAGGAAGGGA280ATCCAGGCTCAGACTGCTGGGGAACTATTCTTTGTGGTTG320GAGGGATCCAAAGAGGAAGATGCCGGGCGGTACTGGTGCG360CTGTGCTAGGTCAGCACCACAACTACCAGAACTGGAGGGT400GTACGACGTCTTGGTGCTCAAAGGATCCCAGTTATCTGCA440AGGGCTGCAGATGGATCCCCCTGCAATGTCCTCCTGTGCT480CTGTGGTCCCCAGCAGACGCATGGACTCTGTGACCTGGCA520GGAAGGGAAGGGTCCCGTGAGGGGCCGTGTTCAGTCCTTC560TGGGGCAGTGAGGCTGCCCTGCTCTTGGTGTGTCCTGGGG600AGGGGCTTTCTGAGCCCAGGAGCCGAAGACCAAGAATCAT640CCGCTGCCTCATGACTCACAACAAAGGGGTCAGCTTTAGC680CTGGCAGCCTCCATCGATGCTTCTCCTGCCCTCTGTGCCC720CTTCCACGGGCTGGGACATGCCTTGGATTCTGATGCTGCT760GCTCACAATGGGCCAGGGAGTTGTCATCCTGGCCCTCAGC800ATCGTGCTCTGGAGGCAGAGGGTCCGTGGGGCTCCAGGCA840GAGATGCCTCGATTCCTCAGTTCAAACCCGAAATCCAGGT880CTATGAGAACATCCATTTGGCCCGTCTTGGCCCACCTGCC920CACAAGCCCAGGTGATTTTGGTGACATCTGCTGGGAAGTG960cDNA 使用 DNA 字母 T;mRNA 模式改以 U 顯示。轉錄本保留已註解的非編碼區,未另外加入 poly(A) 尾;非編碼 RNA 的參考轉錄本也可能仍需後續加工。數字為所選序列的 1-based 位置。長序列以黃色捲軸瀏覽,可複製或下載完整轉錄本與蛋白質;基因組 DNA 隨捲動取得所需範圍。